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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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421 | 2025-04-05 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
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研究论文 | 研究开发了一种能够持续再生20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)的重构系统,为自复制人工系统的实现提供了重要进展 | 通过五种改进方法(序列优化、翻译系统组成优化、特定AARS替换、翻译抑制消除及DNA浓度平衡),实现了20种AARS的可持续再生 | 研究未涉及该重构系统在更复杂环境中的应用效果 | 推动自复制人工系统的实现 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS) | 合成生物学 | NA | 体外重构系统 | NA | NA | NA |
422 | 2025-04-05 |
Redesigning and rethinking genetic circuits: the potential of transcriptional rewiring in filamentous fungi
2025-Apr-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103301
PMID:40179610
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综述 | 本文探讨了丝状真菌中基因调控网络(GRN)操作的分子工具包,重点关注转录重连和启动子工程 | 利用对光和温度等物理线索响应的顺式元件,实现了前所未有的时空精确基因表达控制,并展示了转录重连如何增强纤维素酶生产和揭示复杂电路的设计原则 | 主要关注丝状真菌,对其他真菌种类的应用潜力讨论较少 | 探索丝状真菌中基因调控网络的操纵潜力,特别是在代谢工程和基础研究中的应用 | 丝状真菌,特别是以Neurospora crassa为模型 | 合成生物学 | NA | 转录重连,启动子工程 | NA | NA | NA |
423 | 2025-04-05 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文全面总结了木质素降解的前沿生物策略、木质素分解酶、代谢途径以及降解菌株或菌群,并批判性地评估了其潜在机制 | 强调了利用数字系统和合成生物学等创新方法来释放木质素衍生原材料的商业潜力,以及人工智能驱动技术在克服当前挑战和推动木质素增值广泛采用中的前景 | 木质素的复杂组成和抗分解性仍然是其定向增值的主要障碍 | 探索木质素增值和利用木质素基原材料进行生物制造的潜力 | 木质素及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、人工智能驱动技术 | NA | NA | NA |
424 | 2025-04-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 研究DNA纳米结构与脂质膜之间的相互作用,探讨纳米尺度立体效应对其影响 | 首次揭示了DNA纳米结构锚定物的立体环境及局部纳米级双层形态对膜相互作用的影响,并展示了通过非脂化DNA区域实现50和200纳米囊泡尺寸区分的创新方法 | 研究仅针对四种特定立体环境下的DNA纳米结构,可能无法涵盖所有可能的相互作用情况 | 探索DNA纳米结构与脂质膜相互作用的机制,为合成生物学和生物传感应用提供理论基础 | 具有四种不同立体环境膜锚定物的3D DNA纳米结构与不同尺寸膜囊泡的相互作用 | DNA纳米技术 | NA | 3D DNA纳米结构构建技术 | NA | 实验观测数据 | 不同尺寸的膜囊泡(特别展示了50nm和200nm囊泡的区分) |
425 | 2025-04-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
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research paper | 该研究介绍了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层(dsLBs)的新型合成细胞技术,用于体外扩增治疗相关的T细胞表型 | 提出了一种具有可调生物化学和生物物理特性的软合成细胞技术,作为人工抗原呈递细胞(aAPCs),用于体外T细胞扩增,并揭示了横向配体移动性在T细胞激活中的关键作用 | 研究主要基于体外实验,未涉及体内验证 | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术,以改善免疫治疗效果 | T细胞,特别是IL-4/IL-10分泌的调节性CD8 T细胞和Her2/CD3双特异性T细胞接合剂介导的T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离液滴支撑脂质双层(dsLBs)技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 |
426 | 2025-04-04 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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review | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在合成生物学和再生医学中的潜在应用 | 综述了多种原始细胞模型的构建方法及其组装成功能化原始组织的化学和物理策略,强调了原始组织在细胞间通讯和集体行为方面的独特性质 | NA | 探索原始细胞网络工程在原始组织发展中的应用 | 原始细胞模型(如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚体和乳液滴)及其组装成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
427 | 2025-04-04 |
Polymerase-Based Signal Delay for Temporally Regulating DNA Involved Reactions, Programming Dynamic Molecular Systems, and Biomimetic Sensing
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400142
PMID:38676334
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研究论文 | 本研究通过DNA聚合酶(DNAP)的信号延迟技术,实现了对DNA参与反应的时空调控,编程动态分子系统及仿生传感 | 首次通过分子动力学模拟分析和荧光测定表征DNAP的催化活性,并开发了包括引入引物悬垂、使用抑制试剂和改变DNA模板长度等新策略,实现了信号链释放的延迟 | 研究主要局限于体外实验,尚未在活体系统中验证其应用效果 | 探索DNAP催化反应在时空调控DNA参与反应、动态分子信号建立及目标基因多重检测中的应用 | DNA聚合酶(DNAP)及其催化的DNA链置换反应 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟分析、荧光测定 | NA | 分子信号数据 | NA |
428 | 2025-04-04 |
Synthetic Cells from Droplet-Based Microfluidics for Biosensing and Biomedical Applications
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400086
PMID:38563581
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综述 | 本文综述了基于液滴微流控技术制备合成细胞的最新研究进展及其在生物传感和生物医学应用中的潜力 | 结合微流控技术与自下而上的合成生物学,实现了从简单结构到更高层次结构的批量合成细胞模型的可重复和可调构建 | 合成细胞研究的挑战和未来发展仍需进一步探讨 | 探讨合成细胞的制备及其在生物传感和生物医学领域的应用 | 合成细胞,包括脂质囊泡(脂质体)、聚合物囊泡(聚合物体)、凝聚微滴和胶体体 | 生物医学工程 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA |
429 | 2025-04-03 |
Establishing a Serine Integrase-Based Genetic Memory System In Vitro
2025-Apr-02, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28986
PMID:40171936
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研究论文 | 本研究开发了一种基于丝氨酸整合酶的体外遗传记忆系统,用于DNA信息存储和处理 | 利用三种正交丝氨酸整合酶构建模块化、正交且可量化的体外遗传记忆系统,并成功应用于级联生物转化过程 | 研究仅限于体外环境,尚未在活体生物中进行验证 | 开发先进的体外遗传记忆系统以存储和处理遗传信息 | 基于DNA的遗传记忆系统 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶技术 | NA | DNA序列数据 | NA |
430 | 2025-04-03 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 本研究通过文献计量和知识图谱方法,探索了亚胺还原酶(IREDs)的研究格局和演变 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示,揭示了当前趋势和新兴主题 | 研究仅基于Web of Science Core Collection的数据,可能存在遗漏 | 评估IRED研究的现状和发展趋势,为学者提供研究方向和潜在合作者信息 | 239篇关于IREDs的研究文章和综述 | 生物催化 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法(CiteSpace, VOSviewer, Pajek, Scimago Graphica) | NA | 文献数据 | 239篇研究文章和综述(2010-2024年) |
431 | 2025-04-03 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域中数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域与人工智能、大模型和高性能计算等信息技术融合的发展方向与新兴技术方法 | 未具体说明所涵盖研究的样本量或数据规模 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术应用 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
432 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文综述了人工智能在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用及其进展 | 总结了AI在生物制造中核酸元件设计方面的最新工具和应用案例 | 生物系统的复杂性及缺乏高度量化的训练数据限制了AI在生物制造中的应用 | 探讨AI如何加速生物制造中核酸元件的设计与优化 | 生物制造中的核酸元件(如启动子、核糖体结合位点、终止子等) | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |
433 | 2025-04-03 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
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综述 | 本文全面总结了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 人工智能技术,尤其是机器学习,通过分析高通量测序数据,革新了sgRNA设计,提高了编辑效率并高精度预测脱靶效应 | NA | 探讨人工智能在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用 | CRISPR-Cas系统 | 合成生物学 | NA | 高通量测序 | 机器学习 | 测序数据 | NA |
434 | 2025-04-03 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
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review | 本文回顾了机器学习在合成生物学部件和遗传电路设计中的应用,并讨论了当前挑战及未来趋势 | 探讨了机器学习如何从传统试错方法转向标准化、智能化的工程设计,为合成生物学提供创新支持 | 未具体说明机器学习模型在复杂遗传电路设计中的实际效果及数据需求 | 推动合成生物学从经验驱动向智能工程设计的范式转变 | 合成生物学部件(如启动子、RNA调控元件、转录因子)及简单遗传电路 | machine learning | NA | 机器学习算法 | NA | 生物数据 | NA |
435 | 2025-04-03 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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review | 本文全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 首次从跨膜蛋白和传感器蛋白、自然细胞的适应调控机制以及应用场景三个方面系统性地综述了细胞代谢和环境适应的调控 | 缺乏对具体实验数据和案例的深入分析 | 探讨细胞感知代谢和环境变化的机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
436 | 2025-04-03 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
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综述 | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型重建与优化的最新研究进展 | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用,为高精度构建细胞生理代谢网络模型提供了新机遇 | 未提及具体模型在实际应用中的性能局限或验证不足 | 为定量合成生物学和系统生物学研究提供计算生物学工具支持 | 细胞生理代谢网络模型(包括GEMs、动力学模型和ecGEMs) | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型构建技术、人工智能技术 | GEMs、动力学模型、ecGEMs | 代谢网络数据 | NA |
437 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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review | 本文综述了转录因子(TF)基生物传感器在计算模拟和人工智能辅助下的工程与优化最新进展 | 结合计算模拟和人工智能技术优化转录因子基生物传感器,相比传统工具更准确快速 | NA | 总结转录因子基生物传感器的工程与优化方法,促进新型生物传感器的发展 | 转录因子基生物传感器 | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
438 | 2025-04-03 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的实时监测、人工智能优化策略和数字孪生技术的进展 | 整合了在线监测技术、人工智能驱动的动态优化和数字孪生技术,为发酵过程的精确优化和高效放大提供了新范式 | 未提及具体实验验证或案例研究的局限性 | 实现发酵过程的精确优化和高效放大,推动生物制造向更高效率、智能化和可持续发展方向发展 | 发酵过程的实时监测、智能控制和优化策略 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、人工智能、数字孪生 | 人工神经网络、支持向量机、遗传算法 | 实时传感数据 | NA |
439 | 2025-04-03 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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评论 | 本期特刊探讨了人工智能驱动的生物制造的机遇、挑战和发展现状 | 综述了人工智能在生物制造领域的创新应用,包括智能设计、构建生物部件、电路和人工细胞,以及智能生物过程控制与优化 | NA | 把握人工智能驱动的生物制造的创新与发展 | 生物制造领域的技术创新和产业发展 | 生物制造 | NA | 人工智能 | NA | 生物大数据 | NA |
440 | 2025-04-03 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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research paper | 该研究通过调节转录因子凝聚物的材料特性,探索其对基因表达调控的影响 | 首次系统性地调节光遗传诱导的转录因子凝聚物的材料特性,并揭示其对基因表达激活的影响 | 研究主要关注转录因子凝聚物的物理性质对基因表达的影响,未深入探讨具体的分子机制 | 探索生物分子凝聚物材料特性对基因表达调控的影响 | 哺乳动物细胞和小鼠中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 哺乳动物细胞和小鼠模型,使用不同合成和天然转录因子 |