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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4141 | 2024-08-13 |
Strategies in engineering sustainable biochemical synthesis through microbial systems
2024-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102493
PMID:38971129
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综述 | 本文综述了利用微生物系统进行可持续生物化学合成的策略 | 结合系统生物学和合成生物学,以及将人工智能与代谢工程整合,以精确和数据驱动的方式设计生物合成途径 | 讨论了当前的限制并提出了优化生物系统的策略 | 开发可持续替代品以替代化石燃料和化学品,并推动绿色生物技术的发展 | 微生物系统的生物合成能力 | 生物技术 | NA | 代谢工程 | 人工智能 | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4142 | 2024-08-13 |
Biosynthesis and recruitment of reactive amino acids in nonribosomal peptide assembly lines
2024-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102494
PMID:38936328
|
研究论文 | 本文探讨了非核糖体肽装配线上反应性氨基酸侧链的生物合成及其招募机制 | 本文揭示了多种反应性氨基酸在非核糖体肽中的生物合成途径及其在药物开发中的应用潜力 | NA | 研究反应性氨基酸在非核糖体肽合成中的作用及其在制药领域的应用 | 反应性氨基酸及其在非核糖体肽中的生物合成和功能 | 生物化学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4143 | 2024-08-13 |
AI-Assisted Rational Design and Activity Prediction of Biological Elements for Optimizing Transcription-Factor-Based Biosensors
2024-Jul-26, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29153512
PMID:39124917
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综述 | 本文综述了人工智能算法在合成生物学中生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器响应性能调控中的应用 | 探讨了人工智能算法在分析生物数据中的强大潜力,并提出了针对该领域挑战的创新解决方案 | NA | 探索人工智能在合成生物学中的应用,以推动学术研究和生物技术的实际应用 | 生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器的调控 | 合成生物学 | NA | 机器学习、深度学习 | AI算法 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4144 | 2024-08-13 |
Proton gradients from light-harvesting E. coli control DNA assemblies for synthetic cells
2021-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24103-x
PMID:34172734
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研究论文 | 本文通过基因工程改造大肠杆菌,使其过量表达光驱动的向内质子泵,并将其封装在人工细胞大小的隔室中,利用光暗循环实现pH值的可逆调节,进而触发DNA结构与隔室边缘的附着 | 本文创新地将自下而上和自上而下的合成生物学方法结合,利用光驱动质子泵实现对合成细胞系统的控制 | NA | 实现光转化为质子梯度,用于驱动合成细胞系统的动作 | 大肠杆菌、人工细胞大小的隔室、DNA结构 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 生物分子 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4145 | 2024-08-13 |
Refactoring biosynthetic gene clusters for heterologous production of microbial natural products
2021-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.12.011
PMID:33476936
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综述 | 本文综述了微生物天然产物异源生产的最新进展,重点介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主 | 介绍了下一代转录调控模块、新型BGC重构技术和优化的异源宿主,为微生物天然产物的发现、产量优化和组合生物合成研究提供了新的合成生物学方法 | NA | 总结微生物天然产物异源生产的最新进展 | 微生物天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | BGC重构技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4146 | 2024-08-12 |
Functional modification of gut bacteria for disease diagnosis and treatment
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.06.003
PMID:38964334
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研究论文 | 本文讨论了通过功能性修饰肠道细菌用于疾病诊断和治疗的方法,包括包装材料、生物医学应用及未来发展 | 利用合成生物学和光遗传学技术改进细菌的定殖和控制释放,将肠道细菌转化为药物化学合成的细胞工厂 | 口服使用肠道细菌治疗受限于胃液的高酸性和免疫系统对外来细菌的攻击 | 探索通过功能性修饰肠道细菌以实现疾病诊断和治疗的新方法 | 肠道细菌及其在疾病治疗中的应用 | NA | NA | 合成生物学、光遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4147 | 2024-08-12 |
Plant synthetic biology as a tool to help eliminate hidden hunger
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103168
PMID:38964080
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术提高植物营养成分以对抗因缺乏负担得起的健康食品而导致的隐性饥饿的最新生物技术方法 | 介绍了在植物中生产通常在动物性饮食中发现的化合物,如维生素D或Omega-3脂肪酸的最新进展 | NA | 探讨利用合成生物学技术改善植物营养成分,以解决因食品不足导致的隐性饥饿问题 | 植物营养成分的改善,特别是维生素、矿物质和其他代谢物的增加 | 合成生物学 | 营养不良相关疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4148 | 2024-08-12 |
Engineering plant-microbe communication for plant nutrient use efficiency
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103150
PMID:38810302
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研究论文 | 研究通过工程化植物与微生物之间的交流,提高植物对养分的利用效率 | 利用植物工程和合成生物技术,开发能够通过根分泌物选择性富集有益微生物的植物,以及能够改善植物养分可用性和吸收的微生物 | NA | 通过工程化植物与微生物的交流,优化植物对养分的利用效率 | 植物与根际微生物的交流 | NA | NA | 植物工程和合成生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4149 | 2024-08-11 |
Insights into the synthesis, engineering, and functions of microbial pigments in Deinococcus bacteria
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1447785
PMID:39119139
|
综述 | 本文综述了Deinococcus细菌中微生物色素的合成、工程化及其功能 | 探讨了通过代谢工程和合成生物学提高色素产量和扩展其应用前景的策略 | NA | 探讨微生物色素的生产优化及其在多个领域的应用前景 | Deinococcus细菌中的微生物色素及其相关酶和基因 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4150 | 2024-08-11 |
Some remarks on the argument appealing to nature against synthetic biology
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1428832
PMID:39119275
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评论 | 本文主要分析了以自然为名反对合成生物学的论点,并通过展示自然概念的模糊性、否认自然与非自然之间道德上显著的界限,以及反驳该论点对合成生物学的指控,提出了反驳 | 本文通过分析自然概念的模糊性和否认自然与非自然之间的道德界限,提出了对以自然为名反对合成生物学论点的反驳 | NA | 分析并反驳以自然为名反对合成生物学的论点 | 合成生物学及其相关论点 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4151 | 2024-08-10 |
Biomedical engineering utilizing living photosynthetic cyanobacteria and microalgae: Current status and future prospects
2024-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101154
PMID:39113912
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综述 | 本文综述了利用光合蓝细菌和微藻进行生物医学工程的现状与未来展望 | 探讨了合成生物技术在利用活体/工程蓝细菌进行生物医学应用中的潜力 | NA | 旨在讨论基于蓝细菌的生物医学工程的现状与未来展望 | 蓝细菌及其在生物医学应用中的特性 | 生物医学工程 | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4152 | 2024-08-10 |
A synthetic microbial consortium protects against obesity by regulating vitamin B6 metabolism
2024 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2024.2304901
PMID:38269591
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研究论文 | 本文通过构建合成微生物群落,研究其对肥胖的保护作用及对维生素B6代谢的调控 | 利用微流控技术分离出能利用工程菌BsS-RS06551代谢物的细菌,并发现其与JJ3菌株的共培养能显著缓解肥胖及相关疾病 | NA | 探索合成微生物群落在肥胖治疗中的应用 | 合成微生物群落、肥胖及相关疾病 | 合成生物学 | 肥胖 | 微流控技术 | NA | 微生物数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 4153 | 2024-08-10 |
Quasi-robust control of biochemical reaction networks via stochastic morphing
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0985
PMID:33849334
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研究论文 | 本文提出了一种通过随机变形控制生物化学反应网络的准鲁棒控制器 | 该控制器能够在适当的时标分离下,将目标分子种类的概率分布变形为预定义的形式,实现多模态或多稳定性 | NA | 开发分子控制器,以操纵最多部分已知的生物化学网络的动力学 | 生物化学反应网络的控制 | 合成生物学 | NA | 随机变形控制 | NA | 概率分布 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4154 | 2024-08-10 |
Metabolic buffer analysis reveals the simultaneous, independent control of ATP and adenylate energy ratios
2021-04, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2020.0976
PMID:33906384
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研究论文 | 本文通过控制理论和新型缓冲分析研究了能量代谢中的缓冲作用 | 发现缓冲作用可以实现多个耦合输出的同时独立控制,并通过腺苷酸激酶和AMP脱氨酶在代谢中实现ATP和腺苷酸能量比的同时控制 | NA | 揭示生物调节的基本原理,理解生命原理,治疗复杂疾病,创造合成生物学 | 能量代谢中的缓冲作用及其在分子生物学中的协同作用 | 生物学 | NA | 控制理论,缓冲分析 | NA | 数据 | 人类肌肉和老鼠脂肪细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 4155 | 2024-08-10 |
If you eat it, or secrete it, they will grow: the expanding list of nutrients utilized by human gut bacteria
2020-Nov-09, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/JB.00481-20
PMID:33168637
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综述 | 本文综述了人类肠道细菌如何适应并利用来自宿主、饮食和细菌来源的碳水化合物营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 强调了先前未被充分研究的底物如单糖、核苷和美拉德反应产物对肠道微生物群的影响,并介绍了合成生物学领域在设计新型饮食控制营养利用途径方面的进展。 | NA | 探讨人类肠道细菌如何适应并利用不同来源的营养素,以及这些营养素对肠道微生物群的影响。 | 人类肠道细菌及其对不同营养素的利用机制。 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4156 | 2024-08-09 |
Bacteria-Based Cancer Immunotherapy
2021-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202003572
PMID:33854892
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research paper | 本文综述了基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展,重点介绍了天然细菌、工程细菌和细菌成分在癌症免疫疗法中的应用 | 利用合成生物学和基因技术使细菌成为高效的免疫治疗剂生产者,以及细菌与纳米材料的结合为癌症免疫疗法提供了多功能性 | NA | 探讨基于细菌的癌症免疫疗法的最新进展及其未来研究方向 | 基于细菌的癌症免疫疗法 | NA | 癌症 | 基因技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4157 | 2024-08-09 |
Engineering precision therapies: lessons and motivations from the clinic
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaa024
PMID:33817342
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综述 | 本文讨论了过去十年中基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并回顾了有望增强现有治疗策略或为新精准药物铺路的临床前研究 | NA | NA | 探讨基因和细胞疗法的核心技术和治疗策略,并评估其临床应用潜力 | 基因和细胞疗法的技术与策略 | 生物医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4158 | 2024-08-09 |
Redefining fundamental concepts of transcription initiation in bacteria
2020-11, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-0254-8
PMID:32665585
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研究论文 | 本文重新定义了细菌转录起始的基本概念,以支持一个逻辑一致的细菌基因调控概念框架 | 提出了精确、更新的定义,这些概念可以通过本体论进行形式化,为改进的生物信息学工具、知识基础资源和科学交流奠定基础 | NA | 重新定义细菌转录起始的基本概念,以支持一个逻辑一致的细菌基因调控概念框架 | 细菌基因调控的基本概念 | 基因学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4159 | 2024-08-08 |
A multiplexed, automated evolution pipeline enables scalable discovery and characterization of biosensors
2021-03-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21716-0
PMID:33664255
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DRIVER的多重自动化进化流程,用于大规模发现和表征生物传感器 | 使用aptamer-coupled ribozyme库和ribozyme再生方法,实现了RNA生物传感器的快速体外从头进化,并成功应用于小分子检测和基因表达调控 | NA | 开发一种可扩展的流程,用于从头设计和表征生物传感器,应用于生物制造、诊断、治疗和合成生物学 | 生物传感器及其在活细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | DRIVER和CleaveSeq | NA | RNA | 六种小分子,包括五种之前未发现适配体的小分子 | NA | NA | NA | NA |
| 4160 | 2024-08-07 |
Splittable systems in biomedical applications
2024-Aug-06, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d4bm00709c
PMID:39012216
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综述 | 本文综述了可分割系统在生物医学应用中的设计原则、策略和应用 | 介绍了通过融合其他模式引入的几种结合对和正交分割片段,以开发更复杂和稳健的设计 | 文章提到了面临的挑战,如脱靶效应和过度激活,但未详细说明具体的解决方法 | 探讨可分割系统在生物医学领域的应用 | 可分割系统的设计和其在不同生物医学领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |