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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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501 | 2025-02-12 |
New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza
2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384
PMID:39756484
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综述 | 本文综述了丹参中丹参酮生物合成的最新生物技术工程策略 | 总结了丹参酮的生物活性、生物合成途径及调控、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量 | 提高丹参中丹参酮的产量 | 丹参(Salvia miltiorrhiza) | 生物技术 | 心血管疾病 | 合成生物学、表观遗传修饰 | NA | NA | NA |
502 | 2025-02-12 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Feb-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
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综述 | 本文综述了光合作用的原理及其在设计和工程化光合系统中的应用,探讨了光合作用在能源和物质转换中的潜力 | 综述了多种设计和工程化光合系统的策略,包括纳米材料辅助方法、微流体技术、合成生物学技术和光生物电化学系统,并探讨了这些技术在人工细胞器、缺氧组织愈合、生物生产和环境可持续性等领域的应用 | NA | 探讨光合作用在能源和物质转换中的潜力,并介绍设计和工程化光合系统的最新策略 | 光合作用及其工程化系统 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助方法、微流体技术、合成生物学技术、光生物电化学系统 | NA | NA | NA |
503 | 2025-02-12 |
Recent Advances in Biocatalytic and Chemoenzymatic Synthesis of Oligonucleotides
2025-Jan-24, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400987
PMID:39854143
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综述 | 本文综述了生物催化和化学酶法合成寡核苷酸的最新进展,强调了酶工程、底物和反应条件优化方面的创新 | 介绍了生物催化和化学酶法作为传统固相合成和聚合酶方法的替代方案,提供了更高的选择性和效率 | 尽管生物催化和化学酶法具有优势,但仍存在一些局限性,如反应条件的优化和酶工程的技术挑战 | 探讨生物催化和化学酶法在寡核苷酸合成中的应用,以克服传统方法的局限性 | 寡核苷酸 | 合成生物学 | NA | 生物催化、化学酶法 | NA | NA | NA |
504 | 2025-02-12 |
[Function of flavoprotein monooxygenases in natural product biosynthesis]
2025-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文全面回顾了黄素蛋白单加氧酶(FPMOs)在天然产物生物合成中的最新研究进展 | 系统分析了FPMOs的分类、催化反应和催化机制,特别是植物中Class B FPMOs的三个亚家族(FMO、BVMO和NMO)的催化特性 | NA | 探讨FPMOs在天然产物生物合成中的作用及其应用潜力 | 黄素蛋白单加氧酶(FPMOs) | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
505 | 2025-02-12 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 本文描述了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的协议,使其无法进行细胞分裂并抵抗环境压力,从而创建了一种新型的细胞-材料混合体,称为赛博格细菌细胞 | 提出了一种新的细胞底盘,结合了合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性,扩展了合成生物学的工具集 | 实施该协议需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术的专业知识,进一步功能化和协议适应需要从合成遗传电路工程到水凝胶聚合化学的技能 | 开发一种新型的细胞底盘,用于生物技术、生物医学工程和活体治疗 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 水凝胶化学、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | NA | NA |
506 | 2025-02-12 |
A versatile in situ cofactor enhancing system for meeting cellular demands for engineered metabolic pathways
2024-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105598
PMID:38159859
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研究论文 | 本文介绍了一种最小干扰系统XR/乳糖,用于增加大肠杆菌中与NAD(P)H、FAD、FMN和ATP生物合成相关的糖磷酸盐水平,从而提高代谢工程细胞的生产力 | 提出了一种新的XR/乳糖系统,通过增加细胞内的糖磷酸盐水平来增强体内辅因子的生成,适用于不同辅因子需求的代谢工程细胞系统 | 虽然XR/乳糖系统在提高生产力方面表现出色,但其他糖还原系统(如葡萄糖脱氢酶)的效果较差,且未对所有可能的代谢工程系统进行测试 | 研究如何通过增加细胞内糖磷酸盐水平来满足代谢工程细胞对辅因子的需求,从而提高其生产力 | 大肠杆菌中的代谢工程细胞系统 | 合成生物学 | NA | XR/乳糖系统,葡萄糖脱氢酶系统 | NA | 代谢组学数据,转录组学数据 | 三种不同的代谢工程细胞系统(脂肪醇生物合成、生物发光光生成和烷烃生物合成) |
507 | 2025-02-11 |
A synthetic chronogenetic gene circuit for programmed circadian drug delivery
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56584-5
PMID:39920119
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研究论文 | 本文开发了一种基于合成生物学和组织工程的昼夜节律基因电路,用于编程昼夜节律药物递送 | 创新点在于开发了称为“时间遗传学”的昼夜节律基因电路,该电路在核心时钟基因Period2(Per2)启动子下游表达规定的转基因 | NA | 研究目的是开发一种基于细胞的昼夜节律疗法,用于昼夜节律医学中的各种应用 | 研究对象是类风湿性关节炎和其他炎症性疾病 | 合成生物学 | 类风湿性关节炎 | 合成生物学、组织工程 | NA | NA | NA |
508 | 2025-02-11 |
The evolution of sequences and spatial conformation in vertebrate chromosomes
2025-Feb, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-212
PMID:39924699
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综述 | 本文综述了脊椎动物染色体的序列和空间构象的进化,探讨了染色体重排在物种形成中的作用、染色体重排的分子机制、从祖先染色体到现存染色体的进化模式以及性染色体作为研究染色体进化的通用范例的意义 | 本文利用高通量测序技术的快速发展,提供了对染色体变异的新理解,并讨论了合成生物学在染色体进化研究领域带来的新机遇和挑战 | 本文主要关注脊椎动物,可能不适用于其他生物类群 | 旨在提供对脊椎动物染色体进化的新见解和参考 | 脊椎动物的染色体 | 基因组学 | 癌症 | 高通量测序技术 | NA | 序列数据 | NA |
509 | 2025-02-10 |
CAR-T cell therapy for breast cancer: Current status and future perspective
2025-Feb, Cancer treatment reviews
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.ctrv.2024.102868
PMID:39798230
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研究论文 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在乳腺癌治疗中的现状和未来前景 | 探讨了CAR-T细胞疗法在乳腺癌治疗中的应用,提出了通过合成生物学、逻辑门控CAR构建、装甲CAR等技术改进CAR-T细胞疗法的策略 | 当前CAR-T细胞疗法在乳腺癌中的效果远未达到在血液癌症中的成功,主要由于肿瘤特异性抗原的稀缺和乳腺癌免疫抑制微环境 | 探讨CAR-T细胞疗法在乳腺癌治疗中的应用和改进策略 | 乳腺癌患者,特别是转移性乳腺癌患者 | 细胞免疫疗法 | 乳腺癌 | CAR-T细胞疗法,合成生物学,逻辑门控CAR构建,装甲CAR | NA | 临床和临床前数据 | NA |
510 | 2025-02-09 |
Increased accumulation of fatty acids in engineered Saccharomyces cerevisiae by co-overexpression of interorganelle tethering protein and lipases
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.11.005
PMID:39613152
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研究论文 | 本文提出了一种通过共表达细胞器间连接蛋白和脂肪酶来增加工程化酿酒酵母中脂肪酸积累的新策略 | 通过比较油性和非油性酵母的脂滴形态变化,开发了一种新的工程策略,通过调控与脂滴相关的调节因子和脂肪酶来增加酿酒酵母中的脂肪酸积累 | NA | 提高微生物细胞工厂中脂肪酸及其衍生物的生产能力 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
511 | 2025-02-09 |
A rapid CAT transformation protocol and nuclear transgene expression tools for metabolic engineering in Cyanidioschyzon merolae 10D
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.001
PMID:39638031
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研究论文 | 本文介绍了一种针对Cyanidioschyzon merolae 10D的快速转化协议和核转基因表达工具,用于代谢工程 | 优化了转化和选择协议,能够在两周内获得单氯霉素抗性转化体,并开发了合成模块质粒工具包,包括新的荧光报告基因 | NA | 促进Cyanidioschyzon merolae作为代谢工程和未来可持续生物技术生产的藻类系统 | Cyanidioschyzon merolae 10D | 合成生物学 | NA | 荧光报告基因成像和分析技术 | NA | NA | NA |
512 | 2025-02-09 |
Towards polyethylene terephthalate valorisation into PHB using an engineered Comamonas testosteroni strain
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.005
PMID:39708916
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研究论文 | 本研究通过工程化改造Comamonas testosteroni RW31菌株,验证了其能够将聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)降解为单体并生产生物塑料聚羟基丁酸酯(PHB)的能力 | 首次验证了Comamonas testosteroni RW31菌株能够通过异源表达PET降解酶FAST-PETase和IsMHETase,成功降解PET并生产PHB | 研究中PET的降解率在体外和体内分别为37.1%和0.83%,体内降解效率较低 | 探索将PET废料转化为生物塑料PHB的合成生物学策略 | Comamonas testosteroni RW31菌株 | 合成生物学 | NA | 异源表达、酶降解 | NA | 实验数据 | NA |
513 | 2025-02-08 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-Feb-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的酵母文库转化方法HEEL,通过结合热休克和电穿孔技术,提高了单转化酵母细胞的比例,从而实现了近乎完美的表型到基因型的关联 | HEEL方法通过结合热休克和电穿孔技术,显著提高了单转化酵母细胞的比例,从20%提升至70%以上,解决了传统方法中多质粒摄取导致的异质基因型问题 | 尽管HEEL方法显著提高了转化效率和单转化细胞比例,但其在更大规模应用中的效果和稳定性仍需进一步验证 | 开发一种高效的酵母文库转化方法,以提高表型到基因型关联的准确性 | 酵母细胞 | 分子生物学 | NA | 热休克-电穿孔结合技术(HEEL) | NA | DNA文库 | 每个反应超过10个酵母细胞 |
514 | 2025-02-08 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本文开发了位点选择性交联探针,用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与其酶域之间的相互作用 | 使用四嗪点击化学捕获载体蛋白底物在缩合域活性位点的缩合过程,并报告了该复合物的高分辨率冷冻电镜结构 | 由于多域和多模块架构的固有动态性,这些合成酶的结构表征仍然具有挑战性 | 理解非核糖体肽合成酶的分子细节,并为未来的合成生物学设计提供关键信息 | 非核糖体肽合成酶中的载体蛋白及其酶域 | 生物化学 | NA | 四嗪点击化学,冷冻电镜,X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA |
515 | 2025-02-08 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
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研究论文 | 本文概述了一个旨在为微生物学领域提供公平的高影响力研究经验和课程指导的途径项目 | 提出了一个途径项目,旨在通过高影响力研究经验和课程指导,促进微生物学领域的多样性和包容性 | NA | 促进微生物学领域的多样性和包容性,培养未来关键领域的多样化人才 | 微生物学领域的学生和研究人员 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
516 | 2025-02-08 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 本文介绍了一种在凝胶颗粒格式中测量XNA聚合酶保真度的新方法 | 开发了一种无需纯化的方法,通过在凝胶包覆的磁性颗粒基质中进行XNA转录和逆转录步骤,显著减少了测量XNA聚合酶保真度所需的时间和反应规模 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种更高效的方法来测量能够合成人工遗传聚合物(XNA)的聚合酶的保真度 | XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 凝胶包覆的磁性颗粒基质中的XNA转录和逆转录 | NA | NA | NA |
517 | 2025-02-08 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本文介绍了一种名为“foldtuning”的新方法,利用蛋白质语言模型(pLMs)探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域 | 通过foldtuning方法,利用pLMs生成和自反馈能力,探索与自然序列无同源性的蛋白质“深空”区域,并构建了一个包含700多种自然折叠的foldtuned pLMs库 | 尽管foldtuning方法展示了在蛋白质序列设计中的潜力,但其生成的蛋白质变体的功能和稳定性仍需进一步实验验证 | 探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域,推动合成生物学系统的重新设计和重构 | 蛋白质序列和结构 | 自然语言处理 | NA | 蛋白质语言模型(pLMs) | pLMs | 蛋白质序列和结构数据 | 超过700种自然折叠的蛋白质 |
518 | 2025-02-08 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
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综述 | 本文回顾并总结了非编码RNA(ncRNA)在细胞命运决定中的数学模型框架及其在真实生物过程中的应用 | 探讨了ncRNA与转录因子之间的正反馈环以及miRNA-mRNA相互调控的新兴特性,这些特性使得双稳态开关能够指导细胞命运决定 | ncRNA介导的双稳态开关的分子机制仍然不明确且存在争议 | 阐明ncRNA介导的细胞命运决定过程的分子机制 | 非编码RNA(ncRNA)、mRNA、miRNA和竞争性内源mRNA(ceRNA) | 系统生物学与合成生物学 | NA | 数学模型与定量实验分析 | NA | NA | NA |
519 | 2025-02-08 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
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综述 | 本文探讨了微生物组工程在提高食品安全和质量方面的作用,并评估了相关的最新技术和社会伦理问题 | 本文综合评估了合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术在微生物组工程中的应用,并强调了跨学科合作的重要性 | 需要进一步研究以解决复杂食品系统中微生物动态的理解和统一监管框架的制定等关键挑战 | 探讨微生物组工程在提高食品安全和质量方面的潜力 | 微生物组及其在食品系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能、系统生物学 | NA | NA | NA |
520 | 2025-02-08 |
Development of robust constitutive synthetic promoter using genetic resources of plant pararetroviruses
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1515921
PMID:39911660
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研究论文 | 本研究旨在通过开发高效的合成启动子来增加植物基因工程中使用的组成型启动子库,特别是针对高水平基因表达的启动子 | 开发了一种新的三杂交启动子MuasFuasH17(MFH17),该启动子在双子叶和单子叶植物中均表现出高度的组成型和高效性 | 研究中未提及该启动子在所有植物种类中的广泛适用性,且未详细讨论其在环境压力下的表现 | 增加植物基因工程中使用的组成型启动子库,特别是针对高水平基因表达的启动子 | 植物合成生物学中的基因调控元件(启动子) | 植物合成生物学 | NA | DNA shuffling技术 | NA | 基因表达数据 | 转基因植物幼苗 |