合成生物学相关文章
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当前共找到 5211 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-05-31 |
Defense-associated reverse transcriptases define an emerging class of noncanonical DNA-writing systems
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.001
PMID:42212300
|
综述 | 防御相关逆转录酶定义了新兴的非经典DNA写入系统类别 | 揭示DRT不仅仅是RNA到DNA的复制蛋白，而是作为DNA构建模块，能够生成多种非经典DNA产物，包括从头基因组装cDNA、随机单链DNA、DNA同聚物、富含poly(A)的cDNA和蛋白模板化二核苷酸重复DNA，并展示了RNA模板化与蛋白模板化合成在单一防御途径中的结合机制 | 具体局限性未在摘要中提及，可能包括对DRT酶新型反应机制的全面理解仍处于早期阶段，以及其生物学功能和生态意义尚未完全阐明 | 阐明防御相关逆转录酶作为DNA写入系统的机制，探索其在合成生物学和核酸工程中的潜在应用 | 细菌的防御相关逆转录酶（DRTs），特别关注DRT3的合成途径 | 机器学 | NA | 逆转录技术、DNA合成 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 非经典DNA写入系统（包括从头基因组装、随机单链DNA生成、DNA同聚物合成等） | 合成生物学，核酸工程 |
| 422 | 2026-05-31 |
Microbial factories for lipid: Engineering synthetic routes and regulatory networks for Triacylglycerol biosynthesis
2026-Oct, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2026.105136
PMID:42215216
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综述 | 系统总结了微生物三酰甘油（TAG）生产的合成生物学策略与监管网络工程进展 | 将基础脂质生物化学与先进代谢工程技术相结合，评估多种产油微生物的底盘潜力，并提出非模式菌株开发、前体供应优化、关键酶工程及共培养等创新策略 | 未提供具体实验验证数据，主要基于文献总结提出技术路线 | 综述微生物三酰甘油生物合成的最新进展，并提供工业化生产的技术路线图 | 产油微生物（包括模式菌株和非模式菌株） | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程工具 | 产油微生物（如酵母、微藻等） | 三酰甘油合成路径（包括前体供应、关键酶优化、共培养系统） | 生物能源, 食品 |
| 423 | 2026-05-31 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究文章 | 通过机器学习模型BT预测转录因子BmoR的关键残基区域，实现严格正交生物传感器设计，最大化可再生生物燃料的过量生产 | 首次利用机器学习模型BT预测三个关键残基区域，结合半理性工程改造BmoR突变体实现严格信号分子正交性，并建立TF-SM氢键计数主导作用的框架 | 该研究中BT模型的预测准确率为88.5%，可能存在预测误差；实验仅限于BmoR和四种信号分子，通用性尚待验证 | 通过机器学习指导的转录因子进化，实现严格正交生物传感器设计，提高可再生生物燃料产量 | 转录激活因子BmoR及其与信号分子的相互作用 | 机器学习 | NA | 机器学习, 随机森林算法, Discovery Studio分子模拟, 微量热泳动(MST)亲和力测定, 半理性工程 | 随机森林模型 | 分子模拟数据, 实验验证数据 | 245个TF-SM复合物用于训练和测试，5700个BmoR突变体与4种信号分子模拟得到22800个复合物 | NA | 微生物（未具体指明） | 基于BmoR的正交生物传感器 | 合成生物学, 代谢工程, 能源 |
| 424 | 2026-05-31 |
Microbial and synthetic biology solutions for waste management and biomanufacturing off Earth
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103491
PMID:41930789
|
综述 | 探索利用微生物和合成生物学技术解决国际空间站废物管理问题，并将废物转化为有价值资源的策略 | 提出利用微生物和合成生物学方法在太空中实现废物资源化、再生生命支持系统和可持续生物制造，为长期地外居住和火星任务提供物质闭环的解决方案 | 未提及 | 研究微生物和合成生物学解决方案用于地球外的废物管理和生物制造 | 微生物和合成生物学策略在太空废物处理中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、生物采矿、极端微生物工程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 极端微生物 | 废物转化和生物制造通路 | 环境、工业生物技术 |
| 425 | 2026-05-31 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
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综述 | 本文综述了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二元酸生物合成效率的策略 | 重点强调了疏水底物跨膜转运机制增强和新型转运蛋白挖掘，以及针对关键酶（如细胞色素P450）的蛋白质工程策略，包括理性设计、融合表达和新型二聚化技术 | 主要受限于低质量传递效率、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 为中长链二元酸的高效和可持续生物制造提供理论指导 | 中长链二元酸生物合成系统和相关酶（如细胞色素P450） | 合成生物学 | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程、融合表达、二聚化技术 | NA | 反向β氧化循环、辅因子再生和能量代谢重编程 | 工业生物技术、材料 |
| 426 | 2026-05-31 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
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综述 | 本文综述了嗜热甲醇芽孢杆菌作为一种新兴的生物制造平台，能够高效利用甲醇和甘露醇进行可持续化学生产 | 强调了该菌株在热生长、海水适应性和能量高效甲醇同化途径方面的固有优势，并总结了合成生物学工具的最新进展以实现理性菌株工程 | 讨论了从甲醇和甘露醇进行生物制造面临的挑战，但未深入量化实际瓶颈 | 探讨嗜热甲醇芽孢杆菌作为连接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台的潜力 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 甲醇和甘露醇代谢路径 | 工业生物技术 |
| 427 | 2026-05-31 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
|
综述 | 本文概述了人工智能驱动工程生物学与新兴技术的融合，推动全球网络化自主生物工厂的发展 | 提出AI驱动的全自主生物工厂概念，整合计算设计、自动化制造和数据驱动学习，实现自我改进的设计-构建-测试-学习循环 | NA | 综述塑造AI驱动合成生物学的技术，强调其与自动化、数字化和小型化的融合趋势 | AI驱动的合成生物学技术，包括全细胞建模、数字孪生及自动化生物工厂 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 428 | 2026-05-31 |
Systems-level regulation principles for microbial lignin valorization
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103479
PMID:41875688
|
综述 | 系统总结微生物木质素增值的调控原理，涵盖代谢调控、转录因子调控和动态生物传感器调控 | 首次从系统层面整合代谢调控、转录因子工程和动态传感器调控，提出提升木质素生物转化效率的集成框架 | 未涉及具体实验验证，且对工业规模化应用的挑战分析有限 | 阐述微生物木质素增值的系统级调控原理 | 微生物细胞工厂及木质素衍生的芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、环境 |
| 429 | 2026-05-31 |
The TfoX revolution: a review of genetic engineering in Vibrio natriegens
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103506
PMID:42119170
|
综述 | 本文综述了Vibrio natriegens的基因工程工具发展，特别是TfoX介导的自然转化能力如何推动其成为合成生物学底盘 | 系统梳理了TfoX介导的遗传能力机制如何突破V. natriegens的基因改造瓶颈，将其转变为可编程底盘 | 仍面临基因组编辑效率和规模化应用的挑战 | 概述V. natriegens基因工程方法的演进及应用潜力 | V. natriegens菌株及其TfoX调控机制 | 合成生物学 | NA | TfoX介导的自然转化 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 430 | 2026-05-31 |
A guide to Direct Pathway Cloning (DiPaC) for natural product discovery
2026-May-29, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250016
PMID:42210810
|
综述 | 介绍直接通路克隆（DiPaC）作为一种合成生物学方法，用于天然产物发现中的生物合成基因簇克隆和重构 | DiPaC结合长片段PCR和体外DNA组装，无需中间文库构建、大量体内重组或多个抗生素选择标记，即可同时克隆和重构生物合成通路 | 未明确提及，但可推断对复杂序列的扩增和组装仍存在技术障碍 | 提供DiPaC方法在天然产物发现中的指导和应用综述 | 天然产物生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 长片段PCR、体外DNA组装 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas9 | 多种微生物和环境中 | 生物合成通路重构、启动子交换、调控元件移除、模块化通路重建 | 医药、生物技术 |
| 431 | 2026-05-31 |
Synthetic DNA circuits for programming cell functions
2026-May-29, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102701
PMID:42214130
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综述 | 综述合成DNA电路在编程细胞功能中的最新进展，重点介绍其在细胞环境中实现逻辑门控控制的策略 | 强调了从体外演示向原位功能实现的范式转变，以及DNA电路与内源性通路整合的策略 | 未明确讨论当前技术瓶颈或局限性 | 阐述基于核酸的逻辑网络在合成生物学中用于构建智能细胞系统的潜力 | 合成DNA电路及其在细胞功能编程中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 逻辑门、放大器、神经形态架构、链置换网络 | 医学, 工业生物技术 |
| 432 | 2026-05-31 |
Self-driving medicine: closed-loop therapeutics for autonomous disease control
2026-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.003
PMID:42209322
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综述 | 综述了由合成生物学驱动的闭环基因电路在自主疾病控制中的应用，迈向自动驾驶医疗 | 将治疗剂量定义为对生理状态的连续计算响应而非固定方案，通过反馈控制实现自稳态维持 | NA | 探讨闭环基因电路在自主疾病控制中的原理与实现路径 | 模块化传感器、处理器和效应器组成的反馈控制疗法 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 闭环基因电路（包含传感器、处理器和效应器） | 医学 |
| 433 | 2026-05-31 |
A T7 RNAP regulatory toolbox for cell-free network engineering and biosensing applications
2026-May-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73811-9
PMID:42209525
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研究论文 | 在无细胞系统中工程化T7 RNAP调控工具箱，实现可编程合成抑制子、激活子和生物传感器，用于基因网络构建和生物分子检测 | 首次系统构建T7 RNAP的模块化调控工具箱，结合蛋白质设计流程和全合成结合子开发生物传感器，并实现多种生物分子（小分子药物、抗体、蛋白质）的一管式多重检测 | NA | 开发一种灵活可扩展的无细胞系统，用于构建响应多种生物分子的基因电路并实现即时诊断应用 | T7 RNA聚合酶及其调控元件（合成抑制子、激活子、生物传感器） | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、蛋白质设计、酶扩增 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 基因调控网络（抑制子、激活子、生物传感器） | 医学、诊断 |
| 434 | 2026-05-31 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 总结微生物与生物技术策略增强聚乳酸（PLA）生物降解的最新进展 | 该综述系统整合了从自然微生物群落筛选、宏基因组学探索到合成生物学、酶工程与人工智能驱动的酶设计的多学科策略，提出基于AI的结构预测和机器学习平台用于开发高性能PLA降解酶 | 未提及具体实验验证或定量比较不同策略的效率，重点在于概念性综述而非深入技术评估 | 概述加速PLA生物降解的多学科方法，为工业堆肥、废水处理和生物修复提供路线图 | PLA降解微生物群落、酶及降解机制 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 宏基因组数据, 环境DNA数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, 定向进化 | 细菌, 真菌 | 代谢途径设计，反馈调节回路 | 工业生物技术, 环境修复 |
| 435 | 2026-05-31 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-04-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 综述了一种通过计算设计代谢网络遗传电路的方法，以优化蛋白质投资下的代谢通量 | 提出了一种基于最大化每单位投资蛋白质通量的方法来推断和设计遗传电路，并用于解释大肠杆菌的天然调控策略 | 仅以大肠杆菌为模型系统进行验证，未涉及真核生物或更复杂的代谢网络 | 理解并计算设计代谢网络的遗传电路，以实现动态条件下的最优代谢适应度 | 大肠杆菌的核糖体表达调控和氨基酸生物合成酶的基因表达控制电路 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 通量优化模型 | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通量调控电路 | 工业生物技术 |
| 436 | 2026-05-31 |
A robust yeast chassis: comprehensive characterization of a fast-growing Saccharomyces cerevisiae
2024-02-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03196-23
PMID:38214535
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研究论文 | 全面表征了一种快速生长的酵母新菌株XP，并为其遗传操作开发了工具箱 | 发现了一种生长速度快于常用研究和工业菌株的酵母新分离株XP，并在基因组、转录组和代谢组层面解析了其快速生长的机制，开发了包括基因插入、删除和倍性转换在内的遗传操作工具箱 | 未明确提及菌株XP在长期工业应用中的稳定性及潜在风险 | 开发快速生长的酵母底盘以促进合成生物学和生物技术应用 | 酵母新分离株XP及其与常用菌株的比较 | 机器学习 | NA | 基因组测序, 转录组测序, 代谢组分析, 基因编辑 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae） | L-乳酸生产途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 437 | 2026-05-31 |
Genomic imprints of unparalleled growth
2024-02, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19444
PMID:38072860
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研究论文 | 比较了快速生长的沙漠微藻Chlorella ohadii与其他绿藻的基因组，揭示其无与伦比生长速率和抗逆性的基因组印记 | 首次对最快生长藻类C. ohadii进行基因组比较分析，发现其核糖体基因数量多、内含子丰富、密码子偏好性强及特有基因与代谢灵活性和抗光损伤相关 | 未明确讨论基因组特征与生长速率的直接因果关系，且研究仅限于两种绿藻比较 | 探究C. ohadii快速生长和抗逆性的基因组基础及其进化意义 | C. ohadii及其近缘种C. sorokiniana UTEX 1663的基因组 | 基因组学 | NA | 基因组比较分析 | NA | 基因组序列数据 | 两种绿藻基因组 | NA | Chlorella ohadii, Chlorella sorokiniana | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 438 | 2026-05-30 |
Current Progress and Future Outlook for Synthetic Gene Circuits in Cardiovascular Therapy
2026-May-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16050754
PMID:42194102
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综述 | 该综述总结了合成基因回路在心血管治疗中的当前进展，并展望了未来发展方向 | 首次系统性地从直接心脏应用、间接靶向心血管疾病和未来潜在应用三个维度梳理合成基因回路，并提出改进的设计-构建-测试-学习框架以促进临床转化 | NA | 探讨合成基因回路在心血管治疗中的现状与未来前景 | 合成基因回路及其在心血管治疗中的应用 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 甲基化测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 诱导开关, 分类器系统, 代谢通路 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 439 | 2026-05-30 |
Bioengineered Silver Nanoparticles: Next-Generation Biogenic Synthesis Strategies for Precision Biomedical Applications
2026-May-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050587
PMID:42194344
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综述 | 本文综述了利用生物工程策略合成银纳米颗粒的新一代方法及其在精准生物医学中的应用 | 不同于传统综述聚焦绿色合成方法，本文重点突出了新兴的生物工程范式，如代谢工程、合成生物学、微流控辅助合成和人工智能引导工艺优化，实现了可编程、可规模化及精密可控的生物源银纳米颗粒制备 | 纳米-生物相互作用、毒理学安全性、监管合规性和转化可扩展性方面仍存在关键挑战，且银纳米颗粒与杂原子掺杂碳纳米点组成的生物源复合材料需要深入研究 | 探讨下一代生物合成银纳米颗粒的范式与策略，阐明其形成的分子机制，突出新兴功能化与生物医学应用范式，并讨论当前转化障碍 | 银纳米颗粒及其生物工程合成策略 | 机器学习 | 癌症 | 生物合成 | NA | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | 植物,微生物,真菌,藻类 | NA | 医学 |
| 440 | 2026-05-30 |
Classical Phytohormones and Peptide Plant Hormones in Abiotic Stress Tolerance: Crosstalk, Physiological Integration, and Crop Improvement
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101538
PMID:42197671
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综述 | 本文综述了经典植物激素与肽类植物激素在非生物胁迫耐受中的相互作用、生理整合及作物改良应用 | 首次综合阐述了植物褪黑素作为整合枢纽在经典激素与肽激素网络中的双重作用（直接抗氧化和双向调控经典激素信号） | 存在网络复杂性、激素响应的上下文依赖性、实验室到田间应用的转化差距，以及多胁迫条件下肽激素作用机制理解不完整等问题 | 探讨植物激素信号网络在非生物胁迫适应中的作用，并提出利用这些网络改良作物的策略 | 植物激素信号通路及其在非生物胁迫响应中的整合网络 | 植物生物学 | NA | 转录组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,代谢组学,系统生物学,CRISPR基因编辑 | NA | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 激素信号调控网络（包括褪黑素抗氧化级联、CEP通路等） | 农业 |