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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-10-01 |
Heterologous synthesis of the complex homometallic cores of nitrogenase P- and M-clusters in Escherichia coli
2023-10-31, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2314788120
PMID:37871225
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研究论文 | 本研究报道在大肠杆菌中异源合成固氮酶P-簇和M-簇核心的成功方法 | 首次在非固氮宿主中通过共表达特定基因成功合成P-簇和L-簇,并采用金属中心、分而治之的策略 | 尚未在异源宿主中完成完整固氮酶的表达,仅实现了关键金属簇的合成 | 解决固氮酶在异源表达中复杂金属簇合成的关键难题 | 固氮酶的P-簇([FeS])和M-簇核心(L-簇; [FeSC]) | 合成生物学 | NA | EPR、XAS/EXAFS光谱分析、金属含量测定 | NA | 光谱数据、活性测定数据 | 纯化的金属蛋白样品 |
22 | 2025-10-01 |
Ribozyme activity modulates the physical properties of RNA-peptide coacervates
2023-06-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83543
PMID:37326308
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研究论文 | 本研究开发了一种连接酶核酶系统,通过RNA-肽凝聚层调节液滴物理性质 | 首次证明核酶活性可通过改变RNA链长度来调控凝聚层液滴的物理特性,建立了基因型-表型关联 | NA | 研究核酶活性对RNA-肽凝聚层物理性质的影响机制 | 连接酶核酶系统、聚赖氨酸和RNA片段组成的凝聚层微滴 | 合成生物学 | NA | 连接酶核酶催化、凝聚层形成技术 | NA | 物理性质测量数据、催化活性数据 | 包含活性和非活性核酶序列的凝聚层微滴对比实验 |
23 | 2025-09-30 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-Sep-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
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观点文章 | 回顾SBOL Visual标准在过去十年间的发展历程及其在合成生物学领域的应用情况 | 首次系统总结SBOL Visual标准从2013年推出到3.0版本的演进过程及其在科学出版物中的采用趋势 | 尚未实现完全合规性和最佳实践的普遍采用,需要进一步努力 | 分析SBOL Visual标准在合成生物学领域的采用情况和未来发展前景 | SBOL Visual标准及其相关可视化工具 | 合成生物学 | NA | 可视化标准制定 | NA | 图表标准 | 从最初21个图形符号发展为全面的图示语言体系 |
24 | 2025-09-30 |
Unearth hidden terpenoids in plants by genome mining and synthetic biology
2025-Sep-27, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103365
PMID:41016367
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综述 | 本文综述了通过基因组挖掘和合成生物学技术发掘植物中隐藏萜类化合物的方法与应用 | 整合基因组挖掘与合成生物学技术,系统发现和表征所有主要萜类中的新型支架,显著扩展药物开发的化学空间 | NA | 探索植物中隐藏萜类化合物的发现与表征方法 | 植物萜类化合物,包括三萜、二萜、倍半萜和双萜等 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、可扩展生产系统 | NA | 基因组数据 | NA |
25 | 2025-09-30 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
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研究论文 | 本研究开发了一种内含子优化的双碱基编辑器,用于提高构巢曲霉对棘白菌素B的耐受性并优化其调控回路 | 开发了基于真菌内含子的策略解决质粒不稳定性问题,创建了PAM-less SpRY-CABE系统实现高效双碱基编辑 | 未明确说明实验样本量及系统在其他丝状真菌中的普适性 | 解决棘白菌素B生产中的调控机制理解不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其相关基因(AniJ, aniA, FKS1) | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(CABE)、启动子突变、发酵优化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物数据 | NA |
26 | 2025-09-30 |
Edible fungus Fusarium venenatum: advances, challenges, and engineering strategies for future food production
2025-Sep-25, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.009
PMID:41015229
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综述 | 系统总结食用真菌Fusarium venenatum在合成生物学工具开发、底盘工程及应用方面的最新进展 | 首次系统聚焦该菌株的合成生物学工具开发与底盘工程研究,提出未来食品生物制造的发展策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述和分析 | 为基于F. venenatum的未来食品生产系统开发提供思路和指导 | 食用丝状真菌Fusarium venenatum | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、微生物制造 | NA | 文献资料 | NA |
27 | 2025-09-30 |
Molecular Paleontology Meets Drug Discovery: The Case for De-extinct Antimicrobials
2025-Sep-23, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05530
PMID:41018632
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综述 | 探讨从灭绝生物中复活分子用于药物发现的研究进展 | 提出通过古基因组学和古蛋白质学技术复活灭绝生物抗菌分子的创新策略 | 面临技术挑战和伦理考量 | 开发新型抗菌剂以应对抗生素耐药性问题 | 灭绝生物中的生物活性肽、抗生素和其他生物活性剂 | 合成生物学 | 细菌感染 | 高通量DNA测序、质谱分析、计算生物学、古基因组学、古蛋白质学 | NA | 基因序列、蛋白质序列 | 多个灭绝生物物种 |
28 | 2025-09-30 |
Beyond Purification: Evolving Roles of Fusion Tags in Biotechnology
2025-Sep-17, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090768
PMID:41020890
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综述 | 本文总结了融合标签在生物技术中的多样化应用及其发展历程 | 系统阐述了融合标签从传统纯化功能向实时成像、空间定位、靶向递送和蛋白质活性调控等多功能工具的演变 | 非完全全面的综述,主要提供研究设计指导 | 帮助研究人员针对特定目标设计合适的标签格式 | 蛋白质标签和肽标签及其应用方法 | 生物技术 | NA | 基因融合技术、pull-down、免疫共沉淀 | NA | NA | NA |
29 | 2025-09-30 |
Metabolic Engineering of Terpenoid Biosynthesis in Medicinal Plants: From Genomic Insights to Biotechnological Applications
2025-Sep-05, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090723
PMID:41020846
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综述 | 本文综述了药用植物中萜类化合物生物合成的代谢工程策略及其生物技术应用 | 提出'从基因组见解到生物技术应用'范式,整合多组学技术和CRISPR工具实现萜类化合物产量的显著提升 | 面临代谢通量平衡、细胞毒性和规模化经济性等持续挑战 | 加速萜类化合物生物制造从发现到商业化应用的转化 | 萜类化合物、药用植物、微生物系统和异源植物宿主 | 合成生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、代谢组学)、CRISPR、酶工程、亚细胞靶向 | NA | 多组学数据 | NA |
30 | 2025-09-30 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-05, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展,包括合成生物学工具和数学建模在开发微生物细胞工厂中的应用 | 强调了合成生物学和代谢模型加速代谢工程设计-构建-测试-学习周期的创新方法 | NA | 开发能够可持续生产各种化合物的酵母微生物细胞工厂 | 酵母菌作为平台细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、数学建模 | 代谢模型 | NA | NA |
31 | 2025-09-30 |
Light-Controlled Synthetic Communication Networks via Paired Connexon Nanopores
2025-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.11.648033
PMID:40291719
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研究论文 | 通过工程化连接蛋白通道在合成细胞间构建光控通讯网络 | 首次设计出对紫外光和近红外光分别响应的连接蛋白43和32通道,实现合成细胞间正交信号传递 | NA | 在基于脂质体的合成细胞中模拟生物细胞间的通讯网络 | 连接蛋白通道和脂质体合成细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、脂质体组装 | NA | 实验数据 | NA |
32 | 2025-09-30 |
Targeting the gut-liver axis in cholangiocarcinoma: mechanisms, therapeutic advances, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1646897
PMID:41018102
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综述 | 本文探讨肠道-肝脏轴在胆管癌中的作用机制、治疗进展及未来研究方向 | 系统阐述肠道微生物群失调、胆汁酸代谢紊乱和免疫微环境重塑在胆管癌进展中的相互作用,并提出合成生物学与人工智能等新兴治疗策略 | 面临微生物群异质性和受体信号双重性等挑战,需要更深入的机制研究和标准化方案 | 研究肠道-肝脏轴在胆管癌发病机制中的作用并开发针对性治疗策略 | 胆管癌患者及其相关的肠道微生物群、胆汁酸代谢和肿瘤微环境 | 肿瘤学研究 | 胆管癌 | 多组学分析、合成生物学、人工智能 | NA | 临床证据、微生物组数据、代谢组数据 | 胆管癌患者的肠道和胆道微生物样本 |
33 | 2025-09-30 |
Therapeutic potential of the gut commensal bacterium Parabacteroides goldsteinii in human health and disease treatment
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1618892
PMID:41019532
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综述 | 系统探讨肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的潜在应用价值 | 首次系统综述该菌株通过短链脂肪酸分泌、胆汁酸转化和免疫调节等多重机制对抗多种疾病的治疗潜力 | 存在转化挑战,如优化培养条件、剂量反应特征描述和遗传工具开发等 | 评估Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的治疗潜力 | 肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii及其与宿主互作机制 | 微生物组研究 | 代谢疾病、神经系统疾病、炎症性疾病、恶性肿瘤 | NA | NA | 文献资料 | NA |
34 | 2025-09-30 |
Fitness Landscapes and Evolution of Catalytic RNA
2024-07, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文讨论RNA适应性景观的研究进展及其在合成生物学中的应用 | 结合体外筛选和高通量测序技术绘制RNA适应性景观,并提出利用机器学习技术进行序列空间的数据驱动插值和外推 | 序列空间的巨大规模限制了纯实验研究 | 研究RNA适应性景观及其在进化生物学和合成生物学中的意义 | 催化RNA | 机器学习 | NA | 体外筛选、高通量测序 | 机器学习 | 序列数据 | NA |
35 | 2025-09-30 |
CRISPR/Cas Technology: The Unique Synthetic Biology Genome-Editing Tool Shifting the Paradigm in Viral Diagnostics, Defense, and Therapeutics
2024-07, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文全面介绍CRISPR/Cas系统的基本原理及其在病毒检测、防御和治疗中的应用 | 系统评估了基于CRISPR/Cas技术的多种病毒应对方法,包括诊断、疫苗开发、B细胞工程和表观遗传修饰 | 讨论了CRISPR/Cas系统使用中面临的挑战和生物伦理问题 | 评估CRISPR/Cas系统在应对已知和未知生物威胁方面的潜力 | CRISPR/Cas系统及其在病毒检测、防御和治疗中的应用技术 | 合成生物学 | 病毒感染 | CRISPR/Cas基因组编辑技术 | NA | NA | NA |
36 | 2025-09-29 |
Photoacid-Fueled Nanopropeller for the Controllable Motion of One-Hole Colloidal Motors with On-Board ATP Supply
2025-Sep-27, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506850
PMID:41014546
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研究论文 | 开发了一种基于FF-ATPase的旋转胶体马达,能够实现自主运动并同步合成ATP | 首次将光酸驱动的质子动力与ATPase旋转机制结合,实现了胶体马达的自主推进与局部ATP合成功能 | 需要外部UV光照激活,运动速度相对较慢(3.05 µm/s) | 开发具有自主运动和能量合成功能的多功能纳米机器人平台 | 基于硅-聚电解质胶囊的单孔胶体马达系统 | 纳米技术 | NA | 光酸驱动技术、跨膜质子动力系统 | 仿生推进平台 | 实验数据 | NA |
37 | 2025-09-29 |
Advances in the sustainable biosynthesis of valuable terpenoid flavor compounds and precursors in micro-organisms
2025-Sep-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02699-2
PMID:40999400
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综述 | 本文综述了微生物中萜类风味化合物及其前体可持续生物合成的最新进展 | 整合了合成生物学在微生物底盘细胞改造、合成途径设计和规模化发酵方面的最新进展 | NA | 支持可持续生产技术的发展并促进香料行业的工业应用 | 萜类风味化合物及其前体 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、合成生物学 | NA | NA | NA |
38 | 2025-09-29 |
Phase Separation-Regulated Fungal Growth, Sexual Development, Adaptation and Synthetic Biology Applications
2025-Sep-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11090680
PMID:41003226
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综述 | 本文综述了液-液相分离在真菌生长、发育和适应性中的调控作用及其合成生物学应用 | 系统总结了环境信号通过液-液相分离调控真菌生物学过程的最新进展,并探讨了合成生物分子凝聚体在代谢工程中的应用策略 | NA | 探讨液-液相分离在真菌生物学过程中的调控机制及其在合成生物学中的应用前景 | 真菌蛋白质的液-液相分离现象及其形成的无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS) | NA | 文献综述数据 | NA |
39 | 2025-09-29 |
Automated and Programmable Cell-Free Systems for Scalable Synthetic Biology with a Focus on Biofoundry Integration
2025-Sep-16, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2507.07019
PMID:40967915
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白质合成技术与自动化生物铸造厂融合的技术创新及其在合成生物学中的应用 | 重点展示了CFPS与自动化生物铸造厂结合的技术创新,通过自动化技术和机器学习实现可编程、可扩展的生物工程平台 | NA | 探讨无细胞系统与自动化平台融合的技术发展现状、挑战和未来方向 | 无细胞蛋白质合成系统和自动化生物铸造厂平台 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成、液体处理机器人技术、数字微流控技术、机器学习 | NA | NA | NA |
40 | 2025-09-29 |
Microalgae-Based 3D Bioprinting: Recent Advances, Applications and Perspectives
2025-Aug-27, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23090342
PMID:41003311
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综述 | 本文综述了基于微藻的3D生物打印技术的最新进展、应用领域及未来发展前景 | 首次系统分析微藻3D生物打印在六大应用领域的发展,并提出合成生物学指导下的未来发展方向 | 当前微藻培养仍主要依赖传统液体浸没系统,存在工艺和经济限制 | 探讨3D生物打印技术如何解决微藻培养限制并拓展其应用领域 | 微藻及其在3D生物打印中的应用 | 生物技术 | NA | 3D生物打印、合成生物学 | NA | 文献综述 | NA |