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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-07-17 |
Chassis selection and metabolic fine-tuning enable efficient in planta betalain production
2026-Jul-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag337
PMID:42261105
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研究论文 | 通过底盘选择和代谢微调,在三种不同植物中高效生产甜菜红素 | 比较了拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘,并通过推拉策略(push+ pull)优化甜菜红素生物合成途径,实现高产且不影响大豆生长 | 强启动子驱动的推拉株系在拟南芥和烟草中导致矮化,仅在大豆中无严重生长缺陷,表明底盘耐受性差异 | 优化植物底盘选择和代谢平衡,实现甜菜红素的高效生产 | 拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 三种植物物种(拟南芥、烟草、大豆)的转基因株系 | NA | 拟南芥、烟草、大豆 | 甜菜红素生物合成途径(RUBYv2构建体)包含推拉策略:额外DODA酶(拉)和通过不同启动子调节酪氨酸前体供应(推) | 食品工业、生物技术 |
| 462 | 2026-07-17 |
De Novo Synthesis in Cancer Immunotherapy: Applications and Prospects
2026-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70847
PMID:42444981
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综述 | 本文综述从头蛋白质设计在癌症免疫治疗中的应用与前景 | 将理性设计原则(特异性、模块性、适应性)融入蛋白质从头创制,结合计算工具和合成生物学优化免疫调节蛋白 | 当前领域仍存在关键局限性,需进一步克服 | 探讨从头蛋白质设计在癌症免疫治疗中的最新进展及面临的挑战 | 从头设计的蛋白质及其在免疫疗法中的应用 | 机器学习 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 463 | 2026-07-17 |
Overcoming cellular secretion bottlenecks: advanced secretion engineering and molecular tailoring for next-generation microbial α-amylases with enhanced industrial performance
2026-Jun-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05053-2
PMID:42329468
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综述 | 综述了微生物α-淀粉酶重组生产中克服细胞分泌瓶颈的策略,包括信号肽优化、分子伴侣共表达和CRISPR-Cas技术的应用 | 将传统克隆转向设计参数框架,利用人工智能和分子动力学模拟进行理性设计,并结合CRISPR-Cas技术实现精确基因组编辑,达到创纪录的酶产量 | 未明确讨论当前方法的实际工业应用局限,如长期稳定性或成本效益 | 系统分析通过先进分泌工程和分子修饰提升微生物α-淀粉酶工业性能的策略 | α-淀粉酶及其重组生产中涉及的宿主(枯草芽孢杆菌、毕赤酵母、黑曲霉、大肠杆菌) | 合成生物学,蛋白质工程 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌,毕赤酵母,黑曲霉,大肠杆菌 | 信号肽优化,分子伴侣共表达,碳水化合物结合模块融合,代谢途径重构 | 工业生物技术,医药,食品,能源 |
| 464 | 2026-07-17 |
Engineering peroxisomal cofactor systems in Saccharomyces cerevisiae for enhanced biosynthesis of α-humulene
2026-Jun-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05060-3
PMID:42257761
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研究论文 | 通过工程化酿酒酵母过氧化物酶体辅因子系统,实现α-葎草烯的高效生物合成 | 首次系统性地工程化酿酒酵母过氧化物酶体中的辅因子平衡,并通过细胞质-过氧化物酶体双区室工程策略优化合成途径,显著提高了α-葎草烯的产量 | 研究主要关注α-葎草烯的合成,未探讨该策略在其他萜类化合物生物合成中的通用性及放大生产中的稳定性 | 利用合成生物学和代谢工程技术,在酿酒酵母中实现α-葎草烯的高效生物合成 | 酿酒酵母BY4741菌株及工程化菌株产α-葎草烯的过程 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, ScPEX5*-oPTS1*正交转运系统 | 酿酒酵母 | 过氧化物酶体区室化的甲羟戊酸途径、辅因子代谢循环(CoA循环),通过基因过表达和敲除优化乙酰-CoA供应、NADH可用性及CoA转运 | 工业生物技术 |
| 465 | 2026-07-17 |
Development of Bacillus subtilis cell factories for nutraceuticals production
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05068-9
PMID:42250015
|
综述 | 系统总结了利用枯草芽孢杆菌细胞工厂生产营养保健品的研究进展 | 详细比较了合成生物学工具和代谢工程策略在枯草芽孢杆菌中应用的局限性和优势 | 讨论当前挑战和未来研究方向 | 综述枯草芽孢杆菌在营养保健品生物合成中的应用 | 枯草芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、代谢工程策略 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 营养保健品生物合成途径 | 食品、医药 |
| 466 | 2026-07-17 |
Microbial innovations for climate-resilient agriculture: mechanisms, applications, and emerging technologies
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05031-8
PMID:42250135
|
综述 | 综述微生物技术在气候适应型农业中的应用、机制及新兴技术 | 系统整合微生物组工程、合成生物学与人工智能工具,提出精准微生物干预策略 | 未详细讨论微生物技术在实际推广中的技术、生态和社会经济障碍的量化分析 | 探讨微生物创新如何助力建造气候适应型农业,减少农业环境足迹 | 微生物(如菌根真菌)、生物肥料、生物农药及土壤-植物微生物组 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 微生物组工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | 微生物组工程, 合成生物学 | 微生物(如菌根真菌) | 微生物传感器, 代谢通路设计 | 农业, 环境 |
| 467 | 2026-07-17 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
|
综述 | 本文综述了植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的作用机制、治疗潜力及转化挑战 | 系统整合了吲哚生物碱对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号等关键炎症轴的调控机制,并强调了单萜和色氨酸衍生的吲哚生物碱在微生物群和器官选择性治疗中的前景 | 大部分证据来自临床前研究,缺乏足够的临床转化数据 | 评估植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的治疗潜力和转化可行性 | 植物来源的吲哚生物碱类化合物 | NA | 结肠炎、骨关节炎、慢性阻塞性肺疾病、动脉粥样硬化、慢性肾病、炎症驱动的癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 468 | 2026-07-17 |
Synthetic mechanobiology
2026-Apr-20, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.03.005
PMID:42013804
|
综述 | 本文综述了合成力学生物学领域,将机械信号感知与合成生物学工具相结合,重新设计细胞对机械力的响应以实现有用结果 | 将机械生物学原理与合成生物学工具整合,把力感知视为可编程的输入-输出设计问题,并通过重新布线机械信号通路作为研究策略 | 开放挑战部分未详细说明具体局限性,可能包括体内应用复杂性、机械遗传部件的精度和可预测性不足 | 探索机械信号感知的分子机制,将其用作模块化机械遗传部件,并讨论构建能读取并响应组织力学特性的工程细胞的长期愿景 | 机械信号感知分子机制及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学, 机械生物学 | NA | 机械遗传学(mechanogenetics) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 真核细胞(泛指) | 机械信号感知通路重新设计,机械遗传部件(如张力敏感元件、受体拉动模块、底物刚度响应模块) | 医学 |
| 469 | 2026-07-17 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
|
研究论文 | 提出一种用于动力学代谢模型构建、注释、可视化和分享的标准化工作流 | 整合社区标准和开源工具,确保模型的复现性、互操作性和用户可访问性 | 未提及具体限制 | 促进动力学代谢模型的可重复使用和良好文档化,推动其在代谢研究中的应用 | 动力学代谢模型 | 机器学习 | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 |
| 470 | 2026-07-17 |
Chemical organizations as a conceptual tool: from synthetic biology to interdisciplinary systems and back
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1801128
PMID:42453133
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研究论文 | 提出化学组织理论(COT)作为合成生物学概念框架,并展示其跨学科应用 | 通过反应网络形式化合成生物学概念,实现跨尺度统一建模,并验证了从非生物系统到合成生物学的渐进式教学法有效性 | NA | 建立领域通用的组织理论框架以促进合成生物学教育与复杂系统素养传播 | 跨学科学生群体(设计、社会科学、数学、生态学背景) | 合成生物学 | NA | 化学组织理论(COT)、pyCOT计算平台 | 反应网络模型 | 教学实践数据 | 4年跨学科教学实践,具体样本量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学教育、复杂适应系统素养培养 |
| 471 | 2026-07-17 |
Advances in microbial extracellular vesicles: synthetic biology platforms and medical applications
2026, Extracellular vesicles and circulating nucleic acids
DOI:10.20517/evcna.2025.103
PMID:42454186
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综述 | 综述微生物细胞外囊泡的合成生物学平台和医学应用 | 概述如何利用合成生物学工具和平台工程化微生物细胞外囊泡,包括提高产量、修饰货物和定制表面特性 | 临床转化面临缺乏标准化、普遍适用的分离纯化方案的挑战 | 填补知识空白并促进基于微生物细胞外囊泡的治疗策略发展 | 微生物细胞外囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 472 | 2026-07-15 |
Devising a divisome for synthetic cells
2026-Jul-13, Nature reviews. Chemistry
DOI:10.1038/s41570-026-00848-1
PMID:42443379
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综述 | 本文综述了构建合成细胞分裂机制的研究进展 | 系统总结了模拟细胞分裂关键阶段(对称性破缺、膜变形缩窄、最终分裂)的现有策略,并批判性评估了各方法的成功与局限 | 当前各模块尚未实现有效整合,且缺乏完整的功能性分裂系统 | 实现合成细胞最小化功能分裂系统 | 合成细胞的分裂机制 | 合成生物学 | NA | 蛋白质体外重建 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成分裂装置(包括对称性破缺、膜变形缩窄、最终分裂模块) | 合成生物学 |
| 473 | 2026-07-15 |
Frontiers in polysaccharide biosynthesis: Decoding the catalytic logic of enzymes for future applications
2026-Jul, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2026.109907
PMID:41931921
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综述 | 系统分析多糖生物合成的分子机制,涵盖从前体活化到修饰的全过程,并探讨动物、植物和微生物系统的共性与特性 | 整合酶学工具与合成生物学策略,揭示并重构多糖生物合成网络,强调人工智能与系统生物学驱动的创新潜力 | 未具体讨论机制解析中的技术挑战或现有合成系统在实际应用中的瓶颈 | 为理解多糖生物合成提供全面的生物学视角和理论框架,推动可控生产结构明确的多糖 | 多糖生物合成酶与生物合成系统(来自动物、植物和微生物) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多种宿主生物(动物、植物、微生物) | 多糖生物合成通路重构与优化 | 农业、工业生物技术、医学、材料学 |
| 474 | 2026-07-15 |
Microbial and synthetic biology solutions for waste management and biomanufacturing off Earth
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103491
PMID:41930789
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综述 | 探讨利用微生物和合成生物学策略将太空废物转化为有价值的资源,以支持可持续发展和减少对地球依赖 | 创新点在于利用工程极端微生物在微重力环境下实现废物分解、生物采矿和生物制造,为建立自给自足的地外栖息地奠定基础 | 未提及具体实验验证或实际应用中的挑战与局限性 | 研究在太空中通过微生物和合成生物学解决废物管理并实现生物制造的可持续方案 | 国际空间站中的废物(包括有机废物、电子废物)以及利用的工程极端微生物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 极端微生物 | 废物分解电路、生物采矿通路、生物制造平台 | 环境, 工业生物技术 |
| 475 | 2026-07-15 |
Current Progress of Natural Product Export by Yeast
2026-Apr-15, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08982
PMID:41926336
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综述 | 本文综述了通过缓解代谢负担提高酵母天然产物合成的最新进展,重点关注萜类化合物的外排策略 | 系统总结了三种缓解酵母细胞内天然产物积累引起的代谢负担的策略:过表达和工程化转运蛋白、改变膜结构以及萃取方法 | 仅关注酵母物种,且主要聚焦于萜类化合物,未涉及其他微生物或天然产物类型 | 提升酵母细胞工厂中天然产物的合成效率,实现经济可行的可持续生产 | 酵母酿酒酵母中的天然产物合成,特别是萜类化合物 | 合成生物学, 微生物工程 | NA | 转运蛋白工程, 细胞膜工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 天然产物外排通路 | 工业生物技术, 医药 |
| 476 | 2026-07-15 |
A highly limited amino acid library from asteroid Bennu yields wide-ranging protein folds
2026-Apr-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71509-6
PMID:41932940
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研究论文 | 利用AI蛋白质设计软件探索古老蛋白质结构,发现小规模原始氨基酸库能产生广泛关键折叠 | 首次证明只需6种氨基酸(基于Bennu小行星数据)即可重现所有测试蛋白折叠,挑战了蛋白质复杂折叠需多样氨基酸的传统观点 | 蛋白质设计基于模拟预测,缺乏实验验证;仅关注折叠结构,未涉及功能活性 | 探究原始氨基酸库规模对蛋白质折叠多样性的影响,揭示生命起源可能性 | 小行星Bennu氨基酸数据、Miller-Urey实验及默奇森陨石数据约束的原始氨基酸库 | 蛋白质设计、人工智能 | NA | AI蛋白质设计软件、AlphaFold2 | AlphaFold2 | 氨基酸序列数据 | 6种(Bennu高丰度组)、7种(Miller-Urey与默奇森混合组)、8种氨基酸(另一实验组) | NA | NA | NA | 合成生物学、医学 |
| 477 | 2026-07-15 |
Bioactive Peptides: Production Strategies, Biological Activities, and Emerging Therapeutic Applications
2026, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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综述 | 综述了生物活性肽的生产策略、生物活性及其新兴治疗应用 | 整合了2024-2025年间分子、生物技术和信息学驱动的生物活性肽研究最新进展,涵盖生产策略、生物测定优化及治疗转化 | 纯化困难、稳定性问题和生物利用度限制影响广泛应用 | 探讨生物活性肽在营养、功能食品和治疗应用中的潜力 | 生物活性肽 | 机器学习 | NA | 酶解、微生物发酵、化学合成、重组方法、超滤、色谱、质谱、电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 食品 |
| 478 | 2026-07-15 |
Oncobiotics in urinary bladder cancer. A narrative review of living cancer therapeutics
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1845015
PMID:42440727
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综述 | 本文综述了活体癌症疗法在尿路上皮膀胱癌中的应用,涵盖细菌、病毒和微生物组为基础的肿瘤生物制剂的作用机制、历史发展和转化进展 | 系统总结了五种相互关联的机制(直接肿瘤破坏、免疫系统调节、工程化药物递送、溶瘤病毒疗法和微生物组驱动的免疫调节),并强调这些机制在实践中经常重叠,反映了活体治疗的多功能性 | 当前证据受限于小规模研究、异质性终点和长期随访不足;生物递送障碍、宿主免疫中和、患者间异质性、生物安全问题、监管复杂性以及缺乏晚期随机临床数据 | 绘制活体癌症疗法在膀胱癌中的机制、历史和转化进展图谱,评估其克服传统疗法局限性的潜力 | 尿路上皮膀胱癌及相关活体癌症疗法(细菌型、病毒型和微生物组型肿瘤生物制剂) | 数字化病理学 | 膀胱癌 | NA | NA | NA | NA | 遗传工程、合成生物学 | 细菌、病毒、人体微生物组 | 肿瘤精细胞编程的递送系统 | 医学 |
| 479 | 2026-07-14 |
Transposons as Tools for Future Genome Engineering in Yeasts and Filamentous Fungi
2026-Jul-13, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70036
PMID:42439777
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综述 | 总结了转座子在酵母和丝状真菌基因组工程中作为工具的研究现状和未来机遇 | 系统概述了不同类型转座子(如ITR DNA转座子、LTR及非LTR反转录转座子和CRISPR相关转座子)在真菌基因组工程中的应用潜力,特别是CASTs在低同源重组效率宿主中实现大片段定点整合的优势 | 转座子工具在非酵母属宿主中的开发仍处于早期阶段,实际应用可能受制于转座效率、靶向特异性和宿主适应性 | 探讨转座子技术在真菌基因组工程中的发展前景,加速菌株开发 | 酵母和丝状真菌 | NA | NA | 转座子技术、CRISPR相关转座子(CASTs) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(用于转座子整合) | 酵母属、丝状真菌 | NA | 合成生物学、代谢工程 |
| 480 | 2026-07-14 |
Enhancing the Secretion Systems: Genetic Engineering of Super Bioagents for Effective Plant Disease Control
2026-Jul-12, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70303
PMID:42437521
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综述 | 本文综述了通过遗传工程改造微生物分泌系统以开发超级生物制剂用于植物病害控制的前景 | 提出了超级生物制剂的概念,强调利用CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白酶工程和合成生物学精准改造分泌系统以增强病原靶向和分泌效率 | 大规模部署生物防治剂仍面临挑战,且超级生物制剂的实际应用和田间性能验证尚不充分 | 探讨通过理性定量工程化微生物分泌系统将传统生物防治剂转化为集成超级生物制剂的可能性 | 微生物分泌系统和超级生物制剂 | 机器学 | 植物病害 | CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 分泌系统工程 | 农业 |