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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-10-05 |
Unpaired cysteine insertions favor transmembrane dimerization and induce ligand-independent constitutive cytokine receptor signaling
2024-07-26, Biological chemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1515/hsz-2023-0344
PMID:38695485
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研究论文 | 本研究揭示了跨膜区PPCL插入突变如何诱导细胞因子受体发生配体非依赖性二聚化和组成性激活 | 发现PPCL跨膜区插入可作为通用策略生成配体非依赖性组成性活性细胞因子受体 | 研究主要基于Ba/F3前B细胞系,尚未在更复杂的生理环境中验证 | 探究跨膜区半胱氨酸插入对细胞因子受体激活机制的影响 | IL-7Rα及其PPCL突变体,以及IL-6、IL-12和干扰素家族的细胞因子受体 | 合成生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞信号转导分析,磷酸化检测 | NA | 细胞增殖数据,信号通路激活数据 | Ba/F3前B细胞系 | 基因改造 | 哺乳动物细胞 | 组成性活性细胞因子受体设计 | 医学 |
| 482 | 2025-10-05 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
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综述 | 本文综述了迷幻化合物在真核和原核宿主中的生物合成研究进展 | 系统总结了不同类型迷幻化合物的最新生物合成成就,并整理了具有异源活性的生物合成酶列表 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 吲哚胺类(裸盖菇素、N,N-二甲基色胺等)、麦角碱类(麦角酸)和苯乙胺类(麦司卡林)迷幻化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、异源表达 | NA | 文献数据 | NA | NA | 真核生物, 原核生物 | 代谢途径工程 | 医药 |
| 483 | 2025-10-05 |
Microbial food waste valorization: advances, challenges, and perspectives
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103323
PMID:40554099
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综述 | 探讨微生物发酵作为食物废弃物增值的可持续解决方案,将有机质转化为能源、高价值化合物和生物材料 | 强调合成生物学和代谢工程在提升微生物效率、优化底物利用和扩展工业应用方面的作用,并分析生物精炼整合路径 | NA | 研究通过微生物发酵实现食物废弃物增值的技术路径和挑战 | 食物废弃物及其微生物转化过程 | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 484 | 2025-10-05 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
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研究论文 | 开发了一种结合工程微生物与可摄入光电胶囊的双向通信系统,用于可控的疾病治疗干预 | 首次建立了生物-光学-电子信号处理链,实现体内工程微生物的实时监测和远程控制 | 目前仅在猪模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发数字健康监测和可控治疗干预的新方法 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 光遗传学, 生物发光检测 | NA | 生物发光信号, 无线电信号 | 猪模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 炎症检测生物传感器和抗炎纳米抗体表达系统 | 医学 |
| 485 | 2025-10-05 |
Cholesterol modulates membrane elasticity via unified biophysical laws
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62106-0
PMID:40745155
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研究论文 | 本研究通过核自旋技术和计算分析揭示了胆固醇如何通过统一生物物理定律调节膜弹性 | 发现脂质膜在介观尺度表现出统一的弹性行为,与胆固醇含量、脂质不饱和度或温度无关 | 研究主要关注介观尺度,未涉及分子和宏观尺度的完整验证 | 探索胆固醇调节膜弹性的生物物理机制 | 脂质膜的弹性特性 | 生物物理学 | NA | 核自旋技术、计算分析 | NA | 物理测量数据、计算模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、材料科学 |
| 486 | 2025-10-05 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
|
研究论文 | 本研究通过实验评估了大肠杆菌中所有独特的Cas9引导RNA功能,揭示了gRNA设计的普遍功能性和设计规则 | 首次系统评估了近50万个独特gRNA在基因组中的活性,推翻了关于非功能性gRNA稀有的假设,并发现了间隔序列自相互作用是导致非功能性的主要原因 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株,未在其他细菌或真核系统中验证 | 评估Cas9引导RNA在细菌基因组中的实际功能效率并建立gRNA设计规则 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的近500,000个独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | 基因组数据、功能活性数据 | 约500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 487 | 2025-10-05 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 开发了一种通过DNA杂交纯化方法获得具有天然转录后修饰的tRNA,用于增强无细胞翻译系统 | 首次开发了结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的方法,能够高产率获得保留天然修饰的tRNA,并首次提供了特定tRNA的完整修饰谱 | NA | 解决传统体外转录方法无法获得具有天然修饰tRNA的问题,提高无细胞翻译系统的效率和保真度 | 转移RNA(tRNA)及其转录后修饰 | 合成生物学 | NA | DNA杂交纯化、tRNA过表达、无细胞翻译反应 | NA | 生化分析数据、修饰谱数据 | NA | NA | 大肠杆菌(基于上下文推断) | NA | 工业生物技术、医学研究 |
| 488 | 2025-10-05 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
|
研究论文 | 开发基于BERT的茶树转录因子预测工具TeaTFactor | 首次将BERT预训练策略应用于茶树转录因子预测,并开发了在线网络服务器 | NA | 开发准确识别茶树转录因子的计算方法 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练 | BERT | 蛋白质序列数据 | NA | NA | 茶树 | NA | 农业 |
| 489 | 2025-10-05 |
Single-Cell Synchro-Subtractive-Additive Nanoscale Surgery with Femtosecond Lasers
2024-07-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c00970
PMID:38989671
|
研究论文 | 提出一种飞秒激光单细胞手术的同步减材-增材技术,实现单细胞结构的精确修改 | 首次实现同步纳米级三维减材与增材制造,通过非热消融和双光聚合实现单细胞结构的精确移除与修饰 | 术后存活率为70%,仍有提升空间 | 开发新型单细胞操作技术以克服现有方法的不足 | 单细胞结构 | 生物工程 | NA | 飞秒激光手术、双光聚合、非热消融 | NA | NA | NA | 飞秒激光 | 单细胞 | NA | 合成生物学、医学 |
| 490 | 2025-10-05 |
Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices
2024-07-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104
PMID:38920331
|
研究论文 | 本研究开发了基于DNA折纸的纳米器件,通过脂质纳米颗粒实现器官特异性基因表达调控 | 构建了坚固的DNA折纸结构,可在低pH等恶劣条件下封装于脂质纳米颗粒中,实现器官特异性基因递送 | 未明确说明实验样本数量及具体器官靶向效率的量化数据 | 开发器官特异性基因表达控制的纳米递送系统 | DNA折纸纳米器件、脂质纳米颗粒、mRNA和siRNA | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术、低温电子显微镜 | NA | 显微镜图像、基因表达数据 | 小鼠器官(未明确具体数量) | DNA折纸 | 小鼠 | 基因递送纳米器件 | 医学 |
| 491 | 2025-10-05 |
Genetically programmable wearable devices for precision physiological and molecular monitoring
2025-Aug-04, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/adf25a
PMID:40690926
|
综述 | 本文综述了基因编程可穿戴设备在生理和分子监测领域的最新进展与应用前景 | 将基因工程和合成生物学整合到可穿戴平台,创建具有增强特异性、响应性和功能多样性的基因可编程生物界面 | 存在生物安全性问题、生物组件不稳定性以及临床转化障碍等挑战 | 开发用于精准医疗的基因编程可穿戴监测设备 | 可穿戴生物传感器和生物界面 | 生物医学工程 | NA | 基因工程, 合成生物学 | NA | 生物化学标记物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞, 微生物细胞 | 生物传感器, 自调节功能电路 | 医疗, 个性化医疗 |
| 492 | 2025-10-05 |
Revolutionizing Caffeic Acid Production: Advanced Microbial Metabolic Engineering and Synthetic Biology Approaches
2025-Aug, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70091
PMID:40757780
|
综述 | 本文总结了通过微生物代谢工程和合成生物学方法优化咖啡酸生产的五种策略 | 系统整合了咖啡酸生物合成的五种优化策略:生物合成途径、代谢途径修饰、系统生物学与合成生物学、辅因子工程和模块化共培养 | 微生物底盘生产咖啡酸面临前体供应有限、代谢中间体毒性、辅因子利用效率低和宿主微生物种类单一等瓶颈 | 优化咖啡酸的微生物生产方法 | 咖啡酸及其微生物生产系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 咖啡酸生物合成途径、代谢途径修饰 | 医药、食品 |
| 493 | 2025-10-05 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-06, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢产物的三大研究方向:吲哚咔唑和RiPPs的生物合成机制,以及通过微生物相互作用激活隐性次级代谢途径 | 开发了无细胞一锅合成平台用于RiPPs类似物生产,并通过放线菌与含分枝杆菌的共培养策略发现了42种新化合物 | NA | 探索放线菌次级代谢产物的生物合成机制及其在药物发现中的应用潜力 | 放线菌(特别是链霉菌)及其产生的次级代谢产物 | 合成生物学 | 癌症 | 共培养策略、无细胞一锅合成、基因修饰 | NA | NA | NA | NA | 放线菌、链霉菌、含分枝杆菌的细菌 | 隐性生物合成途径激活、肽类天然产物生物合成途径 | 医药 |
| 494 | 2025-10-05 |
Chemical Communication between Giant Vesicles and Gated Nanoparticles for Strip-Based Sensing
2024-11-06, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c04022
PMID:39442006
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研究论文 | 本文开发了一种基于巨型囊泡和门控纳米粒子化学通讯的传感系统,用于条带检测 | 首次将巨型囊泡作为发送器与门控介孔纳米粒子作为接收器结合,实现化学通讯并应用于传感系统 | 实际应用验证仍需进一步开展 | 开发基于微纳粒子化学通讯的传感系统 | 巨型单层囊泡和门控介孔纳米粒子 | 纳米技术,合成生物学 | NA | 条带传感,智能手机检测 | NA | 化学信号 | 以细菌毒素α-溶血素为目标分析物进行实际样品测试 | NA | NA | 化学通讯系统,信号放大系统 | 医学检测,环境监测 |
| 495 | 2025-10-05 |
Applications and prospects of synthetic receptors for therapeutic protein delivery
2025-Sep, European journal of pharmaceutics and biopharmaceutics : official journal of Arbeitsgemeinschaft fur Pharmazeutische Verfahrenstechnik e.V
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.ejpb.2025.114789
PMID:40553909
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综述 | 本文综述了合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用类型、特征及生物医学前景 | 系统归纳了GPCR受体系统、MESA、synNotch受体和SNIPRs等新型合成受体在蛋白质递送领域的创新应用 | 存在安全性问题、递送效率欠佳以及受体设计与优化复杂等挑战 | 探讨合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用现状与发展前景 | 合成受体及其递送的 therapeutic proteins | 合成生物学 | 肿瘤、炎症性免疫疾病、中枢神经系统疾病、关节病、病毒感染 | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | G蛋白偶联受体系统、模块化胞外传感架构、合成Notch受体、合成膜内蛋白水解受体 | 医学 |
| 496 | 2025-10-05 |
Plant synthetic biology-based biofortification, strategies and recent progresses
2025-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13934
PMID:40376763
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综述 | 本文概述了基于植物合成生物学的生物强化策略及其最新进展 | 系统总结了合成生物学在植物生物强化中的五大核心策略,并重点介绍了中国研究团队的最新突破 | NA | 通过植物合成生物学方法解决全球微量营养素缺乏问题 | 植物生物强化策略和技术 | 合成生物学 | 营养缺乏症 | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 内源生物合成基因过表达、异源生物合成途径引入、营养特异性转运蛋白表达、转录调控优化、蛋白质定向进化 | 农业, 食品 |
| 497 | 2025-10-05 |
Thermodynamically consistent, reduced models of gene regulatory networks
2025-Jul, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.241725
PMID:40746961
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于细胞群体建模的热力学一致基因表达简化模型 | 结合键合图方法确保热力学一致性,并开发了适用于大规模细胞群体模拟的简化基因表达模型 | NA | 为合理设计细胞群体行为开发数学建模方法 | 基因调控网络和细胞群体 | 合成生物学 | NA | 数学建模,键合图 | 动力学模型,基于代理的模型 | NA | NA | NA | NA | 切换开关,阻遏振荡器 | 工业生物技术 |
| 498 | 2025-10-05 |
Direct high-throughput deconvolution of non-canonical bases via nanopore sequencing and bootstrapped learning
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62347-z
PMID:40739090
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研究论文 | 本研究开发了一种通过纳米孔测序和自助学习方法高通量解卷积非经典碱基的技术 | 首次实现了非经典碱基的高通量纳米孔测序,并开发了基于自助学习和数据增强的通用性AI模型 | NA | 开发能够高通量识别和测序非经典碱基的技术方法 | 含有非经典碱基的合成异源核酸和寡核苷酸 | 生物信息学 | NA | 纳米孔测序,AI模型训练,数据增强 | 自助学习模型 | 纳米孔测序信号数据 | 1,024种含有非经典碱基的寡核苷酸,每个流动槽产生超过2.3×10^6条读长 | NA | NA | NA | 病毒基因组学,合成生物学,DNA存储 |
| 499 | 2025-10-05 |
Bioengineering Outer-Membrane Vesicles for Vaccine Development: Strategies, Advances, and Perspectives
2025-Jul-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13070767
PMID:40733744
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综述 | 本文综述了外膜囊泡在疫苗开发中的工程化策略、研究进展和未来前景 | 系统总结了包括表面抗原基因工程、表面偶联、糖工程、纳米颗粒工程、杂交OMV和原位生产在内的新兴工程策略,并提出了合成生物学技术的整合潜力 | NA | 探索外膜囊泡作为新一代疫苗开发平台的潜力 | 革兰氏阴性菌自然分泌的外膜囊泡 | 合成生物学 | 传染病和癌症 | 基因工程、生物技术、糖工程、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 革兰氏阴性菌 | 表面抗原展示系统、生物传感器、代谢通路 | 医学 |
| 500 | 2025-10-05 |
Soilless Cultivation: Precise Nutrient Provision and Growth Environment Regulation Under Different Substrates
2025-Jul-16, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14142203
PMID:40733440
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综述 | 系统回顾无土栽培技术体系及其在精准调控作物根际环境方面的创新潜力 | 系统整合无土栽培技术体系与根际微生物互作机制,提出通过合成生物学方法优化微生物群落结构 | 有机体系中根际微生物群落结构和功能稳定性易失衡,技术成本与基质可持续性亟待解决 | 揭示无土栽培技术优势并推动其向低碳化、精准化和空间化方向发展 | 无土栽培技术体系、营养液管理策略、根际微生物互作机制 | 现代农业技术 | NA | 合成生物学方法、智能环境控制系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |