合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
481	2025-02-23	Metabolic Engineering of Escherichia coli for the Production of l-Homoserine 2024-Apr-25, Chem & bio engineering DOI:10.1021/cbe.3c00077 PMID:39974203	综述	本文综述了通过系统代谢工程策略提高大肠杆菌中l-高丝氨酸生产的最新进展	总结了通过阻断竞争和降解途径、增强关键酶和前体、以及运输系统的基因改造等策略来提高l-高丝氨酸生产的系统性方法	NA	提高l-高丝氨酸的微生物工业生产	大肠杆菌	合成生物学与生物技术	NA	微生物发酵	NA	NA	NA
482	2025-02-23	Artificial structural proteins: Synthesis, assembly and material applications 2024-03, Bioorganic chemistry IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107162 PMID:38308999	综述	本文综述了仿生结构蛋白质的设计、生产及其在多尺度组装中的化学修饰方法，并讨论了其功能定制和当前应用	总结了仿生结构蛋白质的设计和生产方法，并探讨了其功能定制和当前应用，展望了未来研究方向	生物合成的固有局限性和复杂宏观组装的模仿难度仍是主要挑战	开发具有优异性能的定制结构蛋白质及其组装体	仿生结构蛋白质及其组装体	合成生物学	NA	模块化蛋白质工程、多肽修饰、合成生物学	NA	NA	NA
483	2025-02-23	A zinc finger transcription factor enables social behaviors while controlling transposable elements and immune response in prefrontal cortex 2024-Jan-25, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-024-02775-5 PMID:38272911	研究论文	本文通过合成生物学方法重新编程ZFP189转录因子的功能，揭示了其在啮齿动物前额叶皮层中对社交行为的保护作用及其对转座子和免疫反应基因表达的调控	创新性地设计了合成ZFP189转录因子，并展示了其对前额叶皮层神经元成熟树突棘形态的促进作用，以及其对社交行为、转座子和免疫相关基因表达的调控作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他高等动物中进行验证	探究ZFP189转录因子在前额叶皮层中对社交行为的调控机制及其对转座子和免疫反应的影响	小鼠前额叶皮层神经元	神经生物学	NA	合成生物学方法、RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠前额叶皮层组织
484	2025-02-23	Advances in ligand-specific biosensing for structurally similar molecules 2023-12-20, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2023.10.009 PMID:38128482	综述	本文总结了近年来在开发高特异性生物传感器系统及其关键应用方面的进展	强调了通过合成生物学策略增强分子特异性，特别是在基因编码生物传感器中的应用	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持	探讨如何提高生物传感器对结构相似分子的特异性	生物传感器系统及其在医学和环境样品中的应用	生物传感器技术	NA	合成生物学策略、高通量筛选技术、计算机辅助评估和预测方法	NA	NA	NA
485	2025-02-23	Engineering microbial diagnostics and therapeutics with smart control 2020-12, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2020.05.006 PMID:32563763	综述	本文讨论了合成生物学技术在工程化微生物用于生物医学应用中的应用，特别是通过生物传感器实现区域选择性和疾病响应性的微生物	介绍了通过生物传感器实现区域选择性和疾病响应性的工程化微生物，用于诊断和治疗多种疾病	主要依赖动物模型或临床样本进行微生物传感的验证，可能限制了其直接应用于人类的广泛性	探讨合成生物学技术在工程化微生物用于生物医学应用中的进展	工程化微生物	合成生物学	细菌感染、癌症、炎症性疾病、代谢性疾病	生物传感器	NA	NA	动物模型或临床样本
486	2025-02-22	DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA 2025-Feb-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00649 PMID:39902634	研究论文	本文介绍了一种名为DRIMS的合成生物学平台，该平台能够实现DNA的删除、替换、插入、突变和合成	DRIMS平台通过PCR技术实现了DNA的多种修改和合成，且不依赖于recA重组途径，简化了操作流程并降低了成本	虽然DRIMS平台展示了其在DNA修改和合成方面的效率，但文中未提及其在更复杂或大规模应用中的表现	开发一种高效、简单且成本效益高的DNA修改和合成平台，以加速合成生物学领域的发展和治疗策略的开发	DNA片段，包括不同大小的DNA片段、DNA结合序列、嵌合抗原受体组件、人工microRNAs和高GC含量的DNA序列	合成生物学	癌症	PCR	NA	DNA序列	包括四种删除、六十四种替换、四种嵌合抗原受体组件替换、五十一种人工microRNA插入、五种点突变和八种DNA序列合成
487	2025-02-22	Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens 2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology DOI:10.1111/tpj.70020 PMID:39981890	研究论文	本研究开发了一种体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了在苔藓植物Physcomitrium patens中插入大片段DNA的效率	开发了体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统，显著提高了大片段DNA插入的效率	研究主要针对苔藓植物Physcomitrium patens，尚未在其他作物中验证其适用性	提高CRISPR/Cas9系统在大片段DNA插入中的效率	苔藓植物Physcomitrium patens	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	DNA序列	两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段
488	2025-02-22	DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0318015 PMID:39946422	研究论文	本文介绍了一种名为DAPE的新型DNA克隆方法，通过使用修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端	DAPE方法能够在DNA片段的两端生成精确长度的3'突出端，克服了传统SLIC技术在克隆小于50bp的DNA片段时的局限性	NA	开发一种更高效的DNA克隆和合成生物学工具	DNA片段	合成生物学	NA	PCR, DNA克隆	NA	DNA序列	NA
489	2025-02-21	Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria 2025-Mar, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015 PMID:39848497	研究论文	本研究构建并表征了乳酸菌中P23组成型启动子的突变体库，以丰富乳酸菌启动子库	首次提供了一组显著不同的P组成型启动子突变体元素，为乳酸菌的代谢工程和合成生物学应用奠定了基础	突变体库在乳酸菌中表现出特异性，但在大肠杆菌中表现出显著差异，可能限制了其跨物种应用的广泛性	丰富乳酸菌启动子库，为代谢工程和合成生物学应用提供基础	乳酸菌中的P23组成型启动子	合成生物学	NA	错误倾向PCR和dNTP类似物诱导的随机突变	NA	荧光强度数据	247个P启动子突变体
490	2025-02-21	Questions and Consequences of Omics in Genetically Engineered Crop Regulation 2025-Feb, Plant-environment interactions (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/pei3.70033 PMID:39967832	研究论文	本文探讨了将组学技术整合到基因编辑和合成生物学作物监管系统中的问题和后果	提出了需要回答的一系列问题，以将组学实验和数据整合到作物监管系统中，并强调了这些问题的科学有效性和监管负担	未具体说明组学技术在监管系统中应用的具体技术挑战或数据限制	探讨组学技术在基因编辑和合成生物学作物监管中的应用	基因编辑和合成生物学作物	生物技术	NA	组学技术	NA	组学数据	NA
491	2025-02-21	Applied photosynthesis: An idea whose time has come 2025-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525 PMID:39571881	研究论文	本文介绍了生物混合能源系统的最新研究，利用光合作用机制开发环保、高效的太阳能技术替代方案	通过合成生物学和纳米材料工程的结合，优化了蛋白质功能和设备稳定性，探索了独特的光活性色素	NA	开发可持续能源技术，利用光合作用机制提高能源转换效率	生物混合设备，包括蓝藻、藻类、紫色细菌和古菌等光合生物	可再生能源技术	NA	合成生物学、纳米材料工程	NA	NA	NA
492	2025-02-20	Systematic molecular dissection of key intermediates in xanthones biosynthesis in Cudrania tricuspidata and establishment of a viable heterologous expression system 2025-Mar, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109524 PMID:39869995	研究论文	本研究系统解析了柘树中黄酮类化合物生物合成的关键中间体，并建立了一个可行的异源表达系统	首次克隆并表征了柘树中参与黄酮类化合物生物合成的关键酶基因，并成功在酵母和烟草中进行了异源表达	研究中仅初步建立了2,3',4,6-四羟基苯甲酮的异源合成系统，尚未实现完整黄酮类化合物的异源生产	解析柘树中黄酮类化合物的生物合成途径，并建立其异源生产系统	柘树中的黄酮类化合物及其生物合成关键酶	合成生物学	NA	基因克隆、异源表达	NA	基因序列、酶活性数据	柘树根组织、酵母和烟草作为异源表达宿主
493	2025-02-20	Chemistry and biology of natural stilbenes: an update 2025-Feb-19, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d4np00033a PMID:39711130	综述	本文更新了关于天然二苯乙烯类化合物的化学和生物学研究，特别关注了寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性	系统综述了2009年至2023年间新发现的409种二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性，并探讨了其作为新药研究先导化合物的潜力	主要集中于2009年至2023年的研究，可能未涵盖更早期的重要发现	探讨天然二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性，以寻找新药研究的先导化合物	天然二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯	化学与生物学	NA	合成生物学方法	NA	化学结构数据	409种新二苯乙烯类化合物
494	2025-02-20	A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines 2025-Feb-19, Biotechnology progress IF:2.5Q3 DOI:10.1002/btpr.70009 PMID:39968660	研究论文	本研究建立了一个基于合成生物学的平台，用于构建稳定的重组腺相关病毒8型（rAAV8）生产细胞系	将rAAV2细胞系构建管道扩展到rAAV8，并成功生成四个rAAV8生产细胞系，通过调整诱导条件提高病毒颗粒产量	rAAV8生产细胞系的产量仍低于传统的三重质粒转染方法，Cap蛋白生产和衣壳形成是潜在的限制因素	开发适用于不同AAV血清型的rAAV生产细胞系平台	重组腺相关病毒8型（rAAV8）生产细胞系	合成生物学	NA	合成生物学技术	NA	NA	四个rAAV8生产细胞系（VH1-4）
495	2025-02-20	Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing 2025-Feb-19, Biotechnology progress IF:2.5Q3 DOI:10.1002/btpr.70007 PMID:39968680	研究论文	本研究在枯草芽孢杆菌中重构了来自Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统，以实现与细胞生长协调的蛋白质过量生产	通过重构LuxRI群体感应系统并优化启动子，实现了在枯草芽孢杆菌中细胞密度依赖的蛋白质过量生产，超越了常用的启动子系统	研究中未提及该系统在不同环境条件下的稳定性和适应性	提高枯草芽孢杆菌中重组蛋白的生产效率	枯草芽孢杆菌	合成生物学	NA	群体感应系统重构、启动子工程	NA	NA	NA
496	2025-02-19	Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection 2025-Feb-18, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808 PMID:39924741	研究论文	本研究开发了一种基于toehold开关技术的无细胞生物传感器，结合核酸序列扩增技术（NASBA），用于快速、灵敏地检测寨卡病毒	该研究创新性地将toehold开关技术与NASBA技术结合，显著提高了检测灵敏度，达到了2.9 aM的检测限，解决了toehold开关在检测低丰度目标时的固有局限性	研究中未提及该检测系统在实际临床样本中的应用效果，可能需要在更广泛的样本中进行验证	开发一种快速、灵敏的寨卡病毒检测工具	寨卡病毒	合成生物学	传染病	toehold开关技术，核酸序列扩增技术（NASBA）	NA	核酸序列	未提及具体样本数量
497	2025-02-19	A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules 2025-Feb-12, Cell host & microbe IF:20.6Q1 DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002 PMID:39947133	meta-analysis	本文通过对炎症性肠病（IBD）患者和健康对照组的肠道微生物组进行元分析，识别出与克罗恩病（CD）显著相关的两种梭菌衍生的小分子生物合成基因簇（BGCs），并发现这些基因簇产生的六种脂肪酸酰胺在IBD患者的粪便样本中检测到	首次通过元分析识别出与克罗恩病相关的特定微生物组小分子，并揭示了这些分子在肠道通透性和疾病恶化中的作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证这些分子的具体作用机制	探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病（IBD）中的分子和功能作用	炎症性肠病（IBD）患者和健康对照组的肠道微生物组	微生物组学	炎症性肠病	元分析、合成生物学	NA	宏基因组数据	IBD患者和健康对照组的肠道微生物组样本
498	2025-02-19	A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules 2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.02.07.579278 PMID:38370680	meta-analysis	本文通过对5306个肠道微生物组样本的元基因组分析，识别出与炎症性肠病（IBD）显著相关的Clostridia衍生的小分子生物合成基因簇（BGCs），并发现了六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物	首次通过合成生物学方法发现并解析了六种与IBD相关的脂肪酸酰胺结构，并验证了这些分子在小鼠结肠炎模型中对肠道通透性和炎症的影响	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证这些发现的临床相关性	探索肠道微生物组中小分子在炎症性肠病（IBD）中的分子和功能作用	2033名IBD患者和833名健康对照的肠道微生物组样本	微生物组学	炎症性肠病	元基因组分析，合成生物学	小鼠结肠炎模型	元基因组数据	5306个肠道微生物组样本（2033名IBD患者和833名健康对照）
499	2025-02-18	Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels 2025-Feb-17, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400668 PMID:39957478	研究论文	本文研究了在透明质酸微凝胶中无细胞蛋白质合成（CFPS）和原位蛋白质积累的相互作用	首次使用双功能微凝胶作为实验平台，研究蛋白质合成的时间和空间调控	研究仍处于初步阶段，需要进一步验证和优化	研究无细胞蛋白质合成和蛋白质在微凝胶中的积累	透明质酸微凝胶和His标签修饰的GFP	合成生物学	NA	无细胞蛋白质合成（CFPS）	NA	NA	NA
500	2025-02-18	In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models 2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045 PMID:39722304	研究论文	本研究开发了一种合成生物学策略，通过小细胞外囊泡（sEVs）将LRRK2的小干扰RNA（siRNAs）自组装并递送至黑质，以减轻帕金森病（PD）模型中的神经退行性变	利用遗传电路（裸DNA质粒形式）实现siRNA的自组装和递送，通过sEVs将siRNA靶向递送至黑质，为PD治疗提供了新的策略	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	开发一种通过sEVs递送siRNA以减轻PD模型中LRRK2诱导的神经退行性变的治疗策略	LRRK2R1441G小鼠模型	合成生物学	帕金森病	siRNA自组装和递送	遗传电路	NA	两种小鼠模型