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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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481 | 2025-05-10 |
The structure of the Vibrio natriegens 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1-17)
2025-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf324
PMID:40331629
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research paper | 该研究通过冷冻电镜技术解析了Vibrio natriegens 70S核糖体与富含脯氨酸的抗菌肽Bac5(1-17)复合物的结构 | 揭示了Bac5与核糖体出口通道的独特相互作用模式,不同于其他I型PrAMPs | 仅研究了Vibrio natriegens这一种细菌的核糖体结构 | 阐明Bac5抗菌肽与细菌核糖体的结合方式及其抑制蛋白质合成的分子机制 | Vibrio natriegens 70S核糖体与Bac5(1-17)抗菌肽复合物 | 结构生物学 | 细菌感染 | 冷冻电镜(cryo-EM) | NA | 冷冻电镜图像数据 | 单个复合物结构 |
482 | 2025-05-10 |
Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways
2025-Apr, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2025.13465
PMID:39981899
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研究论文 | 研究重组人类胶原蛋白XVII(RHCXVII)在保护皮肤基底膜完整性方面的功效和作用机制 | 首次阐明RHCXVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的机制 | 研究仅基于体外HaCaT细胞模型,未涉及体内实验或临床验证 | 探究RHCXVII在皮肤基底膜保护中的作用及其分子机制 | UVB照射的人HaCaT角质形成细胞 | 合成生物学 | 皮肤损伤 | 逆转录定量PCR、蛋白质印迹、磷酸化抗体阵列 | UVB诱导的皮肤损伤模型 | 分子生物学数据 | 体外培养的HaCaT细胞系 |
483 | 2025-05-10 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
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研究论文 | 开发了一种基于Elitist Genetic Algorithm (EGA)的图形用户界面工具MultiCRISPR-EGA,用于优化多路CRISPR引导RNA阵列的设计 | 利用EGA算法优化多路gRNA阵列设计,提高了效率和特异性,并提供了实时设计进度控制的GUI界面 | 未提及实验验证结果或在实际生物系统中的性能表现 | 优化多路CRISPR引导RNA阵列设计,提高基因组编辑的效率和成本效益 | 多路CRISPR引导RNA阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | Elitist Genetic Algorithm (EGA) | 基因组数据 | NA |
484 | 2025-05-10 |
Intracellular protein ligation and polyprotein synthesis using an asparaginyl endopeptidase core
2025-Mar-11, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06617k
PMID:39981834
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research paper | 开发了一种利用AEP1核心片段在细胞内进行蛋白质连接和聚合的系统,实现了无需酶激活和外部连接的实时多蛋白合成 | 利用AEP1核心片段实现细胞内蛋白质连接和聚合,扩展了AEP在合成生物学和生物材料中的应用 | NA | 开发一种新型的细胞内蛋白质连接和聚合系统 | Ig结构域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质连接和聚合技术 | NA | NA | NA |
485 | 2025-05-10 |
Use and dual use of synthetic biology
2025-03-07, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.173
PMID:40052950
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评论 | 本文回顾了合成生物学领域的历史,并讨论了其潜在的双重用途风险 | 指出了合成生物学领域记忆迅速丧失的现象,并强调了其潜在的双重用途风险 | 缺乏对实验室进行功能增益实验时意外风险的深入思考 | 探讨合成生物学的使用和双重用途风险 | 合成生物学领域及其相关技术 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
486 | 2025-05-10 |
Peptide-mediated liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates
2025-Mar-05, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01477d
PMID:39964249
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review | 本文综述了肽介导的液-液相分离(LLPS)的分子机制及其在生物分子凝聚物形成中的作用 | 强调了疏水效应、静电相互作用和π-π堆积等分子间相互作用在相分离中的角色,以及环境因素如pH、温度、离子强度和分子拥挤对肽凝聚物稳定性和动态的影响 | NA | 探讨肽介导的LLPS在生物技术和医学中的潜在应用 | 肽介导的液-液相分离和生物分子凝聚物 | 生物物理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
487 | 2025-05-10 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 研究展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用,形成涂层以控制液-液相分离隔室的性质 | 首次展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用,形成稳定的涂层,并控制液-液相分离隔室的性质 | 涂层的形成依赖于pH和蛋白质浓度,且一旦形成后不与稀释相交换 | 探索细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用,以开发合成细胞和细胞器 | 细菌微区室壳蛋白(BMC-H)和由RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体 | 合成生物学 | NA | 基因工程和蛋白质工程 | NA | 蛋白质相互作用数据 | NA |
488 | 2025-05-10 |
Innovative applications and research advances of bacterial biosensors in medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1507491
PMID:40336836
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综述 | 本文综述了细菌生物传感器在医学领域的应用和最新进展,并讨论了其研究和应用中存在的挑战和障碍 | 利用合成生物学和基因工程的突破性进展,定制具有卓越检测特性的细菌,为早期疾病诊断和治疗监测提供了强大的技术基础 | 讨论了细菌生物传感器在研究和应用中仍面临的挑战和障碍 | 探讨细菌生物传感器在医学领域的应用和研究进展 | 细菌生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
489 | 2025-05-10 |
Simultaneous selection of nanobodies for accessible epitopes on immune cells in the tumor microenvironment
2023-11-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43038-z
PMID:37978291
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研究论文 | 介绍了一种名为INSPIRE-seq的新方法,用于在复杂环境中筛选纳米抗体 | 开发了INSPIRE-seq技术,能够并行富集穿透肿瘤微环境的免疫细胞结合纳米抗体 | 未提及具体样本量或实验验证的详细限制 | 开发筛选纳米抗体的新技术,用于治疗性生物制剂的靶向分子发现 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | NGS, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 结构建模与对接研究 | NA | 测序数据, 图像数据 | NA |
490 | 2025-05-09 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-May-07, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细胞构建单层人工神经网络,实现3位二进制码到格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换 | 研究尚处于早期阶段,计算能力和应用范围有限 | 探索基因工程细胞在神经形态计算中的应用 | 基因工程细胞构建的人工神经网络 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | ANN(人工神经网络) | 化学输入信号和荧光蛋白表达 | 五个工程细胞群体 |
491 | 2025-05-09 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-May-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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review | 本文综述了基因组记录领域的最新进展,特别是关于构建分子电路以记录细胞事件的方法 | 探讨了新兴合成生物学工具在构建多样化传感器和分子电路中的应用,以实现细胞事件的基因组记录 | 目前直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其揭示细胞命运决定新见解的潜力尚未实现 | 开发新的传感模块和遗传电路架构,以将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中 | 细胞事件和细胞状态 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based genome editing | NA | genomic DNA | NA |
492 | 2025-05-09 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-May-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 本研究揭示了glyceollins的完整生物合成途径,并通过合成生物学和代谢工程在酵母中实现了其从简单碳源的生产 | 发现了glyceollins生物合成途径中未表征的还原酶基因和五个P450酶,首次实现了glyceollins在微生物宿主中的从头合成 | NA | 阐明glyceollins的生物合成途径并实现其可持续生产 | 大豆中的glyceollins化合物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA |
493 | 2025-05-09 |
Engineering a newly identified alcohol dehydrogenase from Sphingobium Sp. for efficient utilization of nicotinamide cofactors biomimetics
2025-May-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00870-z
PMID:40325297
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2),并对其进行了半理性工程改造,以提高其对合成烟酰胺辅因子仿生物(NCBs)的利用效率 | 首次报道了一种能够利用全合成NCBs的天然ADH,并通过工程改造显著提高了其催化效率和辅因子特异性 | NA | 开发能够高效利用低成本NCBs的氧化还原酶 | 来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2) | 合成生物学 | NA | 半理性工程改造 | NA | 酶活性数据 | 野生型SpADH2及其变体(H43L, A290I, H43L/A290I) |
494 | 2025-05-09 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
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研究论文 | 通过定向进化技术增强工程益生菌中羟化酶XcP4H的活性,以促进5-HTP的生产,用于治疗抑郁症 | 采用基于遗传密码扩展的高通量筛选方法对XcP4H进行定向进化,显著提高了5-HTP的产量,并通过分子动力学模拟揭示了其机制 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 解决5-HTP的药代动力学限制,开发一种新型的抑郁症治疗方法 | 羟化酶XcP4H和工程益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 抑郁症 | 定向进化、分子动态模拟、高通量筛选 | NA | NA | 小鼠模型 |
495 | 2025-05-09 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
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研究论文 | 本文揭示了丹参中酚酸合成的NAC36-MYB18-TAT2分子模型调控机制 | 首次报道了SmTAT2在丹参酚酸代谢途径中的生物学功能及调控机制,并揭示了NAC36-MYB18-TAT2分子模型的作用 | NA | 研究丹参中酚酸合成的分子调控机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)中的酚酸代谢途径 | 合成生物学 | NA | 转基因实验(过表达和CRISPR/Cas9)、分子互作技术(酵母单杂交、双荧光素酶报告基因检测和EMSA) | NAC36-MYB18-TAT2分子模型 | 分子生物学数据 | NA |
496 | 2025-05-09 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母进行纤维素酶表达的策略,以及通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的最新进展 | 总结了纤维素酶在酵母中表达的策略,并探讨了如何通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株 | 目前报道的一步法纤维素底物转化为乙醇的滴度和生产率远低于工业要求 | 探讨如何通过工程化酵母菌株实现木质纤维素生物质的高效生物转化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 纤维素酶表达系统、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
497 | 2025-05-09 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 通过蛋白质组学和代谢组学分析嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s的耐碱机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术研究嗜碱菌的耐碱分子机制,并利用CRISPR技术构建突变体验证tonb基因在耐碱机制中的重要作用 | 研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s菌株,未涉及其他嗜碱菌的比较分析 | 探索嗜碱菌对碱性胁迫的响应分子机制 | 嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s及其CRISPR突变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学, 代谢组学, CRISPR | NA | 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 野生型菌株和CRISPR突变体菌株 |
498 | 2025-05-09 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 介绍了一种利用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断的寡核苷酸子集选择方法 | 无需引物进行选择性杂交,能够用少于五个核苷酸的条形码长度编码和选择数百个子集 | NA | 解决复杂寡核苷酸库中子集选择的问题 | 寡核苷酸库 | 合成生物学 | NA | 序列特异性循环核苷酸合成 | NA | NA | NA |
499 | 2025-05-09 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 提出了一种优化的定点诱变方案,利用具有3'端突出部分的引物对提高诱变效率和降低错误率 | 通过部分互补的引物对设计显著提高诱变效率,平均效率达到约50%,部分情况下接近100%的理想阈值 | 未明确说明该方法在不同基因长度或复杂结构区域的适用性 | 开发更高效可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | 分子生物学 | NA | 定点诱变技术 | NA | NA | 每次诱变反应仅需分析3个菌落 |
500 | 2025-05-09 |
The Establishment of Artificial RNA Cascade Circuits for Gene Regulation Based on Doxycycline-Induced Pre-mRNA Alternative Splicing
2025-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031163
PMID:39940931
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研究论文 | 本研究开发了一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路,用于基因调控 | 通过改变开关中的适配体2碱基对,意外获得了具有完全相反调控功能的'开启开关'CTM和'关闭开关'C2ITetR>4A,并将其与L7Ae/k-turn模块整合,创建了内含子剪接的双开关RNA级联系统 | NA | 为哺乳动物合成生物学提供有价值的工具,实现基因表达的精确预测和动态调控 | 人工嵌合内含子模块、RNA核糖开关、TetR适配体 | 合成生物学 | NA | 前mRNA选择性剪接 | NA | NA | NA |