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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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401 | 2025-05-19 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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research paper | 介绍了一个包含6144个短合成启动子的库,用于在哺乳动物细胞中大规模并行报告分析 | 设计了一个短于250bp的合成启动子库,能够精确检测和放大转录活性,适用于多种细胞系和刺激 | 未提及具体的技术限制或样本量的局限性 | 开发可调谐的报告基因,用于药物开发、合成生物学和生命科学研究 | 哺乳动物细胞中的合成启动子 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子 |
402 | 2025-05-18 |
Dynamic Analysis and Robust Strategy for the Delayed Paradoxical Cell Population Control Circuit
2025-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2025.3556585
PMID:40198292
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研究论文 | 本文提出了一种通过分析延迟悖论细胞群体控制电路中的双稳态切换和振荡行为来实现稳健群体控制的策略 | 揭示了两种双稳态切换机制,并提出通过调节初始细胞群体密度和blasticidin浓度来实现稳健控制的新策略 | NA | 研究延迟悖论细胞群体控制电路的动态特性并开发稳健的控制策略 | 合成悖论控制电路中的细胞群体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
403 | 2025-05-18 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
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研究论文 | 本研究探讨了通过生物催化聚合诱导自组装(bioPISA)制备的囊泡作为人工细胞的形成和性质 | 探索了实现囊泡尺寸均匀性的方法,并研究了搅拌速度对囊泡形态的影响,同时展示了将大分子加载到预形成囊泡中的可行性 | NA | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡,用于合成生物学等应用 | 通过bioPISA制备的囊泡 | 合成生物学 | NA | 生物催化聚合诱导自组装(bioPISA)、荧光相关光谱(FCS)、电穿孔 | NA | NA | NA |
404 | 2025-05-18 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
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研究论文 | 研究利用透明质酸微凝胶作为实验平台,探索无细胞蛋白质合成(CFPS)与微凝胶内蛋白质原位积累的相互作用 | 首次提出利用双功能微凝胶平台研究蛋白质合成的时间-空间调控,通过定制蛋白质结合或释放来调控反应环境 | 研究仍处于初步阶段,尚未展示该平台在复杂生物系统中的应用效果 | 开发一种用于研究蛋白质合成时空调控的实验平台 | 透明质酸微凝胶及其修饰后的蛋白质结合能力 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS),线性DNA模板技术 | NA | 实验数据 | NA |
405 | 2025-05-18 |
Distinct Network Morphologies from In Situ Polymerization of Microtubules in Giant Polymer-Lipid Hybrid Vesicles
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400601
PMID:40071650
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research paper | 研究展示了在巨型聚合物-脂质杂化囊泡中原位聚合微管,模拟活细胞中的动态细胞骨架 | 首次在由特定两亲性嵌段共聚物和脂质组成的杂化囊泡中实现微管原位聚合,并观察到不同形态的微管网络 | 未探讨不同膜组成对微管形态影响的具体分子机制 | 模拟活细胞中的动态细胞骨架,探索膜组成对微管形态的影响 | 巨型聚合物-脂质杂化囊泡和微管 | 合成生物学 | NA | 原位聚合技术 | NA | 显微镜图像 | NA |
406 | 2025-05-18 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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研究论文 | 本研究开发了一种自动化方法,用于大规模生产蛋白质合成细胞(SCs),以应用于治疗领域 | 结合机器人液体处理系统和AI图像分析,实现了SCs的大规模自动化生产和质量控制 | 研究主要关注蛋白质表达SCs,可能不适用于其他类型SCs的生产 | 提高合成细胞的生产效率和质量控制,以促进其治疗应用 | 蛋白质合成细胞(SCs) | 合成生物学 | NA | 机器人液体处理系统(LiHa)、AI图像分析 | AI | 图像 | 小鼠实验 |
407 | 2025-05-18 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
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研究论文 | 该研究展示了如何将紧凑型V-K CAST系统重新用于人类细胞基因组中的可编程DNA整合 | 利用来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST系统,实现了人类细胞基因组中治疗相关转基因的安全整合 | 脱靶事件虽罕见但可重复出现在特定基因组区域 | 开发一种无需双链断裂即可实现大片段DNA可编程整合的基因组编辑工具 | 人类细胞基因组 | 基因组编辑 | NA | CRISPR-associated (Cas) transposases (CAST) | type V-K CAST | DNA序列数据 | 多种人类细胞类型 |
408 | 2025-05-17 |
Plant synthetic biology-based biofortification, strategies and recent progresses
2025-May-16, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13934
PMID:40376763
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综述 | 本文概述了基于植物合成生物学的生物强化策略及其最新进展 | 提出了五种合成生物学核心策略,并展示了中国研究团队的最新突破 | NA | 解决全球微量营养素缺乏问题 | 植物组织中的营养素水平 | 合成生物学 | 微量营养素缺乏症 | NA | NA | NA | NA |
409 | 2025-05-17 |
Boosting microalgae-based carbon sequestration with the artificial CO2 concentration system
2025-May-15, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2498464
PMID:40374568
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综述 | 本文综述了微藻为基础的人工CO2封存技术现状,重点讨论了CO2抗性物种的选择、培养优化、碳浓缩反应器设计以及合成生物学在提高CO2溶解度和生物固定效率方面的潜力 | 综合讨论了微藻固碳技术的光反应与暗反应优化,并引入合成生物学方法提升效率 | 未涉及具体实验数据验证技术改进效果 | 优化微藻生物固碳技术以应对全球变暖挑战 | 微藻固碳技术体系 | 环境生物技术 | NA | 生命周期评估(LCA)、技术经济分析(TEA) | NA | 文献数据 | NA |
410 | 2025-05-17 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
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研究论文 | 本文报道了蓝藻噬菌体A4的完整结构,揭示了其双稳定衣壳中的五聚体预喷射体结构 | 发现了由四种喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构,并提出了噬菌体的DNA包装和喷射机制 | NA | 研究蓝藻噬菌体A4的结构及其DNA包装和喷射机制 | 蓝藻噬菌体A4 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(Cryo-EM) | NA | 结构数据 | NA |
411 | 2025-05-17 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
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研究论文 | 开发了一种基于M13噬菌体的细菌间DNA传递系统,用于研究细菌间的协作响应机制 | 利用M13噬菌体构建了动态噬菌粒补充系统,实现了在无抗生素选择压力环境下维持噬菌粒DNA的稳定性,为多细菌联合调控提供了新方法 | NA | 开发细菌间DNA传递系统,研究细菌协作响应机制 | 工程化细菌 | 合成生物学 | NA | 噬菌体介导的DNA传递 | NA | DNA | NA |
412 | 2025-05-17 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
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研究论文 | 本文开发了一种能够持续再生20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)的重构系统,为自复制人工系统的实现提供了重要进展 | 通过五种改进方法实现了20种AARS的可持续再生,包括序列优化、翻译系统组成优化、使用不同细菌的AlaRS和SerRS、减少翻译抑制以及平衡DNA浓度 | NA | 实现自复制人工系统的体外构建 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS) | 合成生物学 | NA | 体外重构系统 | NA | NA | NA |
413 | 2025-05-17 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
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研究论文 | 本研究通过将人类m6Am甲基转移酶PCIF1引入酿酒酵母,显著提高了萜类化合物的生物合成效率 | 首次发现PCIF1能显著促进酿酒酵母中角鲨烯和长叶烯的生物合成,并揭示了其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径相关基因以及激活细胞壁完整性MAPK途径的机制 | 研究仅针对PCIF1在酿酒酵母中的作用,未在其他微生物系统中验证其普适性 | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和萜类化合物(角鲨烯和长叶烯) | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 工程化酵母菌株 |
414 | 2025-05-17 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域的发展方向、挑战及新兴技术方法 | 未提及具体的技术实现细节或实验验证 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术整合 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
415 | 2025-05-17 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文总结了生物制造中使用的各种核酸元件、基于AI算法开发的预测和设计这些元件的工具,以及AI在生物制造中的应用案例 | 通过整合AI与合成生物学及高通量技术,展望开发更高效的核酸元件设计工具,加速AI在生物制造中的应用 | 由于生物系统的复杂性和缺乏高度量化的训练数据,AI在生物制造中的应用仍有限 | 探讨AI在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用 | 核酸元件(如启动子、核糖体结合位点、终止子等) | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |
416 | 2025-05-17 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
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review | 本文综述了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 利用AI技术(特别是机器学习)分析高通量测序数据,优化sgRNA设计,提高编辑效率并准确预测脱靶效应 | NA | 探讨人工智能在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用及其对基因编辑效率和精度的提升 | CRISPR-Cas系统及其相关蛋白 | synthetic biology | NA | high-throughput sequencing | machine learning | sequencing data | NA |
417 | 2025-05-17 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
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综述 | 本文回顾了机器学习在合成生物学部件和遗传电路设计中的常用算法及其典型应用,并讨论了主要挑战和潜在解决方案 | 探讨了机器学习如何从经验驱动的试错模式转向标准化、智能化的工程方法,以支持合成生物学部件和遗传电路的智能设计 | 未具体说明机器学习算法在复杂遗传电路设计中的实际效果和局限性 | 推动合成生物学从传统试错方法向智能化工程设计转变 | 合成生物学部件(如合成启动子、RNA调控元件和转录因子)和简单遗传电路 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 生物数据 | NA |
418 | 2025-05-17 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
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review | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型的最新研究进展,包括基因组尺度代谢模型(GEMs)、动力学模型和酶约束基因组尺度代谢模型(ecGEMs) | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用,为细胞生理代谢网络模型的高精度构建提供了新机遇 | NA | 系统阐明基因型与生长表型之间的关系,为精确表征细胞生理代谢活动和绿色生物制造提供计算生物学工具 | 细胞生理代谢网络模型 | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型(GEMs)、动力学模型、酶约束基因组尺度代谢模型(ecGEMs) | NA | NA | NA |
419 | 2025-05-17 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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综述 | 本文全面总结了在计算模拟和人工智能辅助下,基于转录因子的生物传感器的工程和优化最新进展 | 利用计算模拟和人工智能技术,提高了生物传感器设计的准确性和速度 | NA | 优化基于转录因子的生物传感器性能 | 转录因子(TF) | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
420 | 2025-05-17 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的优化,重点探讨了在线监测技术、人工智能优化策略和数字孪生应用的最新进展 | 整合了在线监测技术、AI驱动的动态优化和数字孪生技术,为发酵过程的实时优化和规模化提供了新范式 | 未提及具体实施案例或实验验证结果 | 实现发酵过程的精确优化和高效规模化 | 发酵过程的实时传感与智能控制 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、机器学习(如人工神经网络和支持向量机)、遗传算法 | 数字孪生、多尺度模型(如细胞代谢动力学和反应器流体力学) | 实时传感数据 | NA |