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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-05 |
Bacteria-algae synergy in carbon sequestration: Molecular mechanisms, ecological dynamics, and biotechnological innovations
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108655
PMID:40701356
|
综述 | 系统阐述细菌-藻类协同作用在碳封存中的分子机制、生态动力学和生物技术创新 | 首次将群体感应等分子机制、RDOC形成等生态碳转化过程与合成生物学应用整合到统一框架,并提出'微生物互作网络优化'新策略 | 存在规模化挑战,包括光生物反应器中的光限制问题和合成菌群的生态风险 | 探讨细菌-藻类协同作用增强碳封存的机制与应用 | 微藻(如小球藻、三角褐指藻)和大型藻类(如巨藻、海带)与细菌的共生体系 | 环境生物技术 | NA | 群体感应、水平基因转移、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | 微藻、大型藻类、细菌 | 合成菌群设计 | 环境,能源 |
| 462 | 2025-10-05 |
Recent advances in engineering microbial lipases for industrial applications
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108658
PMID:40701353
|
综述 | 本文全面综述了脂肪酶的分类、特性、工业生产应用以及通过工程化改造开发新型脂肪酶生物工艺和产品的最新进展 | 整合合成生物学与工程工具设计新型脂肪酶,结合蛋白质工程、固定化技术和人工智能工具提升脂肪酶催化性能 | 微生物脂肪酶存在多种同工型限制了应用并需要昂贵的纯化过程 | 开发适用于多种工业应用的工程化脂肪酶 | 微生物脂肪酶及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、固定化技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物细胞 | 代谢途径、生物传感器 | 农业、能源、化妆品、化学、食品、制药、纺织 |
| 463 | 2025-10-05 |
Revolutionizing keratinase science: Biocatalytic advances, sustainable innovation, and industrial perspectives
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108657
PMID:40701354
|
综述 | 系统回顾角质酶研究进展,阐述其分类机制与应用前景,并提出未来研究方向 | 整合人工智能辅助酶设计与合成生物学技术提升角质酶性能,提出多功能系统开发策略 | 工业化应用受限于高生产成本、酶稳定性不足和监管复杂性 | 推动角质酶在可持续发展和资源管理中的转化应用 | 角质酶(丝氨酸蛋白酶、金属蛋白酶及其杂合蛋白酶) | 工业生物技术 | NA | 蛋白质工程、人工智能辅助酶设计、合成生物学、多组学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业,工业,生物医学,生物能源,环境修复 |
| 464 | 2025-10-05 |
Advances in sphingan production: Biosynthesis and synthetic biology strain modification strategies based on Sphingomonas
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108659
PMID:40712756
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综述 | 综述鞘氨醇单胞菌属产鞘聚糖的生物合成机制及合成生物学改造策略 | 系统整合了鞘聚糖的结构、生物合成途径及遗传工程研究现状,并展望未来研究方向 | NA | 探讨鞘氨醇单胞菌产鞘聚糖的生物合成机制及基因工程改良策略 | 鞘氨醇单胞菌属及其产生的鞘聚糖(如结冷胶、韦兰胶等) | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | Sphingomonas | 鞘聚糖生物合成途径 | 食品, 制药 |
| 465 | 2025-10-05 |
Bioactive metabolites and extracellular vesicles from the marine chlorophyte genus Tetraselmis: Review
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108662
PMID:40714169
|
综述 | 本文综述了海洋绿藻属Tetraselmis的生物活性代谢物和细胞外囊泡在生物技术和生物医学领域的应用潜力 | 系统探讨了Tetraselmis物种的代谢灵活性、生物活性化合物生产及其细胞外囊泡的治疗潜力,并提出了结合人工智能和合成生物学的新兴跨学科工具优化策略 | NA | 探索Tetraselmis属微藻在生物技术和生物医学领域的应用潜力 | 海洋绿藻属Tetraselmis及其产生的生物活性代谢物和细胞外囊泡 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | Tetraselmis物种 | NA | 医药, 食品, 化妆品, 水产养殖, 工业生物技术 |
| 466 | 2025-10-05 |
Decoding NF-κB: nucleocytoplasmic shuttling dynamics, synthetic modulation and post-therapeutic behavior in cancer
2025-Aug-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10917-1
PMID:40775128
|
综述 | 本文综述了NF-κB的结构功能、核质穿梭动力学、合成生物学调控方法及其在癌症治疗后的行为特征 | 系统整合了NF-κB核质穿梭的时空调控机制,并提出通过合成基因电路和光遗传学工具实现精准调控的创新方法 | NF-κB复合物存在随机变异性且缺乏明确的药物结合口袋,使其在癌细胞中的完全抑制具有挑战性 | 深入解析NF-κB信号通路的复杂调控机制及其在癌症耐药中的作用 | 核因子κB(NF-κB)信号通路及其在癌细胞中的行为 | 合成生物学 | 癌症 | 光遗传学工具 | NA | NA | NA | 合成基因电路 | NA | 肿瘤微环境免疫调节电路 | 医学 |
| 467 | 2025-10-05 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
|
综述 | 本文综述了用于细胞事件基因组记录的分子电路策略,探讨了新兴合成生物学工具在构建多样化传感器和遗传电路架构中的应用 | 系统梳理了基因组记录领域的最新进展,重点探讨如何利用新兴合成生物学工具构建能够将细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中的新型传感器和分子电路 | 目前直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其在揭示细胞命运决定新见解方面的潜力尚未完全实现 | 开发能够记录细胞事件的基因组记录技术和分子电路 | 细胞事件、基因组记录、分子电路 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 传感器模块、遗传电路架构、基因组记录电路 | 医学 |
| 468 | 2025-10-05 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
|
综述 | 探讨机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂优化中的协同应用 | 系统阐述机器学习与合成生物学的交叉融合如何推动微生物细胞工厂的升级 | NA | 为生物制造与人工智能交叉领域的研究提供指导 | 微生物细胞工厂 | 机器学习 | NA | 合成生物学技术 | 机器学习衍生模型 | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 化学品生产, 人类健康, 环境修复 |
| 469 | 2025-10-05 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
|
研究论文 | 开发能够持续产生硫化氢治疗血管舒张的红细胞微反应器 | 首次将PLP-PLys复合物封装到红细胞中构建微反应器,实现持续可控的H2S生产和局部血管舒张 | 仅进行了体外实验验证,尚未开展体内研究 | 开发用于心血管治疗的气体递质H2S可控释放平台 | 红细胞微反应器和离体胸主动脉环 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法、荧光成像、体外血管环实验 | NA | 生物化学数据、荧光成像数据 | NA | 低渗膨胀封装技术 | 红细胞 | 级联反应系统:PLP-PLys复合物和血红蛋白介导的L-半胱氨酸转化为H2S | 医学 |
| 470 | 2025-10-05 |
Exploring the Application and Prospects of Synthetic Biology in Engineered Living Materials
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202305828
PMID:37677048
|
综述 | 探讨合成生物学在工程活性材料领域的应用前景与发展趋势 | 系统阐述具有自组织、自修复和适应性等生命特征的工程活性材料如何超越传统合成材料 | NA | 综述工程活性材料在不同应用领域的最新研究进展和设计策略 | 源自细菌、真菌和植物的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌, 植物 | NA | 环境修复, 生态建筑, 可持续能源 |
| 471 | 2025-10-05 |
Engineering DNA nanopores: from structural evolution to sensing and transport
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102137
PMID:40761509
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综述 | 本文回顾DNA纳米孔的结构演变历程,并探讨其在分子传感和跨膜传输中的应用前景 | 首次将DNA纳米孔的结构演进分为三个发展阶段进行系统梳理,并整合了稳定性、可扩展性等关键局限性的分析 | NA | 系统总结DNA纳米孔的技术发展路径,为合成生物学和纳米医学领域的应用提供优化路线图 | DNA纳米孔的结构设计与功能特性 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术、DNA折纸术 | NA | NA | NA | DNA折纸术 | NA | 仿生纳米孔、跨膜传输系统 | 合成生物学, 纳米医学 |
| 472 | 2025-10-05 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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综述 | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的发展前景和应用潜力 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学,实现植物基因组的精确修饰,并强调人工智能与合成生物学的融合 | 面临监管审批和公众接受的挑战,需要进行严格的多领域测试以确保可重复性 | 通过合成生物学技术解决全球粮食安全挑战,建立更具韧性和可持续的农业系统 | 植物基因组和农业系统 | 合成生物学 | NA | 遗传工程、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 光合作用效率优化、固氮途径、抗逆性通路、生物强化代谢途径 | 农业 |
| 473 | 2025-10-05 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文系统探讨了顺式酰基转移酶聚酮合酶的结构特征与理性工程策略 | 聚焦于基于结构机制的模块化构建块选择与催化域设计的多维度工程方法 | 未涉及具体实验验证数据(因属综述类型) | 推动聚酮类化合物的合成生物学应用与天然产物发现 | 顺式酰基转移酶聚酮合酶系统 | 合成生物学 | NA | 酶工程 | NA | 结构生物学数据 | NA | NA | NA | 多模块酶组装线 | 医药 |
| 474 | 2025-10-05 |
[Research progress in the fungal bioluminescence pathway]
2025-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250138
PMID:40769542
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综述 | 本文综述真菌生物发光途径在植物工程中的应用进展及其在生物传感和农业生物技术中的潜力 | 将真菌生物发光途径基因工程改造至植物中创建自发光标本,克服传统报告系统底物限制,并结合机器学习方法优化表型 | NA | 探讨植物真菌生物发光途径工程化应用及其在农业生物技术和环境监测中的创新机会 | 真菌生物发光途径及其在转基因植物中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、机器学习 | NA | NA | NA | 基因工程 | 植物 | 真菌生物发光途径(催化内源性咖啡酸氧化产生绿色生物发光) | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 475 | 2025-10-05 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-05-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
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研究论文 | 开发了一种基于mRNA结构预测的信号肽筛选方法,用于改进骨形态发生蛋白2的生产 | 首次结合氨基酸序列和mRNA二级结构预测来系统筛选信号肽,将MXFold2等计算工具应用于信号肽工程 | mRNA结构预测工具在此应用中可靠性不足,筛选的信号肽在C2C12细胞中活性均不如天然序列 | 开发基于计算预测的信号肽筛选方法,提高BMP2蛋白的生产效率 | 骨形态发生蛋白2(BMP2)及其信号肽 | 合成生物学 | 骨科疾病 | mRNA结构预测,信号肽活性预测,细胞培养实验 | SignalP,DeepLoc,MXFold2 | 氨基酸序列,核苷酸序列 | 2,611个TGF-β超家族信号肽,7个选定序列进行体外测试 | NA | HEK293T细胞,C2C12细胞 | NA | 医学 |
| 476 | 2025-10-05 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
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综述 | 本文综述了红酵母作为食品生物技术底盘细胞的潜力,涵盖多组学研究、细胞工厂构建及食品废弃物增值转化 | 系统评估红酵母作为新型食品生物技术底盘的综合潜力,整合多组学数据与合成生物学工具开发进展 | 红酵母代谢工程面临多组学信息挖掘不足、遗传操作工具效率低下及独特代谢特征认知有限等挑战 | 探索红酵母作为可持续食品生物技术底盘细胞的开发潜力与应用前景 | 红酵母属微生物,特别是用于食品加工废弃物增值转化的菌种 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 红酵母 | 细胞工厂设计,用于生产脂质、类胡萝卜素、酶和糖醇等食品成分 | 食品, 工业生物技术 |
| 477 | 2025-10-05 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
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研究论文 | 本研究通过挖掘UDP-葡萄糖基转移酶开发大黄酚葡萄糖苷的高效生产策略 | 评估了10种高效的大黄酚UDP-葡萄糖基转移酶,开发了全细胞催化系统实现78.9%的高转化率,并揭示了OsUGT的双位点葡萄糖基化活性 | 丝状真菌中植物源蛋白表达存在挑战,阻碍了进一步优化 | 开发大黄酚葡萄糖苷的高效生物合成方法 | 大黄酚-6-β-d-葡萄糖苷(E6G)和大黄酚-8-β-d-葡萄糖苷(E8G) | 合成生物学 | NA | 序列分析、结构分析、系统发育分析 | NA | NA | 10种UDP-葡萄糖基转移酶 | 合成生物学方法 | 丝状真菌 | 大黄酚葡萄糖苷生物合成途径 | 医药 |
| 478 | 2025-10-05 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2025-Aug-06, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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综述 | 系统总结植物异戊烯基转移酶的多样性、催化机制及其在异源生产异戊烯化天然产物中的应用 | 首次对160余种植物UbiA型异戊烯基转移酶和代表性异戊烯二磷酸合酶进行系统性总结,涵盖酶工程策略和异源生产应用 | 植物异戊烯基转移酶的功能多样性仍未完全阐明 | 推进植物异戊烯基转移酶的表征与应用,为基于异戊烯化天然产物的药物开发奠定基础 | 植物异戊烯基转移酶和异戊烯二磷酸合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组学、合成生物学、酶工程 | NA | 文献数据 | 超过160种植物UbiA型异戊烯基转移酶及代表性异戊烯二磷酸合酶 | NA | NA | NA | 医药 |
| 479 | 2025-10-05 |
A framework for complex signal processing via synthetic biological operational amplifiers
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62464-9
PMID:40745425
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研究论文 | 本研究开发了一种通过合成生物学运算放大器处理复杂生物信号的框架 | 通过整合正交运算放大器到标准化生物过程中,实现了高效信号分解和放大,并设计了可扩展的运算放大器 | NA | 开发能够处理复杂生物信号的合成生物学框架 | 遗传电路和全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | σ/anti-σ对工程、核糖体结合位点强度调节、开环和闭环配置 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 运算放大器、全细胞生物传感器、生长状态响应诱导系统 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 480 | 2025-10-05 |
Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization
2024-07-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693
PMID:39017718
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研究论文 | 本研究开发了一种能够独立招募两种不同目标蛋白的自组装蛋白笼Mi3,实现了在体外和活细胞内的双重功能化 | 首次将SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag两种化学方法整合到单一蛋白笼中,实现了两种不同目标蛋白的独立可控定位 | NA | 开发能够同时负载多种功能蛋白的自组装蛋白笼平台 | 自组装蛋白笼Mi3及其双重功能化系统 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag蛋白质连接技术 | NA | 蛋白质组装数据、荧光成像数据、酶活性数据 | NA | 蛋白质工程 | 活细胞 | 双重功能化蛋白笼系统,可同时负载膜靶向肽和酶蛋白 | 医学, 合成生物学 |