合成生物学相关文章
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当前共找到 3183 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-06-01 |
Engineering Microbial Consortia as Living Materials: Advances and Prospectives
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00313
PMID:39174016
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review | 本文综述了工程化微生物群落作为活体材料的设计策略、合成生物学技术及其应用前景 | 介绍了自上而下和自下而上两种设计微生物群落构成的工程化活体材料(ELMs)的策略，并总结了合成生物学技术在复杂任务中的应用 | 基于微生物群落的ELMs仍处于发展阶段，面临诸多挑战 | 探讨工程化微生物群落作为活体材料的设计方法、技术应用及未来发展 | 微生物群落及其构成的工程化活体材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 22 | 2025-06-01 |
MutaT7GDE: A Single Chimera for the Targeted, Balanced, Efficient, and Processive Installation of All Possible Transition Mutations In Vivo
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00316
PMID:39190860
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research paper | 该研究开发了一种名为MutaT7GDE的单一嵌合酶，能够在体内高效、平衡地安装所有可能的过渡突变 | 利用工程化的底物非特异性通用脱氨酶（GDEs）构建单一嵌合酶，简化了系统并提高了突变效率 | NA | 开发一种更高效的定向进化工具，用于目标基因的多样化 | MutaT7嵌合酶及其突变效率 | 合成生物学 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合技术 | NA | NA | 四种不同的MutaT7构建体 |
| 23 | 2025-06-01 |
Integrating Deep Learning and Synthetic Biology: A Co-Design Approach for Enhancing Gene Expression via N-Terminal Coding Sequences
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00371
PMID:39229974
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研究论文 | 本文介绍了一种结合深度学习和合成生物学的共设计方法，用于通过N端编码序列优化基因表达 | 提出了一种新的深度学习和合成生物学共设计的少样本训练工作流程，用于NCS优化，显著提高了基因表达效率 | 方法仅在GFP和N-乙酰神经氨酸的生产中进行了验证，需要更多实验验证其广泛适用性 | 优化N端编码序列以提高基因表达效率 | 绿色荧光蛋白(GFP)和N-乙酰神经氨酸 | 合成生物学 | NA | 深度学习, word2vec, 注意力机制, 时间序列网络 | 时间序列网络 | 基因序列数据 | 六次迭代实验 |
| 24 | 2025-06-01 |
Multilevel Systematic Optimization To Achieve Efficient Integrated Expression of Escherichia coli
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00280
PMID:39262282
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研究论文 | 本文通过系统优化大肠杆菌的整合表达系统，从三个层面提高了外源基因在基因组水平的表达效率 | 筛选出表达活性最高的整合位点，构建了组成型高效整合表达系统CEIES_Ecoli，其表达强度显著高于传统T7启动子系统 | 研究仅限于大肠杆菌BL21(DE3)菌株，未在其他宿主系统中验证 | 开发无需抗生素或诱导剂的稳定高效基因整合表达系统 | 大肠杆菌BL21(DE3)基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、启动子工程 | NA | 基因表达数据 | 18个基因组整合位点筛选，16种内源启动子表征 |
| 25 | 2025-06-01 |
Evaluating the Contribution of Model Complexity in Predicting Robustness in Synthetic Genetic Circuits
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00708
PMID:39264040
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research paper | 该研究比较了五种计算模型在预测合成基因电路稳健性方面的表现，探讨了模型复杂度对预测能力的影响 | 通过比较不同复杂度的模型，揭示了在有无特征化部件情况下模型选择的策略 | 研究仅针对三种基因电路实现，可能无法推广到所有类型的合成电路 | 评估模型复杂度对合成基因电路性能预测的影响 | 五种计算模型和三种基因电路实现 | 合成生物学 | NA | 计算模拟 | 多种复杂度模型 | 模拟数据 | 三种基因电路实现 |
| 26 | 2025-06-01 |
Yeast Surface-Displayed Quenchbody as a Novel Whole-Cell Biosensor for One-Step Detection of Influenza A (H1N1) Virus
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00317
PMID:39256183
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研究论文 | 开发了一种基于酵母表面展示的Quenchbody全细胞生物传感器，用于一步检测甲型H1N1流感病毒 | 提出了一种新型全细胞生物传感器设计，通过表面展示VHH-based quenchbody（Q-body）绕过了分析物跨膜运输的需求，实现了对病毒颗粒的高效检测 | NA | 开发一种敏感、高效且成本效益高的方法，用于检测空气中的病毒 | 甲型H1N1流感病毒 | 合成生物学 | 流感 | 酵母表面展示技术 | VHH-based quenchbody（Q-body） | NA | 17个靶向H1N1-HA蛋白的VHH抗体片段 |
| 27 | 2025-06-01 |
Ten Years of the Synthetic Biology Summer Course at Cold Spring Harbor Laboratory
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00276
PMID:39300908
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review | 回顾冷泉港实验室合成生物学暑期课程的历史、发展和结构，并探讨其对其他短期课程的启示 | 总结了该课程在合成生物学领域的教育影响，包括校友在研究、教育和创业方面的贡献 | NA | 探讨合成生物学教育课程的设计与影响 | 冷泉港实验室合成生物学暑期课程 | 合成生物学 | NA | 细胞无转录翻译、DNA构建、基因回路计算建模、工程基因调控、CRISPR技术 | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-06-01 |
The BioRECIPE Knowledge Representation Format
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00096
PMID:39051984
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research paper | 介绍了BioRECIPE知识表示格式，旨在标准化和促进人机交互，用于创建、验证、评估、管理和扩展细胞内和细胞间信号传导的可执行模型 | BioRECIPE格式能够同时支持人类用户预览和修改模型组件，同时机器可读，并兼容多种表示格式、自然语言处理工具、建模工具和数据库 | NA | 标准化和促进人机交互，用于创建、验证、评估、管理和扩展细胞内和细胞间信号传导的可执行模型 | 细胞内和细胞间信号传导的可执行模型 | systems and synthetic biology | NA | NA | NA | knowledge representation format | NA |
| 29 | 2025-06-01 |
ShuffleAnalyzer: A Comprehensive Tool to Visualize DNA Shuffling
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00251
PMID:38991172
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research paper | 介绍了一个名为ShuffleAnalyzer的Python工具，用于可视化和分析DNA shuffling结果 | 提供直接图形化输出，支持DNA shuffling和肽插入的同步分析与可视化 | 未提及具体性能指标或与其他工具的对比 | 开发一个用户友好的工具，以简化DNA shuffling结果的分析和可视化 | DNA shuffling生成的合成DNA和肽插入 | synthetic biology | NA | DNA shuffling | NA | DNA序列数据 | NA |
| 30 | 2025-06-01 |
Designing a Novel Temperature- and Noncanonical Amino Acid-Controlled Biological Logic Gate in Escherichia coli
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00423
PMID:39110782
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研究论文 | 本研究设计了一种新型的温度和非经典氨基酸控制的生物逻辑门 | 利用外源aaRS/tRNA对在高温下对细胞ATP的高消耗率诱导的基因表达温度敏感性，构建了一种新型的生物AND门 | 对外源aaRS/tRNA对的潜在副作用了解有限 | 探索外源aaRS/tRNA对基因表达的影响并构建新型生物逻辑门 | 大肠杆菌DH10β Δ | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-05-31 |
Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies
2025-Sep-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734
PMID:40441843
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review | 本文综述了鞘聚糖的结构、生物合成途径及其通过代谢工程和合成生物学策略高效合成与定制的方法 | 结合代谢工程和合成生物学策略，利用基因组代谢网络模型(GSMM)和CRISPR等高效工具调控代谢途径，以及通过分子量调控和可控取代基修饰定制不同分子量的鞘聚糖 | 野生型菌株研究背景不清晰及合成路径复杂等问题仍需进一步解决 | 提高鞘聚糖的生产能力并实现其定制化设计 | 鞘聚糖及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组代谢网络模型(GSMM)、CRISPR、高通量筛选技术 | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-05-31 |
The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis
2025-Jul, Journal of invertebrate pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jip.2025.108295
PMID:40032241
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综述 | 本文总结了昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系，以及它们在成功利用昆虫宿主方面的能力 | 强调了昆虫病原线虫与细菌共生体之间的共生关系及其在自然产物研究中的模型系统作用 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系及其在生态学和进化生物学中的模型作用 | 昆虫病原线虫（Steinernema和Heterorhabditis）及其细菌共生体（Xenorhabdus和Photorhabdus） | 生态学与进化生物学 | NA | 合成生物学方法和高通量技术 | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-05-31 |
A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2025-Jun, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01816-w
PMID:39806069
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research paper | 该研究开发了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感器信号放大电路，用于提高小分子检测的灵敏度 | 利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入，从而扩增信号 | NA | 扩展无细胞生物传感技术的能力，提高生物传感器的灵敏度 | 无细胞系统中的基因电路和小分子检测 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收（PSR）技术 | NA | NA | NA |
| 34 | 2025-05-31 |
Engineering nitrogen and carbon fixation for next-generation plants
2025-Jun, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102699
PMID:40056871
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research paper | 探讨利用合成生物学技术优化植物固氮和固碳机制，以提高农业生产力和生态可持续性 | 结合定向进化、AI引导的酶设计和代谢工程，优化固氮酶和固碳循环，并探索在极端环境下增强植物生长的策略 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 提高植物氮和碳的获取与同化效率，以应对全球农业和生态挑战 | 植物固氮和固碳机制，包括氮酶、根瘤菌及非豆科作物的共生关系 | 合成生物学 | NA | 定向进化、AI引导的酶设计、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 35 | 2025-05-31 |
Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842
PMID:40319965
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综述 | 本文总结了葡萄糖脱氢酶（GDH）在工业生物催化、辅因子再生、葡萄糖传感器和生物燃料电池等多方面的应用及其最新研究进展 | 关注通过分子工程或新型固定化技术提高酶的性能，并扩展其应用领域 | NA | 总结葡萄糖脱氢酶的最新研究进展，特别是在酶分子工程、性能提升、新型固定化策略及其在生物传感器、生物催化和生物燃料电池中的最新应用 | 葡萄糖脱氢酶（GDH） | 分子生物学 | NA | 分子工程、固定化技术 | NA | NA | NA |
| 36 | 2025-05-31 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-May-29, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文综述了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学影响 | 探讨了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸作为新兴核苷酸类似物的化学构建方法及其在药物设计、核苷酸酶学研究和合成生物学中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于文献综述 | 研究5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学功能 | 5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸 | 药物化学与生物技术 | NA | 磷酸酰胺化策略、催化方法、绿色化学技术 | NA | NA | NA |
| 37 | 2025-05-31 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在非豆科植物中实现固氮酶功能的研究进展与挑战 | 利用合成生物学和AI驱动设计在酵母线粒体中部分重建固氮酶功能，以解决氧敏感性和能量需求问题 | 尚未完全克服能量成本和氮水平反馈调节的挑战 | 实现在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性，以减少对氮肥的依赖 | 非豆科植物、固氮酶、酵母线粒体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI驱动设计 | NA | NA | NA |
| 38 | 2025-05-31 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和基于CRISPR的基因组编辑这两种方法在病毒基因组操作和功能表征中的应用 | 结合深度突变扫描和CRISPR技术，实现对病毒蛋白的全面突变和功能表征，为病毒进化和适应提供深入理解 | NA | 探讨深度突变扫描和CRISPR基因组编辑在病毒进化、功能基因组学研究中的应用及其对未来疫苗开发和治疗策略的影响 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
| 39 | 2025-05-31 |
Synergistic potential of halophytes and halophilic/halotolerant plant growth-promoting bacteria in saline soil remediation: Adaptive mechanisms, challenges, and sustainable solutions
2025-May-22, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128227
PMID:40440870
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综述 | 本文综述了盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌在盐渍土壤修复中的协同潜力及其适应性机制、挑战和可持续解决方案 | 探讨了盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同作用及其在盐胁迫耐受中的具体适应策略，提出了多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学等先进技术的应用 | 对盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及其具体盐适应策略的理解仍然有限，阻碍了其在盐渍土壤修复中的应用 | 研究盐胁迫耐受机制，优化盐渍土壤修复和植物生长 | 盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌 | 可持续农业 | NA | 多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学、化学计量学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 40 | 2025-05-31 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN进行基因工程改造，成功表达多种异源基因并优化荧光蛋白表达条件，同时实现生物活性化合物的生物合成 | 首次在原生肠道大肠杆菌中应用CRAGE技术实现多基因表达及生物活性化合物合成，拓展了合成生物学在肠道菌群中的应用潜力 | 研究仅针对两种特定菌株进行验证，尚未在更广泛的肠道菌群中测试该技术的普适性 | 开发基于原生肠道大肠杆菌的合成生物学平台 | 肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN | 合成生物学 | NA | CRAGE（底盘独立重组酶辅助基因组工程技术） | NA | 基因表达数据、荧光信号数据 | 2种工程菌株（EcAZ-1和EcN） |