合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
381	2025-03-05	Promoting the glycosylation of drug-like natural products in a Saccharomyces cerevisiae chassis by deletion of endogenous glycosidases 2025-Apr, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132258 PMID:39971105	研究论文	本文探讨了通过删除内源性糖苷酶来提高酿酒酵母中药物样天然产物糖基化效率的方法	通过删除EXG1或SPR1糖苷酶，提高了糖苷化产物的产量和区域异构体分布的多样性	研究仅限于酿酒酵母系统，且仅测试了18种糖苷中的13种	提高天然产物或其非天然产物类似物的糖基化效率和区域特异性	苯二酚内酯家族的多酮类和苯丙烷类的多酚类化合物	合成生物学	NA	糖基化技术	NA	NA	18种糖苷
382	2025-03-05	Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation 2025-Mar-15, Environmental research IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.envres.2025.120904 PMID:39842755	综述	本文介绍了聚羟基脂肪酸酯（PHAs）的碳循环概念，包括其生物合成途径、碳转化过程以及在堆肥、土壤和海洋环境中的降解	提出了聚羟基脂肪酸酯（PHAs）的碳循环（CCP）概念，并详细描述了其生物合成和降解的碳途径	在实现成本效益高的PHA生产和降解产物再利用方面仍存在挑战，且对PHA合成和降解中的碳途径理解有限	探讨PHAs作为生物材料的可持续利用价值，支持全球绿色和低碳发展	聚羟基脂肪酸酯（PHAs）	生物材料	NA	合成生物学	NA	NA	NA
383	2025-03-05	Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications 2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.) DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996 PMID:40032480	综述	本文综述了利用油性原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸（DHA）的当前生物技术，特别关注菌株改良、发酵优化、DHA油提取策略、安全评估和稳定性维护方案，以及DHA产品在食品中的应用	提出了利用多种育种技术改良菌株、考虑人工智能和机器学习优化发酵过程、引入纳米颗粒包装技术提高DHA产品的氧化稳定性、用特色风味食品掩盖DHA气味缺陷，以及利用合成生物学构建含DHA的结构脂质以开发潜在功能的建议	裂殖壶菌DHA产品的广泛应用受到菌株性能、发酵参数、产品收获和提取策略、安全性和稳定性维护以及健康和功能特性应用限制等因素的影响	探索裂殖壶菌DHA的生产技术并推动其在食品和健康领域的应用发展	油性海洋原生生物裂殖壶菌	生物技术	NA	发酵优化、纳米颗粒包装技术、合成生物学	NA	NA	NA
384	2025-03-05	CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models 2025-Feb-25, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-13780-2 PMID:40000974	研究论文	本文研究了一种新型的双靶向CAR-NK细胞（dtCAR-NK92），用于治疗肺癌	设计了一种新型的双靶向CAR（dtCAR），结合了PD-L1纳米抗体和NKG2D，增强了NK细胞的细胞毒性和细胞因子产生	研究中未提及长期疗效和潜在副作用	探索双靶向CAR-NK细胞在肺癌治疗中的效果	肺癌H1299细胞	免疫治疗	肺癌	合成生物学，CAR-NK细胞工程	双靶向CAR（dtCAR）	体外和体内实验数据	未明确提及样本数量
385	2025-03-05	Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications 2025-Feb, mLife IF:4.5Q1 DOI:10.1002/mlf2.12167 PMID:40026576	综述	本文综述了合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的方法和工具，并讨论了其在生物制造中的应用	本文详细讨论了转录调控、模板依赖和非模板依赖的方法，并全面总结了进化酿酒酵母在提高环境应激耐受性和细胞代谢性能方面的应用	未明确提及具体的研究局限性	探讨合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的应用	酿酒酵母	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
386	2025-03-05	Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin 2024-09, Bioorganic chemistry IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600 PMID:38945086	研究论文	本研究探讨了将生物素的四氢噻吩环替换为氧杂环或（甲基）吡咯烷基团对其分子相互作用的影响，旨在寻找适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体	通过分子动力学模拟和荧光滴定实验，发现氧杂生物素与链霉亲和素的结合行为与生物素相似，而氨基类似物则表现出较低的结合能力，特别是氮杂生物素在酸性条件下表现出增强的结合能力	研究仅关注了少数几种硫替代物，未全面评估所有可能的替代物及其在不同条件下的结合行为	研究硫替代对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响，以寻找适用于合成生物学的替代亲和配体	生物素及其硫替代物与链霉亲和素的相互作用	合成生物学	NA	分子动力学模拟（MD）、荧光滴定实验	NA	分子相互作用数据	NA
387	2025-03-05	Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae 2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.24.605010 PMID:39091764	研究论文	本文通过生物信息学和体内突变分析，探讨了绿藻中多顺反子基因的翻译机制	揭示了绿藻中多顺反子转录本的翻译机制，特别是通过漏读扫描实现ORF 2的翻译	研究主要基于两种绿藻，可能不适用于其他生物	研究绿藻中多顺反子基因的翻译机制	绿藻中的多顺反子基因	生物信息学	NA	生物信息学分析、体内突变分析	NA	基因序列数据	两种绿藻的高置信度手动注释数据集
388	2025-03-05	Rethinking cancer targeting strategies in the era of smart cell therapeutics 2022-12, Nature reviews. Cancer DOI:10.1038/s41568-022-00505-x PMID:36175644	研究论文	本文探讨了在智能细胞治疗时代重新思考癌症靶向策略的必要性和潜力	提出了将机器学习分析与基因组数据结合，以指导设计更具区分性和可操作性的治疗识别程序，从而增强智能细胞工程的能力	这些新兴的智能细胞工程技术尚未在临床中完全实施	探索更有效的癌症治疗策略，特别是通过结合细胞治疗和机器学习分析	癌症治疗策略，特别是细胞治疗和机器学习分析	合成生物学	癌症	机器学习分析，合成生物学	NA	基因组数据	NA
389	2025-03-04	Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design 2025-Mar-03, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202401969 PMID:40025899	综述	本文介绍了合成生物学纳米医学的基本概念，并探讨了其与传统和仿生纳米医学的关系与区别	提出了合成生物学纳米医学这一新概念，区别于传统或仿生纳米医学，采用基因工程策略进行设计	讨论了利用合成生物学开发纳米医学的潜在优势和挑战，但未具体说明具体挑战内容	探索合成生物学与纳米医学的融合，推动纳米医学在疾病诊断和治疗中的应用	合成生物学纳米医学	合成生物学	NA	基因工程	NA	NA	NA
390	2025-03-04	SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation 2025-Feb-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91249-9 PMID:40021804	研究论文	本文介绍了一种名为SHIP的算法，用于在真核生物中系统地识别基因组安全港（GSHs）	SHIP算法通过基因组一般特征注释，系统地识别基因组安全港，填补了现有方法主要依赖经验识别的空白	研究主要基于酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）进行实验验证，尚未在其他真核生物中广泛验证	开发一种系统识别基因组安全港的工具，以支持合成生物学中多基因模块的研究	真核生物的基因组安全港	基因组工程	NA	DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq	算法（SHIP）	基因组数据	基于酿酒酵母的实验验证
391	2025-03-04	Self-Driven CuAAC Reaction Catalyzed by Photosensitive Biohybrids Energized by Lactate for Boosting Cancer Immunotherapy 2025-Feb-20, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202425018 PMID:39973575	研究论文	本文构建了一种光辅助靶向电活性细菌装备的生物正交催化剂系统，用于增强癌症免疫治疗	创新点在于利用细菌在肿瘤部位厌氧代谢乳酸并转移电子至生物正交催化剂，从而触发CuAAC反应原位生成活性药物，并通过光照加速反应	NA	开发一种不依赖化学还原剂的高效CuAAC反应，用于癌症免疫治疗	肿瘤代谢与CuAAC反应	合成生物学	癌症	CuAAC反应、光辅助催化	NA	NA	NA
392	2025-03-04	Combating Infectious Diseases with Synthetic Biology 2022-02-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.1c00576 PMID:35077138	研究论文	本文探讨了合成生物学在传染病诊断和治疗中的应用	提出了利用合成生物学设计合成系统和设备作为治疗人类疾病的有力工具	未具体提及研究的具体限制	开发新型、特异、灵敏且有效的传染病诊断和治疗方法	传染病，包括寄生虫、真菌、细菌和病毒感染	合成生物学	传染病	合成生物学技术	NA	NA	NA
393	2025-03-03	Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations 2025-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259 PMID:39827498	研究论文	本文探讨了计算代谢建模方法的演变，并提出了将生物分子模拟和机器学习预测结合以指导结构导向的合成生物学应用的新阶段	首次将生物分子模拟与代谢模型相结合，开创了结构导向的合成生物学应用的新范式	尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型结合的具体技术细节和实现方法	优化和理解代谢途径，以改善蛋白质和小分子产品的生物生产，应用于健康、环境、能源和可持续性领域	从微生物到人类的细胞代谢	合成生物学	NA	生物分子模拟，机器学习	NA	NA	NA
394	2025-03-03	Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications 2025-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256 PMID:39827499	review	本文综述了蛋白质工程在设计功能性治疗和生物技术应用的生物纳米分子组装体方面的最新进展	利用AI工具（如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN）显著提高了从头设计的可扩展性和成功率	NA	探讨蛋白质工程在生物纳米分子组装体设计中的应用及其在生物技术和生物医学领域的潜力	有限组装体（如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构）和扩展组装体（如丝状体和2D/3D晶格）	生物技术	NA	AI工具（AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN）	NA	NA	NA
395	2025-03-03	Machine learning for synthetic gene circuit engineering 2025-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263 PMID:39874719	研究论文	本文讨论了机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用，以及如何通过机器学习增强从单个组件到电路层面的工程设计	提出了机器学习与机制建模相结合的混合方法，以利用数据驱动模型的优势与基于机制的模型的规范性能力	需要克服的挑战包括如何有效地整合机器学习与机制建模，以及如何在实际应用中实现这些方法的潜力	探讨机器学习在合成基因电路工程中的应用，以解决设计空间大、组件与宿主细胞机器之间复杂交互的挑战	合成基因电路	合成生物学	NA	机器学习	混合模型（机器学习与机制建模）	NA	NA
396	2025-03-03	Progress on production of malic acid and succinic acid by industrially-important engineered microorganisms 2025-Apr, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.02.001 PMID:39923900	综述	本文综述了通过代谢工程改进有机酸生物合成的最新研究进展，特别是L-苹果酸（L-MA）和琥珀酸（SA）的生产	总结了利用合成生物学和高通量筛选等新技术改进有机酸生物合成的最新进展	微生物发酵的低产量和长发酵周期限制了其工业应用	改进有机酸生物合成，特别是L-苹果酸和琥珀酸的生产	工业上重要的工程微生物	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学、高通量筛选	NA	NA	NA
397	2025-03-03	Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories 2025-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270 PMID:39978295	研究论文	本文探讨了通过代谢工程、合成生物学和实验室进化增强假单胞菌细胞工厂的底物范围，以利用多样化的废弃物底物	提出了通过代谢工程和合成生物学手段增强假单胞菌的底物利用能力，以应对工业生物技术中的新挑战	自然分离的假单胞菌并不总是适合高要求的生物技术应用，需要进一步的工程改造	探索和扩展假单胞菌细胞工厂的底物范围，以利用多样化的废弃物底物	假单胞菌物种	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学、实验室进化	NA	NA	NA
398	2025-03-03	Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways 2025-Apr, Molecular medicine reports IF:3.4Q2 DOI:10.3892/mmr.2025.13465 PMID:39981899	研究论文	本研究探讨了重组人胶原XVII（RHCXVII）在保护皮肤基底膜完整性方面的功效及其作用机制	首次揭示了RHCXVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路的磷酸化来保护皮肤基底膜完整性的机制	研究仅基于体外实验，未涉及体内实验或临床试验	阐明RHCXVII在保护皮肤基底膜完整性中的作用机制	人类HaCaT角质形成细胞	生物医学	皮肤损伤	逆转录定量PCR、蛋白质印迹分析、磷酸化抗体阵列	NA	细胞实验数据	UVB照射的HaCaT细胞
399	2025-03-03	Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles 2025-Feb-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57178-x PMID:40016255	研究论文	本文介绍了一种基于脂质的组织模拟物，能够通过活性粒子诱导的网络张力波动进行重塑	开发了一种毫米大小的脂质泡沫组织模拟物，具有自愈能力，并展示了由游泳细菌驱动的网络张力波动促进组织重塑	现有原型组织的横向尺寸较小或缺乏重塑能力	理解和模拟生物组织的结构和力学特性	脂质泡沫组织模拟物	合成生物学	NA	脂质双层技术	NA	NA	NA
400	2025-03-03	Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes 2024-Mar, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.28621 PMID:38079116	综述	本文讨论了利用酵母细胞器隔离技术研究和工程化翻译后修饰酶（PTM-enzymes）的原理和方法	首次详细讨论了酵母内质网隔离技术，并介绍了基于酵母表面展示和酶介导的转录激活的细胞质隔离方法	不同系统的测量和控制酶催化效率的能力存在局限性	旨在通过高通量功能筛选和选择方法，解析PTM-enzymes的酶学和生物学机制，开发能够探测和调控它们的分子，并赋予它们改进和新功能	翻译后修饰酶（PTM-enzymes），包括蛋白酶、蛋白质连接酶、氧化还原酶、激酶和其他转移酶	合成生物学	NA	酵母细胞器隔离技术	NA	NA	NA