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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-01-29 |
Advances in microbial biosynthesis of indirubin
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.004
PMID:41584701
|
综述 | 本文系统总结了靛玉红的生物合成机制、关键酶催化特性、工程菌构建策略及发酵条件进展,并提出潜在解决方案以促进其绿色生物制造 | 基于合成生物学和代谢工程的微生物合成技术为靛玉红高效生产提供了新途径,具有高效、环境可持续和生态友好等优势 | 靛玉红异构体分离困难、副产物抑制及工业化瓶颈等挑战仍需解决 | 促进靛玉红的绿色生物制造,以克服植物提取和化学合成方法的局限性 | 靛玉红(IND)这种具有显著药理活性的双吲哚生物碱 | 合成生物学 | 白血病 | 微生物合成技术、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 工程菌 | NA | 医药 |
| 402 | 2026-01-29 |
A review of Siraitia grosvenorii: Applications, breeding, and biosynthesis of mogrosides
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.005
PMID:41584700
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综述 | 本文系统综述了罗汉果的应用、育种以及罗汉果甜苷的生物合成研究进展 | 提出通过分子设计育种和构建三种合成生物学平台来提高罗汉果甜苷V含量的策略,以解决其应用受限的问题 | NA | 探讨罗汉果的应用、育种及罗汉果甜苷的生物合成,旨在提高其活性成分产量并扩大商业应用 | 罗汉果及其主要活性成分罗汉果甜苷 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品 |
| 403 | 2026-01-29 |
Genome-wide identification and characterization of methyltransferase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis from Menispermum dauricum
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.007
PMID:41584705
|
研究论文 | 本研究通过全基因组鉴定和生化分析,揭示了北豆根中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的甲基转移酶的功能与特异性 | 首次系统鉴定了北豆根基因组中的甲基转移酶,并发现了四种关键酶(三种OMTs和一种NMT)在BIA结构多样化中的特异性作用 | 研究主要基于体外酶学实验,体内功能验证和调控机制尚未深入探讨 | 系统鉴定和表征北豆根中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的甲基转移酶,明确其在BIA生物合成中的功能 | 北豆根(Menispermum dauricum)中的甲基转移酶基因及其编码的酶蛋白 | 植物代谢工程 | NA | 全基因组鉴定、体外酶学测定、蛋白质建模、分子对接 | NA | 基因组数据、酶学活性数据 | 75个甲基转移酶基因 | NA | NA | NA | 合成生物学、医药生物技术 |
| 404 | 2026-01-29 |
Herbgenomics: Unraveling natural product biosynthesis in traditional Chinese medicine
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.008
PMID:41584702
|
综述 | 本文介绍了Herbgenomics这一新兴学科,旨在通过基因组学策略解析传统中药中天然产物的生物合成途径 | 整合基因组学驱动策略(如生物合成基因簇挖掘、共表达分析和转录组-代谢组联合分析),系统识别关键生物合成酶并揭示代谢创新的进化机制 | NA | 探索和工程化传统中药中天然产物的生物合成,以可持续方式发现和生产生物活性化合物 | 传统中药中的生物活性成分及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 405 | 2026-01-29 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本研究开发了一种双诱导转录调控系统,通过时序控制气囊蛋白的组装因子和外壳蛋白的表达,以解决异源表达气囊时引起的细胞生长抑制和裂解问题 | 首次观察到气囊诱导后8-16小时细胞密度下降的现象,并设计了时序诱导策略,在维持气囊产量的同时恢复了细菌正常生长 | 研究仅在大肠杆菌中进行验证,未在其他宿主中测试该调控系统的普适性 | 优化气囊在非天然宿主中的异源表达,减少其对细胞生长的负面影响 | 气囊蛋白的组装过程及其对宿主细胞的影响 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统、时序诱导策略 | NA | NA | NA | 双诱导转录调控系统 | 大肠杆菌 | 时序调控的基因回路,通过正交控制组装因子蛋白和外壳蛋白的表达时序与化学计量比 | 生物医学工程、合成生物学 |
| 406 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
|
综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群相互作用的研究进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等多组学视角,系统阐述了β细胞异质性、肠道微生物群调控机制及其交汇点作为潜在治疗靶点的创新框架 | 作为综述文章,主要基于现有文献进行整合分析,未提供新的原始实验数据 | 理解2型糖尿病中β细胞功能衰退的分子机制及肠道微生物群的调控作用,探索精准治疗策略 | 胰腺β细胞、肠道微生物群、胰岛内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间基因表达数据 | NA | 合成生物学方法、基因工程 | 基因工程益生菌菌株 | 用于递送生物活性分子(如GLP-1)的工程化益生菌系统 | 医学 |
| 407 | 2026-01-29 |
Pyrite as a catalyst for the emergence of multiphase primitive cells
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1747422
PMID:41586365
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于凝聚层的原始细胞模型,利用天然黄铁矿的催化活性诱导单相液滴向多相液滴转变,模拟了生命细胞的层次结构和功能 | 首次利用天然矿物的类过氧化物酶催化活性构建具有内部相分离结构的多相原始细胞,实现了寡核苷酸在亚区室中的选择性分配 | 研究在模拟前生命条件下进行,尚未验证在更复杂环境或与生物分子网络整合时的稳定性与功能性 | 探索非生命化学系统向生命系统过渡的机制,构建具有层次结构和类生命功能的原始细胞模型 | 基于单链寡核苷酸、季铵化葡聚糖和TMB的凝聚层液滴系统,以及天然黄铁矿催化剂 | 合成生物学 | NA | 凝聚层自组装、类酶催化反应 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于黄铁矿催化TMB氧化驱动的相分离结构,形成具有内部TMBox/ss-oligo相和外部Q-dextran/ss-oligo相的多区室系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 408 | 2026-01-28 |
Melatonin-enabled omics: understanding plant responses to single and combined abiotic stresses for climate-smart agriculture
2026-Dec, GM crops & food
DOI:10.1080/21645698.2026.2614130
PMID:41589633
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综述 | 本文综述了褪黑素(MLT)通过调控多组学层面(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学和微生物组学)来增强植物对单一及复合非生物胁迫耐受性的机制 | 系统性地整合了褪黑素介导的多组学响应网络,并强调了利用整合多组学(泛组学)方法解析复杂调控网络,以及通过先进基因工程和合成生物学平台将组学见解转化为可操作策略的前瞻性方向 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳与展望 | 阐明褪黑素如何通过调控多组学层面帮助植物适应非生物胁迫,以推动气候智能型农业发展 | 植物(作物)在单一及复合非生物胁迫下的生理、生化和分子响应 | 农业生物技术 | NA | 多组学分析(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学) | NA | 多组学数据 | NA | 基因工程,合成生物学平台 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 409 | 2026-01-28 |
A comparative review of vector insertion techniques in Saccharomyces cerevisiae
2026-Feb, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107378
PMID:41435996
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综述 | 本文比较了酿酒酵母中三种主要的载体插入技术:体内同源重组、Cre-lox重组和CRISPR/Cas9 | 对酿酒酵母中三种主流载体插入技术进行了系统性的比较分析,突出了各自在基因组工程和合成生物学中的应用与特点 | 未涉及其他新兴或较少使用的载体插入技术,且主要基于现有文献综述,缺乏新的实验数据验证 | 比较和评估酿酒酵母中不同载体插入技术的应用、优势与局限性 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 体内同源重组、Cre-lox重组、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cre-lox | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 工业生物技术 |
| 410 | 2026-01-28 |
Classification, catalytic mechanisms, and functional characterization of non-heme diiron oxygenases: A review
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150277
PMID:41544786
|
综述 | 本文综述了非血红素双铁加氧酶(NDOs)的分类、催化机制及其功能表征,并探讨了其在合成生物学和可持续生物制造中的应用前景 | 整合了结构生物学、光谱学、计算模型和动力学分析的最新进展,为NDOs的家族分类、催化循环和底物结合策略提供了系统的概念框架 | NA | 为非血红素双铁加氧酶的未来机理研究和蛋白质工程提供指导 | 非血红素双铁加氧酶(NDOs) | NA | NA | 结构生物学、光谱学、计算建模、动力学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、可持续生物制造 |
| 411 | 2026-01-28 |
In Situ Synthesis of Glycosaminoglycan-Mimicking Coatings Driven by Local Pathological Microenvironment: Boosting Bladder Mucosal Regeneration and Barrier Function
2026-Jan-27, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202505017
PMID:41589795
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研究论文 | 本文提出了一种利用内源性微环境触发器在膀胱内原位合成糖胺聚糖仿生涂层的方法,以促进膀胱黏膜再生和屏障功能恢复 | 创新点在于开发了一种基于内源性酶驱动的原位自组装系统,结合了抗黏膜冲洗的持久保留和微环境调节功能,模拟了糖胺聚糖的阴离子和屏障特性 | NA | 研究目的是开发一种用于膀胱黏膜修复的生物响应性治疗平台,通过模拟糖胺聚糖功能来增强屏障完整性和减轻炎症 | 研究对象包括大鼠模型中的环磷酰胺诱导的间质性膀胱炎,以及藻酸盐寡糖共轭聚多巴胺涂层 | 合成生物学 | 间质性膀胱炎 | 原位合成策略,利用过氧化氢酶和过氧化氢驱动聚合 | NA | 组织学和分子分析数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 412 | 2026-01-28 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Jan-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
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评论 | 本文讨论了微生物菌株KT2440的分类学重命名问题及其对科学界的影响 | 从科学实践与社区共识的角度批判性地分析微生物分类学重命名的决策过程,强调历史连续性与实用性的重要性 | 主要基于单一菌株的案例讨论,未提出系统性的分类学命名改革方案 | 探讨微生物分类学命名决策如何平衡科学严谨性与社区实践需求 | 假单胞菌菌株KT2440及其分类学身份争议 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | Pseudomonas putida KT2440 | NA | 环境微生物学, 生物技术, 合成生物学 |
| 413 | 2026-01-28 |
Advances in artificial cells capable of metabolic mimicry: from fundamentals to applications
2026-Jan-27, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01330e
PMID:41591296
|
综述 | 本文全面综述了能够模拟代谢的人工细胞的研究进展,从其基本原理到应用领域 | 系统总结了基于物理特性的各类人工细胞在代谢模拟方面的优势与局限,并重点介绍了能量生成、合成代谢与分解代谢路径构建的新策略及其在生物传感和疾病诊断中的新兴应用 | NA | 为人工代谢系统的设计和部署提供有价值的见解,并推动下一代合成生物学工具的发展 | 能够模拟代谢的人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢途径重建,包括能量生成(如细胞器封装、光合磷酸化、纳米材料辅助ATP合成)、合成代谢(如碳固定、脂质生物合成、蛋白质表达)和分解代谢(碳氮代谢) | 生物传感, 疾病诊断 |
| 414 | 2026-01-28 |
Probiotic and Microbial Enzymatic Mechanisms for PFAS Detoxification
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10921-2
PMID:41591586
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综述 | 本文综述了微生物和益生菌对PFAS进行生物修复的当前进展,重点探讨了酶促机制、微生物途径以及与常规处理系统的整合 | 系统性地整合了微生物(包括益生菌)对PFAS的吸附、转化和脱氟机制,并探讨了合成生物学在工程化增强PFAS降解能力方面的最新进展 | 当前微生物途径主要通过部分转化而非完全矿化作用,常积累稳定的氟化中间体;真正的矿化受限于酶效率低、底物特异性窄以及实验室成果难以转化到复杂环境基质中 | 评估微生物和工程化益生菌方法对PFAS进行生物修复的可行性,并指出知识空白和未来发展方向 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS) | NA | NA | 微生物生物修复、酶学研究、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌、真菌、蓝细菌、肠道微生物群、益生菌菌株 | 具有增强PFAS摄取和降解能力的工程化微生物系统 | 环境 |
| 415 | 2026-01-28 |
A Microbial Odyssey: Reshaping Probiotic Destinies through Advanced Delivery Technologies
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10926-x
PMID:41591587
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综述 | 本文系统总结了益生菌递送技术的最新进展,包括多种工程策略和材料平台,并批判性地探讨了临床转化中的关键挑战 | 全面整合了靶向递送系统、基因工程益生菌、微胶囊技术和纳米载体平台等先进递送策略,并引入了智能响应系统、仿生技术和合成生物学等跨学科方法以实现精确释放和持续定植 | 临床转化面临配方稳定性、个体间差异、监管不一致性和长期安全性等关键挑战 | 优化和高质量开发益生菌递送系统,为下一代益生菌生物疗法的合理设计提供前瞻性框架 | 益生菌及其递送技术 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病和神经精神疾病 | 基因工程、表面修饰、微胶囊技术、纳米载体平台 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 416 | 2026-01-28 |
Molecular gatekeepers: eukaryotic translation factors decoding plant-virus dynamics for resistance engineering
2026-Jan-27, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00273-2
PMID:41591594
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综述 | 本文综述了植物病毒如何利用宿主真核翻译因子(eTFs)完成其生命周期,并探讨了通过靶向操纵这些因子来工程化植物抗病性的策略 | 提出了一个以eTF为中心的抗性育种框架,整合了分子生物学与应用策略,为开发广谱、持久且环境可持续的植物抗病毒方案提供了新视角 | NA | 阐明真核翻译因子在植物-病毒互作中的机制作用,并探索通过调控这些因子来增强植物抗病毒能力的策略 | 植物病毒、宿主真核翻译因子(如eIF4E, eIF(iso)4E, eIF4G, eEF1A, eEF1B) | 合成生物学 | 植物病毒病 | 自然等位基因挖掘、诱导诱变、TILLING/EcoTILLING、RNA干扰、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物 | NA | 农业 |
| 417 | 2026-01-28 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 本文综述了微生物黑色素在生物合成途径、生产优化策略、挑战及潜在应用方面的最新进展 | 重点强调了组学技术和基因工程在阐明生物合成机制和提高产量方面的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和全面安全评估的未来研究方向 | NA | 为微生物黑色素这一快速发展的领域提供全面且具有批判性的参考 | 微生物黑色素(由多种细菌和真菌产生的天然色素) | NA | NA | 组学技术、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌 | NA | 生物技术 |
| 418 | 2026-01-28 |
Amodiaquine Enhances Anti-Melanoma Efficacy of Attenuated Salmonella via Targeting Glutathione Reductase in Neutrophils
2026-Jan-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515009
PMID:41588921
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研究论文 | 本研究探讨了阿莫地喹通过靶向中性粒细胞中的谷胱甘肽还原酶,增强减毒沙门氏菌抗黑色素瘤疗效的机制 | 首次揭示了减毒沙门氏菌VNP20009在肿瘤微环境中招募的主要是N2型中性粒细胞,并发现阿莫地喹能通过靶向谷胱甘肽还原酶选择性消除这些细胞,从而增强抗肿瘤效果 | NA | 增强减毒沙门氏菌在癌症治疗中的抗肿瘤疗效,并探索中性粒细胞在其中的作用 | 黑色素瘤、减毒沙门氏菌VNP20009、中性粒细胞 | NA | 黑色素瘤 | 化学生物学方法、shRNA负载工程 | NA | NA | NA | shRNA负载工程 | 减毒沙门氏菌VNP20009 | 负载GR-shRNA的工程菌株,用于靶向谷胱甘肽还原酶 | 医学 |
| 419 | 2026-01-28 |
An Optimization Scheme Based on the Simulated Annealing Algorithm for In situ DNA Microarray Synthesis
2026-Jan-21, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究将DNA微阵列原位合成建模为旅行商问题,并开发基于模拟退火算法的优化策略以提高合成效率 | 首次将DNA微阵列合成顺序优化问题转化为旅行商问题,并应用模拟退火算法显著减少合成周期 | 研究主要基于计算模拟,未涉及实际实验验证优化策略的物理合成效果 | 优化DNA微阵列原位合成的核苷酸添加顺序以提高效率和降低成本 | DNA微阵列合成过程 | 合成生物学 | NA | DNA微阵列合成 | 模拟退火算法、贪婪算法 | 序列数据 | 从10×10 nt到10000×120 nt的不同规模阵列 | NA | NA | NA | 基因编辑、药物开发、DNA数据存储 |
| 420 | 2026-01-28 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
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综述 | 本文综述了基于酵母的生物传感器在啤酒、葡萄酒和康普茶等发酵饮料安全与质量保障方面的开发与应用 | 利用合成生物学工具开发基因工程酵母菌株,通过荧光、颜色变化或电信号等报告系统实时检测重金属、霉菌毒素等污染物,为发酵饮料安全监控提供快速、低成本的新方法 | 目前主要局限于实验室规模研究,在鲁棒性、可扩展性和监管整合方面仍需进一步研究以实现广泛的工业应用 | 开发用于发酵饮料安全监控的生物传感器技术,以生产更安全、更高质量的产品 | 基因工程酵母菌株及其在发酵饮料(啤酒、葡萄酒、康普茶)安全检测中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、基因工程 | NA | 生物传感器信号(荧光、颜色、电信号) | NA | NA | 酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 生物传感器电路(包含感应元件和报告系统,如荧光蛋白、显色酶等) | 食品、工业生物技术 |