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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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501 | 2025-03-10 |
SynBioNanoDesign: pioneering targeted drug delivery with engineered nanomaterials
2025-Mar-06, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03254-9
PMID:40050980
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review | 本文综述了合成生物学在推动工程纳米材料用于靶向药物递送系统中的关键作用 | 探讨了合成生物学与纳米技术的融合,以及如何通过生物原理设计新型纳米材料 | 讨论了SynBioNanoDesign在药物递送中的挑战、当前弱点、机会、未来方向及伦理和社会影响 | 推动工程纳米材料在靶向药物递送系统中的应用 | 工程纳米材料 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
502 | 2025-03-10 |
Prospects for synthetic biology in 21st Century agriculture
2024-Dec-30, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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研究论文 | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的前景,强调了其在提高粮食安全、应对气候变化和实现可持续农业实践方面的潜力 | 通过整合先进的遗传工具、计算建模和系统生物学,研究人员能够精确修改植物基因组,以增强产量、抗逆性和养分利用效率等特性 | 尽管植物合成生物学在农业中具有巨大潜力,但仍面临监管批准和公众接受度方面的挑战 | 探讨植物合成生物学在农业中的应用,以应对全球粮食安全挑战并实现环境可持续性 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | 遗传工具、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA |
503 | 2025-03-09 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本文研究了水通道蛋白Aqp1在多种细胞类型中作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 研究表明Aqp1过表达不会对细胞活力或形态产生不利影响,且不会引起ER应激,这为Aqp1作为遗传报告基因的广泛应用提供了安全依据 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系,未涉及体内实验 | 评估Aqp1作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 生物医学工程 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞生理数据 | 多种小鼠和人类细胞系 |
504 | 2025-03-08 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Mar-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
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综述 | 本文综述了大语言模型(LLMs)在合成生物学(SynBio)教育和研究中的进展及其在生物制造中的潜在影响 | 探讨了LLMs在从非结构化数据中提取SynBio信息、构建知识图谱、实现检索增强生成等方面的应用,并预测LLMs将革新代谢建模和工程中的设计-构建-测试-学习(DBTL)周期,并推动未来生物制造中的自动驾驶实验室 | 需要建立LLMs的基准,促进可信的知识合成,发展生物安全框架以防止滥用,并鼓励人工智能科学家、SynBio研究人员和生物过程工程师之间的合作 | 探讨LLMs在合成生物学和生物制造中的应用和潜在影响 | 大语言模型(LLMs)及其在合成生物学和生物制造中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | 大语言模型(LLMs) | 非结构化数据 | NA |
505 | 2025-03-08 |
Principles for introducing new genes and species for conservation
2025-Mar, Trends in ecology & evolution
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.tree.2024.11.011
PMID:39667987
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研究论文 | 本文探讨了将新基因和新物种引入生态系统的机会和复杂决策,结合了生物、法律、社会、文化和伦理考虑,提出了一套全面的原则,以帮助保护管理者应对新兴技术 | 首次将生物、法律、社会、文化和伦理等多方面因素结合,提出了一套全面的原则,以指导保护管理者在面对高后果保护决策时进行综合考虑 | 未具体说明这些原则在实际应用中的具体效果和潜在问题 | 为保护管理者提供一套全面的原则,以应对新兴技术带来的高后果保护决策 | 新基因和新物种的引入 | 生态保护 | NA | NA | NA | NA | NA |
506 | 2025-03-08 |
From specialization to broad adoption: Key trends in droplet microfluidic innovations enhancing accessibility to non-experts
2025-Mar, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0242599
PMID:40046719
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综述 | 本文综述了液滴微流体技术的最新进展,旨在提高系统的稳健性和可访问性,使其更易于非专业实验室使用 | 讨论了液滴微流体技术从专业化到广泛采用的关键趋势,特别是商业化和自动化方面的创新 | 商业解决方案的适应性通常不如内部开发的设备 | 提高液滴微流体技术的稳健性和自动化,促进技术向非专业实验室的转移 | 液滴微流体技术及其在单细胞研究、合成生物学、定向进化和诊断等领域的应用 | 微流体技术 | NA | 液滴生成、试剂添加、分裂、洗涤、孵育、分选和分配 | NA | NA | NA |
507 | 2025-03-08 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
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研究论文 | 本文通过挖掘噬菌体基因组中的启动子,揭示了T7样RNA聚合酶与启动子之间的特异性相互作用规则,并设计了正交性更强的T7 RNAP-启动子变体 | 首次全面挖掘了多种ssRNAPs的启动子,并通过序列共变分析揭示了T7样RNA聚合酶与启动子之间的关键位点相互作用网络,设计了正交性更强的变体 | 研究主要集中于T7样RNA聚合酶,其他类型的ssRNAPs的启动子特异性规则仍需进一步探索 | 揭示T7样RNA聚合酶与启动子之间的特异性相互作用规则,并设计正交性更强的RNAP-启动子变体 | 噬菌体基因组中的启动子和T7样RNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、序列共变分析 | NA | 基因组序列 | 多种噬菌体基因组 |
508 | 2025-03-08 |
DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae409
PMID:39162313
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepEnzyme的深度学习模型,该模型结合了Transformer和图卷积网络(GCN),通过利用蛋白质的序列和3D结构信息来提高酶周转数(kcat)的预测准确性 | DeepEnzyme模型首次结合了Transformer和GCN,利用蛋白质的序列和3D结构信息进行kcat预测,显著提高了预测的准确性和鲁棒性,特别是在处理与训练数据集序列相似性低的酶时 | 尽管DeepEnzyme在kcat预测上取得了显著进展,但其在处理与训练数据集序列相似性极低的酶时,可能仍存在一定的预测误差 | 提高酶周转数(kcat)的预测准确性,以支持蛋白质工程和合成生物学等领域的研究 | 酶的周转数(kcat) | 机器学习 | NA | 深度学习 | Transformer, GCN | 蛋白质序列和3D结构数据 | NA |
509 | 2025-03-08 |
Biosynthesis of Cytosporones in Leotiomycetous Filamentous Fungi
2024-03-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c14066
PMID:38386630
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研究论文 | 本文研究了Leotiomycetous丝状真菌中细胞孢菌素的生物合成机制 | 揭示了细胞孢菌素结构多样性和生物活性生成的机制,并发现了新的聚酮类生物合成酶 | 研究主要集中在特定真菌中的基因簇,可能不适用于其他真菌 | 探索细胞孢菌素的生物合成途径及其在药物发现中的应用 | Leotiomycetous丝状真菌 | 生物合成 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、体外酶反应 | NA | 基因数据、酶反应数据 | 特定Leotiomycetous丝状真菌 |
510 | 2025-03-06 |
Designer mammalian living materials through genetic engineering
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.007
PMID:40034809
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研究论文 | 本文讨论了通过基因工程策略设计和组装下一代细胞密集或细胞基材料的最新进展和机会 | 通过基因工程策略实现对细胞行为和空间排列的完全控制,解锁具有定制细胞功能和空间排列的用户定义活体材料 | NA | 探索基因工程在设计和组装细胞密集或细胞基材料中的应用,以实现对细胞行为和空间排列的完全控制 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 基因编辑和合成生物学工具箱 | NA | NA | NA |
511 | 2025-03-06 |
From Spores to Suffering: Understanding the Role of Anthrax in Bioterrorism
2025-Feb-27, Military medicine
IF:1.2Q2
DOI:10.1093/milmed/usae535
PMID:39656926
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review | 本文综述了炭疽病在生物恐怖主义中的作用,并探讨了未来应对策略 | 提出了利用合成生物学技术、纳米诊断和CRISPR技术等新兴技术来预防、检测和治疗炭疽病的新方法 | NA | 探讨炭疽病在生物恐怖主义中的威胁及应对策略 | 炭疽病及其病原体炭疽芽孢杆菌 | 生物恐怖主义与传染病防控 | 炭疽病 | 合成生物学技术、纳米诊断、CRISPR技术 | NA | 文献数据 | 53篇文献 |
512 | 2025-03-06 |
Nucleic Acid Framework-Enabled Spatial Organization for Biological Applications
2025-Feb-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00164
PMID:40041004
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研究论文 | 本文总结了利用DNA折纸和四面体DNA纳米结构(TDNs)进行分子空间组织的方法,并探讨了基于核酸框架(NAFs)的蛋白质和生物膜仿生应用 | 本文创新性地将NAFs应用于无机纳米颗粒的精确尺寸和结构形成,并展示了其在生物传感、生物成像和纳米医学治疗中的多功能性 | NA | 探讨核酸框架在分子空间组织和生物应用中的潜力 | DNA折纸和四面体DNA纳米结构(TDNs) | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
513 | 2025-03-06 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
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研究论文 | 本文报道了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构,并通过结构比较和系统定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 通过晶体结构和定点突变揭示了BcmA酶活性和底物选择性的关键残基,特别是非保守残基D161和K165在P2口袋中的作用 | 未提及具体的研究局限性 | 研究BcmA酶的结构基础及其对酶活性和底物选择性的影响 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA | 结构生物学 | NA | 晶体结构分析、定点突变 | NA | 晶体结构数据 | NA |
514 | 2025-03-06 |
Living material assembly of bacteriogenic protocells
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05223-w
PMID:36104562
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研究论文 | 本文提出了一种基于细菌捕获和现场处理的活体材料组装过程,用于构建具有高组织复杂性和多样功能的合成细胞 | 开发了一种新的活体材料组装过程,能够内生构建膜包围、分子拥挤、组成、结构和形态复杂的合成细胞 | NA | 解决人工细胞自下而上构建中的高组织复杂性和多样功能问题 | 合成细胞 | 合成生物学 | NA | 细菌捕获和现场处理 | NA | NA | NA |
515 | 2025-03-06 |
Current and future techniques for detecting oxytocin: Focusing on genetically-encoded GPCR sensors
2022-01-15, Journal of neuroscience methods
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.jneumeth.2021.109407
PMID:34763021
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综述 | 本文全面回顾了神经科学中检测催产素的现有方法,并讨论了它们的优缺点,同时提出了下一代催产素传感器的发展方向 | 提出了基于合成生物学的高性能基因编码神经调节传感器的发展方向 | 现有技术监测催产素动态或测试相关行为后果的能力有限 | 探讨检测催产素的当前和未来技术,特别是基因编码的GPCR传感器 | 催产素及其在神经科学中的应用 | 神经科学 | NA | 基因编码的GPCR传感器 | NA | NA | NA |
516 | 2025-03-05 |
Promoting the glycosylation of drug-like natural products in a Saccharomyces cerevisiae chassis by deletion of endogenous glycosidases
2025-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132258
PMID:39971105
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研究论文 | 本文探讨了通过删除内源性糖苷酶来提高酿酒酵母中药物样天然产物糖基化效率的方法 | 通过删除EXG1或SPR1糖苷酶,提高了糖苷化产物的产量和区域异构体分布的多样性 | 研究仅限于酿酒酵母系统,且仅测试了18种糖苷中的13种 | 提高天然产物或其非天然产物类似物的糖基化效率和区域特异性 | 苯二酚内酯家族的多酮类和苯丙烷类的多酚类化合物 | 合成生物学 | NA | 糖基化技术 | NA | NA | 18种糖苷 |
517 | 2025-03-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的方法和工具,并讨论了其在生物制造中的应用 | 本文详细讨论了转录调控、模板依赖和非模板依赖的方法,并全面总结了进化酿酒酵母在提高环境应激耐受性和细胞代谢性能方面的应用 | 未明确提及具体的研究局限性 | 探讨合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
518 | 2025-03-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
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研究论文 | 本研究探讨了将生物素的四氢噻吩环替换为氧杂环或(甲基)吡咯烷基团对其分子相互作用的影响,旨在寻找适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 通过分子动力学模拟和荧光滴定实验,发现氧杂生物素与链霉亲和素的结合行为与生物素相似,而氨基类似物则表现出较低的结合能力,特别是氮杂生物素在酸性条件下表现出增强的结合能力 | 研究仅关注了少数几种硫替代物,未全面评估所有可能的替代物及其在不同条件下的结合行为 | 研究硫替代对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响,以寻找适用于合成生物学的替代亲和配体 | 生物素及其硫替代物与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟(MD)、荧光滴定实验 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
519 | 2025-03-05 |
Rethinking cancer targeting strategies in the era of smart cell therapeutics
2022-12, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-022-00505-x
PMID:36175644
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研究论文 | 本文探讨了在智能细胞治疗时代重新思考癌症靶向策略的必要性和潜力 | 提出了将机器学习分析与基因组数据结合,以指导设计更具区分性和可操作性的治疗识别程序,从而增强智能细胞工程的能力 | 这些新兴的智能细胞工程技术尚未在临床中完全实施 | 探索更有效的癌症治疗策略,特别是通过结合细胞治疗和机器学习分析 | 癌症治疗策略,特别是细胞治疗和机器学习分析 | 合成生物学 | 癌症 | 机器学习分析,合成生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
520 | 2025-03-04 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Mar-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
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综述 | 本文介绍了合成生物学纳米医学的基本概念,并探讨了其与传统和仿生纳米医学的关系与区别 | 提出了合成生物学纳米医学这一新概念,区别于传统或仿生纳米医学,采用基因工程策略进行设计 | 讨论了利用合成生物学开发纳米医学的潜在优势和挑战,但未具体说明具体挑战内容 | 探索合成生物学与纳米医学的融合,推动纳米医学在疾病诊断和治疗中的应用 | 合成生物学纳米医学 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |