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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-12-12 |
Cell-free immuno-profiling on a genetically programmed biochip
2025-Dec-10, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-02058-0
PMID:41372446
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研究论文 | 本文介绍了一种基于无细胞合成生物学的微流控生物芯片平台,用于定量重构抗原与抗体的相互作用,实现深度免疫分析 | 扩展了先前开发的微流控生物芯片平台,通过局部基因刷在微型化光刻图案化隔室中创建连续抗原密度梯度,生成多个抗体结合曲线以确定亲和力,无需蛋白质纯化步骤 | 未明确提及具体技术限制,如芯片可扩展性或实际应用中的灵敏度问题 | 开发一种快速、定量的方法,用于复杂蛋白质-蛋白质相互作用的分析,以支持人类免疫分析和新兴病原体应对 | SARS-CoV-2抗原、单克隆抗体、多克隆抗体、人类血清、人类ACE2受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 无细胞合成生物学、光刻图案化、微流控技术 | NA | 蛋白质相互作用数据 | 使用超过30个病毒表位和总计1微升人类血清 | 基因刷、光刻技术 | 无细胞系统 | 抗原密度梯度生成系统、受体-配体相互作用重构 | 医学 |
| 382 | 2025-12-12 |
Rna triplet repeats: improved algorithms for structure prediction and interactions
2025-Dec-10, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-025-00292-8
PMID:41372930
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研究论文 | 本文研究了由三核苷酸重复序列构成的RNA的最小自由能二级结构预测及RNA间相互作用,提出了改进的计算算法 | 针对三核苷酸重复RNA,改进了最小自由能和配分函数的计算算法,并为RNA-RNA相互作用设计了新算法,将阶乘时间复杂度降低至指数级 | 对于三核苷酸重复序列的情况,计算上存在困难,仅能获得参数化算法 | 开发更高效的算法来预测三核苷酸重复RNA的二级结构及其相互作用 | 由三核苷酸重复序列构成的RNA分子 | 计算生物学 | NA | RNA二级结构预测算法 | 最小自由能模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 383 | 2025-12-12 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
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研究论文 | 本研究构建了一个多样化的合成可调启动子库,用于在哺乳动物细胞中灵活控制多基因表达 | 设计了同时包含通用激活位点和特异性激活位点的合成可调启动子,结合CRISPRa系统实现多层级表达控制,并通过大规模平行报告基因检测验证了其正交性和可调性 | NA | 构建合成可调启动子库以实现哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 合成可调启动子及其在哺乳动物细胞多基因系统中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统、大规模平行报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 24,960个独特的非冗余启动子 | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 包含通用激活位点和特异性激活位点的合成启动子,用于构建多基因表达系统 | 基因治疗、生物技术 |
| 384 | 2025-12-12 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本文通过数学模型探讨了配体-受体相互作用如何使细胞群体通过响应异质性编码配体身份,揭示了受体二聚化在配体识别中的新机制 | 提出了配体识别可在群体水平通过响应异质性实现的新机制,特别强调了异二聚体受体在调控群体响应异质性中的功能优势 | 研究基于数学模型,可能未完全涵盖体内复杂生物环境的影响,且主要聚焦于特定信号通路如I型干扰素通路 | 探究细胞如何通过信号通路在群体水平区分不同配体信号,以理解免疫调节和组织发育的机制 | 配体-受体相互作用、细胞群体响应异质性、二聚体受体(特别是异二聚体) | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 385 | 2025-12-12 |
Governing Synthetic Biology: A Co-Evolutionary Framework for Sustainable Innovation
2025-Nov-26, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2508.08001
PMID:41309363
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综述 | 本文回顾了合成生物学的发展历程,分析了其面临的监管与政策挑战,并基于经合组织的框架提出了一个促进技术与制度框架共同演化的“协同演化”治理模型 | 提出了一个基于经合组织“新兴技术预见性治理框架”的“协同演化”模型,强调研发、战略情报、社会信任构建、敏捷监管和国际合作五个关键要素的协同 | 本文是一篇综述性文章,主要进行理论分析和框架构建,未涉及具体的实验验证或案例数据 | 探讨如何通过协同治理框架,使合成生物学的技术发展与社会制度、监管及公众接受度同步,以实现可持续创新 | 合成生物学领域的整体发展、监管政策框架及社会接受度 | NA | NA | NA | 协同演化模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 386 | 2025-12-12 |
A stable and antibiotic-free plasmid expression system for Salmonella typhimurium VNP20009 in tumor therapy
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113863
PMID:41362775
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研究论文 | 本研究为鼠伤寒沙门氏菌VNP20009开发了一种稳定且无抗生素的质粒表达系统,用于肿瘤治疗 | 通过比较不同复制子、转录控制和稳定模块,构建了无抗生素依赖的质粒平台,利用axe/txe毒素-抗毒素系统实现质粒稳定保留,并实现超过100倍的基因表达动态调控 | 研究仅在鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10)中测试,未涉及其他肿瘤类型或更广泛的体内环境 | 开发用于肿瘤基因治疗的稳定无抗生素质粒表达系统 | 鼠伤寒沙门氏菌VNP20009作为肿瘤靶向载体 | 合成生物学 | 肿瘤 | 质粒工程、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | 鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10) | Gibson Assembly, BioBrick | Salmonella typhimurium VNP20009 | 质粒表达系统,包含复制子、可调启动子-RBS组合和axe/txe毒素-抗毒素稳定模块 | 医学 |
| 387 | 2025-12-12 |
A Computational Framework for Optimal and Model Predictive Control of Stochastic Gene Regulatory Networks
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3598449
PMID:40911462
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研究论文 | 本文开发了一个用于随机基因调控网络的最优和模型预测控制的计算框架,旨在高效管理分子噪声并精确调控细胞群体行为 | 通过部分积分-微分方程高效近似化学主方程,实现高计算效率、精确控制概率密度函数以微调细胞群体复杂行为,并稳健处理内在分子噪声 | NA | 为合成生物学中随机生物分子系统的精确控制提供高效计算框架 | 随机基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 部分积分-微分方程近似、伴随优化方法 | 模型预测控制 | NA | NA | NA | NA | 诱导基因调控回路 | 合成生物学 |
| 388 | 2025-12-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文全面综述了在微流控系统中,利用外部电场调控软物质多相系统(如液滴和囊泡)的传输动力学 | 系统性地探讨了电场强度、流体性质与膜特性之间的耦合作用,并强调了囊泡双层脂膜带来的独特动力学行为,为下一代微流控设备设计提供了新视角 | NA | 研究电场如何调控软物质多相系统在微流控通道中的传输行为,以优化其操控与应用 | 软物质多相系统,特别是液滴和囊泡 | NA | NA | 高精度成像、微操控、复杂计算建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送、合成生物学、材料制造、芯片实验室平台、生物分析工具 |
| 389 | 2025-12-12 |
A new paradigm in transplant immunology: At the crossroad of synthetic biology and biomaterials
2023-07-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.05.002
PMID:37244257
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综述 | 本文探讨了合成生物学与生物材料在移植免疫学中的交叉应用,旨在通过工程化活体和非活体结构进行免疫调节 | 提出了合成生物学与生物材料结合的新范式,以增强移植免疫治疗的多样性和精准性 | NA | 研究合成生物学和生物材料在解决实体器官移植临床挑战中的潜在应用 | 实体器官移植受者及其免疫系统 | 移植免疫学 | 实体器官移植相关疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 390 | 2025-12-11 |
Engineered living materials: emerging frontiers in therapeutic innovation and management of skin disorders
2025-Dec-11, Zeitschrift fur Naturforschung. C, Journal of biosciences
DOI:10.1515/znc-2025-0208
PMID:41369022
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综述 | 本文综述了工程化活性材料在皮肤疾病治疗创新与管理中的新兴前沿,探讨了其作为新型治疗剂的潜力 | 将合成生物学与材料工程相结合,创造出具有实时感知、自适应响应和局部治疗递送功能的动态活性材料系统 | 临床转化面临生物安全性、可扩展性和监管问题等挑战 | 探索工程化活性材料作为皮肤疾病新型治疗平台的开发与应用 | 慢性伤口、烧伤、感染和皮肤病等皮肤并发症 | 合成生物学 | 皮肤病 | 遗传电路工程、支架优化、生物相容性增强 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌, 真菌 | 生物传感器、逻辑门、治疗性肽类释放系统 | 医学 |
| 391 | 2025-12-11 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-Dec-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 本文综述了细菌芳香聚酮生物合成中的氧化重排反应,重点介绍了相关氧化还原酶在结构多样性和生物活性形成中的作用 | 系统总结了细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排的化学规律和酶学机制,包括Baeyer-Villiger、Favorskii型重排及创新碳骨架重排 | NA | 阐明细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的化学和酶学基础 | 细菌芳香聚酮生物合成途径中的氧化还原酶及其催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 392 | 2025-12-11 |
Advances in Producing Health-Promoting Punicic Acid: From Extraction Technologies to Cutting-Edge Biotechnology Innovations
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12722
PMID:41284366
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综述 | 本文综述了促进健康pun酸的生产进展,从提取技术到前沿生物技术创新 | 探讨了微波、超声波、酶辅助和超临界流体辅助提取技术,以及合成生物学在植物和微生物中优化pun酸积累的生物技术进展 | NA | 提高pun酸的产量、纯度和稳定性,以促进其在功能性食品中的广泛应用 | pun酸(一种ω-5多不饱和脂肪酸) | NA | NA | 微波提取、超声波提取、酶辅助提取、超临界流体辅助提取、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物、微生物 | 调整脂肪酸谱以促进pun酸积累 | 食品、工业生物技术 |
| 393 | 2025-12-11 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2025-Dec-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合结构生物学、计算模拟与多种工程化技术,结合机器学习与高通量筛选,以克服萜烯合酶催化复杂性和序列-功能相关性弱的挑战 | 萜烯合酶催化复杂性高且序列-功能相关性弱,这构成了显著的工程化挑战 | 工程化I类萜烯合酶以生成多样化的萜烯骨架,这是合成生物学的一个关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制导向工程、半理性与随机方法(如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化)、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | 结构引导设计、进化方法、机制导向工程、丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化 | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 394 | 2025-12-11 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2025-Dec-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 本文报告了首个使用中性双组分系统在生理pH下促进cAMP和AMP跨脂质体膜转运的实例 | 首次实现了cAMP和AMP通过人工设计的小分子系统进行跨膜转运,结合合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物以提高效率 | NA | 研究核苷酸跨膜转运机制,开发新型药物递送和合成生物学工具 | cAMP和AMP核苷酸 | 合成生物学 | NA | 荧光实验、P NMR实验 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 合成生物学 |
| 395 | 2025-12-11 |
Nanotechnology-based cytokine delivery strategies in gastrointestinal cancers
2025-Dec, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2025.11.002
PMID:41242181
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综述 | 本文综述了基于纳米技术的细胞因子递送策略在胃肠道癌症治疗中的应用、优势与挑战 | 系统总结了利用脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶和智能纳米载体等纳米平台实现细胞因子的靶向、可控和持续释放,以增强抗肿瘤免疫并克服传统细胞因子疗法的局限性 | 仍面临生物屏障、细胞因子不稳定性、免疫原性以及制造复杂性等挑战 | 探讨纳米技术驱动的细胞因子递送平台如何改善胃肠道癌症免疫疗法的疗效与安全性 | 胃肠道癌症(包括结直肠癌、胃癌和食管癌)及其肿瘤微环境 | NA | 胃肠道癌症 | 纳米技术递送平台(脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶、智能纳米载体等) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 396 | 2025-12-11 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
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综述 | 本文综述了微生物生产类胡萝卜素torulene的现状、策略、生物特性及其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 系统总结了通过上游和下游工艺提高torulene产量的策略,并探讨了其在多个工业领域的应用潜力 | torulene的研究仍有限,其商业化潜力尚未充分开发,微生物生产面临挑战 | 总结torulene的微生物生产策略、生物特性及潜在应用,推动其商业化发展 | 红酵母生产的类胡萝卜素torulene | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 红酵母(如Rhodotorula和Sporobolomyces) | NA | 食品,化妆品,制药 |
| 397 | 2025-12-10 |
Biogenic amines in fermented foods: A comprehensive review from formation pathways, risk analysis, detection technologies to control measures
2026-Jan-15, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117832
PMID:41360534
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综述 | 本文系统综述了发酵食品中生物胺的形成途径、风险分析、检测技术及控制措施,特别聚焦于微生物策略及其机制与未来展望 | 特别强调微生物控制策略作为内在兼容的解决方案,并展望了将微生物策略与AI驱动的生物传感器等智能技术结合,以及利用合成生物学提高酶产量的未来研究方向 | 在优化菌株效能、稳定性及大规模生产应用方面仍存在挑战 | 为发酵食品中生物胺的相关研究和实际应用提供结构化参考 | 发酵食品中的生物胺 | NA | NA | AI驱动的生物传感器、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 398 | 2025-12-10 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠的H3K9甲基化酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读分子HP1对转录和染色质结构的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基化酶和HP1,以克服系统冗余问题,直接评估其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能无法完全反映H3K9甲基化和HP1在高等生物中的全部功能,且未观察到对转录或染色质三维结构的显著影响 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的具体作用机制 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基化酶催化H3K9甲基化及HP1蛋白 | 基础研究 |
| 399 | 2025-12-10 |
Methyltransferase Detection Based on Target-Responsive Transcription Amplification of Light-Up Aptamer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05886
PMID:41296341
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研究论文 | 开发了一种基于目标响应转录扩增的DNA甲基转移酶检测新方法 | 提出了一种名为MTA的简单、无标记、通用策略,利用Broccoli RNA光敏适配体和转录扩增实现高灵敏度检测,并支持逻辑门设计和多目标检测 | NA | 开发高灵敏度、高特异性的DNA甲基转移酶检测方法 | DNA甲基转移酶(如Dam和M.SssI MTase) | 合成生物学 | NA | 转录扩增、光敏适配体检测 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | 基于甲基化响应开关的转录调控电路,支持逻辑门设计 | 生物医学 |
| 400 | 2025-12-10 |
Phenotyping and Selection of Cells Using Mass Spectrometry and a Microfluidic Droplet Printer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05032
PMID:41309380
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研究论文 | 本文介绍了一种结合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机的系统,用于无标记细胞表型分析和选择 | 整合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机,实现在线分析和捕获含细胞液滴,提供无标记表型分析和选择能力 | 系统操作速率限制在0.4-1.2液滴/秒范围内,可能影响高通量筛选效率 | 开发一种高通量、无标记的细胞表型分析和选择方法 | 含细胞的微流控液滴 | 合成生物学 | NA | 液滴电喷雾电离质谱、微流控电压介导液滴打印 | NA | 质谱数据、图像数据 | NA | NA | 微生物细胞 | NA | 合成生物学、酶工程 |