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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-05-06 |
Synthetic biology of Fusarium for the sustainable production of valuable bioproducts
2025 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108579
PMID:40222460
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综述 | 本文综述了利用合成生物学优化镰刀菌属作为可持续生产多种生物制品的高效平台 | 综述了CRISPR/Cas9、RNA干扰和合成启动子等先进工程技术在优化镰刀菌代谢途径中的应用,以及下一代测序和组学技术对镰刀菌代谢网络理解的扩展 | 代谢瓶颈、监管复杂性和菌株稳定性等挑战仍是工业规模应用的主要障碍 | 探索镰刀菌作为可持续细胞工厂的潜力,以生产生物燃料、药品、酶和其他有价值的化合物 | 镰刀菌属 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, RNA干扰, 合成启动子, 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA |
22 | 2025-05-06 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-May-05, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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review | 本文提出了一种通过工程化人工微生物群落来个性化调节肠道微生物组并治疗疾病的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计定制化微生物群落以执行特定功能 | 需要进一步的临床试验来评估其安全性、有效性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组来治疗代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落及其在肠道微生物组中的应用 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA |
23 | 2025-05-06 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-May-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的钙卫蛋白生物传感器,用于检测和治疗肠道炎症 | 开发了一种结合锌摄取调节器(Zur)控制启动子和记忆电路的生物传感器,能够检测并记录体内肠道炎症,同时具备诊断和治疗功能 | 研究仅在两种独立的小鼠结肠炎模型中进行验证,尚未在人类临床试验中应用 | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物体 | 肠道炎症及其生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症 | 合成生物学技术、生物传感器技术 | NA | 生物标志物数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 |
24 | 2025-05-06 |
Cytomimetic calcification in chemically self-regulated prototissues
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59251-x
PMID:40319022
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research paper | 该研究通过化学自调节的原组织实现了细胞模拟的钙化 | 通过共价键将碱性磷酸酶无机原细胞固定在交联有机网络上,建立了具有位点特异性矿化模式的原组织,并展示了内源性钙化和脱钙化的能力 | NA | 开发具有协调和适应性功能的细胞模拟材料,推动自下而上的合成生物学在化学材料研究中的应用 | 含有碱性磷酸酶的无机原细胞(胶体小体)和交联有机网络组成的原组织 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
25 | 2025-05-06 |
An acoustofluidic embedding platform for rapid multiphase microparticle injection
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59146-x
PMID:40319024
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research paper | 开发了一种声流体频率相关的微球嵌入平台,实现了从氟化油到水滴的微尺度快速微粒注入 | 首次实现了固体微粒在水相和油相之间的自由动态操控,并建立了跨相操控的理论模型和实用原则 | 未提及该平台的具体操作限制或适用范围 | 增强现有液滴操控技术,实现多相和跨相操作 | 水凝胶微球 | 微流控技术 | NA | 声流体技术 | 理论模型 | 微粒运动数据 | 未明确说明具体样本数量 |
26 | 2025-05-06 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
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research paper | 提出了一种新的预训练框架,整合了蛋白质一级和三级结构的序列和几何编码器,以提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测 | 整合了序列和几何编码器,模拟自然选择指导突变方向,并在三个基准测试中展示了卓越性能 | 现有方法主要依赖蛋白质序列,难以高效编码氨基酸局部环境的几何方面,且缺乏对蛋白质热稳定性预测的基本评估 | 提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测的准确性和全面性 | 蛋白质序列和结构 | synthetic biology | NA | deep learning | pre-training framework with sequential and geometric encoders | protein sequence and structure data | over 300 deep mutational scanning assays |
27 | 2025-05-06 |
Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells
2025-May-02, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842
PMID:40319965
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综述 | 本文总结了葡萄糖脱氢酶(GDH)在工业生物催化、辅因子再生、葡萄糖传感器和生物燃料电池等领域的最新研究进展 | 重点关注了通过分子工程或新型固定化技术提高酶的性能,以及扩展其应用领域 | NA | 提升葡萄糖脱氢酶在全球性挑战中的贡献,如人类健康诊断、工业生物催化升级和生物能源开发 | 葡萄糖脱氢酶(GDH) | 分子生物学 | NA | 分子工程、固定化技术 | NA | NA | NA |
28 | 2025-05-06 |
Improved biosynthesis of C4 derivatives by Engineered thiolase
2025-May-02, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001
PMID:40320002
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研究论文 | 通过工程化硫解酶改进C4衍生物的生物合成 | 开发了一种新型代谢途径,利用大肠杆菌作为宿主,从乙二醇等二碳底物生物合成四碳化合物,并通过定向进化提高了关键酶的催化效率 | NA | 开发可持续的生物制造策略,将塑料废弃物转化为高价值化学品 | 乙二醇、1,4-丁二醇、1,2,4-丁三醇和琥珀酸 | 合成生物学 | NA | 定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA |
29 | 2025-05-06 |
Biotechnological approaches for the production of neuroactive huperzine A
2025-Apr-29, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.04.020
PMID:40311807
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综述 | 本文综述了石杉碱甲(HupA)的神经保护特性及其在治疗神经退行性疾病中的潜力,并探讨了提高其产量的生物技术策略 | 强调了生物技术在提高HupA产量中的应用,包括化学合成、微生物发酵、植物组织培养和合成生物学方法 | 目前对HupA生物合成的认识仍存在知识空白,需要进一步研究以开发经济高效的可持续生产方法 | 探讨HupA在神经退行性疾病治疗中的潜力及提高其产量的生物技术策略 | 石杉碱甲(HupA)及其在神经退行性疾病中的应用 | 生物技术 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化症、癫痫、重症肌无力 | 化学合成、微生物发酵、植物组织培养、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA |
30 | 2025-05-04 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点,开发出新型人工生物催化剂,用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸,成功诱导了过氧化物酶活性,显著提升了催化效率 | NA | 开发无需NAD(P)H或双功能小分子辅助的高效生物催化剂,用于环境污染物降解 | 五种氯苯胺类化合物(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 化学分析数据 | 五种氯苯胺类化合物 |
31 | 2025-05-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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research paper | 本研究开发了一种多模块组装的prime editing (mPE)系统,显著提高了双子叶植物中多碱基插入的精确编辑效率 | 提出了一种新型的多模块组装mPE系统,相比原始PE2系统,在多个基因位点上实现了1.3至1288.5倍的编辑效率提升,特别在多碱基插入方面平均提高了197.9倍 | 研究主要局限于双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草,尚未在其他植物或实际农作物中验证 | 解决prime editing在双子叶植物中编辑效率低下的问题,开发系统性优化方案 | 双子叶植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、深度扩增子测序(0.2-0.5 million clean total reads) | prime editing系统优化模型 | 基因组测序数据 | 大规模转化实验(具体数量未明确说明) |
32 | 2025-05-04 |
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c00262
PMID:40313816
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研究论文 | 本文报道了多种细菌通过中心硫代谢和非酶化学形成P=S键(PhP到PhPS),并首次应用于微生物P=Se键(PhPSe)的形成 | 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究,并首次将微生物代谢物用于化学合成中的P=Se键形成 | NA | 探索微生物代谢物在化学合成中的直接应用 | 细菌及其代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
33 | 2025-05-04 |
Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation
2025-Mar-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.120904
PMID:39842755
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综述 | 本文综述了聚羟基脂肪酸酯(PHAs)的碳循环过程,包括其生物合成、降解途径以及在环境和生物医学中的应用 | 提出了聚羟基脂肪酸酯碳循环(CCP)的概念,并详细描述了芳香族单体的生物合成途径、碳转化过程以及在不同环境中的降解机制 | 在实现经济高效的PHA生产和降解产物再利用方面仍存在挑战,对PHA合成和降解中的碳途径理解有限 | 探讨PHAs作为生物材料的可持续利用价值,支持全球绿色低碳发展 | 聚羟基脂肪酸酯(PHAs) | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
34 | 2025-05-04 |
Rational multienzyme architecture design with iMARS
2025-Mar-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.029
PMID:39855196
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research paper | 开发了一种名为iMARS的标准化框架,用于快速设计最优的多酶结构,以提高催化效率 | iMARS框架整合了高通量活性测试和结构分析,能够预测性地设计多酶结构,显著提高催化效率 | 未明确提及框架的适用范围或潜在的生物学限制 | 提高多酶结构的催化效率,应用于绿色化学、合成生物学和生物制造 | 多酶结构及其在代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量活性测试和结构分析 | iMARS框架 | NA | NA |
35 | 2025-05-04 |
Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015
PMID:39848497
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研究论文 | 本研究构建并表征了乳酸菌中P23组成型启动子的突变体文库,用于丰富乳酸菌启动子库并定量表征其活性 | 首次提供了一组显著不同的P组成型启动子突变体元件,为乳酸菌的代谢工程和合成生物学应用奠定了基础 | 突变体文库的特异性仅限于乳酸菌,在大肠杆菌中表现出显著差异 | 丰富乳酸菌启动子库并定量表征启动子活性,以促进代谢工程和合成生物学应用 | 乳酸菌中的P23组成型启动子 | 合成生物学 | NA | 易错PCR和dNTP类似物诱导的随机突变 | NA | 荧光强度数据 | 247个P启动子突变体 |
36 | 2025-05-04 |
Advances in magnetic nanoparticles for molecular medicine
2025-Feb-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc05167j
PMID:39846549
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综述 | 本文综述了磁性纳米粒子(MNPs)在分子医学中的最新进展及其多样化应用 | 探讨了MNPs在分子医学中的新兴应用,如基因组编辑、细胞疗法和神经科学,展示了其在细胞和分子水平上精确控制生物过程的独特能力 | NA | 总结MNPs在分子医学中的临床应用,并探索其在疾病治疗中的下一代平台开发 | 磁性纳米粒子(MNPs)及其在分子医学中的应用 | 分子医学 | NA | NA | NA | NA | NA |
37 | 2025-05-04 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
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综述 | 本文概述了当前处于后期开发阶段的最新技术,探讨了它们在微生物组治疗中的优势和局限性 | 探讨了从粪便衍生产品到活体生物治疗、噬菌体疗法和合成生物学等多种微生物组治疗技术的未来发展路径 | 现有商业微生物组导向产品往往效果不佳 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向 | 人类微生物组及其治疗技术 | 微生物组学 | NA | 粪便衍生产品、活体生物治疗、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | NA | NA |
38 | 2025-05-04 |
Towards microbial consortia in fermented foods for metabolic engineering and synthetic biology
2025-Feb, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115677
PMID:39849795
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综述 | 本文综述了发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其功能,并探讨了利用新型发酵剂与本地微生物群落结合开发功能性发酵食品的未来发展方向 | 总结了发酵食品中微生物相互作用的当前机制(拮抗、竞争、共生和互惠),并探讨了将这些稳定的微生物群落应用于代谢工程和合成生物学的潜力 | 未提及具体实验数据或案例研究来支持微生物相互作用机制的具体应用 | 探讨发酵食品中微生物群落的相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用 | 发酵食品中的微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
39 | 2025-05-04 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
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research paper | 探讨利用天然产物、合成生物学和人工智能开发下一代治疗方法 | 结合eXchange Unit between Thiolation domains方法和AI工具如Synthetic Intelligence,革新非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程,创造新型生物活性化合物 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 应对抗生素耐药性和癌症等关键挑战,开发精确且可扩展的治疗方案 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程 | 合成生物学与人工智能 | 抗生素耐药性和癌症 | eXchange Unit between Thiolation domains方法,AI工具 | Synthetic Intelligence | NA | NA |
40 | 2025-05-04 |
[Research progress in the design and application of whole-cell biosensors for antibiotics]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240400
PMID:39855682
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综述 | 本文综述了抗生素全细胞生物传感器的设计和应用研究进展 | 总结了已报道的抗生素全细胞生物传感器,并将其分为特异性和通用性两类,详细阐述了两类抗生素生物传感器的设计原理和应用 | NA | 为其他抗生素全细胞生物传感器的构建和应用提供参考 | 抗生素全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器 | NA | NA | NA |