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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-01-22 |
From edits to insights: precision microbial engineering for systems biology
2026-Jan-19, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102705
PMID:41558158
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综述 | 本文综述了精准微生物工程在系统生物学中的应用,重点探讨了从基因编辑到系统洞察的技术进展 | 强调了精准扰动策略(如序列变异分析)在揭示基因水平扰动无法触及的生物学原理方面的创新,包括蛋白质序列-功能图谱和途径变异影响 | NA | 通过精准工程方法提升对生物功能的理解,并加速生物技术和合成生物学的进展 | 微生物系统,包括其基因组和细胞机制 | 系统生物学 | NA | 基因敲除文库、CRISPRi/a文库、精准扰动策略 | NA | 基因组序列数据、变异数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物(如细菌、酵母) | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 482 | 2026-01-22 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
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研究论文 | 本文介绍了InSillyClo,一个开源网络应用程序,用于辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | InSillyClo是首个专门处理大规模克隆工作流程中耗时且易错任务的软件工具,提供用户友好的界面和自动化数据生成 | NA | 开发一个工具来简化和自动化大规模克隆工作流程中的计算任务 | Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 支持用户定义的遗传设计和工作流程生成 | 工业生物技术 |
| 483 | 2026-01-22 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
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研究论文 | 本研究通过重构最小黏着斑样复合物于巨型单层囊泡中,揭示了仅由特定蛋白质-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递及结构稳定性,为探究机械传感和工程化力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等核心蛋白的最小黏着斑复合物,并展示了其能独立介导肌动蛋白网络形成、力传递及囊泡变形,无需完整细胞环境 | 研究基于简化合成系统,可能未完全模拟天然细胞中黏着斑的复杂调控机制和动态相互作用 | 探究黏着斑复合物进行力传递和机械传感的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP等蛋白质与含PIP和整合素β1尾的膜组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重构与膜锚定技术 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | 巨型单层囊泡(GUVs) | 黏着斑样复合物作为力传感与传递模块,结合肌动蛋白网络和非肌肉肌球蛋白IIa形成收缩系统 | 医学、工业生物技术 |
| 484 | 2026-01-22 |
Synthetic Biology Strategies for Activating Cryptic BGCs in Streptomyces: Engineering Native and Synthetic Promoters for Antibiotic Discovery
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c08473
PMID:41552574
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综述 | 本文综述了在链霉菌中利用天然和合成启动子工程激活隐性生物合成基因簇以发现新型抗生素的策略 | 系统整合了CRISPR激活系统和机器学习引导的启动子设计等前沿技术,用于激活隐性基因簇 | NA | 为天然产物发现提供启动子工具的系统级理解和转化应用指南 | 链霉菌中的隐性生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、CRISPR激活系统、机器学习引导设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 启动子重构(组成型和诱导型)用于激活隐性生物合成基因簇 | 医药 |
| 485 | 2026-01-22 |
CRISPR/Cas9-Mediated Metabolic Engineering of Endophytic Pseudomonas loganensis sp. nov. for the Production of Nutritionally Valuable Carotenoids
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05877
PMID:41552580
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术对内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov.进行代谢工程改造,以生产具有营养价值的类胡萝卜素 | 首次将内生细菌作为微生物底盘用于类胡萝卜素生产,并利用CRISPR-Cas9技术敲除关键基因构建了能生产多种类胡萝卜素的工程菌株 | 未提及大规模发酵的可行性及生产成本评估 | 开发可持续且环境友好的类胡萝卜素生物生产方法 | 内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov. | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、HPLC分析、响应面方法学 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas loganensis sp. nov. | 代谢途径工程(敲除类胡萝卜素合成关键基因,引入过表达质粒) | 食品、饲料、制药、化妆品 |
| 486 | 2026-01-22 |
Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110714
PMID:41289712
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研究论文 | 本研究在萝芙木中鉴定并表征了育亨宾O-乙酰转移酶(YAT),揭示了其在育亨宾生物碱代谢中的关键作用及叶特异性表达模式 | 首次在利血平生物合成基因簇中发现并表征了叶特异性乙酰转移酶YAT,阐明了育亨宾乙酰化的酶学基础及其在生物碱多样性演化中的意义 | 研究主要基于Rauvolfia serpentina,未在其他物种中广泛验证;对YAT的调控机制和进化路径的探索仍有限 | 解析萝芙木中单萜吲哚生物碱(MIAs)的生物合成途径,特别是育亨宾乙酰化的酶学机制与进化动态 | 萝芙木(Rauvolfia serpentina)中的育亨宾O-乙酰转移酶(YAT)及其在育亨宾和别育亨宾乙酰化中的作用 | 合成生物学 | NA | 同源建模、底物对接实验、基因表达分析 | NA | 基因序列、酶活性数据、表达模式数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 487 | 2026-01-22 |
Cell-free immuno-profiling on a genetically programmed biochip
2026-Jan, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-02058-0
PMID:41372446
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研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞合成生物学的微流控生物芯片平台,用于定量分析抗体与抗原的相互作用,实现快速免疫分析 | 扩展了先前开发的微流控生物芯片平台,通过局部基因刷在图案化隔室中创建连续抗原密度梯度,实现单次芯片上同时合成多种抗原并生成多个抗体结合曲线 | 未明确说明样本处理的通量限制或芯片的可扩展性 | 开发一种无需蛋白纯化步骤的快速定量方法,用于分析复杂蛋白质相互作用,特别是针对人类免疫分析和新兴病原体应对 | SARS-CoV-2抗原、单克隆抗体、多克隆抗体、人类血清样本、人类ACE2受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 无细胞合成生物学、光刻图案化、微流控技术 | NA | 蛋白质相互作用数据 | 1微升人类血清(未明确总样本数) | 基因刷、光刻图案化 | 无细胞系统 | 抗原梯度生成系统、受体-配体相互作用重建系统 | 医学 |
| 488 | 2026-01-22 |
Deciphering the molecular roles of antimicrobial peptides in plant innate immunity and their potential applications in crop protection
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110961
PMID:41422562
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综述 | 本文综述了植物抗菌肽在先天免疫中的作用及其在作物保护中的潜在应用 | 整合多组学技术与合成生物学,加速了抗菌肽的理性设计及其在农业中的生态友好型应用 | 存在病原体快速进化抗性、目标特异性不足、田间条件下肽不稳定性、潜在植物毒性以及复杂监管审批路径等挑战 | 探讨植物抗菌肽的分子角色及其在可持续作物保护中的应用潜力 | 植物抗菌肽及其在先天免疫系统中的作用 | NA | NA | 多组学技术(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)与合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 489 | 2026-01-22 |
A zinc finger transcription factor enables social behaviors while controlling transposable elements and immune response in prefrontal cortex
2024-01-25, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-024-02775-5
PMID:38272911
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法重编程转录因子ZFP189的功能,揭示其在调控前额叶皮层结构、转座子表达和免疫反应中促进复杂社交行为的作用 | 通过创建合成ZFP189转录因子(包括激活型ZFP189),逆转内源性抑制功能,首次证明ZFP189转录控制对树突棘形态和社交行为的双向调控,并关联转座子与免疫基因表达 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类或其他物种;病毒递送方法可能引入非特异性效应;社交行为评估可能受环境因素影响 | 探究ZFP189转录因子在前额叶皮层中调控社交行为的神经生物学机制 | 小鼠前额叶皮层、ZFP189转录因子、树突棘形态、转座子、免疫相关基因 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、病毒递送、RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 小鼠前额叶皮层组织 | 病毒递送系统 | 小鼠 | 转录因子重编程,包括激活型ZFP189合成转录因子 | 医学 |
| 490 | 2026-01-22 |
A zinc finger transcription factor tunes social behaviors by controlling transposable elements and immune response in prefrontal cortex
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535374
PMID:37066210
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法重编程锌指转录因子ZFP189,探究其在鼠前额叶皮层中调控转座元件和免疫反应以调节社会行为的作用 | 利用合成生物学创建新型合成ZFP189转录因子,揭示其通过结合DNA转座元件富集区域调控免疫相关基因,从而协调社会行为所需的结构和转录神经适应 | 研究仅基于鼠模型,未在人类或其他物种中验证,且社会行为评估可能受实验条件限制 | 探究ZFP189在前额叶皮层中调控社会行为的神经生物学机制 | 鼠前额叶皮层中的ZFP189转录因子及其对转座元件和免疫基因的调控 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、病毒递送、RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 鼠前额叶皮层组织 | 合成生物学方法 | 鼠 | 合成ZFP189转录因子,包括激活型ZFP189以调控目标基因转录 | 医学 |
| 491 | 2026-01-21 |
CRISPR-Based Approaches to Engineer Nonmodel Bacteria for Bioproduction and Biotherapeutics
2026-Jan-20, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.5c00613
PMID:41488985
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综述 | 本文综述了基于CRISPR-Cas系统在非模式细菌工程化中的应用,以开发生物生产和生物治疗产品 | 强调利用CRISPR效应蛋白相对独立于宿主辅助因子的特性,克服物种特异性障碍,实现对难以工程化的非模式微生物(如C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌)的精确基因操作,从而拓展其独特的代谢和生物合成潜力 | 文中提及当前工具在非模式微生物中的应用仍存在局限性,但未具体说明是哪些技术或生物学障碍 | 探讨如何利用CRISPR-Cas系统扩展微生物工程的范围,以开发可持续生物制造、天然产物发现和下一代活体生物治疗剂 | 非模式细菌,特别是C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非模式细菌,包括C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌、肠道共生菌 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 492 | 2026-01-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Jan-20, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中内切-β-甘露聚糖酶(MAN2和MAN5)在维持半纤维素生物合成中的作用,揭示了它们通过切割不溶性β-甘露聚糖聚合物来促进亲水性对应物生成的新机制 | 发现了内切-β-甘露聚糖酶在细胞内(高尔基体)的新功能,即通过切割不溶性β-甘露聚糖聚合物来维持半纤维素生物合成,这挑战了传统上认为这些酶仅参与种子萌发过程中细胞壁多糖降解的观点 | 研究主要基于拟南芥模型,可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性;对MAN酶与CSLA相互作用的分子机制细节仍需进一步探索 | 研究植物细胞壁β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在调控因子 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的内切-β-甘露聚糖酶(MAN2和MAN5)以及纤维素合成酶类似物A(CSLA) | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学、基因过表达、突变体分析 | NA | NA | 拟南芥突变体(man2 man5双突变体)及相关转基因株系 | 酵母合成生物学 | 酵母(用于合成生物学研究) | NA | 农业 |
| 493 | 2026-01-21 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析由两性霉素B与麦角固醇相互作用引起的纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C的效果 | 首次开发了通过浓度依赖性释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂活性的分析系统,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 分析脂质体膜上纳米孔形成的特性,并开发用于筛选膜活性化合物的实用系统 | 脂质体膜上的纳米孔形成,涉及两性霉素B、麦角固醇和shodoamide C的相互作用 | NA | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 494 | 2026-01-21 |
Extended Dissipative Analysis for Uncertain Delayed Genetic Regulatory Networks via Interval Type-2 T-S Fuzzy Framework
2026-Jan-19, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2026.3652172
PMID:41553905
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研究论文 | 本研究在区间二型T-S模糊框架下,对不确定时滞基因调控网络进行扩展耗散性分析 | 首次利用区间二型模糊集捕捉基因调控网络的复杂动态和参数不确定性,并通过构建新型Lyapunov-Krasovskii泛函获得最大允许时滞界限的显式推导 | NA | 为基因调控网络开发鲁棒控制策略的理论理解和实际设计 | 不确定时滞基因调控网络 | 机器学习 | NA | 区间二型T-S模糊框架,Lyapunov-Krasovskii泛函方法 | T-S模糊模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 495 | 2026-01-21 |
Electrochemical techniques in protein engineering: Innovations in redox-active protein design and electron transfer mechanisms
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149750
PMID:41418956
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综述 | 本文综述了电化学技术在蛋白质工程中的应用,特别是在设计氧化还原活性蛋白和探究电子转移机制方面的创新 | 综述了人工智能与计算建模在识别增强电子转移效率的突变中的应用,以及合成生物学构建人工电子传递途径和纳米结构材料改善蛋白质固定化与电荷传导的最新进展 | 蛋白质稳定性、隧穿效应的精确控制以及有效的电子集成等挑战仍需解决 | 探讨电化学技术如何支持工程化氧化还原蛋白的设计与功能优化,并推动其在生物电子系统中的应用 | 氧化还原活性蛋白及其工程化设计 | 蛋白质工程 | NA | 电化学技术(阻抗谱、循环伏安法、计时电流法、扫描电化学显微镜) | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 人工电子传递途径 | 生物传感、生物电催化、生物电子学、医疗保健监测 |
| 496 | 2026-01-20 |
A review of phage therapy for drug-resistant Pseudomonas aeruginosa infections
2026-Apr, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128417
PMID:41412007
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综述 | 本文系统总结了噬菌体疗法在治疗耐药铜绿假单胞菌感染方面的最新进展,涵盖体外杀菌活性、生物膜降解、与抗生素的协同作用、动物模型证据及临床应用案例 | 全面整合了从基础研究到临床应用的噬菌体疗法证据,并强调了工程化噬菌体与个体化治疗策略的发展前景 | 存在转化障碍,如需要精确宿主匹配、存在免疫中和风险、缺乏标准化监管框架和GMP级生产体系 | 评估噬菌体疗法作为耐药铜绿假单胞菌感染替代治疗策略的潜力与挑战 | 耐药铜绿假单胞菌及其引起的感染(如慢性呼吸道感染、烧伤伤口感染、尿路感染、器械相关感染) | NA | 铜绿假单胞菌感染 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 497 | 2026-01-20 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
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综述 | 本文综述了叶际微生物组作为地球上最大微生物栖息地之一,在可持续农业和环境健康中的关键作用及其应用潜力 | 系统阐述了叶际微生物组在精准农业和环境可持续性中未被充分探索的前沿领域,并提出了通过组学技术、微生物群落工程和纳米递送系统等新方法克服应用限制的策略 | 叶际微生物的实际应用仍面临环境不稳定性、田间持久性差、功能表征不完整以及叶面微气候多变等挑战 | 探索叶际微生物组在精准农业和环境可持续性中的应用潜力 | 植物叶际(地上部分表面)的微生物群落,包括细菌、真菌和酵母 | NA | NA | 组学技术、微生物群落工程、纳米递送系统 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 498 | 2026-01-20 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-Jan-19, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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综述 | 本研究对1994年至2024年全球植物基因工程领域的文献进行了文献计量分析,以揭示其发展趋势、国际合作网络和技术演进 | 通过文献计量学方法系统揭示了全球植物基因工程研究的双核合作结构(中国和美国),并识别了技术生命周期的三个阶段及未来技术轨迹 | NA | 系统考察全球植物基因工程的发展趋势、合作网络和技术演进 | 全球植物基因工程领域的科学文献 | NA | NA | Agrobacterium介导的转化、RNA干扰(RNAi)、CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 烟草植物 | NA | 农业 |
| 499 | 2026-01-20 |
Regulation of Single and Multiple Genes in Bacillus amyloliquefaciens by an Evolution System In Vivo
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00480
PMID:41396964
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研究论文 | 本研究开发了一种用于枯草芽孢杆菌单基因和多基因调控的高效体内进化系统,通过CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器和进化模板设计,成功优化了碱性蛋白酶活性和血红素产量 | 开发了基于CRISPR/Cas9n-AID的体内进化系统,首次在枯草芽孢杆菌中实现单基因和多基因的同时进化调控,并通过扩展sgRNA策略优化进化效率 | NA | 开发一种高效的体内进化系统,用于调控枯草芽孢杆菌中的单基因和多基因,以优化细胞工厂的构建 | 枯草芽孢杆菌及其基因(如碱性蛋白酶基因和血红素代谢网络关键基因) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑、下一代测序、分批补料发酵 | NA | 测序数据、发酵数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 碱基编辑器(Cas9n与AID融合表达)、进化模板(含可编辑RBS序列) | 工业生物技术 |
| 500 | 2026-01-20 |
A Dual CRISPR-Cas/Cre-loxP Genome Engineering Strategy for Stable Uricase Expression in Food-Grade Probiotics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00774
PMID:41432353
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研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR-Cas9基因敲入与Cre/loxP介导的基因组精简的双重基因组工程策略,用于在食品级益生菌中实现尿酸酶的稳定表达 | 首次将CRISPR-Cas9基因编辑与Cre/loxP系统整合,构建了遗传稳定、生物安全的食品级益生菌底盘,并实现了异源尿酸酶的高效稳定表达 | 研究目前仅在小鼠肠道中验证了定植能力,尚未进行人体临床试验;尿酸降解实验仅在体外条件下完成 | 开发具有定制代谢功能的食品级微生物底盘,用于合成生物学在健康与营养领域的应用 | 乳酸乳球菌NZ9000菌株及其工程改造菌株 | 合成生物学 | 高尿酸血症/痛风 | CRISPR-Cas9基因编辑, Cre/loxP重组系统, 基因组工程 | NA | 酶活性数据, 基因组测序数据, 体内定植数据 | 工程菌株(NZ9000-Δ)及其对照 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 乳酸乳球菌(Lactococcus lactis) | 尿酸酶异源表达系统, 基因组精简设计 | 食品, 医药 |