合成生物学相关文章
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当前共找到 3098 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-03-19 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
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研究论文 | 本文展示了如何将来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST重新用于人类细胞基因组中的可编程DNA整合 | 使用单Cas12k效应器的V-K CAST系统进行可编程DNA整合，相比需要三个Cas蛋白的Cascade系统更为简化 | 尽管脱靶事件较少，但仍会在特定基因组区域中重复出现 | 加速基因组编辑在治疗开发、生物技术和合成生物学中的应用 | 人类细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-associated (Cas) transposases (CAST) | NA | DNA | 多种人类细胞类型 |
| 442 | 2025-03-19 |
Magnetizing Biotech-Advances in (In Vivo) Magnetic Enzyme Immobilization
2025-Mar, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.70000
PMID:40083857
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综述 | 本文综述了磁性酶固定化的现有和新兴方法，特别关注体内固定化解决方案 | 结合合成生物学和多功能材料（如磁性纳米材料）的发展，提出了新的酶固定化方法，提高了分离和纯化过程的效率 | NA | 提高工业生物催化中酶的稳定性和活性，改善酶的使用效率 | 酶固定化方法，特别是磁性蛋白固定化 | 生物技术 | NA | 磁性纳米材料 | NA | NA | NA |
| 443 | 2025-03-19 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
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研究论文 | 本文介绍了一种快速、自动化、可扩展的高通量植物生物工程管道（FAST-PB），用于玉米和本氏烟草的基因组编辑和产物表征 | FAST-PB整合了自动化生物工厂工程与单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱（MALDI-MS），显著提高了合成生物学、基因组编辑和代谢工程的通量 | NA | 提高植物细胞中的脂质产量 | 玉米（Zea mays）和本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 合成生物学 | NA | CRISPR编辑、单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱（MALDI-MS） | NA | 单细胞脂质组学数据 | 96个载体并行构建 |
| 444 | 2025-03-19 |
Cyanobacterial type I CRISPR-Cas systems: distribution, mechanisms, and genome editing applications
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1552030
PMID:40084131
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研究论文 | 本文深入分析了蓝藻基因组中的内源性CRISPR-Cas系统，特别是分布最广的I型系统，并总结了其在基因组编辑中的应用 | 首次全面总结了蓝藻I型CRISPR-Cas系统的DNA防御机制及其在基因组编辑中的应用，并展望了其在合成生物学中的潜力 | 未提及具体的实验验证或应用案例，主要基于已有文献的总结和分析 | 探索蓝藻I型CRISPR-Cas系统的分布、机制及其在基因组编辑中的应用 | 蓝藻及其内源性CRISPR-Cas系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 445 | 2025-03-19 |
Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1547974
PMID:40093602
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综述 | 本文综述了植物细菌病原体诊断的现状和未来展望，从基于培养的策略发展到无培养检测 | 介绍了微拉曼光谱技术在单细胞水平上快速、无标记、非侵入性地鉴别活但不可培养病原体的创新应用 | 光谱学方法在检测先前未知的植物病原体方面存在不足 | 探讨植物细菌病原体诊断技术的发展及其应用 | 植物细菌病原体 | 植物病理学 | NA | 微拉曼光谱技术、单细胞测序、合成生物学 | NA | 光谱数据 | NA |
| 446 | 2025-03-19 |
Fungi: Pioneers of chemical creativity - Techniques and strategies to uncover fungal chemistry
2025, IMA fungus
IF:5.2Q1
DOI:10.3897/imafungus.16.142462
PMID:40093757
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review | 本文综述了真菌在药物开发和新型化学物质发现中的重要作用，并探讨了从过去到现在天然产物发现和药物先导物识别的分析及战略框架 | 强调了利用合成生物学系统探索真菌基因组的努力，并提出了合作与协作的必要性以充分利用真菌次级代谢物的潜力 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨真菌在药物开发和新型化学物质发现中的应用及其技术进展 | 真菌及其次级代谢物 | 生物化学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 447 | 2025-03-19 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感信号放大电路，通过利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录来回收DNA链置换电路中的核酸输入 | 开发了PSR电路，扩展了无细胞生物传感的能力，实现了高特异性和低检测限的RNA目标直接传感 | NA | 扩展无细胞电路的能力，通过PSR实现信号放大，用于生物技术中的多种应用 | RNA目标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收（PSR），DNA链置换电路 | 双平衡模型 | 核酸 | NA |
| 448 | 2025-03-18 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
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研究论文 | 本文提出了一种名为CasGen的新型生成模型，用于设计CRISPR Cas蛋白，通过分类和基于边缘的优化来提高新生成Cas9和Cas12蛋白的质量 | CasGen是一种基于Transformer的深度生成模型，结合了分类、贝叶斯优化和AlphaFold结构验证，以增强新生成Cas蛋白的功能性和结构相似性 | 研究依赖于现有的Cas9和Cas12蛋白序列数据，可能限制了生成蛋白的多样性 | 扩展基因组编辑工具包，设计更多样化的Cas蛋白，以应用于合成生物学和治疗领域 | Cas9和Cas12蛋白 | 合成生物学 | NA | AlphaFold结构预测、BLAST序列比对 | Transformer | 蛋白质序列 | 3,021个Cas9、597个Cas12和597个非Cas蛋白序列 |
| 449 | 2025-03-18 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 本研究构建了一个微生物平台，用于高效生产具有强杀菌活性的植物源倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建了用于可持续生产这种抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂 | 关键酶TPS18的催化活性限制了5-epi-jinkoheremol的进一步产量 | 开发一种可持续的生物杀菌剂生产方法 | 5-epi-jinkoheremol | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA |
| 450 | 2025-03-17 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Mar-14, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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评论 | 本文描述了一个分析学术界与产业界在合成生物学领域接口的研讨会 | 强调了从学术研究到成功生物技术企业的转化过程中各组成部分的必要性和协作性 | 未提及具体的研究数据或案例 | 探讨如何将学术研究转化为成功的生物技术企业 | 学术界与产业界在合成生物学领域的合作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2025-03-16 |
Systematic Characterization and Analysis of the Freeze-Thaw Tolerance Gene Set in the Budding Yeast, Saccharomyces cerevisiae
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052149
PMID:40076774
|
研究论文 | 本文对酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的冻融耐受基因集进行了系统表征和分析，以优化低温培养条件下的生物合成效率 | 首次在统一的遗传背景下（BY4741实验室菌株）对冻融耐受基因家族进行标准化表征，揭示了这些基因在冻融和热激应激下的生存能力增强 | 研究仅限于BY4741实验室菌株，未涵盖其他遗传背景的酵母菌株 | 研究冻融耐受基因在低温培养条件下对酵母生存能力的影响，以优化生物合成效率 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）的冻融耐受基因 | 合成生物学 | NA | 基因突变技术（KanMX6抗性盒） | NA | 基因表达数据 | BY4741实验室菌株及其突变体 |
| 452 | 2025-03-16 |
Structural Features of 5' Untranslated Region in Translational Control of Eukaryotes
2025-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051979
PMID:40076602
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综述 | 本文综述了真核生物中5'非翻译区（5' UTR）在翻译控制中的结构特征及其功能影响 | 详细阐述了5' UTR的结构特征如何独立或通过反式作用因子调节翻译，并探讨了其在合成生物学和基于mRNA的靶向治疗中的潜在应用 | NA | 探讨5' UTR在真核生物翻译控制中的作用及其在生物医学中的潜在应用 | 真核生物的5'非翻译区（5' UTR） | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2025-03-16 |
Global and gene-specific translational regulation in Escherichia coli across different conditions
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010641
PMID:36264977
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研究论文 | 本文研究了在不同条件下大肠杆菌中全局和基因特异性翻译调控的机制 | 揭示了基因特异性翻译调控的多样性，并发现许多调控翻译的基因自身也受到翻译调控，提出了可能的反馈机制 | 研究主要集中在大肠杆菌，未涉及其他细菌或更复杂的生物系统 | 探讨mRNA转录水平与蛋白质丰度之间的关系，特别是在不同环境下的翻译调控机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 全基因组转录组分析 | 随机森林模型 | mRNA和蛋白质数据 | 12种不同条件下的大肠杆菌样本 |
| 454 | 2025-03-15 |
A novel interpretability framework for enzyme turnover number prediction boosted by pre-trained enzyme embeddings and adaptive gate network
2025-May, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.02.010
PMID:40021034
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研究论文 | 本文提出了一种新的可解释性框架GELKcat，用于预测酶转换数（kcat），结合了预训练的酶嵌入和自适应门网络 | 开发了一种端到端的双表示可解释性框架GELKcat，利用图变换器进行底物分子编码和CNN进行酶word2vec嵌入，并通过自适应门网络整合底物和酶特征 | NA | 提高酶转换数（kcat）预测的准确性和可解释性，以支持合成生物学和早期药物发现 | 多物种酶-底物对的转换数数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图变换器、CNN、自适应门网络 | 分子数据、酶嵌入数据 | NA |
| 455 | 2025-03-15 |
Unleashing the potential of biotechnological strategies for the sustainable production of microalgal polysaccharides
2025-Mar-14, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2475240
PMID:40084718
|
综述 | 本文探讨了利用生物技术策略可持续生产微藻多糖的潜力 | 提出了利用合成生物学和代谢工程克服微藻多糖生产中的技术生物复杂性，并实现大规模生产的关键策略 | 尽管合成生物学有进展，但微藻产品的商业化生产仍未被充分利用 | 探索可持续的生物原料，特别是通过光合作用生产多糖的微藻，以实现碳封存和绿色生产有价值的代谢物 | 微藻及其多糖生物合成途径 | 生物技术 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA |
| 456 | 2025-03-15 |
Identification, Characterization, and Catalytic Mechanism of Regioselective UbiA Prenyltransferases in Morus Plants
2025-Mar-13, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504190
PMID:40080387
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研究论文 | 本文研究了桑树中UbiA预酰基转移酶的识别、表征及其催化机制，特别是区域选择性的精确控制 | 通过分子对接、动力学模拟和量子化学计算揭示了底物诱导的构象变化，以及不同MaPTs与moracin M之间的差异结合，并讨论了预酰基供体的识别和区域选择性逆转的潜在机制 | 尽管识别了10种MaPTs，但其催化机制，特别是区域选择性的精确控制仍不完全清楚 | 研究桑树中UbiA预酰基转移酶的催化机制，特别是区域选择性的控制 | 桑树中的UbiA预酰基转移酶及其底物moracin M | 生物化学 | NA | 分子对接、动力学模拟、量子化学计算 | NA | 分子结构数据 | 10种MaPTs |
| 457 | 2025-03-15 |
A globular protein exhibits rare phase behavior and forms chemically regulated orthogonal condensates in cells
2025-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57886-4
PMID:40069234
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研究论文 | 本文发现了一种具有化学可调节相分离特性的球状蛋白，其在体外和细胞内形成正交凝聚体，并可通过小分子调控 | 发现了一种具有罕见LCST型可逆相分离特性的球状蛋白LplA，并展示了其在细胞中形成正交凝聚体的能力 | 研究主要集中于LplA蛋白的相行为及其调控机制，尚未探讨其在更广泛生物医学应用中的潜力 | 研究蛋白质的相分离行为及其在合成生物学和生物医学中的应用 | 球状蛋白LplA及其在E. coli和人类U2OS细胞中的相行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | E. coli和人类U2OS细胞 |
| 458 | 2025-03-15 |
Design principles of gene circuits for longevity
2025-Mar-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006
PMID:40082090
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review | 本文探讨了影响寿命的基因回路，并强调了反馈回路在维持细胞平衡中的作用 | 通过系统生物学和合成生物学的方法，提出了稳定单细胞中反馈回路的策略，以增强其对衰老相关损伤的抵抗力 | 主要基于酵母模型，可能不直接适用于其他生物体 | 探索基因回路如何影响寿命，并提出延长寿命的策略 | 基因回路，特别是SIR2-HAP回路 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 459 | 2025-03-15 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Dsembler的基于网络的软件应用，旨在组装长DNA序列，以解决合成生物学中的基因组装挑战 | Dsembler通过提供具有最佳熔解温度和GC重叠的寡核苷酸集合，提高了寡核苷酸设计的准确性，解决了合成生物学中的关键挑战 | NA | 开发一种工具以促进寡核苷酸的组装，支持合成生物学、基因工程和分子生物学的进步 | 长DNA序列的组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | DNA序列 | NA |
| 460 | 2025-03-15 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-Feb-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在作物改良中的应用，包括基因电路设计、基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程和AI等策略 | 首次系统性地综述了AI驱动的合成生物学在植物工程中的应用，并提出了通过AI赋能的合成生物技术开发SMART作物的概念 | 尚未解决合成生物学发展中的挑战，如技术复杂性和伦理问题 | 探讨合成生物学和人工智能在作物改良中的应用，以提高作物产量、营养吸收、抗逆性和营养质量 | 作物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程 | AI | 基因数据、蛋白质数据、多组学数据 | NA |