合成生物学相关文章
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当前共找到 5124 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-05-18 |
Engineering Noncanonical Cofactors To Expand Cellular Functions
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00473
PMID:40923492
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综述 | 探讨利用非经典辅因子扩展细胞功能的方法与应用 | 通过使用非经典辅因子隔离特定代谢反应，无需物理屏障即可实现与宿主细胞天然机制的独立运行 | 对非经典辅因子依赖型酶的工程化进展及实际应用潜力仍需进一步实验验证 | 综述非经典辅因子的类型、合成方法、酶工程进展及其在合成生物学中的应用前景 | 非经典辅因子及其依赖性酶和利用细胞 | 合成生物学 | NA | 酶工程, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 非经典辅因子依赖代谢通路 | 合成生物学 |
| 482 | 2026-05-18 |
Engineering of a Complex of the DNase Domain of Colicin E9 with the Immunity Protein Im9 Activated by the Protease pS273R of African Swine Fever Virus
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00398
PMID:40925015
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研究论文 | 设计了一种由ASFV pS273R蛋白酶激活的DNase E9与Im9蛋白复合物，作为病毒触发型杀灭开关 | 通过将病毒蛋白酶切割位点插入免疫蛋白Im9的暴露环中，构建了仅当ASFV蛋白酶存在时才释放DNase活性的蛋白质开关，提供了一种可推广的利用病毒编码蛋白酶触发休眠效应物的合成生物学策略 | 尚未在活体细胞或动物模型中验证该开关的有效性和安全性，且对非靶标蛋白酶的特异性需进一步评估 | 开发一种针对非洲猪瘟病毒的合成限制系统，通过病毒DNA降解使猪细胞对ASFV不具允许性 | 大肠杆菌素E9的DNase结构域及其免疫蛋白Im9的复合物 | 合成生物学 | 非洲猪瘟 | 蛋白质工程，蛋白酶切割位点插入，体外酶活测定 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白开关（蛋白酶切割激活的DNase） | 农业，医学 |
| 483 | 2026-05-18 |
RNA Polymerase III Promoters Compatible with CRISPR Gene Regulation in Saccharomyces cerevisiae
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00122
PMID:40824237
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研究论文 | 表征了不同酵母物种和哺乳动物来源的20种RNA聚合酶III启动子在酿酒酵母中实现CRISPR基因调控的功能 | 首次系统比较跨物种RNA Pol III启动子在CRISPR激活和抑制中的功能，发现启动子架构和核心序列基序影响功能，并证明支架介导的多效应子招募可补偿弱启动子功能 | 部分启动子功能可能受限于特定环境或基因靶点，未测试所有可能的启动子组合 | 扩展酿酒酵母中用于CRISPR sgRNA表达的RNA聚合酶III启动子库，实现多重基因调控 | 跨物种RNA聚合酶III启动子（来自不同酵母、酿酒酵母自身及哺乳动物） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因表达数据 | 20种启动子 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | CRISPR激活与抑制回路 | 合成生物学, 代谢工程, 表型工程 |
| 484 | 2026-05-18 |
Recent Advances in the Biological Synthesis of l-Tyrosine Derivatives by Genetically Engineered Microbes
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00475
PMID:40833382
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综述 | 总结了利用基因工程微生物生物合成l-酪氨酸衍生物的最新进展 | 系统综述了多种l-酪氨酸衍生物（如酪醇、左旋多巴、对香豆酸等）在微生物中的生物合成，并介绍了代谢工程、酶修饰和菌株育种等提高产量的策略 | 未具体说明，但综述性文章可能缺乏原始实验数据和定量比较 | 概述l-酪氨酸衍生物的微生物合成研究现状及未来发展趋势 | l-酪氨酸衍生物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶修饰、菌株育种 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物 | 生物合成途径 | 食品, 化妆品, 制药 |
| 485 | 2026-05-18 |
Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00368
PMID:40844977
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研究论文 | 本文鉴定了黑曲霉中最强的翻译延伸因子1-α基因启动子及其首个内含子，并构建了高效的报告系统 | 首次报道了tef1α启动子及其内含子作为黑曲霉中最强的启动子，活性超过常用gpdA启动子20倍以上，并验证了其在多基因共表达和核定位中的高效性能 | 未提及在工业发酵条件下或长时间培养中的启动子稳定性及可能存在的调控复杂性 | 开发并验证黑曲霉中强启动子驱动的报告系统，用于真菌合成生物学和代谢工程 | 黑曲霉 | 机器学习 | NA | 荧光报告基因检测、共表达系统、融合构建 | NA | 荧光信号图像、染色信号 | 使用多个报告基因（EGFP、mCherry、mRFP1、GUS）和多个融合构建进行实验 | NA | 黑曲霉 | 强启动子驱动的报告系统和双顺反子表达系统 | 工业生物技术 |
| 486 | 2026-05-18 |
Progress in the Synthesis of Sterols and Related Natural Products by Manipulating the Ergosterol Biosynthetic Pathway in Saccharomyces cerevisiae
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00438
PMID:40859817
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综述 | 综述了通过操纵酿酒酵母麦角固醇生物合成途径合成甾醇及相关天然产物的研究进展 | 系统总结了利用合成生物学策略在酿酒酵母中实现多种高价值甾醇从头合成的最新代谢工程进展 | 未明确指出当前研究方法的具体局限，如产率瓶颈或代谢负担 | 回顾和总结酿酒酵母中甾醇生物合成的代谢工程研究进展 | 甾醇及酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢工程 | 酿酒酵母 | 麦角固醇生物合成途径 | 农业, 医药 |
| 487 | 2026-05-18 |
Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00379
PMID:40891340
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研究论文 | 通过重新编程酶的催化残基，将通用碱基替换为具有更高固有pKa值的可电离残基，实现酶在碱性pH下的高效催化 | 提出了一种整合理性设计催化残基与定向进化的酶工程策略，通过将羧酸盐介导的质子转移机制转变为酚盐介导的机制，实现了酶在碱性pH下的高效催化，并将最优pH值移动了超过3个单位 | 该策略目前主要在TEM β-内酰胺酶中验证，对其他类型水解酶的普适性有待进一步研究 | 开发一种通用的酶工程方法，使酶能够在碱性pH条件下发挥功能，扩展酶在工业和环境生物催化中的应用范围 | TEM β-内酰胺酶及其工程变体YR5-2 | 生物催化 | NA | 定向进化、分子动力学模拟 | NA | 酶动力学数据、模拟数据 | 涉及多种变体（E166Y、YR5-2及Y166E回复突变体）的动力学表征 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物催化、环境生物催化 |
| 488 | 2026-05-18 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
|
研究论文 | 提出利用预印本批判性分析和探究式实验课程提升合成生物学学习体验的教学方法 | 将预印本引入教学，通过对比手稿与最终发表版本培养学生的批判性分析能力，并结合基于CRISPRi基因电路的实践实验，完整覆盖设计-构建-测试-学习循环 | 未具体指出研究局限性 | 改进合成生物学教学模式，结合主动学习工作流提升学生批判性分析能力与概念掌握程度 | 大学合成生物学课程的学生 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | NA | 学生群体，具体数量未说明 | CRISPRi | NA | 基于CRISPRi的基因电路 | 教育 |
| 489 | 2026-05-18 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
|
研究论文 | 通过编程调控基因可用性的时序，在生物传感器电路中实现数字开关功能 | 利用位点特异性重组酶通过可编程调控多基因电路中基因的可用时间，来校正瞬态递送引起的非稳态效应，显著降低传感器的基线泄漏并提高动态范围 | NA | 研究通过时序控制基因可用性来改善生物传感器电路性能的方法 | 内源性微小RNA的比例传感器及其在细胞类型分类中的应用 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | NA | NA | 位点特异性重组酶 | 哺乳动物细胞 | 比例传感器电路，包含阻遏元件及其靶标的去同步化设计 | 医学, 诊断 |
| 490 | 2026-05-17 |
PromoterAtlas: decoding regulatory sequences across Gammaproteobacteria using a transformer model
2026-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72837-3
PMID:42140912
|
研究论文 | 提出基于Transformer的模型PromoterAtlas，从3371种γ-变形菌的900万调控序列中学习，实现全基因组启动子注释 | 首次使用大规模跨物种调控序列训练Transformer模型，实现启动子序列的跨物种进化关系聚类与转录/翻译水平预测 | 模型训练数据仅限于γ-变形菌，可能无法直接推广到其他细菌类群 | 开发能识别多种调控元件并预测转录/翻译水平的通用启动子注释工具 | γ-变形菌的调控序列 | 机器学习 | NA | Transformer深度学习模型 | Transformer | 基因组序列 | 3371种细菌的900万条调控序列 | NA | NA | NA | 合成生物学, 比较基因组学 |
| 491 | 2026-05-17 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-May-15, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
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研究论文 | 构建了一个含有两种动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器，用于模拟和扩展天然细胞系统的功能复杂性 | 创新地利用巨型单层囊泡膜动力学介导的信号通路，协调光响应小孔与自组装可密封大孔之间的相互作用，实现具有高时空精度的按需顺序递送分子反应物 | NA | 在合成生物学中重建细胞复杂性，通过动态DNA基孔实现膜渗透性的可控调节 | 巨型单层囊泡膜上的动态DNA基孔系统 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 图像 | NA | DNA折纸 | NA | 光响应小孔和自组装可密封大孔的信号通路，以及酶联反应、细胞骨架模拟和细胞外无细胞系统 | 生物技术, 纳米技术 |
| 492 | 2026-05-17 |
Abiotic Stress Sensing in Plants: Biochemical and Biophysical Basis
2026-May-14, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
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综述 | 综述植物感知非生物胁迫的生化和生物物理机制，并讨论主要未解决问题和新兴研究方法 | 系统整合温度、干旱、盐碱、洪涝及土壤压实等多种胁迫的感知机制，强调生物物理过程与化学信号编码的逻辑，并引入AI建模、单细胞技术等前沿方法 | 未明确定量描述各感知机制的相对贡献，缺乏在单细胞或全株水平上空间组织的实验证据 | 阐明植物将环境胁迫从物理化学信号转化为生物信号的分子逻辑 | 植物（模式植物及农作物）中感知多种非生物胁迫的分子机制 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 493 | 2026-05-17 |
TargetGAN: A generative AI framework for the design of plant core promoters with targeted activity
2026-May-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
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研究论文 | 提出TargetGAN，一个基于生成对抗网络和预训练活性预测器的深度学习框架，用于设计具有目标活性的植物核心启动子 | 首次将GAN与活性预测器结合，实现用户自定义活性的植物核心启动子从头设计，并发现合成启动子可超越天然启动子的活性上限 | 预测活性与实验活性仅为中等相关性，且STARR-seq验证后只有约55%的合成启动子成功表征 | 开发一个能够设计具有目标活性的植物核心启动子的通用框架 | 植物核心启动子的设计和功能验证 | 机器学习 | NA | STARR-seq，荧光素酶报告基因检测，深度测序 | 生成对抗网络 (GAN) 和预训练活性预测器 | DNA序列 | 训练集包含76,851个天然启动子；生成了55,296个合成启动子，其中5,250个用于高通量功能验证，2,909个成功表征 | NA | 植物（拟南芥原生质体用于STARR-seq验证） | 植物核心启动子设计（包含激活基序的精确排列） | 农业，合成生物学 |
| 494 | 2026-05-17 |
Growth versus decline: root aging and plant performance
2026-May-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
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综述 | 综述根老化对植物生长的影响及延迟根老化的潜在策略 | 首次从概念上桥接根系生长调节与根老化过程，并提出利用遗传学和合成生物学方法延迟根老化以提升作物生产力 | 由于技术挑战，对老根采样和分析的研究有限 | 探讨根老化机制及其对植物生长的影响，并评估延迟根老化的策略在提高作物产量和应对气候变化中的潜力 | 根系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 延迟根老化或再激活老根生长的遗传和合成生物学回路 | 农业, 环境 |
| 495 | 2026-05-17 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-May, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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评论文章 | 探讨RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域及其潜在应用 | 首次系统性地提出RNA适配体与表观转录组学之间的相互作用，包括RNA修饰如何影响适配体折叠或结合，以及适配体如何用于检测或调节表观转录组状态 | 这两个领域之间的直接调控联系尚未完全阐明，内容主要基于概念性探讨而非实验验证 | 激发RNA适配体和表观转录组学领域之间的跨学科讨论，并吸引对这些交叉领域进行未来研究 | RNA适配体和表观转录组学修饰（如N6-甲基腺苷、假尿苷和5-甲基胞嘧啶） | 分子生物学, 合成生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 496 | 2026-05-17 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 整合植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的化学、来源、机制通路及治疗潜力证据 | 系统总结了单萜和色氨酸衍生吲哚生物碱通过整合AhR与NF-κB/STAT3通路实现器官选择性治疗的前景 | 主要基于临床前证据，转化医学面临合成生物学、代谢组学和合理杂合设计等挑战 | 评估植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力及转化障碍 | 植物来源吲哚生物碱及其在慢性炎症性疾病中的作用 | 机器学习 | 慢性炎症性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 497 | 2026-05-17 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 通过结构设计合成4-喹唑啉酮衍生物，显著提升茶碱核糖开关在原核和真核系统中的调控动态范围 | 首次通过结构导向方法设计合成4-喹唑啉酮衍生物，使茶碱适配体结合亲和力提升30倍，基因表达动态范围在细菌中达到380倍 | 未说明 | 提升茶碱核糖开关的调控动态范围，以增强生物技术应用中基因调控的精确性 | 茶碱核糖开关及其在细菌、分枝杆菌和真核系统中的调控性能 | 合成生物学 | 未适用 | 结构导向配体设计、核糖开关调控 | 未适用 | 未适用 | 未适用 | CRISPR-Cas9 | 细菌、分枝杆菌、真核细胞 | 核糖开关介导的条件性基因表达 | 生物医学工程 |
| 498 | 2026-05-17 |
Reprogramming the SARS-CoV-1 Neutralizing Antibody S230 to SARS-CoV-2 via Directed Evolution and Molecular Docking-Based Binding Mode Analysis
2025-12-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00425
PMID:41236374
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研究论文 | 结合定向进化和分子对接分析，将SARS-CoV-1中和抗体S230重新编程为靶向SARS-CoV-2的抗体 | 通过少量协同突变即可在进化上分化但结构保守的靶标间重建抗原识别，建立了基于合成生物学原理的模块化可进化抗体重编程平台 | 未提及抗体在体内的稳定性和免疫原性评估 | 将SARS-CoV-1中和抗体S230的抗原特异性重编程至SARS-CoV-2 | SARS-CoV-1中和抗体S230及其突变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 定向进化、分子对接、细菌展示 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | 一个突变文库和少数筛选出的克隆 | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学 |
| 499 | 2026-05-17 |
CTRL Enables Gene-Specific RNA Regulation Using CRISPR-Cas7-11
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00658
PMID:41202215
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas7-11效应器开发了一种名为CTRL的基因特异性RNA调控工具，实现对mRNA和蛋白质表达的高效、可调抑制 | 首次利用CRISPR-Cas7-11的直接重复序列加工活性开发基因抑制工具，实现可调控的基因特异性RNA调控，并在多种模式系统中展示广泛适用性 | NA | 开发一种新型基因表达调控工具以实现精确的RNA靶向抑制 | 合成mRNA分子及Cas7-11效应器的多种变异体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas7-11 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas7-11 | 多种模式系统 | CRISPR-Cas转基因可抑制元件，用于靶向合成mRNA | 医学, 生物技术 |
| 500 | 2026-05-17 |
Harnessing Fungal Secretion Systems for Precision Fermentation of Food Proteins
2025-11-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00521
PMID:41220338
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综述 | 探讨利用真菌分泌系统进行食品蛋白质精密发酵的策略与挑战 | 系统阐述了酵母和丝状真菌分泌途径在精密发酵生产食品蛋白质中的作用，并强调数据驱动的分泌效率工程是从小规模生产向工业化制造的关键 | 未提供具体实验数据支持，仅基于现有研究提出观点和未来方向 | 分析如何通过修饰分泌途径提高蛋白质分泌效率，以实现精密发酵食品蛋白质的成本效益和规模化生产 | 酵母和丝状真菌等微生物宿主及其蛋白质分泌途径 | 合成生物学, 蛋白质工程, 生物加工优化 | NA | 精密发酵, 蛋白质分泌工程 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 丝状真菌 | 蛋白质分泌途径修饰 | 食品工业, 替代蛋白质生产 |