合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-09-28	Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening 2025-Sep, aBIOTECH IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s42994-025-00240-5 PMID:40994446	综述	本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用，重点关注m6A介导的调控网络	提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学的创新路线图	对RNA修饰（尤其是m6A以外的修饰）的分子机制理解仍然有限	解析植物表观转录组的调控机制并应用于精准农业	植物系统（特别是被子植物）的RNA修饰	植物分子生物学	NA	表观转录组测序、CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学	NA	表观转录组数据	跨被子植物物种的比较研究
22	2025-09-28	Biofilms Exposed: Innovative Imaging and Therapeutic Platforms for Persistent Infections 2025-Aug-28, Antibiotics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/antibiotics14090865 PMID:41009844	综述	探讨生物膜在感染治疗中的挑战，并综述新型成像技术和靶向治疗平台的进展	整合超分辨率显微镜、微流控和AI建模等先进技术，提出基于合成生物学的工程化益生菌基因回路等创新疗法	NA	分析生物膜耐药机制并探索精准化生物膜管理策略	临床和工业环境中的生物膜	合成生物学	感染性疾病	超分辨率显微镜、微流控技术、AI建模、CRISPR-Cas修饰噬菌体	AI驱动建模	NA	NA
23	2025-09-28	Untangling the Complexity of Two-Component Signal Transduction in Bacteria 2025-Aug-28, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms13092013 PMID:41011345	综述	本文探讨细菌双组分信号转导系统的非典型结构及其调控机制	系统阐述非典型双组分系统的转录调控多样性、替代性反应调节蛋白活性及磷酸化调控机制	NA	解析细菌双组分信号转导系统的多样性及其在生物技术和医学中的应用潜力	细菌双组分信号转导系统	合成生物学	NA	NA	NA	文献综述	NA
24	2025-09-28	Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation 2025-Apr-28, JACS Au IF:8.5Q1 DOI:10.1021/jacsau.5c00262 PMID:40313816	研究论文	首次报道微生物通过中心硫代谢和非酶化学反应形成P=S和P=Se键	首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究，并首次利用微生物代谢物实现化学合成中的P=Se键形成	NA	探索微生物代谢物在化学合成中的应用潜力	多种细菌及其代谢产物	合成生物学	NA	微生物代谢工程、非酶化学反应	NA	生化实验数据	多种细菌菌株
25	2025-09-28	Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability 2014-Dec, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/nchembio.1680 PMID:25306443	研究论文	通过基因可用性的可编程时序控制实现生物传感器电路中的数字切换	利用位点特异性重组酶通过可编程时序控制多基因电路中基因的可用性，显著降低传感器本底泄漏	NA	提高合成生物学中瞬时基因电路应用的稳健性	内源性microRNA比例传感器和细胞类型分类	合成生物学	NA	位点特异性重组酶技术	NA	基因表达数据	NA
26	2025-09-27	Glyceollin biosynthesis in a plant chassis engineered for isoflavone production 2025-Oct, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-025-01914-3 PMID:40437134	研究论文	本研究通过代谢工程策略在本氏烟草叶片中重构了大豆抗菌化合物glyceollin的生物合成途径	首次鉴定出6个glyceollin合成酶并完成15步生物合成途径解析，实现了异源植物底盘的高产合成	研究局限于本氏烟草模型系统，尚未在作物中验证应用效果	解析glyceollin生物合成途径并建立植物底盘生产平台	大豆glyceollin生物合成途径及相关酶系	合成生物学	植物病害	代谢工程、酶功能鉴定、病原体抑制实验	NA	代谢组学数据、酶活性数据	本氏烟草叶片表达系统，产量达7.04 g/kg干重（前体）和5.9 g/kg干重（终产物）
27	2025-09-27	In Situ Plant Sensors: Toward Real-Time, High-Resolution Monitoring 2025-Sep-26, ACS sensors IF:8.2Q1 DOI:10.1021/acssensors.5c01494 PMID:40830763	综述	本文综述了柔性可穿戴设备和基因编码传感器在植物实时原位监测中的最新进展与应用潜力	强调柔性可穿戴设备与基因编码传感器的协同创新，实现组织水平和细胞内分子的高分辨率实时监测	存在适应性、传感稳定性、空间分辨率、参数覆盖范围有限以及多模态集成等技术挑战	开发新一代植物传感系统以推动高通量表型分析、精准农业和植物基础生物学研究	植物生理状态和应激反应	植物传感技术	NA	柔性可穿戴传感、基因编码传感器(GESs)	NA	生理参数（生长、微气候、水运输等）、分子信号（钙、活性氧、植物激素等）	NA
28	2025-09-27	An Engineered Probiotic Consortium Based on Quorum-Sensing for Colorectal Cancer Immunotherapy 2025-Sep-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202512744 PMID:40999885	研究论文	设计了一种基于群体感应的工程益生菌联合体，用于结直肠癌免疫治疗	开发了能够整合多种肿瘤微环境信号并通过正交群体感应系统协调多治疗载荷释放的工程益生菌联合体	NA	开发用于癌症治疗的工程化活体生物治疗产品	工程益生菌联合体及其在结直肠癌治疗中的应用	合成生物学	结直肠癌	合成生物学、正交群体感应系统	NA	实验数据	使用hPD-L1 MC38肿瘤的人源化PD-1小鼠模型和携带HT-29肿瘤的人源化外周血单核细胞小鼠模型
29	2025-09-27	Strategies to improve photosynthesis by modifying the RuBisCO system and its limitations 2025-Sep-26, Molecular biology reports IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s11033-025-11075-0 PMID:41003756	综述	本文综述了通过改造RuBisCO系统提高光合效率的策略及其局限性	系统整合了从蛋白质工程到合成生物学等多学科策略，并探讨了人工智能在预测突变和指导蛋白质设计中的应用	讨论了各种改良方法的固有局限性	提高RuBisCO酶的光合效率以增强作物生产力	RuBisCO酶系统及其相关调控机制	合成生物学/植物生物技术	NA	蛋白质工程、合成生物学、人工智能预测	机器学习	文本/综述分析	NA
30	2025-09-27	Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules 2025-Sep-25, Chemical communications (Cambridge, England) DOI:10.1039/d5cc02423d PMID:40905114	研究论文	开发了一种能够模拟细胞区室化的动态多相凝聚系统，实现选择性分子分配	通过动态膜化形成核壳结构凝聚体，可根据极性选择性定位颗粒和小分子	NA	构建仿生化学系统用于催化作用和合成生物学应用	多相凝聚体系统	合成生物学	NA	pH响应平台技术	NA	NA	NA
31	2025-09-27	Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials 2025-Sep-25, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00620 PMID:40999683	综述	本文探讨了合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何推动具有环境响应功能的可编程绿色纳米材料的发展	将生物相容性从静态属性重新定义为动态可编程特性，使纳米材料能够像复杂生物实体一样自主响应生物信号	在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在重大挑战	开发具有动态生物界面和自适应功能的新一代绿色纳米材料	可编程纳米材料	纳米医学	NA	合成生物学、DNA纳米技术、人工智能、4D生物打印、代谢工程	机器学习	NA	NA
32	2025-09-27	Probiotic-Based Materials as Living Therapeutics 2025-Sep-25, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202508500 PMID:40999775	综述	本文综述了基于基因工程益生菌的益生菌活性材料在生物医学应用中的潜力与挑战	提出了益生菌活性材料这一新概念，区别于传统活体生物治疗产品，整合了合成生物学与材料科学	缺乏稳健的益生菌基因工程工具包、存在生物安全问题、临床转化困难以及监管框架不明确	探讨PLMs作为靶向动态疗法的生物医学应用前景	基因工程益生菌与基质材料结合的活性材料系统	合成生物学与生物材料	多疾病领域（感染、骨骼修复、伤口愈合、阴道失衡、肠道疾病、癌症等）	基因工程技术与材料合成技术	NA	文献综述数据	NA
33	2025-09-27	Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning 2025-Sep-24, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101392 PMID:40997797	研究论文	本研究结合全细胞模型和机器学习技术，加速了大肠杆菌简化基因组的设计过程	利用机器学习代理模型将全细胞模型的计算时间减少95%，并成功设计出基因减少40%的大肠杆菌简化基因组	全细胞模型本身存在运行时间长的局限性	开发加速基因组设计的计算方法	大肠杆菌基因组	合成生物学	NA	全细胞模型、机器学习、基因本体分析	机器学习代理模型	计算模拟数据	计算机模拟的大肠杆菌细胞
34	2025-09-27	RNA Polymerase III Promoters Compatible with CRISPR Gene Regulation in Saccharomyces cerevisiae 2025-Sep-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00122 PMID:40824237	研究论文	本研究鉴定并表征了20个RNA聚合酶III启动子在酿酒酵母中用于CRISPR基因调控的适用性	首次系统评估跨物种来源的Pol III启动子在酵母CRISPR系统中的功能，发现支架介导的效应子招募可挽救部分启动子功能	研究仅限于酿酒酵母模型，未在其他真核生物中验证启动子兼容性	开发适用于酵母CRISPR系统的多基因同步调控工具	酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的基因调控系统	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9基因编辑技术	NA	基因表达数据	20个来自不同物种的RNA Pol III启动子
35	2025-09-27	Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum) 2025-Sep-19, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008 PMID:40976505	研究论文	本研究开发了一种适用于嗜热菌Acetivibrio thermocellus的L-阿拉伯糖诱导表达系统	首次在嗜热非模式微生物中构建了热稳定的L-阿拉伯糖诱导系统，将诱导倍数从5.4倍提升至175倍	NA	开发适用于嗜热菌的精确基因表达调控工具	Acetivibrio thermocellus（热纤梭菌）	合成生物学	NA	启动子工程、条件优化	NA	实验数据	NA
36	2025-09-27	Systematic Optimization Enables Near-Perfect In Vitro Transformation Efficiencies for Spirodela polyrhiza (Greater Duckweed) 2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.09.10.675371 PMID:41000642	研究论文	本研究系统优化了浮萍（Spirodela polyrhiza）的体外转化流程，实现了接近完美的转化效率	首次实现浮萍体外转化全流程的系统优化，在各关键步骤达到90%-100%的高效率，并将转化周期从数月缩短至数周	研究主要针对浮萍单一物种，未验证在其他植物物种的适用性	优化浮萍的体外遗传转化技术，克服转化过程中的技术瓶颈	浮萍（Spirodela polyrhiza，大浮萍）植物材料	植物生物技术	NA	体外遗传转化技术、愈伤组织诱导、转基因筛选、植物再生	NA	实验数据	转化植株稳定表达超过100代
37	2025-09-27	Recent Advances in Heterologous Protein Expression and Natural Product Synthesis by Aspergillus 2025-Jul-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/jof11070534 PMID:40985424	综述	本文综述了曲霉属真菌作为异源表达底盘在异源蛋白表达和天然产物合成方面的最新研究进展	重点探讨了CRISPR-Cas9技术在曲霉遗传改造中的应用现状及在萜类化合物异源生物合成中的创新应用	NA	总结曲霉平台在异源蛋白表达和天然产物生物合成领域的技术发展	曲霉属真菌（包括米曲霉、黑曲霉等）	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9基因编辑技术	NA	文献资料	NA
38	2025-09-27	Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology 2024-Sep-25, Chemical reviews IF:51.4Q1 DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938 PMID:39207844	综述	本文回顾了合成生物学中非标准氨基酸定点掺入的方法学进展和主要应用	系统总结了遗传密码扩展技术在合成生物学中的双向促进作用：既为合成生物学提供超越自然限制的工具，又受益于合成生物学的发展推动自身技术进步	NA	探讨遗传密码扩展技术介导的非标准氨基酸定点掺入在合成生物学中的方法进展和应用前景	非标准氨基酸、遗传密码扩展技术、合成生物学工具	合成生物学	NA	遗传密码扩展技术、非标准氨基酸掺入技术	NA	NA	NA
39	2025-09-26	[Advances in yeast biosynthesis of triterpenoids for cosmetic applications] 2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.250116 PMID:40994325	综述	本文综述了酵母合成三萜类化合物在化妆品领域的研究进展，重点分析了两大合成途径及其在不同微生物宿主中的应用	系统比较甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径在不同微生物宿主中合成三萜类化合物的优劣，并提出提高产量的策略	未涉及具体实验数据验证不同合成策略的实际效果	促进三萜类化合物在化妆品领域的应用发展	三萜类化合物及其衍生物	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	文献资料	NA
40	2025-09-26	[Progress in the heterologous synthesis of sesquiterpenes by Yarrowia lipolytica] 2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.240845 PMID:40994326	综述	本文综述了利用解脂耶氏酵母异源合成倍半萜类化合物的研究进展	系统总结了通过合成生物学策略在解脂耶氏酵母中高效合成倍半萜的创新方法	NA	探讨通过代谢工程和合成生物学技术提高倍半萜产量的工程策略	解脂耶氏酵母和倍半萜类化合物	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	文献资料	NA