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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-07-24 |
From fundamental understanding to engineering of carboxysomes for biotechnological applications
2026-07-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
|
综述 | 综述了从基本原理到工程化羧酶体用于生物技术的应用 | 强调羧酶体作为合成生物学和生物工程中的强大模型,提供增加碳同化和解锁新型生物技术功能的前所未有的机会 | 面临精确控制壳渗透性、高效货物封装和将羧酶体整合到异源宿主中的关键挑战 | 总结对羧酶体结构、组装和功能的分子机制的理解,并概述工程化羧酶体作为增强CO₂固定引擎和多功能纳米材料的未来策略 | 羧酶体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 382 | 2026-07-24 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
|
研究论文 | 构建了一种具有两种动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器,用于模拟和扩展自然细胞系统的功能复杂性 | 首次在巨型单层囊泡膜上整合两种动态DNA基孔(光响应小孔和自排列可密封大孔),实现高时空精度的顺序按需分子递送 | NA | 重建细胞复杂性和动态膜组件相互作用,开发仿生纳米技术平台 | 双颈合成细胞微反应器(DCM)及其膜上的动态DNA基孔 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、光响应系统 | NA | NA | 巨型单层囊泡(GUV) | DNA基孔设计 | 无 | 信号通路介导的膜动力学调控:光响应小孔与自排列可密封大孔相互作用 | 生物技术、纳米技术 |
| 383 | 2026-07-24 |
Microscopic Fungi as Sources of Natural UV-Protective Compounds
2026-Jun-18, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-05005-x
PMID:42310121
|
综述 | 综述了2014至2025年间微观真菌产生的具有光保护潜力的代谢物研究,包括黑色素、类菌孢素氨基酸、类胡萝卜素、醌类、呫吨酮和生物碱等 | 强调了微观真菌在光保护代谢物开发中相较于藻类和细菌被忽视的潜力,并整合了真菌代谢物在防晒和皮肤健康方面的多方面功能 | 产量优化、制剂稳定性和监管验证方面仍存在挑战 | 探索微观真菌作为天然紫外防护化合物的可持续和生物相容性来源 | 微观真菌及其产生的光保护代谢物 | 微生物学、生物技术 | 皮肤疾病 | 提取、发酵、合成生物学 | NA | 文本、实验数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 极端真菌、工程酵母 | 光保护代谢物生物合成途径 | 医药、化妆品 |
| 384 | 2026-07-24 |
Advances in the heterologous biosynthesis of QS saponins: a review
2026-May-26, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03034-6
PMID:42192394
|
综述 | 系统总结QS皂苷的异源生物合成进展,重点介绍QS-21的作用机制与应用 | 聚焦合成生物学策略用于微生物合成QS皂苷,并针对当前研究挑战提出目标响应策略 | NA | 为推动QS皂苷的医学应用和可持续生产奠定理论基础 | QS皂苷(特别是QS-21)的异源生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | QS皂苷生物合成途径 | 医药, 兽医疫苗 |
| 385 | 2026-07-24 |
TargetGAN: A generative AI framework for the design of plant core promoters with targeted activity
2026-05-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
|
研究论文 | 提出TargetGAN框架,利用生成对抗网络和预训练活性预测器,设计具有靶向活性的植物核心启动子 | 首次将生成对抗网络与活性预测器结合,实现用户自定义活性的植物核心启动子的从头设计,并发现合成的超强启动子活性远超天然启动子 | 预测活性与实验实测活性之间仅中等程度相关(皮尔逊相关系数=0.6435),且合成启动子的超强活性机制尚需进一步验证 | 开发能够设计具有靶向活性的植物核心启动子的深度学习框架 | 植物核心启动子 | 机器学习 | NA | 高通量功能验证(STARR-seq)、荧光素酶报告基因检测 | 生成对抗网络(GAN) | 序列数据 | 76851个天然启动子用于训练,55296个合成启动子生成,5250个用于高通量验证,2909个成功表征 | NA | 植物 | 靶向活性植物核心启动子 | 农业, 合成生物学 |
| 386 | 2026-07-24 |
The gut-tumor connection: the role of microbiota in cancer progression and treatment strategies
2026-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.038
PMID:40850681
|
综述 | 本文探讨了肠道微生物群与肿瘤微环境在癌症进展和治疗策略中的复杂相互作用 | 系统总结了肿瘤内微生物群跨癌种的多样性及其对肿瘤微环境异质性的影响,并评估了多种微生物群调节策略的治疗潜力 | 缺乏标准化研究方案、先进测序技术和精炼动物模型,转化研究仍面临挑战 | 阐明肠道微生物群与肿瘤微环境互作机制,探索以微生物群为靶点的癌症治疗策略 | 肠道微生物群、肿瘤相关微生物群、肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 人体 | NA | 医学 |
| 387 | 2026-07-24 |
Yeast-based green nanoparticle synthesis: past, present and future in nanomedicine
2026-04, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2642296
PMID:41797356
|
综述 | 概述了基于酵母的绿色纳米颗粒合成在纳米医学中的历史进展、当前应用和未来潜力 | 系统总结了酵母合成纳米颗粒的酶促还原路径和生物分子封端机制,并强调了合成生物学与生物过程工程在提升颗粒可控性和医学级生产中的关键作用 | 临床转化受限于标准化GMP生产、毒性及免疫原性评估不足以及缺乏明确监管框架 | 评估酵母作为纳米颗粒生物合成平台在纳米医学中的应用前景与挑战 | 酵母合成的银、金、硒等纳米颗粒 | 纳米医学 | 癌症 | 绿色合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酵母 | NA | 医学 |
| 388 | 2026-07-24 |
Editorial: Metabolic engineering and synthetic biology for sustainable microbial cell factories
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1871007
PMID:42487703
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2026-07-24 |
Biomimetic polymers and their characterization: toward sustainable materials using synthetic biology
2026, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2026.1846334
PMID:42487928
|
综述 | 综述了可持续性天然仿生聚合物的特性及表征技术,聚焦于低碳足迹材料 | 专注于可持续性天然衍生仿生聚合物,并系统总结了跨长度尺度的多种表征方法,包括光谱、显微镜、衍射/散射和热力学分析 | 未提供具体实验数据或定量比较,可能缺乏对实际应用性能的深入分析 | 指导下一代仿生材料的理性设计,弥合仿生学、材料表征和可持续材料之间的差距 | 可持续性天然仿生聚合物 | 材料科学 | NA | 光谱学、显微镜、衍射/散射、热力学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可持续材料 |
| 390 | 2026-07-24 |
Bacteriophage therapy beyond antibiotics: emerging innovations for infectious and non-infectious diseases
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1879718
PMID:42488416
|
综述 | 综述噬菌体疗法在抗感染及非感染疾病中的新兴应用及其挑战 | 系统阐述了噬菌体疗法超越传统抗菌应用,涵盖多重耐药感染、癌症研究及工程化噬菌体(如CRISPR改造、表达生物膜降解酶)的创新设计 | 面临噬菌体耐药性、患者反应差异、药代参数未知、免疫问题、监管指南不明确及水平基因转移等安全挑战 | 综述噬菌体疗法在抗菌与治疗应用中的进展及潜在临床转化 | 多重耐药病原体、生物膜感染、肿瘤细胞、兽医学及动物生产相关病原体 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染、癌症 | 噬菌体疗法、CRISPR工程、噬菌体展示技术、基因组重构 | NA | NA | 超过100例临床案例和44项注册试验 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(M13、T7、λ噬菌体宿主) | 工程化噬菌体表达生物膜降解酶,噬菌体展示平台衍生自M13、T7和λ噬菌体 | 医学,兽医,动物生产 |
| 391 | 2026-07-24 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-06-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
|
研究论文 | 利用合成生物学与化学结合的方法,设计并研究具有抗菌活性的生物基羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物库 | 首次将真菌宿主异源生产的单体前体与化学修饰及开环聚合相结合,合成出具有抗菌和生物膜破坏能力且可降解的聚合物材料 | 具体聚合物对微生物的长期稳定性及体内应用效果未充分探讨 | 开发具有抗菌活性的可降解生物基聚合物,对抗抗生素耐药性 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-co-丙交酯聚合物 | 合成生物学与材料化学 | 细菌感染及相关耐药性疾病 | 异源表达、化学修饰、开环聚合 | NA | 实验数据(聚合度、抗菌活性测试结果) | 不同聚合度(M/I = 5-30)的聚合物样品 | CRISPR-Cas9、合成生物学工具 | 真菌宿主 | 羟基苯甲酸-co-丙交酯聚合物的合成代谢通路 | 医药 |
| 392 | 2026-07-24 |
Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences
2025-03, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01733-y
PMID:39266721
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研究论文 | 开发一种不改变内源基因编码序列即可实现基因感测与响应的方法 | 通过将生物传感器整合到内源基因的终止子区域而不修改其编码序列,利用sgRNA激活下游电路,避免了传统方法可能对内源基因调控的不可预测影响 | 该方法可能依赖于特定宿主细胞类型(如CHO-K1细胞),且传感器响应的调谐范围可能存在限制 | 开发一种平台技术,用于不改变内源基因编码序列的条件下实现基因感测与响应控制 | CHO-K1细胞中的内源基因及其终止子区域 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基因传感器整合 | 数学模型用于预测传感器响应 | 基因表达数据 | NA(主要基于工程化的CHO-K1细胞系) | CRISPR-Cas9 | CHO-K1细胞 | 细胞应激传感器与致动器电路,通过下游电路条件性激活抗凋亡蛋白BCL-2 | 生物制造, 细胞命运控制, 细胞疗法 |
| 393 | 2026-07-24 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-02-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 探讨合成生物学与人工智能在作物改良中的应用,综述了工程原理、遗传电路设计方法及未来发展方向 | 系统性地将人工智能驱动的合成生物学路径应用于植物工程,并提出开发SMART作物的概念 | 尚未有系统性综述整合AI与合成生物学的作物改良途径 | 探索作物合成生物学的工程原理及其在作物改良中的应用,并展望AI增强的合成生物技术 | 作物(包括光合效率、植株结构、代谢途径、环境适应性、养分吸收等性状) | 机器学习和数字农业 | NA | 基因编辑、合成核酸技术、合成蛋白技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 作物(植物) | 遗传电路(包括基因编辑、合成核酸和蛋白质回路、代谢通路设计) | 农业 |
| 394 | 2026-07-24 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-09-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科植物在基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学方面的研究进展,并探讨了基因组学在药用植物研究中的应用前景 | 将新兴的“药用植物基因组学”学科引入罂粟科研究,系统整合多组学数据揭示药用植物遗传基础和次生代谢途径,并探讨CRISPR/Cas9等现代基因操作技术的应用潜力 | 仅简要概述了组学视角在制药和农业生物技术领域的潜在应用,未深入讨论具体技术实现细节或案例研究 | 综合回顾罂粟科植物在基因组、转录组、蛋白质组和代谢组学方面的研究进展,并探索药用植物组学研究在制药工业和农业生物技术中的应用机会 | 罂粟科植物,特别是罂粟和白屈菜等产胶植物 | 药用植物基因组学 | NA | 高通量测序, CRISPR/Cas9, RNA干扰 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 制药工业, 农业生物技术 |
| 395 | 2026-07-23 |
Recent advances in decoding biosynthetic pathways and synthetic biology approaches for plant alkaloids
2026-Jul-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00089k
PMID:42132682
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综述 | 综述2018至2025年间植物生物碱生物合成途径解析和合成生物学方法的研究进展 | 系统总结了近期在单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托烷生物碱等主要类别中的途径解析突破,并重点讨论了立体化学控制、关键环化和特异性修饰酶催化等挑战,提出了长途径解码的创新方法 | 未涉及动物来源生物碱,且可能因文献覆盖范围限制,对某些新兴类别或技术细节的讨论深度有限 | 激发植物生物碱功能基因表征、合成生物系统开发、产量优化和药物创新的研究,促进植物学、化学、生物学和药学跨学科合作 | 代表性植物生物碱,包括单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托烷生物碱及其他类型 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径、代谢通路 | 医药, 可持续生产 |
| 396 | 2026-07-23 |
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-Jul-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00013d
PMID:42187150
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综述 | 总结了齐墩果烷型五环三萜类化合物生物合成的最新进展,包括关键酶、调控机制和合成生物学策略 | 整合了基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学与人工智能/机器学习方法,从基因发现到合成生物学全面综述了OPT生物合成的突破 | 未详细讨论具体工程化实施中的挑战,如异源表达效率、代谢通量平衡等(因综述性质) | 综述OPT生物合成中基因发现、调控机制和合成生物学策略的最新进展,推动可持续高产生产 | 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径 | 机器学习 | NA | 基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 异源表达, 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物宿主, 植物宿主 | 生物合成途径 | 医学 |
| 397 | 2026-07-23 |
To Biotic or Abiotic: Biohybrid Systems for Artificial Photosynthesis
2026-Jul-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00963
PMID:42371621
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综述 | 本文综述了用于人工光合作用的生物-非生物杂化系统的最新进展 | 结合合成生物学、计算和可视化技术以及高分辨率表征手段,深入理解界面并改善电子传递过程和设计架构 | 未明确提及 | 探讨人工光合作用和生物-非生物杂化系统的发展,以实现光诱导能量或燃料生产 | 天然光合蛋白质、无机光催化剂和先进生物杂化材料 | NA | NA | 合成生物学、计算技术、可视化技术、高分辨率表征 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可再生能源、人工光合作用 |
| 398 | 2026-07-23 |
The plant Golden Gate toolkit: compatibility, interoperability, and harmonized assembly in plant synthetic biology
2026-Jul-21, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-026-01563-0
PMID:42482144
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综述 | 该综述全面介绍了超过25种植物特异性Golden Gate克隆工具包,并深入探讨了其模块兼容性,旨在提高系统互操作性并简化克隆工作流程 | 首次系统评估多种植物Golden Gate克隆工具包的兼容性,并提出包括驯化策略、甲基化酶辅助分层DNA组装和多克隆位点在内的系统协调方法 | 未提供实证比较数据或工具包效率的定量分析,且兼容性评估可能受限于已有公开模块的可用性 | 提升植物合成生物学中Golden Gate克隆工具包的互操作性与标准化,降低技术门槛 | 植物特异性Golden Gate克隆工具包及其模块 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 植物 | 遗传模块与转录单元的标准组装 | 农业,工业生物技术 |
| 399 | 2026-07-23 |
Biotransformation-Driven Structural Remodeling of Natural Products by Ganoderma lucidum Fermentation: Mechanisms and Enhanced Bioactivities
2026-Jul-14, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
|
综述 | 本文系统综述了灵芝发酵驱动的天然产物结构重塑机制及其生物活性增强作用 | 首次系统阐明灵芝发酵通过酶水解、微生物代谢重塑和底物-微生物互作精确调控天然产物化学谱和生物活性的机制,并强调整合多组学和合成生物学对实现精准控制的重要性 | 未提供具体的实验数据验证或比较不同发酵条件的效应 | 阐明灵芝发酵驱动天然产物结构修饰的机制及其在功能食品和药物发现中的应用前景 | 灵芝发酵过程中多糖、皂苷、三萜类、黄酮类和蛋白质等关键化合物的结构修饰 | 机器学习和数字病理学以外的其他领域 | NA | 发酵、多组学、合成生物学 | NA | 综述性文字 | NA | NA | 灵芝 | NA | 食品、药物发现 |
| 400 | 2026-07-23 |
A T7 RNAP regulatory toolbox for cell-free network engineering and biosensing applications
2026-May-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73811-9
PMID:42209525
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研究论文 | 构建了一个T7 RNA聚合酶调控工具箱,用于无细胞网络工程和生物传感应用 | 开发了可编程的合成抑制子、激活子和生物传感器组成的T7 RNAP调控工具箱,实现了无细胞系统中基于T7 RNAP的基因调控网络可扩展设计,并集成蛋白质设计管线生成全合成结合物生物传感器 | 局限性未在摘要中明确说明 | 实现无细胞系统中基因调控网络的精确模块化控制,并用于多种生物分子的快速灵敏检测 | T7 RNA聚合酶及其调控组件 | 合成生物学、生物技术 | 传染病(SARS-CoV-2) | 无细胞系统、蛋白质设计 | NA | 生物分子(小分子药物、抗体、蛋白质) | NA | T7 RNAP调控工具箱 | 无细胞系统(大肠杆菌提取物) | 基因调控网络(包括抑制子、激活子、生物传感器) | 医学、诊断 |