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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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481 | 2025-02-16 |
Engineering artificial photosynthetic life-forms through endosymbiosis
2022-04-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29961-7
PMID:35474066
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研究论文 | 本文设计和工程化了光合蓝藻与芽殖酵母之间的人工、遗传可操作的光合内共生关系 | 通过工程化光合蓝藻作为酵母细胞内的内共生体,实现了在特定光合条件下支持酵母细胞生长的生物能量功能 | 对进化转变的理解仍然有限 | 研究光合内共生的进化及其在合成生物学中的应用 | 光合蓝藻和芽殖酵母 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
482 | 2025-02-14 |
Advances in magnetic nanoparticles for molecular medicine
2025-Feb-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc05167j
PMID:39846549
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综述 | 本文综述了磁性纳米粒子(MNPs)在分子医学中的最新进展及其在疾病治疗中的潜在应用 | 磁性纳米粒子通过外部磁场生成机械或热刺激,能够在组织和分子水平上精确远程控制生物过程,开辟了基因组编辑、细胞治疗和神经科学等新兴领域的新途径 | NA | 总结磁性纳米粒子在分子医学中的经典应用,并探索其在疾病治疗中的整合,以激发下一代基于磁性纳米粒子的平台开发 | 磁性纳米粒子(MNPs) | 分子医学 | NA | NA | NA | NA | NA |
483 | 2025-02-14 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2025-Feb-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98110
PMID:39937081
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研究论文 | 本文介绍了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器,旨在将蛋白质-蛋白质相互作用或诱导邻近作为基因组编辑的触发器 | 提出了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化crRNA:tracrRNA相互作用,将蛋白质-蛋白质邻近与功能性CRISPR-Cas9双组分引导RNA的形成联系起来,从而激活人类细胞中的主要编辑或碱基编辑 | NA | 增强基于CRISPR的基因组编辑的可控性,促进其在活细胞中部署的合成分子电路中的应用 | 人类细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 主要编辑, 碱基编辑 | NA | NA | NA |
484 | 2025-02-14 |
Modular plasmid design for autonomous multi-protein expression in Escherichia coli
2025-Feb-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00483-2
PMID:39930458
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研究论文 | 本研究描述了一组用于大肠杆菌中重组表达的细菌质粒,这些质粒可以独立诱导表达多达三种重组蛋白 | 提出了一种新的多基因表达策略,通过使用四种不同的细菌表达盒,实现了在一个质粒中独立表达多达三种重组蛋白 | 尽管系统展示了多基因表达的潜力,但每种表达盒的潜在限制和代谢机制的影响仍需进一步研究 | 探索独立且可控的多基因共表达系统,以优化重组蛋白的生产 | 大肠杆菌中的重组蛋白表达 | 合成生物学 | NA | Golden Standard Molecular Cloning kit组装 | NA | NA | NA |
485 | 2025-02-14 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Feb-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
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研究论文 | 本研究构建了一个多样化的合成可调启动子库,用于在哺乳动物细胞中灵活控制多基因表达 | 设计了包含通用激活位点(UAS)和特定激活位点(SAS)的合成可调启动子(STPs),通过CRISPR激活系统实现多层次表达控制 | NA | 构建一个多样化的合成可调启动子库,以实现对哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 哺乳动物细胞中的多基因系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统(CRISPRa),大规模平行报告基因检测(MPRA) | NA | 基因表达数据 | 24,960个独特的非冗余启动子 |
486 | 2025-02-14 |
Effectors of the Future: Universal Chimeric Antigen Receptor
2025-Feb, Transfusion medicine and hemotherapy : offizielles Organ der Deutschen Gesellschaft fur Transfusionsmedizin und Immunhamatologie
IF:1.9Q4
DOI:10.1159/000539609
PMID:39944409
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review | 本文综述了通用嵌合抗原受体(CAR)技术在癌症免疫治疗中的应用及其潜力 | 提出了通用适配器CAR技术,以解决肿瘤抗原异质性和抗原逃逸机制的问题,并展示了其在多靶点免疫治疗中的潜力 | NA | 探讨通用CAR技术在癌症免疫治疗中的应用及其未来发展方向 | 通用嵌合抗原受体(CAR)技术及其在癌症治疗中的应用 | 免疫治疗 | 癌症 | 合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA |
487 | 2025-02-14 |
Elucidation of the key flavonol biosynthetic pathway in golden Camellia and its application in genetic modification of tomato fruit metabolism
2025-Feb, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae308
PMID:39944987
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研究论文 | 本研究揭示了金花茶中关键黄酮醇生物合成途径,并将其应用于番茄果实代谢的遗传改良 | 发现了金花茶中黄酮醇生物合成的关键基因CnFLS1,并通过转基因技术成功改良了番茄果实的代谢途径,使其具有金花茶特有的黄酮醇成分和增强的抗氧化能力 | 研究中仅涉及23种金花茶物种,样本量相对较小,且转基因番茄的长期稳定性和安全性尚未验证 | 揭示金花茶中黄酮醇生物合成机制,并利用这些机制改良番茄果实的代谢途径 | 金花茶物种和栽培番茄 | 合成生物学 | NA | 转录组学、共表达网络分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 23种金花茶物种 |
488 | 2025-02-14 |
Challenges and limitations in using bacterial metabolites as immunomodulators
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1535394
PMID:39944722
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review | 本文探讨了利用细菌代谢物作为免疫调节剂在治疗免疫相关疾病中的潜力和挑战 | 强调了细菌代谢物在免疫调节中的潜力,并探讨了其在发现、生产、表征、稳定性、配方、安全性和个体差异方面的挑战 | 许多代谢物的生物利用度有限,存在脱靶效应的可能性,且需要精确靶向 | 探讨细菌代谢物作为免疫调节剂的临床转化潜力 | 细菌代谢物及其在免疫调节中的应用 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | NA | NA | NA | NA |
489 | 2025-02-14 |
Challenges in observing transcription-translation for bottom-up synthetic biology
2025, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2024.27
PMID:39944880
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review | 本文详细讨论了如何使用PURE系统和细胞裂解液在体外重建转录-翻译过程,并探讨了将这些系统封装在GUVs中的现有方法 | 本文创新性地评估了使用多种荧光显微镜技术和探针来成像转录和翻译的方法,并提出了解决PURE系统中两个系统解耦挑战的方案 | 本文主要讨论了体外系统的挑战,未涉及体内系统的复杂性和实际应用中的限制 | 本文的研究目标是探讨如何重建和观察转录-翻译系统,以实现合成生物学的目标 | 本文的研究对象是转录和翻译系统,特别是PURE系统和细胞裂解液 | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜技术 | NA | 图像 | NA |
490 | 2025-02-14 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科药用植物的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究的最新进展,并探讨了这些技术在制药工业和农业生物技术领域的潜在应用 | 结合基因组信息与其他组学研究,揭示药用植物遗传基础和次生代谢物生物合成途径,并探讨了现代基因编辑技术如CRISPR/Cas9和RNA干扰的应用 | NA | 探讨罂粟科药用植物的基因组学及其他组学研究,以揭示其药用活性的遗传基础 | 罂粟科药用植物,如罂粟(Papaver somniferum)和白屈菜(Chelidonium majus) | 基因组学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA |
491 | 2025-02-14 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 本文介绍了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器,称为“P3编辑”,它将蛋白质-蛋白质邻近性与功能性CRISPR-Cas9双组分引导RNA的形成联系起来 | 通过工程化crRNA:tracrRNA的相互作用,展示了已知蛋白质-蛋白质相互作用以及化学诱导的蛋白质结构域二聚化如何激活人类细胞中的prime编辑或碱基编辑,并探索了P3编辑如何整合基于ADAR的RNA传感器的输出 | NA | 增强CRISPR基因组编辑的可控性,促进其在活细胞中部署的合成分子电路中的应用 | 人类细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, prime编辑, 碱基编辑 | NA | 分子数据 | NA |
492 | 2025-02-13 |
Engineered Bacteria Manipulate Cysteine Metabolism to Boost Ferroptosis-Based Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Therapy
2025-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412982
PMID:39696900
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研究论文 | 本文探讨了通过工程化细菌操纵半胱氨酸代谢以增强基于铁死亡的胰腺导管腺癌(PDAC)治疗的效果 | 利用合成生物学开发了一种能够直接消耗半胱氨酸的工程化细菌,通过产生工程化胱氨酸酶(CGL)来阻断半胱氨酸代谢,从而触发PDAC细胞的铁死亡 | 当前限制半胱氨酸可用性的方法由于肿瘤靶向不足和半胱氨酸的补偿来源而未能有效阻断半胱氨酸代谢 | 研究目的是通过工程化细菌调节半胱氨酸代谢,增强PDAC的铁死亡治疗效果 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | 合成生物学 | 胰腺导管腺癌 | 工程化细菌和胱氨酸酶(CGL) | NA | NA | NA |
493 | 2025-02-13 |
Model-guided gene circuit design for engineering genetically stable cell populations in diverse applications
2025-Feb, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0602
PMID:39933591
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研究论文 | 本文提出了一种生物分子控制器,用于在合成生物学中维持工程细胞群体的遗传稳定性 | 开发了一种不依赖于特定合成基因身份的突变细胞生长抑制控制器,适用于多种合成电路而无需重新设计其遗传组件 | 该控制器的性能评估依赖于模拟方法,尚未在实际应用中广泛验证 | 解决合成生物学中工程细胞群体遗传稳定性问题 | 工程细胞群体 | 合成生物学 | NA | 生物分子控制器设计 | 资源感知细胞模型 | 模拟数据 | NA |
494 | 2025-02-13 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触(MLCs)的方法,以实现对活细胞中细胞器功能的动态控制 | 利用光遗传学技术动态调控细胞器功能,为细胞工程和合成生物学提供了创新范例 | 当前实验策略在调节细胞器功能方面存在局限性,主要由于细胞器在活细胞中的动态性和亚细胞分布 | 研究目的是通过光遗传学技术动态调控细胞器功能,以探索细胞工程和合成生物学的新方法 | 研究对象为活细胞中的线粒体-溶酶体接触(MLCs) | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
495 | 2025-02-13 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 本文通过定向进化改造植物来源的非血红素酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACCO),实现了非天然的立体选择性C(sp)-H氟化反应 | 首次成功将非血红素Fe卤化酶转化为氟化酶,并通过定向进化显著提高了酶的活性、化学选择性和立体选择性 | 研究中几乎所有有益突变都远离Fe中心,强调了底物通道工程在非血红素Fe生物催化中的重要性 | 开发新的生物催化氟化反应,以解决自然界中C-F键形成酶活性稀缺的问题 | 非血红素Fe酶ACCO及其定向进化产物 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
496 | 2025-02-13 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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研究论文 | 本文介绍了一种通过定向内共生方法在酵母中引入碳同化的技术 | 通过工程化光合作用蓝藻内共生体,使酵母细胞在光合条件下无需外部碳源即可生长,并能够生物合成天然产物 | NA | 研究如何将异养生物转化为部分或完全自养生物,以实现可持续生物技术和合成生物学的目标 | 酵母细胞和光合作用蓝藻内共生体 | 合成生物学 | NA | 定向内共生方法 | NA | NA | NA |
497 | 2025-02-13 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-Jan-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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研究论文 | 本文提出了一种开放式的生物设计方法,强调设计的新颖性至少与其实现目标的能力同等重要 | 提出了一种开放式的生物设计方法,强调设计的新颖性,而不仅仅是优化现有功能 | 未具体提及实验验证或实际应用中的挑战 | 探索更具创造性的生物设计方法,以突破现有工程生物学的性能瓶颈 | 合成生物学中的生物设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
498 | 2025-02-13 |
Leveraging artificial intelligence in the fight against infectious diseases
2023-07-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh1114
PMID:37440620
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综述 | 本文探讨了人工智能在检测、治疗和理解传染病中的应用,并强调了人工智能在这些领域中的进展 | 强调了人工智能在抗感染药物发现、感染生物学理解和诊断开发中的快速进展,并提出了未来人工智能在控制传染病爆发和大流行中的潜在应用 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨人工智能在传染病领域的应用及其未来潜力 | 传染病 | 人工智能 | 传染病 | 人工智能 | NA | NA | NA |
499 | 2025-02-13 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 本文探讨了基因局部染色体环境对转录的深远影响,特别是在大肠杆菌中,低GC含量的非编码合成序列如何显著降低报告基因的表达 | 揭示了低GC含量的非编码合成序列对基因表达的显著影响,这一影响独立于启动子等调控序列 | 未详细探讨低GC含量序列影响基因表达的具体分子机制 | 研究基因局部染色体环境对转录的影响,以及如何优化合成生物学构建体的表达 | 大肠杆菌中的基因表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | NA |
500 | 2025-02-12 |
Enhancing rufomycin production by CRISPR/Cas9-based genome editing and promoter engineering in Streptomyces sp. MJM3502
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.01.002
PMID:39925944
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9基因编辑和启动子工程增强Streptomyces sp. MJM3502中rufomycin的产量 | 首次在Streptomyces sp. MJM3502中建立了基因操作平台,并通过CRISPR/Cas9技术插入强启动子,显著提高了rufomycin 4/6的产量,并合成了新的rufomycin衍生物 | 尚未完全了解Streptomyces sp. MJM3502的基因组序列和生物合成途径 | 增强rufomycin的产量并生成新的活性天然产物 | Streptomyces sp. MJM3502 | 合成生物学与代谢工程 | 结核病 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |