本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-05-30 |
The NRT1.1-NLP7 Nexus: An Integrative Signaling Nexus from Nitrate Sensing to Systemic Adaptation and Structure-Guided Engineering
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101539
PMID:42197673
|
综述 | 该文章综述了植物中硝酸盐感知与系统性适应中的NRT1.1-NLP7整合信号中枢,并提出了结构引导的工程改造框架 | 揭示了NRT1.1和NLP7形成整合信号中枢的新机制,并提出了三层次理性设计框架,将作物改良从经验选择转向结构引导设计 | 该研究为综述性质,未提供实验验证数据,缺乏对跨物种保守性差异的定量分析 | 探讨硝酸盐感知与核内转录反应之间的耦合机制,并提出利用结构生物学和合成生物学设计提高氮利用效率的作物工程策略 | 植物中的NRT1.1和NLP7蛋白及其相互作用网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 氮响应回路改造 | 农业 |
| 442 | 2026-05-30 |
Biotic Stress Resistance in Sweet Potato: Mechanisms, Perspectives, and Sustainable Production Strategies
2026-May-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101504
PMID:42197638
|
综述 | 本文综述了甘薯生物胁迫抗性的机制、挑战及可持续生产策略,重点分析了真菌、病毒、线虫、害虫和细菌等胁迫的防御机制及分子调控网络 | 首次从多维度系统剖析甘薯防御机制,并提出了结合人工智能、基因编辑、新型组学和合成生物学等新兴技术的十年品种改良路线图 | 未提供具体的实验验证数据,且对多种胁迫交叉作用的分子机制仍缺乏深入解析 | 总结过去两年甘薯生物胁迫抗性研究的最新进展,提出可持续生产策略和品种改良路线 | 甘薯(Ipomoea batatas)及其生物胁迫因子(真菌、病毒、线虫、害虫、细菌) | 数字病理学 | 植物病害 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 甘薯(Ipomoea batatas) | NA | 农业 |
| 443 | 2026-05-30 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-May-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
|
综述 | 综述了食品体系中农药降解的工程生物催化策略,从催化性能到实际应用 | 重点介绍了通过工程策略提升酶降解性能和稳定性的进展,包括天然酶、纳米酶及多酶或杂合级联系统,并讨论了基于人工智能辅助设计和合成生物学的新兴方法 | 实验室系统向实际食品基质转化面临关键障碍,包括有限催化效率、稳定性不足、可重复使用性差、规模化限制以及监管不确定性 | 提供关于酶法降解农药的应用导向综述,重点探讨工程策略以提升性能和鲁棒性 | 天然酶、纳米酶、多酶或杂合级联系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工智能辅助设计 | NA | 多酶或杂合级联系统 | 食品, 农业 |
| 444 | 2026-05-30 |
Advances in Functional Genomics and Biotechnology for Enhancing Therapeutic Potential of Medicinal Plants
2026-May-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104245
PMID:42196225
|
综述 | 综述了功能基因组学和植物生物技术在提升药用植物治疗潜力方面的最新进展 | 提出了一个整合框架,将功能基因组发现与途径工程、合成生物学、人工智能辅助预测及可扩展生产系统相关联 | 对基因组发现如何与途径工程、规模化生产系统和医疗应用相联系的综合理解仍不充分,限制了分子见解向可持续生产转化的有效性 | 提供药用植物研究中前沿方法的全面概述,重点关注通过功能基因组学和生物技术优化关键生物活性化合物的生产 | 药用植物中的关键生物活性化合物,包括青蒿素、大麻素、人参皂苷和紫杉醇 | 机器学习 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学, 代谢工程 | 植物 | 代谢途径, 合成途径设计 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 445 | 2026-05-30 |
Rethinking Microbial Chemical Ecology: Secondary Metabolites as Concentration-Dependent Signaling Hubs with Implications for Anti-Virulence Intervention
2026-May-09, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14051074
PMID:42197459
|
综述 | 提出将微生物次级代谢产物视为浓度依赖性信号中枢的综合信号网络框架,并探讨其对抗毒力干预的启示 | 突破传统线性信号模型,将次级代谢产物重新定义为连接微生物集体行为与环境适应的关键节点,并引入空间组学和合成生物学工具 | 未给出具体实验验证,主要基于理论框架和已有研究的整合分析 | 重新认识微生物化学生态学,建立动态信号网络视角以指导抗毒力干预和应用 | 微生物次级代谢产物及其在群体感应中的双重功能 | 微生物组学 | 抗生素耐药性 | 空间组学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | 信号网络解耦 | 工业生物技术, 环境生物修复, 医学 |
| 446 | 2026-05-30 |
Engineering and Biological Mechanisms of Microalgal CO2 Fixation: A Review from Molecular Regulation to System Optimization
2026-Apr-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14050999
PMID:42197385
|
综述 | 综述了微藻CO₂固定的工程与生物机制,涵盖从分子调控到系统优化的多尺度整合 | 全面整合了多尺度视角,从气液传质、CO₂同化途径、关键酶系统到代谢调控和工程策略,并提出了合成生物学、人工智能与系统工程融合的未来路线图 | 未提供定量比较或实验验证,仅基于文献总结,可能缺乏具体数据支持 | 为开发高效、智能和可持续的微藻CO₂固定系统提供理论框架和前瞻视角 | 微藻的CO₂固定机制,包括碳浓缩机制、Rubisco和碳酸酐酶系统等 | 机器学习 | NA | 代谢通量分析、系统建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | CO₂固定途径、碳浓缩机制 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 447 | 2026-05-30 |
How hard is it to encapsulate life? The general constraints on encapsulation
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0297
PMID:41035324
|
研究论文 | 探讨封装生物系统所需克服的一般约束条件,包括现代生化系统及通用自催化系统的分析 | 首次系统性地量化封装生物系统的物理约束,包括核糖体速率与细胞大小阈值,并建立通用自催化系统的生长速率边界模型 | 基于地球现代生化系统作为测试案例,未验证该约束是否适用于所有可能的生物系统 | 研究封装生物系统时面临的一般性限制条件及其对生命起源、天体生物学和合成生物学的启示 | 现代生化系统(核糖体与细胞)及通用自催化系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 天体生物学, 生命起源研究 |
| 448 | 2026-05-30 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
|
研究论文 | 通过从LUCA代谢映射到原始反应规则,探讨生命起源中从地球化学向生物化学转变的关键过程,并建立综合建模框架进行假设验证 | 提出利用生成模型将LUCA代谢反应规则映射到原始生命反应,结合热力学、行星条件等因子构建综合建模框架,并首次探讨酶混杂性和代谢可进化性在生命起源中的驱动作用 | 尚未提供实验验证结果,仅停留在理论框架和假设层面,缺乏具体案例的定量分析 | 阐明从非生物化学到早期生命代谢的进化联系,为合成生物学应用提供理论基础 | LUCA(最后普遍共同祖先)的代谢网络与原始生命反应规则 | 系统化学,计算生物学 | NA | 生成模型,代谢反应规则映射,计算建模 | 生成模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 449 | 2026-05-30 |
Towards origins of virtual artificial life: an overview
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0298
PMID:41035322
|
综述 | 综述虚拟人工生命的起源、定义、检测及工程实现现状 | 从工程视角综合多种生命定义,提出抽象需求、通用设计与具体实现机制的三层框架,并以此审视现有进展 | 尚未有完全满足所有定义要求的虚拟人工生命实例展示 | 探讨虚拟人工生命的定义、检测与起源机制,促进该领域发展 | 虚拟人工生命(计算机内存在) | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2026-05-30 |
Origins of life: the possible and the actual
2025-10-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0281
PMID:41035333
|
评论 | 本文综述了生命起源研究中的关键理论框架与实验方法,探讨生命形成的必然性、替代生物化学可能性及从化学系统向信息演化实体的转变 | 跨学科整合了地球化学、统计物理、系统生物学、合成生物学等信息论视角,突出了原细胞系统在能量、物质与信息共演化研究中的核心地位 | 未深入探讨具体实验验证方案或量化模型,主要停留在理论框架与现存挑战的综述层面 | 调查生命起源研究的关键理论框架与实验方法,概述推动该领域发展的未解决挑战 | 生命起源的理论框架、原细胞系统及替代生物化学可能性 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2026-05-30 |
Marine bioactives: Pioneering sustainable solutions for advanced cosmetics and therapeutics
2025-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107868
PMID:40684894
|
综述 | 探讨海洋来源生物活性化合物在化妆品和医药领域的应用,并强调可持续发展和创新提取方法 | 系统评估海洋生物活性物在化妆品和医药中的潜力,提出创新提取方法如酶辅助和超临界流体萃取,并展示海洋细胞培养产量比传统提取高50倍,合成生物学可持续生产稀有化合物,纯化纯度达99.5%,环境影响降低60% | 监管挑战和可持续性问题被批判性审视,但未具体说明数据来源或研究限制 | 综述海洋生物活性物在化妆品和医药中的应用,并展望可持续发展方向 | 海洋来源的多糖、肽、脂质和色素等生物活性化合物 | 自然语言处理 | NA | 酶辅助提取、超临界流体萃取、海洋细胞培养、合成生物学、先进纯化技术 | NA | 文献数据 | 不适用 | 合成生物学 | 海藻、海洋无脊椎动物、微生物 | NA | 医药、化妆品 |
| 452 | 2026-05-30 |
Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0319337
PMID:40014593
|
研究论文 | 通过来自13个欧洲国家的全国代表性样本调查,探究公众对合成细胞潜在应用(如抗癌治疗、CO2转化、工业废物回收)的态度 | 首次在大规模跨国样本中系统评估公众对自下而上构建的合成细胞技术的态度,并利用数据驱动决策树模型分析影响态度的因素 | NA | 绘制公众对新兴合成细胞技术的初步态度,以促进社会讨论和利益相关者参与 | 来自13个欧洲国家的8382名公众 | NA | 癌症 | NA | 决策树 | 调查问卷数据 | 13个欧洲国家,8382名参与者 | NA | NA | 合成细胞 | 医疗、环境、能源 |
| 453 | 2026-05-30 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-10-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
|
研究论文 | 开发了一种智能向导RNA,通过双toehold开关在触发RNA存在时调节荧光素酶表达 | 设计了cis抑制的gRNA合成回路,包含双toehold开关和抑制型CrRNA序列,实现高效特异识别触发RNA并释放CrRNA调控靶基因 | NA | 通过合成生物学平台实现RNA响应性CRISPR/Cas9功能调控 | 智能向导RNA双toehold开关回路 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 双toehold开关回路,cis抑制型gRNA,逻辑门 | 医学 |
| 454 | 2026-05-30 |
Thermo-responsive aqueous two-phase system for two-level compartmentalization
2024-08-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51043-z
PMID:39117632
|
研究论文 | 提出一种基于热响应性双水相系统的两级区室化方法 | 首次实现基于热响应性双水相系统的两级区室化,模拟真核细胞的层级区室化结构,并通过温度触发产生类似于胶体体的第二级区室 | 未明确提及 | 开发一种模拟活细胞层级区室化的合成系统 | 热响应性双水相系统(包括PNIPAM和DEX) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物化学工程 |
| 455 | 2026-05-30 |
Glutamine-derived peptides: Current progress and future directions
2024-07, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13386
PMID:38847753
|
综述 | 回顾谷氨酰胺衍生肽在临床、运动和肠内营养中的应用,比较其与单体的功能性效,并探讨基于人工智能的肽组学和合成生物学在新颖设计和规模化生产中的潜在应用 | 综合评估谷氨酰胺衍生肽的结构相关生物活性,并创新性地提出结合人工智能肽组学和合成生物学进行从头设计和规模化生产 | 对谷氨酰胺衍生肽结构-功能关系的理解仍处于探索阶段 | 为谷氨酰胺衍生肽在食品科学中的发现、功能验证和生物制造提供参考 | 谷氨酰胺衍生肽 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品科学, 功能性食品 |
| 456 | 2026-05-30 |
A comprehensive review on novel synthetic foods: Potential risk factors, detection strategies, and processing technologies
2024-07, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13371
PMID:38853463
|
综述 | 本文全面综述了新型合成食品的潜在风险因素、检测策略及加工技术 | 首次系统性地整合了四种新型合成食品(植物基食品、培养肉、发酵食品和微藻基食品)在风险因素、检测与加工技术方面的最新进展 | 未来需继续创新和发展新的检测与加工技术,以有效评估这些新型合成食品的安全性 | 为食品行业中新型合成食品的开发和管理提供见解 | 植物基食品、培养肉、发酵食品和微藻基食品 | NA | NA | 酶联免疫吸附测定、生物传感器、色谱法、聚合酶链式反应、等温扩增、微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 457 | 2026-05-30 |
The pAblo·pCasso self-curing vector toolset for unconstrained cytidine and adenine base-editing in Gram-negative bacteria
2024-02-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1236
PMID:38180826
|
研究论文 | 开发了一套用于革兰氏阴性菌中无限制胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑的自消除载体工具集 | 开发了无需同源重组的自消除载体系统,可在单次培养步骤中去除碱基编辑平台,获得无质粒修饰菌株 | NA | 为革兰氏阴性菌的基因组工程提供精确的单核苷酸修饰工具 | 革兰氏阴性菌,如恶臭假单胞菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9碱基编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌及其他革兰氏阴性菌 | 自消除碱基编辑平台 | 工业生物技术 |
| 458 | 2026-05-30 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
|
研究论文 | 评估共转录折叠模拟质量,开发用户友好的BarMap-QA流程以简化RNA共转录折叠动力学分析 | 提出BarMap-QA流程,克服原始BarMap软件在特定共转录折叠场景下的使用困难,通过迭代工作流和多种质量指标监测实现可靠模拟 | 模拟仍基于二级结构粗粒度表示,无法捕捉RNA三级结构细节;案例仅验证合成核糖开关,普适性需进一步测试 | 提升共转录RNA折叠模拟的实用性和可靠性,验证合成生物电路设计 | 共转录折叠过程中的RNA二级结构动态变化 | 计算生物学, 合成生物学 | NA | 马尔可夫过程模拟, BarMap方法, Docker部署 | 马尔可夫模型 | RNA二级结构数据 | 一个合成转录调控型核糖开关作为案例 | BarMap-QA流程 | NA | 合成转录调控核糖开关 | 合成生物学, 计算模拟 |
| 459 | 2026-05-29 |
Micropeptides in Cancer and Immunity: Diagnostic, Therapeutic, and Synthetic Biology Frontiers
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150217
PMID:42140456
|
综述 | 综述微肽在癌症和免疫中的功能,以及作为诊断、治疗和合成生物学前沿工具的潜力 | 揭示微肽作为隐藏的蛋白质组新层,重新定义编码和非编码基因组区域的界限,并整合单细胞蛋白质基因组学、核糖体图谱、质谱和深度学习进行发现 | 未明确讨论微肽检测的标准化挑战、体内递送效率及临床转化的障碍 | 探索微肽在癌症和免疫中的双重作用,并评估其在诊断、治疗和合成生物学中的应用前景 | 微肽(包括癌基因微肽如SMIM30、circPDHK1-241aa、PDL1P41,以及肿瘤抑制微肽如HOXB-AS3、CIP2A-BP、SPAR、ASRPS) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞蛋白质基因组学, 核糖体图谱, 质谱, 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | CRISPR激活的肽回路, 靶向肽嵌合物 | 医学, 免疫治疗 |
| 460 | 2026-05-29 |
Regulatory mechanisms of secondary metabolite biosynthesis in medicinal plants under drought: advances and perspectives
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158246
PMID:42068881
|
综述 | 总结干旱条件下药用植物中萜类、苯丙素类和生物碱等次生代谢物生物合成的转录调控最新进展 | 提供了揭示转录调控网络的新见解,并为药用植物生物学、天然产物化学和作物逆境生理学领域的研究者提供实际启示 | 未提及具体实验验证或定量分析 | 总结干旱条件下药用植物次生代谢物生物合成的转录调控机制,以筛选候选标记基因和挖掘双功能基因 | 药用植物中的萜类、苯丙素类和生物碱 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 药用植物 | NA | 农业, 食品, 医学, 化妆品 |