合成生物学相关文章
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当前共找到 5561 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-07-13 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
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研究论文 | 本文提出了一种整合逆合成规划与生物约束的框架，提升代谢路径重建的生物可行性 | 创新性地将逆合成规划与大语言模型结合，实现代谢网络的跨层次建模与智能优化 | NA | 利用人工智能技术革新细胞代谢路径重建方法，增强路径设计的生物可行性 | 细胞代谢路径 | 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型 | NA | NA | NA | NA | 代谢路径 | 工业生物技术 |
| 502 | 2026-07-13 |
Advances in gene editing tools for four typical Gram-positive bacteria
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1882312
PMID:42434562
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综述 | 本文综述了四种典型革兰氏阳性菌基因编辑工具的发展，从传统同源重组到CRISPR-Cas9、碱基编辑器和大片段整合工具，并总结了面临的挑战和策略 | 系统梳理了四种代表性革兰氏阳性菌基因编辑工具的演进历程，并针对宿主修复能力、工具兼容性和编辑器固有限制提出了通用策略和工具选择建议 | 结论不能直接推广到所有革兰氏阳性菌，仅针对四种特定菌种进行了分析 | 为革兰氏阳性菌的基因编辑研究提供技术参考 | 四种革兰氏阳性菌：枯草芽孢杆菌、乳酸乳球菌、金黄色葡萄球菌和产气荚膜梭菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 大片段整合工具, 同源重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 乳酸乳球菌, 金黄色葡萄球菌, 产气荚膜梭菌 | NA | 合成生物学, 工业发酵, 益生菌开发 |
| 503 | 2026-07-13 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-03-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
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研究论文 | 本研究展示了细菌细胞通过自然存在的生物分子活性引发原子转移自由基反应，实现丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸类单体在胞内聚合 | 首次证实细菌细胞可利用天然生物分子引发胞内自由基聚合，提供了一种新的细胞工程和合成生物学工具 | 仅使用了有限类型的单体（丙烯酰胺、丙烯酸、甲基丙烯酸类），未探索更广范围的单体和聚合条件 | 探究细菌细胞作为活催化剂进行胞内自由基聚合的可行性及细胞相容性 | 细菌细胞（具体菌种未在摘要中明确指定） | 合成生物学 | NA | NMR, GPC, 荧光标记, 荧光显微镜, 流式细胞术 | NA | 图像, 光谱, 色谱数据 | NA | NA | 细菌（未具体指定） | 胞内自由基聚合体系（基于原子转移自由基聚合引发剂） | 细胞工程, 合成生物学 |
| 504 | 2026-07-13 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究Methanosarcina acetivorans在抑制能量保守性甲烷苯并蒽醌：CoM-CoB异二硫化物还原酶HdrED时的转录响应 | 揭示细胞通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性将甲烷生成与基因调控耦合的未知机制，并发现甲基营养型甲烷生成调节因子MsrC参与异二硫化物感应 | NA | 了解产甲烷古菌如何感知和响应末端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans | 机器学习 | NA | 转录组分析 | NA | 转录本丰度数据 | NA | NA | Methanosarcina acetivorans | NA | 可再生能源生产, 可持续化学品生产, 工业生物技术 |
| 505 | 2026-07-12 |
Engineering extracellular vesicle biogenesis for therapeutic gene delivery: emerging genetic programming strategies and translational prospects
2026-Jul-10, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12320-w
PMID:42429865
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综述 | 本文综述了利用遗传工程策略改造细胞外囊泡生物发生过程，以实现治疗性基因递送的最新进展和转化前景 | 整合了细胞外囊泡生物发生知识与新兴遗传工程技术，包括CRISPR-Cas9基因组编辑和合成生物学工具，以实现可编程基因递送系统的构建 | 面临囊泡异质性、大规模生产和临床转化等关键挑战 | 探讨将细胞外囊泡转化为可编程基因递送系统的策略及其在精准医学中的应用前景 | 细胞外囊泡及其在基因治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 可编程基因递送系统 | 医学 |
| 506 | 2026-07-12 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
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综述 | 合成生物学设计的免疫疗法通过精确控制免疫反应，为癌症和免疫疾病提供新策略 | 利用合成生物学设计模块化信号回路和逻辑门控激活，实现免疫行为的上下文依赖和反馈控制，提升治疗特异性和可调性 | 未提及具体临床试验数据和长期安全性评估 | 综述合成生物学在精准免疫治疗中的转化潜力 | 合成免疫回路、逻辑门控激活、反馈控制细胞因子分泌 | NA | 肿瘤, 免疫疾病 | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 哺乳动物细胞 | 逻辑门控激活回路、反馈控制细胞因子分泌回路 | 医学 |
| 507 | 2026-07-12 |
Diverse molecular mechanisms of in vivo haploid induction in plants: from fertilization interference to genome programming
2026-Jun-29, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03882-x
PMID:42373814
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综述 | 综述植物体内单倍体诱导的三种核心分子机制及其应用平台 | 将雄配子缺陷、配子体重编程和着丝粒工程三种机制整合为统一框架，并强调无转基因基因组编辑平台及AI辅助设计 | 双子叶植物、大基因组作物及父本单倍体诱导效率低 | 阐明植物体内单倍体诱导的分子机制并推动跨物种通用系统开发 | 植物雄性配子（MTL/DMP/KPL）、配子体（BBM-BAR1）、着丝粒（CENH3/KNL2） | 农业生物技术 | NA | 基因组编辑（HIEdit, GEDH）、多组学、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物（作物） | 合成无融合生殖通路 | 农业 |
| 508 | 2026-07-12 |
Endogenous constitutive promoters with a broad range of transcriptional activities for plant synthetic biology
2026-Jun-22, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03885-8
PMID:42329465
|
研究论文 | 本研究从本塞姆氏烟草中鉴定内生组成型启动子，并定量表征其转录活性，为植物合成生物学提供CaMV 35S启动子的可靠替代 | 首次系统鉴定了本塞姆氏烟草的内源组成型启动子库，通过GFP和双荧光素酶报告系统定量测定其转录强度，并在多个异源物种中验证了启动子活性的跨物种保守性 | 启动子在单子叶植物（如玉米）中的活性显著降低，跨物种应用的通用性有限 | 为植物合成生物学提供具有定量定义转录强度的内源组成型启动子，作为CaMV 35S启动子的替代方案 | 本塞姆氏烟草的内源组成型启动子 | 植物合成生物学 | NA | GFP报告基因分析、双荧光素酶报告系统、原生质体瞬时表达 | NA | 基因表达数据 | 多个候选启动子，在拟南芥、白菜、辣椒、玉米等物种的原生质体中测试 | NA | 本塞姆氏烟草、白菜、辣椒、玉米 | 组成型启动子表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 509 | 2026-07-12 |
The big kinship of proline: Counting saturated and unsaturated secondary amino acids of different ring size
2026-Jun-19, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.06.010
PMID:42320729
|
研究论文 | 对脯氨酸及其同系物（不同环大小的饱和与不饱和环状次级氨基酸）进行数学枚举和特性概述 | 提出了所有可能环状次级α-氨基酸和亚氨基酸的数学枚举程序，导出了修正卢卡斯序列的递归公式以及明确计数公式，为虚拟化合物数据库构建和化学合成计算机辅助设计提供了新方法 | 研究主要基于理论枚举和已知结构概述，未涉及实验验证或实际应用的具体效果评估 | 枚举不同环大小下所有可能的饱和与不饱和环状次级氨基酸，并提供这些化合物的结构和功能特性概述 | 脯氨酸及其同系物（不同环大小的环状次级α-氨基酸和亚氨基酸） | 合成生物学 | NA | 数学枚举 | NA | 文本与化学结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药理学 |
| 510 | 2026-07-12 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
|
研究论文 | 该论文报道了下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2，通过删除毒力和非必需基因增强生物安全性，同时保持快速生长和蛋白质表达，并整合多种合成生物学功能用于先进生物制造 | AMAX2在保持高生长速率和蛋白质产量的基础上，通过基因删除显著提升生物安全性，并集成可诱导系统、tRNA补充、基因组规模CRISPRi-seq必需基因鉴定、无DNA微细胞生产、表面展示和蛋白靶向分泌等多功能模块 | 论文未明确讨论AMAX2在长期培养中的遗传稳定性，以及与其他常用底盘（如大肠杆菌）在工业规模生产中的成本效益比较 | 开发一种兼具高性能、生物安全性和多功能性的可编程微生物底盘，用于先进生物制造和生物治疗开发 | 气单胞菌底盘AMAX2及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因删除, 质粒系统, 细胞表面展示, 蛋白质分泌系统 | NA | 基因组数据, 功能实验数据, 生物安全性数据 | 细胞和动物模型（具体数量未在摘要中提供） | CRISPRi-seq, 质粒工程 | 气单胞菌 | 可诱导表达系统, tRNASupplementation系统, SpyCatcher-SpyTag表面展示系统, VI型分泌系统介导的蛋白质转运 | 工业生物技术, 医学 |
| 511 | 2026-07-12 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-06-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
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研究论文 | 本研究揭示了肼基乙酸是细菌产生的硝胺——N-硝基甘氨酸的生物合成前体 | 首次阐明天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成途径，发现肼基乙酸是其关键前体，并验证了赖氨酸为硝基氮的来源，通过基因簇重建和同位素标记实验确认了合成路线 | 研究未完全阐明硝胺生物合成的全部步骤，且生物合成途径在工业生产中的可持续性尚需进一步开发 | 阐明细菌产生的硝胺天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成机制 | 链霉菌属细菌（Streptomyces）及N-硝基甘氨酸 | 合成生物学 | NA | 稳定同位素标记、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、生物信息学分析、基因簇重建 | NA | 同位素标记数据、蛋白质组学数据、晶体结构数据 | 使用多种同位素标记前体（L-赖氨酸、甘氨酸、肼基乙酸）进行培养实验，样本数量未明确说明 | NA | 链霉菌属细菌（Streptomyces） | N-硝基甘氨酸的生物合成途径，涉及肼基乙酸的生成及硝胺中间体 | 工业生物技术、能源（含能材料） |
| 512 | 2026-07-12 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
|
综述 | 综述了免疫受体的膜基组装与相互作用，重点关注其模块化结构及跨膜结构域在信号转导中的作用 | 系统总结了免疫受体在脂双层中组织的分子原理和结构基序，揭示了跨膜结构域特异性相互作用的重复模式及其在合成生物学中的应用潜力 | NA | 理解免疫受体的构建机制及膜内分子相互作用对其结构与功能的影响 | 免疫受体（如配体结合模块和信号模块组成的跨膜蛋白）及其跨膜结构域 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 513 | 2026-07-12 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 直接量化了钙离子介导的巨型单层囊泡融合，揭示了其在无蛋白条件下作为融合剂的有效性和局限性 | 使用微流体捕获平台结合共聚焦显微镜，首次在单个囊泡水平上系统测量钙离子介导的膜融合效率，澄清了以往小泡和大泡实验中存在的矛盾 | 钙离子驱动的膜融合对膜成分和张力高度敏感，参数空间狭窄，限制了其在人工细胞构建中的广泛应用 | 量化无蛋白条件下钙离子作为膜融合剂的有效性，并建立设计规则以用于合成生物学和膜重构研究 | 巨型单层囊泡（GUVs）和用于比较的小型单层囊泡（LUVs） | 合成生物学 | NA | 微流体捕获平台、共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 数百个单个巨型单层囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学、膜重构研究 |
| 514 | 2026-07-12 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 介绍VAST方法，通过真空和超声处理显著提高单子叶和双子叶植物幼苗的瞬时基因表达效率 | 通过系统优化植物生长条件并整合真空浸润和超声预处理，在最小化组织损伤的同时大幅提升基因表达效率，并成功转化多种重要作物 | 未提及 | 开发高效、通用且简单的植物瞬时转化方法以加速功能基因组学和合成生物学研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗，包括番茄、狗尾草、柳枝稷、玉米和小麦 | 数字病理学 | NA | 真空浸润、超声处理、根癌农杆菌共培养 | NA | NA | 多种植物幼苗（具体数量未提供） | NA | 烟草、番茄、狗尾草、柳枝稷、玉米、小麦 | NA | 农业、生物技术 |
| 515 | 2026-07-12 |
The cancer-microbiome axis: Mechanisms and emerging therapeutic strategies
2026-04-16, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-026-01072-1
PMID:41989595
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综述 | 总结癌症-微生物组轴的机制及新兴治疗策略 | 系统综述了从粪便微生物群移植到减量策略（包括单个菌株、定义菌群和工程微生物）的进展，并探讨了微生物调节与传统癌症治疗的交互作用 | 存在变异性、标准化和机制不确定性等挑战，技术性和生物性障碍仍然显著 | 探索微生物组在癌症发展、进展和治疗反应中的作用及基于微生物的治疗策略 | 人类微生物组（特别是细菌）与宿主免疫和代谢途径的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 测序和功能分析 | NA | 文本 | NA | 工程微生物 | 人体微生物组 | 免疫调节因子递送电路 | 医学 |
| 516 | 2026-07-12 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸（PLA）在多种生态系统中生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展，包括昆虫肠道微生物群筛选、真菌分离、宏基因组学及人工智能辅助酶工程等方法 | 首次系统整合了合成生物学、定向进化和人工智能在PLA降解酶工程中的应用，提出了多学科策略加速工业堆肥、废水处理和生物修复中PLA降解的路线图 | 未涵盖具体实验验证数据或定量比较不同策略的效率，且对实际应用中的经济性和规模化挑战讨论有限 | 探索并总结利用微生物群、宏基因组学、酶工程和人工智能技术加速PLA生物降解的策略 | PLA降解相关的微生物群落、真菌物种、降解酶（如解聚酶）以及AI模型 | 机器学习 | NA | 宏基因组学、环境DNA（eDNA）、人工智能、机器学习、定向进化 | 机器学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 合成生物回路（如切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢通路） | 环境, 工业生物技术 |
| 517 | 2026-07-12 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
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研究论文 | 开发并评估了一种基于结瘤基因报告系统，用于筛选能够表达苜蓿中华根瘤菌结瘤基因的根瘤菌和非根瘤菌 | 构建了基于超折叠GFP和mScarlet-I的双荧光报告系统，可高通量筛选能响应植物信号并表达结瘤基因的新型细菌 | 未明确说明局限性 | 开发有效工具以识别可工程化的相容微生物伙伴，增强非豆科植物的生物固氮能力 | 苜蓿中华根瘤菌结瘤基因报告系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物荧光图像 | 多种根瘤菌和非根瘤菌菌株 | NA | 根瘤菌和非根瘤菌 | nod基因报告系统（包含nodD1-PnodA和nodD2-PnodA双荧光标记） | 农业, 环境 |
| 518 | 2026-07-12 |
Synthetic soils for ecological and synthetic biology applications
2026-Jan-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag012
PMID:41860425
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综述 | 本文综述了合成土壤在生态学和合成生物学中的应用，探讨其优势、局限性及未来发展 | 提出了‘合成土壤’作为标准化可控实验平台的概念，系统总结其在模拟自然土壤理化特性并研究生物响应方面的应用 | 合成土壤可能无法完全复制自然土壤的复杂性和异质性，且现有研究尚未充分验证其生态相关性 | 探索合成土壤在生态学和合成生物学研究中的优势、局限及未来发展方向 | 合成土壤系统及其对微生物、植物、土壤动物等生物组分的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生态学, 合成生物学 |
| 519 | 2026-07-12 |
The Cross-Species Implantable ATP Battery Inspired by Photosynthesis for Application in Diseases
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S569114
PMID:41858590
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综述 | 探索受光合作用启发的跨物种植入式ATP电池在疾病中的应用 | 提出一种人工光合系统，能在人体细胞内自主再生ATP，直接对抗疾病进展中的代谢缺陷，整合合成生物学、材料科学和靶向递送策略 | 未提及具体实验验证或临床数据，可能处于理论或概念阶段 | 评估基于光合作用原理的植入式ATP电池在多种疾病中的治疗可行性 | 人体细胞中的ATP再生系统，包括光氧化模块、光磷酸化模块和封装系统 | 合成生物学 | 肿瘤、组织损伤、神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 人体细胞 | 人工光合系统，包括光氧化模块、光磷酸化模块和封装系统 | 医学 |
| 520 | 2026-07-12 |
Systems biology can provide guidance to synthetic biology in the pursuit of new drug targets
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1770107
PMID:41971098
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研究论文 | 通过案例分析，展示系统生物学分析如何引导药物靶点发现，并分析生理反馈回路对直觉的误导 | 结合系统生物学动态建模揭示生理反馈回路的反直觉特性，为合成生物学在药物干预设计中的应用提供新视角 | 仅基于简化线性代谢途径模型，未涉及完整体内实验验证或临床数据 | 为合成生物学在寻找新药物靶点过程中提供系统生物学指导 | 涉及NQO1（NAD(P)H:醌氧化还原酶1）的癌症相关氧化还原回路 | 系统生物学 | 癌症 | 系统生物学分析 | 动态建模 | NA | NA | NA | NA | 正反馈回路 | 医学 |