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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-05 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-04-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
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综述 | 系统阐述真菌来源天然产物的生物合成逻辑与酶学机制及其在药物和农用生物农药开发中的应用 | 整合基因组挖掘与合成生物学策略,提出通过理性设计扩展真菌天然产物化学多样性的新途径 | 未明确说明具体技术实施的技术瓶颈与转化应用的时间周期 | 解析已批准真菌源药物和生物农药的生物合成机制并探索其合成生物学改造策略 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源重建、代谢工程 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA | 异源表达宿主 | 真菌 | 聚酮合酶(PKS)、非核糖体肽合成酶(NRPS)、PKS/NRPS杂合系统、萜类、吲哚生物碱的生物合成途径 | 医药, 农业 |
| 442 | 2025-10-05 |
Simple phenylpropanoids: recent advances in biological activities, biosynthetic pathways, and microbial production
2024-01-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00012e
PMID:37807808
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综述 | 概述简单苯丙素类化合物的生物活性、不同物种的生物合成途径及微生物生产工程策略 | 系统比较植物/细菌/真菌的生物合成路径差异,总结近十年微生物生产的关键工程策略 | 基于文献综述未涉及原始实验数据 | 探讨简单苯丙素类化合物的可持续微生物生产方案 | 简单苯丙素类化合物(C6-C3骨架天然产物) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径工程 | 香料,营养品,生物材料,制药 |
| 443 | 2025-10-05 |
Engineering yeast for the production of plant terpenoids using synthetic biology approaches
2023-12-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00005b
PMID:37523210
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综述 | 本文综述了2011-2022年间通过合成生物学方法在酵母中生产植物萜类化合物的研究进展 | 系统总结了酵母工程化生产萜类化合物的四个关键方向:宿主代谢调控、代谢途径重构、酶催化特性改造以及生产定位策略 | NA | 通过代谢工程和合成生物学方法在微生物宿主中生产萜类化合物 | 酵母工程化及植物萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 代谢途径重构、酶催化系统改造、亚细胞区室化 | 工业生物技术, 医药 |
| 444 | 2025-10-05 |
Synthetic biology approaches for restoring gut microbial balance and engineering disease-specific microbiome therapeutics
2025-Oct, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.107931
PMID:40716471
|
综述 | 探讨利用合成生物学方法恢复肠道微生物平衡及开发疾病特异性微生物组疗法的前沿进展 | 提出整合区域微生物组生态型、饮食响应模块化设计和适应性代谢建模的生态精准工程框架 | NA | 开发精准调控肠道微生物组的下一代策略 | 人工微生物群落(AMCs)与肠道微生物组 | 合成生物学 | 炎症性肠病、肥胖、糖尿病、神经退行性疾病 | CRISPR基因组编辑、代谢工程、多组学整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人工微生物群落 | 疾病特异性微生物功能障碍的理性设计 | 医学 |
| 445 | 2025-10-05 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Aug-11, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
|
综述 | 探讨合成细胞膜系统的脂质多样性与最小化要求 | 通过对比自下而上和自上而下的合成细胞构建方法,强调膜蛋白与脂质环境的关键相互作用 | NA | 定义自繁殖合成细胞所需的最小脂质组要求 | 合成细胞的脂质膜系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 环境科学 |
| 446 | 2025-10-05 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Aug-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
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研究论文 | 本研究首次在真菌中重构了负责合成免疫抑制剂霉酚酸的β-氧化样酶级联反应 | 首次实现真菌β-氧化级联反应的功能性重构,揭示了将分解代谢模块重新用于生物合成的新策略 | NA | 优化免疫抑制剂霉酚酸的生产途径 | 真菌β-氧化酶级联反应和霉酚酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 体外酶活性测定、途径优化 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | 短密青霉NRRL864菌株 | 基因过表达 | Penicillium brevicompactum | β-氧化样代谢途径,包含氧化、脱氢、水合、还原、异构化和逆克莱森缩合反应 | 医药 |
| 447 | 2025-10-05 |
A Strictly Inducible and Orthogonal Dre-rox System for Precise and Markerless Genome Editing in Bacillus subtilis
2025-Jul-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2505.05006
PMID:40730489
|
研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中建立了一种严格诱导且正交的Dre-rox系统,用于精确无标记基因组编辑 | 开发了茶碱诱导型核糖开关严格控制Dre表达以减少渗漏重组,首次证明Dre与Cre在各自识别位点上无串扰正交工作,支持单次诱导同步多位点切除 | NA | 扩展微生物基因组工程工具包,开发与Cre性能相当且能正交功能的位点特异性重组酶系统 | 枯草芽孢杆菌基因组编辑系统 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组,基因组编辑 | NA | NA | NA | Dre-rox系统,Cre-lox系统 | 枯草芽孢杆菌 | 茶碱诱导型核糖开关控制的Dre表达系统,正交重组系统 | 工业生物技术 |
| 448 | 2025-10-05 |
CRISPR.BOT an autonomous platform for streamlined genetic engineering and molecular biology applications
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01655-2
PMID:40770192
|
研究论文 | 介绍CRISPR.BOT自主基因工程平台,旨在革新分子生物学实验流程 | 开发了基于乐高机器人的低成本自主基因工程平台,实现单细胞亚克隆纯度达90-100% | 未提及平台在复杂实验环境中的稳定性和长期运行可靠性 | 开发低成本自动化基因工程平台以提升实验效率和安全性 | 细菌宿主、人类细胞系、SARS CoV-2病毒 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、慢病毒转导、质粒DNA转移 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌, 人类细胞系 | GFP报告基因系统、CRISPR-gRNA编辑系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 449 | 2025-10-05 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
|
综述 | 探讨大型语言模型在合成生物学教育和生物制造领域的应用前景与影响 | 系统分析LLMs在生物制造中的知识图谱构建、DBTL周期优化及自动驾驶实验室等创新应用 | NA | 评估大型语言模型在合成生物学和生物制造领域的应用潜力与发展方向 | 大型语言模型及其在合成生物学中的应用场景 | 自然语言处理 | NA | 检索增强生成、知识图谱构建 | LLM | 非结构化数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 450 | 2025-10-05 |
Pollutant degradation in saline wastewater using synthetic biology
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.012
PMID:40544014
|
研究论文 | 开发了一种能够高效降解高盐环境中复杂有机污染物的工程化 Vibrio natriegens 菌株 | 利用合成生物学技术赋予微生物在高盐环境中降解污染物的新能力 | NA | 解决高盐废水中有机污染物的生物降解问题 | 工程化 Vibrio natriegens 菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | 污染物降解通路 | 环境 |
| 451 | 2025-10-05 |
Tracing the development of CAR-T cell design: from concept to next-generation platforms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615212
PMID:40771804
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综述 | 本文系统回顾了CAR-T细胞设计从概念到下一代平台的发展历程 | 全面梳理了CAR架构从早期原型到包含共刺激域、细胞因子信号、安全开关等先进设计的演进过程 | CAR-T细胞疗法仍面临严重副作用、治疗反应不一致和生产成本高等挑战 | 指导未来CAR疗法向更多癌症类型和其他疾病扩展应用 | CAR-T细胞及其相关技术平台 | 免疫治疗 | 血液恶性肿瘤 | CRISPR、碱基编辑、先导编辑、RNA编辑、表观基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | T细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞 | 逻辑门控CAR系统、生物传感器 | 医学 |
| 452 | 2025-10-05 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
|
综述 | 本文综述了合成生物学中大片段DNA组装技术的研究进展,重点关注在不同宿主中的组装方法和挑战 | 聚焦于大片段DNA组装这一技术难点,系统比较了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母等不同宿主中的组装方法 | NA | 总结DNA组装技术的发展现状,特别是大片段DNA组装的研究进展 | DNA组装技术,特别是大片段DNA组装方法 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | NA | 生物医学, 生物燃料, 新材料 |
| 453 | 2025-10-05 |
Engineering microbial carbon metabolism for sustainable resource utilization
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108622
PMID:40467014
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学方法改造微生物碳代谢以实现可持续资源利用的研究进展 | 重点探讨了利用多组学测序、机器学习和人工智能指导菌株工程以提高可持续碳源利用率的新策略 | NA | 开发绿色节能资源以替代化石燃料 | 微生物碳代谢途径 | 合成生物学 | NA | 多组学测序、机器学习、人工智能 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 微生物 | 碳代谢途径工程 | 能源, 工业生物技术 |
| 454 | 2025-10-05 |
Methanol metabolism in synthetic methylotrophic microorganisms
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108623
PMID:40499848
|
综述 | 本文深入探讨合成甲基营养微生物中的甲醇代谢途径,并概述代谢工程最新进展 | 重点介绍人工甲基营养中创新的C1同化途径,拓展甲醇代谢的应用场景 | NA | 增强对甲醇代谢的理解并开发合成甲基营养菌的工业潜力 | 天然甲基营养微生物(如Komagataella phaffii、Methylobacterium extorquens)及工程化微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | Komagataella phaffii, Methylobacterium extorquens, Bacillus methanolicus, Escherichia coli, 酵母, 细菌 | 甲醇利用途径、C1同化途径、甲醛代谢途径、甲酸代谢途径 | 工业生物技术 |
| 455 | 2025-10-05 |
Fungal bioconversion of lignin-derived aromatics: Pathways, enzymes, and biotechnological potential
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108624
PMID:40505753
|
综述 | 系统整合真菌对木质素衍生芳香化合物的代谢途径、关键酶及其生物技术潜力 | 首次系统整合真菌芳香化合物分解代谢途径,强调转运蛋白系统作用并提出合成生物学整合新方向 | 目前真菌芳香族分解代谢途径的系统性整合研究仍较为零散 | 开发基于真菌的木质素增值化生物技术平台 | 木质素衍生芳香化合物(肉桂酸、没食子酸、阿魏酸、香兰素等) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | 芳香化合物分解代谢途径 | 能源, 工业生物技术 |
| 456 | 2025-10-05 |
Revolutionizing lignin valorization: Key advances in demethylation, methylation, and methyl metabolism
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108634
PMID:40588043
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综述 | 系统综述了木质素生物增值化过程中的脱甲基化、甲基化和甲基代谢过程及其关键酶机制 | 提出了微生物木质素增值化的甲基循环路线,并强调机器学习辅助酶工程、合成生物学和代谢工程等新型策略 | NA | 促进木质素的高效生物转化和可持续增值利用 | 木质素衍生物及其芳香族分解代谢过程 | 工业生物技术 | NA | 机器学习辅助酶工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 甲基循环代谢路线 | 能源, 工业生物技术 |
| 457 | 2025-10-05 |
Beyond nature's clock: Accelerating genomic diversity through hypermutation
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108638
PMID:40614910
|
综述 | 系统评述超突变技术在加速基因组多样性方面的进展及其在生物技术领域的应用 | 通过多维度比较不同超突变工具,为选择最佳诱变工具提供指导,并提出AI驱动预测模型等未来方向 | NA | 突破自然突变限制,满足生物技术应用对遗传多样性的需求 | 超突变技术(包括靶向、多靶点和全基因组方法) | 合成生物学 | NA | 超突变技术 | AI驱动预测模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 进化研究, 工业生物技术 |
| 458 | 2025-10-05 |
Yeast as C1 cell factory: Transforming methanol and Formate into high-value compounds
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108641
PMID:40645511
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综述 | 本文综述了利用酵母作为C1细胞工厂将甲醇和甲酸盐转化为高价值化合物的研究进展、挑战与未来前景 | 探讨了合成甲基营养型酵母的开发策略,包括非理性基因组工程与理性设计相结合的方法,以及模块化共培养工程和过氧化物酶体耦合等创新技术 | 甲酸盐为基础的酵母生长和生物合成仍处于早期阶段,C1生物工艺的可扩展性仍存在差距 | 开发可持续的C1气体生物转化策略,实现制造业脱碳 | 工业酵母对甲醇和甲酸盐的耐受与同化能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学辅助进化工程,非理性基因组工程,理性设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | C1代谢途径,生物合成途径与C1代谢的过氧化物酶体耦合 | 工业生物技术,环境,能源 |
| 459 | 2025-10-05 |
Advances in production and application technologies of minicells: A review
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108648
PMID:40669734
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综述 | 本文综述了微型细胞的生产与应用技术进展,重点介绍其形成机制、分离方法及在合成生物学、农业和医学中的新兴应用 | 系统总结了微型细胞除传统药物递送外的四大新功能:解毒耐受、富集微反应器、分子封装递送和天然结构表征 | NA | 全面回顾微型细胞的技术发展现状与应用前景 | 杆状细菌产生的无核微型细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 杆状细菌 | NA | 合成生物学,农业,医学 |
| 460 | 2025-10-05 |
Unlocking the algae toolbox: Cutting-edge tools for environmental and biotechnological solutions
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108652
PMID:40695391
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综述 | 本文系统评述藻类研究领域的最新技术进展及其在环境和生物技术解决方案中的应用 | 整合了CRISPR-Cas9基因工程、高通量组学、机器学习建模和遥感监测等前沿技术,构建了全面的藻类研究工具箱 | 大规模生产仍面临经济可行性和环境可持续性的挑战 | 推动藻类生物技术发展和全球可持续性 | 藻类及其相关技术应用 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 高通量组学, 机器学习, 遥感监测, 光学传感器, 流式细胞术, 生物传感器, 环境DNA | 机器学习驱动建模 | 组学数据, 环境监测数据, 传感器数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 藻类 | NA | 环境, 能源, 医药, 水产养殖, 工业生物技术 |