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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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501 | 2025-02-22 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的新型DNA克隆方法,通过使用修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端 | DAPE方法能够在DNA片段的两端生成精确长度的3'突出端,克服了传统SLIC技术在克隆小于50bp的DNA片段时的局限性 | NA | 开发一种更高效的DNA克隆和合成生物学工具 | DNA片段 | 合成生物学 | NA | PCR, DNA克隆 | NA | DNA序列 | NA |
502 | 2025-02-21 |
Questions and Consequences of Omics in Genetically Engineered Crop Regulation
2025-Feb, Plant-environment interactions (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/pei3.70033
PMID:39967832
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研究论文 | 本文探讨了将组学技术整合到基因编辑和合成生物学作物监管系统中的问题和后果 | 提出了需要回答的一系列问题,以将组学实验和数据整合到作物监管系统中,并强调了这些问题的科学有效性和监管负担 | 未具体说明组学技术在监管系统中应用的具体技术挑战或数据限制 | 探讨组学技术在基因编辑和合成生物学作物监管中的应用 | 基因编辑和合成生物学作物 | 生物技术 | NA | 组学技术 | NA | 组学数据 | NA |
503 | 2025-02-21 |
Applied photosynthesis: An idea whose time has come
2025-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics
DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525
PMID:39571881
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研究论文 | 本文介绍了生物混合能源系统的最新研究,利用光合作用机制开发环保、高效的太阳能技术替代方案 | 通过合成生物学和纳米材料工程的结合,优化了蛋白质功能和设备稳定性,探索了独特的光活性色素 | NA | 开发可持续能源技术,利用光合作用机制提高能源转换效率 | 生物混合设备,包括蓝藻、藻类、紫色细菌和古菌等光合生物 | 可再生能源技术 | NA | 合成生物学、纳米材料工程 | NA | NA | NA |
504 | 2025-02-20 |
Systematic molecular dissection of key intermediates in xanthones biosynthesis in Cudrania tricuspidata and establishment of a viable heterologous expression system
2025-Mar, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109524
PMID:39869995
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研究论文 | 本研究系统解析了柘树中黄酮类化合物生物合成的关键中间体,并建立了一个可行的异源表达系统 | 首次克隆并表征了柘树中参与黄酮类化合物生物合成的关键酶基因,并成功在酵母和烟草中进行了异源表达 | 研究中仅初步建立了2,3',4,6-四羟基苯甲酮的异源合成系统,尚未实现完整黄酮类化合物的异源生产 | 解析柘树中黄酮类化合物的生物合成途径,并建立其异源生产系统 | 柘树中的黄酮类化合物及其生物合成关键酶 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、异源表达 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 柘树根组织、酵母和烟草作为异源表达宿主 |
505 | 2025-02-20 |
Chemistry and biology of natural stilbenes: an update
2025-Feb-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00033a
PMID:39711130
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综述 | 本文更新了关于天然二苯乙烯类化合物的化学和生物学研究,特别关注了寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性 | 系统综述了2009年至2023年间新发现的409种二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性,并探讨了其作为新药研究先导化合物的潜力 | 主要集中于2009年至2023年的研究,可能未涵盖更早期的重要发现 | 探讨天然二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性,以寻找新药研究的先导化合物 | 天然二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯 | 化学与生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 化学结构数据 | 409种新二苯乙烯类化合物 |
506 | 2025-02-20 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025-Feb-19, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本研究建立了一个基于合成生物学的平台,用于构建稳定的重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 将rAAV2细胞系构建管道扩展到rAAV8,并成功生成四个rAAV8生产细胞系,通过调整诱导条件提高病毒颗粒产量 | rAAV8生产细胞系的产量仍低于传统的三重质粒转染方法,Cap蛋白生产和衣壳形成是潜在的限制因素 | 开发适用于不同AAV血清型的rAAV生产细胞系平台 | 重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 四个rAAV8生产细胞系(VH1-4) |
507 | 2025-02-20 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025-Feb-19, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
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研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中重构了来自Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统,以实现与细胞生长协调的蛋白质过量生产 | 通过重构LuxRI群体感应系统并优化启动子,实现了在枯草芽孢杆菌中细胞密度依赖的蛋白质过量生产,超越了常用的启动子系统 | 研究中未提及该系统在不同环境条件下的稳定性和适应性 | 提高枯草芽孢杆菌中重组蛋白的生产效率 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统重构、启动子工程 | NA | NA | NA |
508 | 2025-02-19 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-Feb-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
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研究论文 | 本研究开发了一种基于toehold开关技术的无细胞生物传感器,结合核酸序列扩增技术(NASBA),用于快速、灵敏地检测寨卡病毒 | 该研究创新性地将toehold开关技术与NASBA技术结合,显著提高了检测灵敏度,达到了2.9 aM的检测限,解决了toehold开关在检测低丰度目标时的固有局限性 | 研究中未提及该检测系统在实际临床样本中的应用效果,可能需要在更广泛的样本中进行验证 | 开发一种快速、灵敏的寨卡病毒检测工具 | 寨卡病毒 | 合成生物学 | 传染病 | toehold开关技术,核酸序列扩增技术(NASBA) | NA | 核酸序列 | 未提及具体样本数量 |
509 | 2025-02-19 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 本文通过对炎症性肠病(IBD)患者和健康对照组的肠道微生物组进行元分析,识别出与克罗恩病(CD)显著相关的两种梭菌衍生的小分子生物合成基因簇(BGCs),并发现这些基因簇产生的六种脂肪酸酰胺在IBD患者的粪便样本中检测到 | 首次通过元分析识别出与克罗恩病相关的特定微生物组小分子,并揭示了这些分子在肠道通透性和疾病恶化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证这些分子的具体作用机制 | 探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病(IBD)中的分子和功能作用 | 炎症性肠病(IBD)患者和健康对照组的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 元分析、合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | IBD患者和健康对照组的肠道微生物组样本 |
510 | 2025-02-19 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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meta-analysis | 本文通过对5306个肠道微生物组样本的元基因组分析,识别出与炎症性肠病(IBD)显著相关的Clostridia衍生的小分子生物合成基因簇(BGCs),并发现了六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物 | 首次通过合成生物学方法发现并解析了六种与IBD相关的脂肪酸酰胺结构,并验证了这些分子在小鼠结肠炎模型中对肠道通透性和炎症的影响 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证这些发现的临床相关性 | 探索肠道微生物组中小分子在炎症性肠病(IBD)中的分子和功能作用 | 2033名IBD患者和833名健康对照的肠道微生物组样本 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 元基因组分析,合成生物学 | 小鼠结肠炎模型 | 元基因组数据 | 5306个肠道微生物组样本(2033名IBD患者和833名健康对照) |
511 | 2025-02-18 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-Feb-17, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
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研究论文 | 本文研究了在透明质酸微凝胶中无细胞蛋白质合成(CFPS)和原位蛋白质积累的相互作用 | 首次使用双功能微凝胶作为实验平台,研究蛋白质合成的时间和空间调控 | 研究仍处于初步阶段,需要进一步验证和优化 | 研究无细胞蛋白质合成和蛋白质在微凝胶中的积累 | 透明质酸微凝胶和His标签修饰的GFP | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS) | NA | NA | NA |
512 | 2025-02-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过小细胞外囊泡(sEVs)将LRRK2的小干扰RNA(siRNAs)自组装并递送至黑质,以减轻帕金森病(PD)模型中的神经退行性变 | 利用遗传电路(裸DNA质粒形式)实现siRNA的自组装和递送,通过sEVs将siRNA靶向递送至黑质,为PD治疗提供了新的策略 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 开发一种通过sEVs递送siRNA以减轻PD模型中LRRK2诱导的神经退行性变的治疗策略 | LRRK2R1441G小鼠模型 | 合成生物学 | 帕金森病 | siRNA自组装和递送 | 遗传电路 | NA | 两种小鼠模型 |
513 | 2025-02-18 |
Bacterial and bacterial derivatives-based drug delivery systems: a novel approach for treating central nervous system disorders
2025-Feb, Expert opinion on drug delivery
IF:5.0Q1
DOI:10.1080/17425247.2024.2444364
PMID:39688950
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综述 | 本文综述了基于细菌及其衍生物的药物递送系统在治疗中枢神经系统疾病中的最新研究进展 | 利用细菌及其衍生物作为药物递送系统,通过其独特的趋化性、生物相容性和靶向能力,克服传统方法的限制,实现精确药物递送 | 生物安全性、免疫排斥和规模化生产等挑战仍需解决 | 探索细菌及其衍生物作为药物递送系统在中枢神经系统疾病治疗中的应用 | 缺血性脑损伤、神经退行性疾病和胶质瘤 | 生物医学工程 | 中枢神经系统疾病 | 基因工程、合成生物学和纳米技术 | NA | NA | NA |
514 | 2025-02-17 |
Genetic retargeting of E3 ligases to enhance CAR T cell therapy
2024-Feb-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.10.024
PMID:37989314
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研究论文 | 本文开发了一种双功能融合蛋白,通过将目标蛋白与E3连接酶复合物桥接,强制目标泛素化和降解,以增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效力 | 开发了条件性降解策略,包括可诱导的降解转基因表达或小分子依赖的E3招募,并设计了针对SMAD2和SMAD3的降解剂,以阻断TGFβ信号传导 | NA | 增强CAR T细胞疗法的抗肿瘤效力 | CAR T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | E3连接酶复合物 | NA | NA | NA |
515 | 2025-02-17 |
Noncanonical Streptococcus sanguinis ComCDE circuitry integrates environmental cues in transformation outcome decision
2024-Feb-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.09.007
PMID:37832551
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研究论文 | 本文研究了血链球菌中一种新型的竞争-捕食协调机制,揭示了其ComCDE电路在环境信号整合中的作用 | 发现了血链球菌中不同于其他链球菌的ComCDE电路,揭示了其独特的CSP前体切割模式和ABC转运蛋白的作用,并发现了一个ComCDE依赖的细菌素基因座 | NA | 探索血链球菌中自然竞争状态的调控机制及其在进化中的作用 | 血链球菌(Streptococcus sanguinis) | 合成生物学 | NA | 合成生物学设备 | NA | NA | NA |
516 | 2025-02-16 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了在酿酒酵母中表达纤维素酶的策略,并探讨了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的潜力 | 总结了在酿酒酵母中表达纤维素酶的最新进展,并探讨了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的潜力 | 尽管已经报道了将纤维素底物一步转化为乙醇的方法,但其产量和生产率远低于工业要求 | 探讨将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品的生物转化策略 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 纤维素酶表达系统 | NA | NA | NA |
517 | 2025-02-16 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 本研究旨在开发一种快速、无标记、多站点、多拷贝的基因组编辑系统,以推进合成生物学在Escherichia coli中的应用 | 识别并高效表达了ATP合成途径中的ppk基因(No.8),并利用MUCICAT技术将其插入E.coli基因组的不同位置和拷贝数,实现了不同活性水平 | 研究主要集中在E.coli中,未涉及其他生物体 | 开发一种快速、无标记、多站点、多拷贝的基因组编辑系统,以推进合成生物学 | Escherichia coli | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT | NA | 基因组数据 | NA |
518 | 2025-02-16 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 本文介绍了一种利用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断的寡核苷酸子集选择方法 | 该方法无需引物进行选择性杂交,并能够以少于五个核苷酸的条形码长度编码和选择数百个子集,增强了寡核苷酸库的可编程性 | NA | 旨在解决复杂寡核苷酸库中子集选择的问题,提高基因组学、合成生物学和DNA数据存储领域的效率和成本效益 | 寡核苷酸库 | 合成生物学 | NA | 序列特异性循环核苷酸合成 | NA | NA | NA |
519 | 2025-02-16 |
Multiscale Mathematical Modeling in Systems Biology: A Framework to Boost Plant Synthetic Biology
2025-Feb-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14030470
PMID:39943032
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综述 | 本文探讨了多尺度数学建模在植物合成生物学中的应用,以评估和减轻相关风险 | 提出了将多尺度数学建模与农业数据分析技术结合,以全面理解作物在不同生物尺度上的表现 | 多尺度数学建模在植物中的应用仍然不足 | 通过多尺度数学建模提高植物合成生物学的安全性,增强作物对病虫害和干旱的抵抗力 | 玉米(Zea mays L.) | 系统生物学 | NA | 参数估计、分岔分析、敏感性分析 | 多尺度数学模型 | 农业数据 | NA |
520 | 2025-02-16 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的定点诱变方案,利用具有3'端突出部分的引物对提高诱变效率和降低错误率 | 通过使用部分互补的引物对和3'端突出部分,显著提高了定点诱变的效率和成功率,同时减少了错误率和所需时间 | 需要熟练的实验人员进行操作,且依赖于高转化效率的细菌细胞 | 开发一种更高效、可靠的定点诱变方法,用于分子生物学、蛋白质工程、质粒工程和合成生物学 | 定点诱变引物对和高转化效率的DH5α细菌细胞 | 分子生物学 | NA | 定点诱变技术 | NA | NA | 每个诱变反应通常需要分析3个菌落,熟练的实验人员可在一周内构建1到2打突变质粒 |