合成生物学相关文章
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当前共找到 3517 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-08-30 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 提出一种名为DySEEP的动态模拟方法，用于评估不同微生物生产PHB的经济潜力 | 开发了结合动态通量平衡分析和经济指标的新方法DySEEP，用于系统评估生物产品生产的经济可行性 | 由于DFBA模拟的性质，无法预测某些关键聚合物特性 | 优化聚-3-羟基丁酸酯(PHB)生物生产工艺的经济性 | 重组大肠杆菌、洋葱伯克霍尔德菌和罗尔斯通氏菌 | 生物过程工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | 代谢网络模型 | 代谢通量数据 | 三种微生物菌株的比较分析 |
| 22 | 2025-08-30 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 开发一种可被可溶性配体激活的模块化合成受体平台SNIPR，用于调控工程化治疗细胞功能 | 首次将SNIPR受体架构适配于可溶性配体激活，实现低基线活性和高折叠激活，并通过内吞pH依赖性切割机制工作 | NA | 创建模块化合成受体以响应可溶性配体并激活定制细胞功能 | 合成受体SNIPR、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-08-30 |
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 本文提出了一个整合微生物生态学、合成生物学和计算建模的框架，用于理性设计农业合成微生物群落（SynComs）以增强气候韧性 | 引入可编程全息生物概念，整合CRISPR干扰、生物传感器电路和群体感应模块等技术实现动态反馈和跨界信号传导 | NA | 通过微生物组工程提升农业对气候胁迫、土壤退化和产量停滞的韧性 | 植物全息生物（宿主与其微生物组的整合单元） | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA |
| 24 | 2025-08-30 |
Harnessing synthetic biology to empower a circular plastics economy
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0053
PMID:40638940
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和微生物群落工程降解和升级回收塑料废物的策略，以支持循环塑料经济 | 整合合成生物学与微生物群落工程，提出预处理塑料材料和改造顽固乙烯基聚合物的互补策略，以提升生物处理效率 | NA | 探讨生物技术如何通过低强度生物过程缓解和升级回收塑料废物，推动循环塑料经济的发展 | 塑料废物，特别是工业与环境背景下的塑料材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，微生物群落工程 | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-08-30 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576308
PMID:39484520
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研究论文 | 开发了一种基于人源化蛋白质的合成电路平台hDIRECT，用于控制细胞因子活性 | 首次使用完全人源化的蛋白质组件构建正交性分泌信号控制系统，降低免疫原性风险 | 目前仅为概念验证研究，尚未进行大规模临床验证 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人源蛋白酶、细胞因子（IL-2, IL-6, IL-10）及其FDA批准抑制剂 | 合成生物学 | 癌症免疫治疗、肌肉再生 | 蛋白质工程、蛋白酶调控技术 | NA | 蛋白质活性数据 | NA |
| 26 | 2025-08-30 |
Toward the clinical development of synthetic immunity to cancer
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13245
PMID:37491719
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评论 | 本文提出五项原则以指导合成生物学细胞疗法在癌症治疗中的临床转化开发 | 提出基于免疫学基础、预测性临床前模型、效力与安全性平衡、临床发现指导及多机制应对的五项下一代细胞疗法设计原则 | 原则主要基于癌症免疫治疗背景，在其他疾病领域的适用性需进一步验证 | 推动合成免疫在癌症治疗中的临床开发与转化 | 合成生物学工具（如CARs）设计的细胞疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术、细胞疗法 | NA | NA | NA |
| 27 | 2025-08-30 |
Synthesizing a Smarter CAR T Cell: Advanced Engineering of T-cell Immunotherapies
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0962
PMID:37429007
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综述 | 本文探讨了合成生物学在改进CAR T细胞免疫疗法中的应用与前景 | 整合合成生物学最新进展以增强CAR T细胞的安全性、效能和治疗范围 | NA | 提升T细胞免疫疗法的精准性和适用疾病范围 | CAR T细胞及工程化免疫细胞 | 合成生物学 | 血液癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-08-29 |
Reinforcement Learning-Based Target-Specific De Novo Design of Cyclic Peptide Binders
2025-Aug-28, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00789
PMID:40824037
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研究论文 | 提出一种基于强化学习的框架CYC_BUILDER，用于靶向特异性从头设计环肽结合剂 | 采用强化学习和蒙特卡洛树搜索指导片段选择、肽链生长和结构优化，实现高效环化 | NA | 开发计算设计环肽结合剂的新方法 | 环肽-蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | reinforcement learning, Monte Carlo Tree Search | RL | 分子结构数据 | 9个设计肽的实验验证（其中4个显示活性） |
| 29 | 2025-08-29 |
Microbial proteases as emerging anti-inflammatory therapeutics: a comprehensive review
2025-Aug-19, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04409-w
PMID:40828296
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综述 | 本文全面探讨微生物蛋白酶作为新兴抗炎治疗剂的潜力，包括其分子机制、生产策略及临床转化前景 | 系统评估微生物蛋白酶替代传统抗炎药物的优势，并首次重点探讨未充分研究的细菌属及生产挑战 | 存在免疫系统敏感性、生理条件下稳定性差、缺乏与其他酶源的性能对比数据、监管审批和靶向递送难题 | 评估微生物蛋白酶在炎症管理中的治疗潜力及临床转化路径 | 微生物蛋白酶及其抗炎机制 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 发酵技术、基因改造、菌株工程、封装技术、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
| 30 | 2025-08-29 |
Recent advances of muconic acid production using microbial synthetic biology
2025-Aug-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04419-8
PMID:40788366
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综述 | 本文重点介绍了利用合成生物学技术生产粘康酸的关键进展及优化策略 | 探讨了辅因子工程、模块化共培养和人工智能辅助酶优化等新型生物合成策略 | NA | 提升粘康酸的微生物合成效率与经济可行性 | 粘康酸生物合成体系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、辅因子工程、人工智能辅助优化 | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-08-29 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
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综述 | 本文全面回顾了利用合成生物学和代谢工程工具（以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例）对肠道微生物组进行治疗的工程化方法 | 重点介绍了通过酶工程和代谢通路改造实现精准肠道治疗的最新进展，特别是针对苯丙酮尿症的工程菌应用 | NA | 探讨基于微生物组的治疗干预方法的发展，特别是合成生物学在肠道健康中的应用 | 肠道微生物组、工程化细菌（特别是大肠杆菌Nissle 1917）、宿主生理和代谢功能 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢功能障碍、结直肠癌、苯丙酮尿症(PKU) | 生物催化、代谢工程、酶工程、基因工程 | NA | 文献证据、工程代谢回路数据、治疗效果指标 | NA |
| 32 | 2025-08-29 |
Advancing fungal phylogenetics: integrating modern sequencing, dark taxa discovery, and machine learning
2025-Jul-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04392-2
PMID:40643763
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综述 | 本文综述了现代分子技术（如NGS、TGS）和机器学习在真菌系统发育研究中的整合应用，推动物种鉴定、进化分析和疾病管理 | 整合第三代测序技术、多组学方法与机器学习算法，提出解决真菌隐秘物种鉴定和抗药性预测的创新框架 | 存在基因组内变异解析困难、基因树不一致性协调挑战以及大规模研究流程标准化不足的问题 | 提升真菌系统发育分析的精度与效率，推动病原体监测和精准治疗策略发展 | 真菌物种（包括Aspergillus、Fusarium、Penicillium等属）及其与环境、临床样本的相互作用 | 生物信息学 | 真菌感染性疾病 | NGS（Illumina/PacBio/Oxford Nanopore）、TGS、CRISPR诊断、多组学整合分析 | 机器学习算法 | 基因组序列、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 涉及环境与临床样本中的广泛真菌多样性（未提供具体数量） |
| 33 | 2025-08-29 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-12-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
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研究论文 | 本文通过数学建模探讨了诱导型双稳态系统中基因调控步骤延迟和外部诱导时间尺度对细胞命运决定动态过程的影响 | 揭示了稳态分析未能捕捉的瞬态现象，提出生化相互作用的不等延迟和外部诱导时间尺度会导致分化轨迹偏离并形成长期存在的瞬态分布 | NA | 研究基因调控网络中细胞命运决定的动态过程 | 诱导型双稳态系统 | 系统生物学 | NA | 常微分方程建模与稳态分析 | NA | 理论模型数据 | NA |
| 34 | 2025-08-12 |
Synthetic biology approaches for restoring gut microbial balance and engineering disease-specific microbiome therapeutics
2025-Oct, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.107931
PMID:40716471
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综述 | 探讨合成生物学方法在恢复肠道微生物平衡及设计疾病特异性微生物组疗法中的应用 | 提出了一种结合区域微生物组生态型、饮食响应模块化设计和自适应代谢模型的生态精准工程框架，以确保跨人群兼容性和稳定性 | NA | 开发可重复、适应性强且包容性广的微生物组干预措施，作为精准医学的一部分 | 人类肠道微生物组 | 合成生物学 | 炎症性肠病(IBD)、肥胖、糖尿病、神经退行性疾病 | CRISPR基因组编辑、代谢工程、多组学整合 | 人工微生物群落(AMCs) | NA | NA |
| 35 | 2025-08-12 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-Aug-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 本文通过开发高通量5DFRETMA方法，研究了环境与序列因素如何调控三链DNA的稳定性 | 开发了高通量5DFRETMA方法，首次预测了pH稳定性，并揭示了离子强度对三链DNA稳定性的双重影响 | NA | 揭示环境与序列因素如何调控三链DNA的稳定性，并为基因靶向治疗和合成生物学应用提供工具 | 三链DNA | 生物化学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA) | 预测模型 | 荧光数据 | 至少414组缓冲条件 |
| 36 | 2025-08-12 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Aug-11, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
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综述 | 本文探讨了合成细胞中脂质多样性与最小化，以定义膜的需求 | 对比了自下而上和自上而下的合成细胞构建方法，强调了膜蛋白与其周围脂质环境的关键相互作用 | 天然脂质膜的复杂性是构建最小系统的主要挑战 | 理解生命的基本原理并构建可应用于多个领域的合成细胞 | 合成细胞的脂质膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2025-08-12 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Aug-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
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研究论文 | 本文研究了乳酸菌中醌类前体DHNA的生物合成调控机制，揭示了遗传、酶和代谢共同作用的双重调控模式 | 首次阐明MenF和MenD酶在DHNA调控中的协同作用，建立包含可逆通量和变构反馈抑制的两阶段数学模型 | 研究仅限于乳酸菌模型，未在其他微生物体系中验证调控机制的普适性 | 解析微生物调控醌类水平的分子机制，为代谢工程改造提供理论基础 | 乳酸菌中甲萘醌前体DHNA的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学建模 | 两阶段调控数学模型 | 酶活性数据、代谢物浓度数据 | NA |
| 38 | 2025-08-12 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Aug-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
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research paper | 该研究首次在真菌中重构了负责组装免疫抑制剂霉酚酸（MPA）的β-氧化样酶级联反应，并通过优化途径提高了MPA的产量 | 首次在真菌天然产物生物合成中建立了完整的β-氧化样酶级联反应，为利用分解代谢模块驱动合成创新提供了范例 | NA | 优化β-氧化样途径以高效生产免疫抑制剂霉酚酸（MPA） | 真菌β-氧化酶级联反应及其在霉酚酸生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | 体外酶测定、基因过表达 | NA | NA | NA |
| 39 | 2025-08-12 |
Intelligent Design of Microbial Carbohydrate Factories: Integrated Chassis-Tools-Strategies Frameworks
2025-Aug-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05803
PMID:40788265
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review | 本文综述了合成生物学在微生物碳水化合物工厂智能设计中的集成方法 | 提出了一个多维理论框架，整合了底盘生物特性、计算与实验工具以及代谢工程策略，用于智能设计碳水化合物生物合成系统 | NA | 探索微生物生产碳水化合物的合成生物学方法 | 工业底盘生物及其碳水化合物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA |
| 40 | 2025-08-12 |
KDBI-RP: Kinetic Data of RNA-Protein Interactions Database
2025-Jul-25, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169357
PMID:40716733
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research paper | 介绍KDBI-RP，一个专注于RNA-蛋白质相互作用动力学的数据库 | KDBI-RP是首个系统整合RNA-蛋白质相互作用动力学数据的专用数据库，填补了该领域定量数据库的空白 | NA | 为RNA生物学和RNA医学研究提供定量动力学数据资源 | RNA-蛋白质相互作用动力学数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 定量动力学数据 | 3657个结合速率常数条目，3761个解离速率常数条目，175,932个平衡解离常数条目 |