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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-11-02 |
Heterologous Biosynthesis of Crocin I in Solanum lycopersicum L
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209984
PMID:41155278
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研究论文 | 本研究在番茄中实现了藏花素I的异源生物合成 | 首次在番茄中成功构建藏花素I的异源生物合成途径,使藏花素I占总藏花素含量的97-99% | NA | 开发藏花素I的新型生物合成平台 | 转基因番茄植物 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、In-fusion技术、2A自切割肽 | NA | NA | NA | 农杆菌介导转化,In-fusion技术 | 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 医药,食品,个人护理产品 |
| 22 | 2025-11-02 |
Key Technologies of Synthetic Biology in Industrial Microbiology
2025-Oct-13, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13102343
PMID:41156802
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综述 | 本文探讨了合成生物学在工业微生物领域的关键技术及其应用前景 | 系统阐述了合成生物学如何通过基因编辑、代谢工程等技术革新工业微生物领域 | 该领域仍面临诸多挑战,需要跨学科合作推动发展 | 讨论合成生物学在工业微生物中的关键技术及应用前景 | 工业微生物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术、代谢工程、高通量筛选、自动化平台、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工业微生物 | 代谢通路优化与重构 | 生物制造, 能源生产, 环境保护, 药物开发 |
| 23 | 2025-11-02 |
Expanding the Terpene Universe: Synthetic Biology and Non-Natural Chemistry in Engineered Microorganisms
2025-Oct-13, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30204065
PMID:41157082
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和非天然化学在工程微生物中扩展萜类化合物多样性的策略 | 将非生物化学转化整合到工程生物合成途径中,利用人工金属酶催化非天然卡宾转移反应,超越自然界合成能力 | NA | 开发微生物细胞工厂以实现萜类化合物的可持续生产并扩展其结构多样性 | 萜类化合物及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、非天然化学转化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 甲羟戊酸途径、甲基赤藓糖醇磷酸途径、萜类合酶系统 | 医药、香料、生物燃料 |
| 24 | 2025-11-02 |
Unleashing the potential of biotechnological strategies for the sustainable production of microalgal polysaccharides
2025, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2475240
PMID:40084718
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综述 | 探讨利用生物技术策略实现微藻多糖可持续生产的方法与前景 | 提出通过合成生物学和代谢工程解决微藻多糖生物合成复杂性的关键技术策略 | 微藻多糖生物合成回路存在技术-生物学复杂性,且合成生物学在商业化生产中尚未充分应用 | 开发微藻作为可持续多糖生产原料的生物技术策略 | 光合自养微藻及其多糖生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 多糖生物合成回路 | 食品,化妆品,制药,工业生物技术 |
| 25 | 2025-10-31 |
Rational Construction of a Robust Bacillus amyloliquefaciens Cell Factory for Acid-Stable α Amylase Production
2025-Oct-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04227
PMID:41165493
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了能够高效生产耐酸α-淀粉酶的解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 建立了高效的CRISPR-nCas9基因编辑流程,理性删除了导致细胞自溶的前噬菌体基因簇和影响外源蛋白表达的次级代谢生物合成基因簇 | NA | 开发高效的解淀粉芽孢杆菌底盘细胞用于工业蛋白生产 | 解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | CRISPR-nCas9基因编辑,补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 解淀粉芽孢杆菌 | 前噬菌体基因簇删除,次级代谢生物合成基因簇删除 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-31 |
Kinetically Programmed Signaling Cascades for Molecular Detection
2025-Oct-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c12059
PMID:41094711
|
研究论文 | 本研究利用DNA化学开发了一种基于动力学编程的信号级联系统,用于分子检测和生物传感 | 首次系统研究动力学编程对信号级联系统性能的影响,并展示了其在多种分子检测中的应用 | NA | 开发可编程的DNA信号级联系统并研究其动力学特性 | DNA分子信号级联系统 | 合成生物学 | NA | DNA化学,电化学传感 | NA | 实验数据,模拟数据 | NA | NA | NA | 四模块信号级联系统(输入、受体、处理器、输出) | 医学,生物传感,分子计算,药物递送 |
| 27 | 2025-10-31 |
Ultrafast Conversion of CO2 into C3-C4 Diols in a Synergistic Electrochemical and AI-Assisted Biosynthesis System
2025-Oct-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c14039
PMID:41100764
|
研究论文 | 开发了一种电化学生物合成级联系统,将CO2高效转化为C3-C4二醇 | 结合电催化与AI辅助生物设计的协同系统,实现安培级电流密度下的高效转化 | 未明确说明系统长期运行的稳定性和规模化成本 | 开发可持续的二氧化碳转化技术生产高价值化学品 | C3-C4二醇(1,3-丙二醇和1,3-丁二醇) | 合成生物学 | NA | 电化学还原、AI辅助设计、分子动力学模拟、原位光谱分析 | NA | 光谱数据、动力学数据 | NA | 理性设计 | NA | 电化学生物合成级联系统,包含CO还原和C-C键延伸模块 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 28 | 2025-10-31 |
MGTbind: a comprehensive database of molecular glue ternary interactome
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1075
PMID:41160881
|
研究论文 | 开发了一个名为MGTbind的分子胶水三元相互作用组综合数据库 | 首个提供分子胶水三元结构和实验数据全面资源的数据库,整合了AlphaFold 3预测结构 | NA | 促进分子胶水的理性设计 | 分子胶水及其参与的三元相互作用 | 生物信息学 | NA | 数据库构建,AlphaFold 3预测 | NA | 化学结构,理化性质,生物活性测量,结构数据 | 3093个分子胶水,3924个三元相互作用 | NA | NA | NA | 药物发现,合成生物学 |
| 29 | 2025-10-31 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2025-Oct-29, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法重构DELTA-NOTCH信号通路,验证振荡性细胞间通讯在脊椎动物胚胎体节分割中的关键作用 | 首次在DELTA缺陷的PSM类器官中整合合成DELTA-NOTCH通路,并利用光遗传学技术揭示配体呈现动力学对细胞通讯的重要性 | NA | 直接验证振荡性细胞间信号传导在发育过程中的作用机制 | 脊椎动物胚胎前体中胚层(PSM)类器官 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 光遗传学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 脊椎动物胚胎PSM类器官 | 合成DELTA-NOTCH信号通路 | 医学 |
| 30 | 2025-10-31 |
Advances in the microbial biosynthesis of therapeutic terpenoids
2025-Oct-28, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103374
PMID:41161185
|
综述 | 本文综述了微生物合成治疗性萜类化合物的最新进展,重点关注合成生物学和代谢工程的应用 | 总结了利用工程微生物生产重要萜类化合物的合成生物学策略,并探讨了自动化、机器学习和人工智能等新兴方法在加速微生物生物合成研究中的应用 | NA | 推动微生物合成治疗性萜类化合物的技术发展,实现经济可行的规模化生产 | 治疗性萜类化合物及其微生物生物合成系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 萜类生物合成途径,代谢通路工程 | 医药,工业生物技术 |
| 31 | 2025-10-31 |
Bio-digital feedback loop systems: a synergistic integration of predictive genomics, genome editing, and AI-driven phenomic synthesis for next-generation edible and medicinal mushroom breeding
2025-Oct-10, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-025-02176-8
PMID:41073589
|
综述 | 提出一种生物-数字反馈循环系统框架,整合多组学、CRISPR工程底盘菌株和AI驱动的表型组学,用于精准食用菌育种 | 首次提出将预测基因组学、基因组编辑和AI驱动的表型组学协同整合的生物-数字反馈循环系统,实现蘑菇的可编程设计 | NA | 开发下一代食用和药用蘑菇的精准育种方法 | 食用和药用蘑菇 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、CRISPR-Cas9、合成生物学工具、人工智能 | AI算法 | 基因组数据、表型组数据、图像数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蘑菇底盘菌株 | 模块化基因电路、即插即用底盘菌株设计 | 农业, 医药, 环境 |
| 32 | 2025-10-31 |
Kinetics and Activation Strategies in Toehold-Mediated and Toehold-Free DNA Strand Displacement
2025-Oct-09, Biosensors
DOI:10.3390/bios15100683
PMID:41149335
|
综述 | 本文综述了DNA链置换反应中动力学特性及激活策略的最新进展 | 强调链邻近性作为核心驱动力,系统总结了基于邻近性的多种激活策略及其在构建动态DNA网络中的应用 | NA | 总结DNA链置换反应动力学调控策略的基本原理和最新进展 | DNA链置换反应及其激活策略 | DNA纳米技术 | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 链置换反应网络、动态网络 | 生物传感,合成生物学,生物计算,医学诊断 |
| 33 | 2025-10-31 |
Fungal Innovations-Advancing Sustainable Materials, Genetics, and Applications for Industry
2025-Oct-06, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11100721
PMID:41149911
|
综述 | 本文综述了真菌在可持续材料开发、遗传工程和工业应用中的创新潜力 | 重点关注合成生物学工具在真菌工程化中的应用,包括可编程调控器、CRISPR基因组编辑和组合通路优化 | 真菌复杂生物系统的控制和优化能力仍存在局限 | 探索真菌在可持续生物基技术中的潜力,促进各行业可持续发展 | 丝状真菌及其产生的刚性和柔性材料 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、组合通路优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 丝状真菌 | 可编程调控器、代谢通路优化 | 材料,能源,工业生物技术,环境 |
| 34 | 2025-10-31 |
From Bench to Bedside: Emerging Paradigms in CAR-T Cell Therapy for Solid Malignancies
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505822
PMID:40855662
|
综述 | 本文综述CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的新兴范式与挑战 | 系统总结CRISPR编辑、现货型异体CAR-T、AI驱动靶点发现及合成生物学等前沿技术突破 | 主要基于早期临床试验数据,长期疗效与安全性仍需验证 | 探索提升CAR-T疗法在实体瘤中疗效的策略与方法 | 胃癌、肝癌、胶质瘤等实体恶性肿瘤 | NA | 实体恶性肿瘤 | CRISPR基因编辑、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞、NK细胞、巨噬细胞 | 嵌合抗原受体设计、细胞因子装甲策略 | 医学 |
| 35 | 2025-10-31 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 通过基因可用性的可编程时序控制实现生物传感器电路中的数字切换 | 利用位点特异性重组酶通过可编程时序控制多基因电路中基因可用性,显著降低传感器基础状态泄漏 | NA | 通过时序控制基因可用性改善合成生物学基因电路的稳健部署 | 内源性microRNA比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 位点特异性重组酶 | 细胞(具体类型未指定) | 比例传感器生物电路,具有可编程时序控制的基因可用性设计 | 医学诊断 |
| 36 | 2025-10-30 |
An efficient CRISPR-Cas12a tool for iterative genome editing, streamlined minimization, and payload engineering of Pseudomonas phage S1
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.09.019
PMID:41141487
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研究论文 | 开发了一种用于假单胞菌噬菌体S1的高效CRISPR-Cas12a基因组编辑工具 | 实现了近乎完全效率的基因编辑,完成了噬菌体领域最大的基因组缩减(13.9 kb) | NA | 推进噬菌体生物技术和治疗开发 | 假单胞菌噬菌体vB_PaeM_SCUT-S1 (S1) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 假单胞菌噬菌体 | 双质粒系统,支持基因删除、点突变、基因插入和替换 | 医药, 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-30 |
Expanding the biocatalytic and oxidative landscape of the old yellow enzyme family
2025-Nov, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70363
PMID:41158077
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和合成生物学技术,系统探索了古老黄色酶家族的自然多样性,显著扩展了其生物催化和氧化功能 | 发现了古老黄色酶家族成员在常温条件下广泛存在的反向氧化化学反应,并鉴定出具有增强催化活性或改变立体选择性的新型酶 | 仅对约115,000个家族成员中的118个酶进行了实验表征,大部分成员仍未探索 | 系统探索古老黄色酶家族的生物催化多样性并发现新型高效生物催化剂 | 古老黄色酶家族的115,000多个成员 | 合成生物学 | NA | 蛋白质相似性网络分析,生物信息学,合成生物学 | NA | 蛋白质序列数据,晶体结构数据 | >115,000个古老黄色酶家族成员,其中118个进行了实验表征 | NA | NA | NA | 工业生物技术,医药 |
| 38 | 2025-10-30 |
Gene silencing regulated by aggregates of Corn aptamer at 3' UTR of mRNA
2025-Oct-28, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00510h
PMID:41148632
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研究论文 | 开发了一种通过在mRNA 3' UTR引入核酸自组装模块实现基因沉默的新策略 | 首次在mRNA 3' UTR引入核酸自组装模块形成RNA聚集体实现基因沉默,可构建多维转录后调控网络 | NA | 开发新型基因沉默技术并研究其调控机制 | 真核细胞中的mRNA翻译效率调控 | 合成生物学 | NA | 核酸自组装技术 | NA | mRNA和蛋白质表达水平数据 | NA | NA | 真核细胞 | 3' UTR自组装模块与5' UTR元件(如TOP序列)组合的多维转录后调控网络 | 医学 |
| 39 | 2025-10-30 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-Oct-28, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
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观点论文 | 提出新的生物分类概念以解决水平基因转移带来的分类挑战 | 引入epaktovars(表型趋同但独立获得相似功能的生物群)和xenotypes(通过水平基因转移共享同源基因的生物)两个互补概念 | NA | 为描述非严格树状进化历史的生物建立分类框架 | 具有水平基因转移和趋同进化特征的生物体 | 进化生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 灭绝物种重建 |
| 40 | 2025-10-30 |
A Lactose-Based Kluyveromyces lactis Cell-Free Protein Synthesis System
2025-Oct-23, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00011
PMID:41158605
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研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸克鲁维酵母的无细胞蛋白质合成平台,使用乳糖作为可持续碳源和能源 | 首次将乳糖作为碳源和能源整合到克鲁维酵母无细胞蛋白质合成系统中,并采用半自动化实验设计方法优化反应条件 | 仅验证了两种模型蛋白的合成效果,需要进一步测试更多蛋白质类型 | 开发可持续且经济高效的酵母无细胞蛋白质合成平台 | 乳酸克鲁维酵母无细胞提取物和蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、实验设计(DoE)、拉丁超立方实验设计 | NA | 蛋白质合成产量数据 | 测试了128种独特的CFPS反应混合物组成 | NA | Kluyveromyces lactis(乳酸克鲁维酵母) | NA | 医药、工业生物技术 |