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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-05-24 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-May-23, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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研究论文 | 本文描述了一种通过共识设计获得的转肉桂酸脱羧酶PSC1,用于苯乙烯的生物合成 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1,能够在细菌中高效催化肉桂酸脱羧生成苯乙烯,解决了传统真菌脱羧酶在细菌系统中应用的难题 | NA | 开发一种高效、环保的苯乙烯生物合成方法 | 转肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
22 | 2025-05-24 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-May-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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review | 本文综述了人工孢子中单细胞纳米封装(SCNE)技术的最新进展,重点讨论了纳米壳的细胞保护和多功能作用 | 受自然界隐生现象的启发,设计了具有纳米壳保护和功能能力的人工'细胞壳'结构,克服了生物原始细胞的固有局限 | NA | 通过SCNE技术实现细胞内和细胞周围化学调控的精细调节,设计和构建满足特定功能需求的人工孢子 | 人工'细胞壳'结构 | 合成生物学、生物化学、材料科学、生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装(SCNE) | NA | NA | NA |
23 | 2025-05-24 |
Removing redundancy of the NCN codons in vitro for maximal sense codon reassignment
2025-May-21, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06740a
PMID:40271033
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research paper | 该研究探讨了通过消除NCN密码子的冗余性,在体外实现最大程度的有义密码子重新分配,以扩展遗传密码的应用 | 提出了一种评估密码子重新分配潜力的通用流程,并将16个密码子分配给10种不同的氨基酸,显著提高了编码潜力 | 研究主要在体外进行,体内应用的可行性和效果尚待验证 | 扩展遗传密码,为合成生物学、蛋白质功能研究和多肽库的创建提供更多可能性 | NCN密码子及其对应的tRNA | 合成生物学 | NA | mRNA展示技术 | NA | NA | NA |
24 | 2025-05-24 |
Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming
2025-May-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf440
PMID:40396492
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研究论文 | 该研究提出了一种基于量子计算原理的新型合成生物学工具包,用于构建具有多输出基因控制的压缩遗传电路,以增强转录编程的生物计算能力 | 利用量子计算原理设计合成双向启动子和转录因子,构建了1输入2输出的生物量子比特和PAULI-X逻辑门,并进一步开发了更复杂的FEYNMAN和TOFFOLI门,以及2输入4输出的量子操作 | NA | 提高生物系统决策操作的复杂性,同时最小化对底盘细胞的代谢负担 | 合成遗传电路和量子启发的逻辑操作 | 合成生物学 | NA | 合成双向启动子工程、合成转录因子调控、重组酶记忆操作 | 量子启发的逻辑门(QUBIT、PAULI-X、FEYNMAN、TOFFOLI) | NA | NA |
25 | 2025-05-24 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过对炎症性肠病(IBD)患者肠道微生物组中小分子生物合成基因簇(BGCs)的荟萃分析,发现与克罗恩病(CD)相关的两种梭菌衍生BGCs,并鉴定了六种脂肪酸酰胺作为其产物,这些分子可能影响肠道通透性并加剧疾病 | 首次通过合成生物学方法发现并解析了与克罗恩病相关的微生物组衍生小分子结构,并验证了这些分子在疾病模型中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本中的验证仍需进一步研究 | 探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者的肠道微生物组及衍生小分子 | 微生物组学 | 炎症性肠病(克罗恩病) | 宏基因组测序,合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | IBD患者和健康对照的肠道微生物组样本 |
26 | 2025-05-24 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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research paper | 该研究探讨了种子植物中跨生物体独脚金内酯(SLs)的生物合成进化 | 揭示了CYP722A在非经典SLs生物合成中的关键作用,并提出了16-OH-CLA作为经典SLs进化中的代谢中间体 | 未涉及所有种子植物种类,可能无法全面代表SLs的进化路径 | 研究独脚金内酯的生物合成进化及其功能分化 | 种子植物中的独脚金内酯及其生物合成酶 | 植物分子生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 生化数据 | 多种开花植物的地上部分 |
27 | 2025-05-23 |
Advances in metabolic engineering for enhanced acetyl-CoA availability in yeast
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2399542
PMID:39266266
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review | 本文总结了酵母中乙酰辅酶A及其衍生物生物合成途径和代谢工程方法的最新进展 | 强调了通过代谢工程策略调控乙酰辅酶A合成以创建更有效的微生物细胞工厂的新见解 | NA | 提高酵母中乙酰辅酶A的可用性以促进其衍生物的高效合成 | 酵母中的乙酰辅酶A及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
28 | 2025-05-23 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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review | 本文综述了虾青素(AXT)的生物合成及其在功能性食品开发和太空任务中的应用 | 探讨了合成生物学和细胞工厂策略在虾青素工业生产中的应用,并提出了其在太空探索中的潜在用途 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持合成生物学策略的有效性 | 研究虾青素的生物合成及其在工业和太空任务中的应用 | 虾青素(AXT)及其在不同底盘生物中的表达 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA |
29 | 2025-05-23 |
Engineering NADH oxidase for regeneration of oxidized non-natural cofactor
2025-May-22, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
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研究论文 | 该研究通过改造来自粪肠球菌的H2O形成NADH氧化酶(EfNOX),使其偏好氧化非天然辅因子NCDH,从而为氧化反应提供NCD+ | 首次成功改造NADH氧化酶以高效氧化非天然辅因子NCDH,并展示了其在代谢工程中的应用潜力 | 研究仅针对特定酶进行改造,未全面评估在复杂代谢网络中的表现 | 开发非天然辅因子NCD+的再生工具以扩展氧化还原生物化学的应用范围 | NADH氧化酶(EfNOX)及其突变体 | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 生化实验数据 | 特定酶突变体(包括NOX-KRGT等) |
30 | 2025-05-23 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-May-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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research paper | 该研究揭示了Burkholderia pseudomallei病原体毒力因子malleicyprol中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 首次阐明了通过两个聚酮链的头对头融合和还原环化形成丁烯内酯核心的硫模板生物合成途径 | 研究主要基于体外重组和化学合成验证,未涉及完整病原体中的生物合成调控 | 解析malleicyprol毒力因子中丁烯内酯核心的生物合成机制 | Burkholderia pseudomallei病原体的毒力因子malleicyprol | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学合成、体外生物转化重组、突变分析、生化检测 | NA | 生化实验数据 | NA |
31 | 2025-05-23 |
dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion
2025-May-22, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763
PMID:40401918
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研究论文 | 本文研究了非天然核苷dTAT1在遗传密码扩展中的光毒性和光物理行为 | 发现dTAT1在390 nm激发下能形成三重态但细胞毒性低,且产生的单线态氧量子产率较低 | 未明确说明dTAT1在不同细胞类型或长期暴露下的毒性表现 | 评估dTAT1作为遗传密码扩展工具的安全性和潜在应用 | 非天然核苷dTAT1及其光物理和细胞毒性特性 | 合成生物学 | NA | 光物理性质分析、活性氧物种检测 | NA | 实验数据 | NA |
32 | 2025-05-23 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-May-21, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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综述 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传学平台的发展、主要特点、当前应用及未来挑战,该平台用于在活细胞中控制蛋白质定位 | 介绍了SLIPT-PM这一新型化学遗传学平台,能够快速将目标蛋白从细胞质招募到质膜,并具有可控的可逆性和重复性 | 未明确提及具体局限性 | 开发用于操纵细胞信号网络的化学遗传学工具 | 细胞信号蛋白和脂质 | 化学生物学与合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白转位)技术 | NA | NA | NA |
33 | 2025-05-23 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
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研究论文 | 通过计算机模拟分析细菌代谢动力学对外部扰动的响应,揭示了代谢网络中辅因子和网络稀疏性的硬编码响应特性 | 发现三种不同动力学模型在非线性状态下对扰动表现出一致的强响应,并识别出腺苷辅因子和网络结构是影响代谢系统响应性的关键因素 | 研究基于计算机模拟,需要进一步实验验证 | 发展定量稳态理论,理解生化系统在扰动下的动力学特性 | 细菌中心碳代谢的动力学模型 | 计算系统生物学 | NA | 动力学模型模拟 | 非线性动力学模型 | 计算机模拟数据 | 三种不同的动力学模型 |
34 | 2025-05-23 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
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研究论文 | 该研究通过合成生物学技术实现了创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生产,并评估了其抗结核活性 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物,并首次报道卤化去甲创新霉素衍生物,实现了实验室水平的最高产量 | 未提及临床前或临床试验数据,活性测试仅限于体外实验 | 开发新型抗结核药物候选物 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、激活子过表达、启动子优化、发酵培养基筛选、HR-MS、HR-MS/MS、NMR | NA | 化学分析数据、生物活性数据 | 11种卤化创新霉素衍生物(其中6种纯化鉴定) |
35 | 2025-05-23 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 本文全面探讨了T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的创新应用、挑战及未来发展方向 | 拓宽了T7RNAP的研究范围,不仅涵盖分子结构和功能动态,还包括其在合成生物学应用中的基础原理和精细电路设计,以及工程化T7RNAP的最新进展 | 讨论了调控复杂性的关键挑战,但未具体说明实验验证或具体案例的局限性 | 优化微生物细胞工厂中的转录系统,提升可持续生物生产性能 | T7RNA聚合酶及其变体在微生物细胞工厂中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
36 | 2025-05-23 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-May-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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research paper | 该研究开发了一种便携式砷传感器,通过合成生物学改造巨大芽孢杆菌并与CMOS技术集成,用于实时检测环境中的砷含量 | 首次将基因改造的巨大芽孢杆菌与CMOS芯片集成,实现了可现场部署的砷检测传感器 | 巨大芽孢杆菌的合成生物学工具包尚不完善,传感器性能有待进一步验证 | 开发一种便携式砷检测传感器,用于资源有限环境中的实时监测 | 砷污染检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | 概念验证阶段,未明确样本数量 |
37 | 2025-05-23 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程细胞在药物递送中的新兴应用 | 探讨了合成生物学与纳米技术在药物递送中的前沿融合,强调了工程细胞的模块化、标准化和智能化发展趋势 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 推动先进药物递送系统的构建 | 合成生物学工程细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA |
38 | 2025-05-23 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
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研究论文 | 本文提出了一种利用合成生物学原理精确控制细菌中肝素糖生物合成的新方法,旨在生产低分子量和低分散指数的肝素糖 | 设计了一种生物分子控制器,通过生物传感器检测肝素糖前体,精确调控肝素糖生物合成过程 | NA | 开发一种能够精确控制肝素糖生物合成的方法,以生产具有特定性能的肝素糖材料 | 肝素糖的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学设计原理 | NA | NA | NA |
39 | 2025-05-23 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定向胆固醇标记的三链DNA作为合成受体,通过H介导的构象变化实现跨膜信号转导的人工信号转导系统 | 利用三链DNA的构象变化模拟天然G蛋白偶联受体的功能动态,实现了跨膜信号转导的多功能应用 | NA | 开发合成生物学中跨膜信号转导的人工系统 | 胆固醇标记的三链DNA和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、选择性光裂解、催化信号放大 | NA | NA | NA |
40 | 2025-05-22 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025-May-21, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法生成适应悬浮生长的HEK293细胞系,用于重组腺相关病毒(rAAV)的可扩展生产 | 开发了能够在无血清悬浮培养基中生长的GX6Bs细胞系,并研究了其转录组变化对rAAV产量的影响 | 悬浮培养的GX6Bs细胞病毒滴度显著降低,即使恢复贴壁培养条件,产量也只能恢复到GX6B的25%-50% | 开发可扩展的rAAV生产技术 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | GX6B和GX6Bs细胞系 |