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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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501 | 2025-04-11 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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research paper | 研究多色荧光适配体Pepper在不同细菌种类中RNA支架的影响 | 评估了多色荧光适配体Pepper在革兰氏阳性和阴性细菌中的应用,并发现不同RNA支架对荧光有显著影响 | 未明确说明研究的细菌种类数量及实验的具体条件 | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌中荧光效果的影响 | 革兰氏阳性和阴性细菌 | RNA合成生物学 | NA | 多色荧光成像 | NA | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及多种细菌 |
502 | 2025-04-10 |
Unraveling the potential of bioengineered microbiome-based strategies to enhance cancer immunotherapy
2025-Jul, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128156
PMID:40158322
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综述 | 本文综述了生物工程微生物组策略在增强癌症免疫治疗中的潜力 | 讨论了合成生物学在重新编程和工程化微生物以提高抗肿瘤活性、增强T细胞功能和实现靶向治疗递送方面的应用 | 存在遗传稳定性要求、有效肿瘤定植和潜在安全性问题控制等挑战 | 探讨微生物组在癌症免疫治疗中的作用及其生物工程应用的潜力 | 胃肠道和肿瘤内的微生物群落 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
503 | 2025-04-10 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文综述了合成生物学在天然产物生物合成中的最新进展 | 总结了合成生物学在天然产物发现和工程中的多学科整合和新工具开发 | NA | 探讨合成生物学在天然产物生物合成中的应用 | 天然产物及其生物合成基因簇(BGCs) | 合成生物学 | NA | 生物信息学、异源表达、组合生物合成 | NA | NA | NA |
504 | 2025-04-10 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Apr-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
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research paper | 该研究提出了一种控制去膜化膜化凝聚液滴的策略,以模拟生物系统中的膜动态过程 | 通过静电竞争触发去膜化过程,实现了凝聚液滴结构的可控重构,并扩展了其在合成生物学和生物技术中的应用 | NA | 研究膜化/去膜化过程对凝聚液滴结构和功能的影响,以开发具有动态和多样膜结构的合成原细胞 | 膜化和去膜化的凝聚液滴 | 合成生物学 | NA | 静电竞争触发去膜化 | NA | NA | NA |
505 | 2025-04-10 |
Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity
2025-03-21, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00582
PMID:39935093
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研究论文 | 研究探讨了不同来源的PARPs蛋白的调控域(REG)和催化域(CAT)能否相互组装形成功能性嵌合体 | 揭示了PARPs蛋白的REG和CAT域可以独立于变构配体相互作用,并且可以在DNA存在下组装成功能活性构象 | 研究仅限于体外实验,尚未在活细胞中验证 | 探究PARPs蛋白的调控域和催化域的交叉互补性及其功能活性 | 哺乳动物(hPARP1和hPARP2)、植物(atPARP2)和细菌(haPARP)的PARPs蛋白 | 分子生物学 | NA | 定性和定量酶活性测定及结合研究 | NA | NA | NA |
506 | 2025-04-10 |
Deep Neural Networks for Predicting Single-Cell Responses and Probability Landscapes
2023-08-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00203
PMID:37467372
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研究论文 | 本文探讨了使用深度神经网络预测单细胞响应和概率景观的方法 | 提出了能够预测未来状态完整分布的更新网络架构,以准确预测双峰表达分布 | 初始方法在预测多模态动态时存在根本性不足 | 预测和控制生物电路,支持合成生物学应用 | 单细胞响应和概率景观 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度神经网络 | 时间序列数据 | 计算模拟的单细胞响应数据 |
507 | 2025-04-09 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Apr-08, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
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research paper | 本文探讨了土壤微生物群落中基因转移的预测和理解,以评估合成生物学技术大规模应用时工程DNA向环境微生物无意转移的频率 | 提出了填补土壤微生物组基因转移知识空白的策略,包括创建土壤标准集和使用新兴技术测量基因转移宿主范围 | 土壤的复杂性和异质性增加了预测基因转移过程的难度 | 提高对土壤微生物群落中基因转移的理解,以设计更安全的生物技术 | 土壤微生物群落和工程微生物 | 合成生物学 | NA | 合成DNA技术、新兴基因转移测量技术 | 社区规模、环境特异性模型 | 微生物基因转移数据 | 多种土壤类型 |
508 | 2025-04-09 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-Apr, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 该研究从云南地不容的转录组数据中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的BIA 7OMTs酶SyOMT4和SyOMT5,并通过蛋白质工程改造其底物结合微环境,成功改变了它们的催化区域选择性 | 通过定点突变成功将SyOMT4转化为高特异性的BIA 6OMT酶SyOMT4-WFE,并将SyOMT5意外改造为BIA NMTs酶SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD,拓展了BIA OMTs酶的功能多样性 | NA | 研究BIA O-甲基转移酶的功能表征与区域选择性调控机制 | 云南地不容中的两个BIA O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 转录组分析、多序列比对、结构建模、定点突变 | NA | 序列数据、结构模型 | NA |
509 | 2025-04-09 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 该研究通过合成转录因子验证了Komagataella phaffii Mxr1中九个氨基酸转录激活域(9aaTADs)的功能 | 首次全面表征了K. phaffii锌指转录因子中的9aaTADs,并揭示了其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化激活转录的机制 | 研究仅针对K. phaffii中的Mxr1转录因子,其他物种或转录因子中的9aaTADs功能尚未验证 | 探究K. phaffii Mxr1转录因子中多个9aaTADs的功能及其转录激活机制 | Komagataella phaffii Mxr1转录因子及其9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 21个推定的9aaTADs(TAD B-V)及1个已知的TAD A |
510 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
511 | 2025-04-08 |
Super-robust synthetic microorganism can get chlorine resistance in advance and transfer their inserted DNA sequence in genome to indigenous bacteria in water
2025-Apr-02, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2025.123594
PMID:40188791
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研究论文 | 本研究探讨了超级稳健合成微生物在水环境中的行为及其对氯的抵抗能力 | 发现超级稳健合成微生物能够将插入的DNA序列转移给土著细菌,并展示出比野生型细菌更强的氯抵抗能力 | 对于超级稳健合成微生物在环境中的长期影响和潜在健康风险了解有限 | 研究超级稳健合成微生物在水环境中的命运及其作为新兴生物污染物的环境风险 | 超级稳健合成微生物和土著细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 实验数据 | NA |
512 | 2025-04-07 |
Bioprinting and synthetic biology approaches to engineer functional endocrine pancreatic constructs
2025-Apr-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.005
PMID:40185667
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review | 讨论生物打印和合成生物学在工程化功能性内分泌胰腺构建体中的最新进展 | 融合合成生物学、细胞工程与生物打印技术,为开发先进体外模型和可移植移植物开辟新途径 | NA | 探索利用生物打印和合成生物学技术开发功能性内分泌胰腺构建体,以治疗糖尿病 | 内分泌胰腺构建体 | 合成生物学 | 糖尿病 | 生物打印、合成生物学、细胞工程 | NA | NA | NA |
513 | 2025-04-07 |
Towards the computational design of protein post-translational regulation
2015-Jun-15, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2015.04.056
PMID:25956846
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review | 本文综述了蛋白质翻译后修饰(PTMs)在细胞调控中的作用及其计算方法设计的最新进展 | 探讨了利用合成生物学方法设计蛋白质翻译后修饰调控的新机遇 | 尚未深入探讨具体设计方法的实验验证和应用限制 | 推动合成生物学在蛋白质翻译后修饰调控领域的应用 | 蛋白质翻译后修饰(PTMs)及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA | NA |
514 | 2025-04-06 |
High-throughput optimisation of protein secretion in yeast via an engineered biosensor
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.010
PMID:39674781
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research paper | 该研究通过工程化生物传感器优化酵母中蛋白质的高通量分泌 | 利用酵母G蛋白偶联受体生物传感器测量与目标蛋白质共分泌的肽标签浓度,实现分泌效率的高通量筛选 | NA | 优化异源蛋白质表达策略中的分泌效率 | 酵母中的蛋白质分泌系统 | 合成生物学 | NA | Combinatorial Golden Gate克隆 | NA | NA | 超过6000种启动子、信号肽和终止子的组合 |
515 | 2025-04-05 |
Editorial: Microbial co-cultures: a new era of synthetic biology and metabolic engineering, volume II
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1587450
PMID:40182290
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
516 | 2025-04-05 |
Redesigning and rethinking genetic circuits: the potential of transcriptional rewiring in filamentous fungi
2025-Apr-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103301
PMID:40179610
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综述 | 本文探讨了丝状真菌中基因调控网络(GRN)操作的分子工具包,重点关注转录重连和启动子工程 | 利用对光和温度等物理线索响应的顺式元件,实现了前所未有的时空精确基因表达控制,并展示了转录重连如何增强纤维素酶生产和揭示复杂电路的设计原则 | 主要关注丝状真菌,对其他真菌种类的应用潜力讨论较少 | 探索丝状真菌中基因调控网络的操纵潜力,特别是在代谢工程和基础研究中的应用 | 丝状真菌,特别是以Neurospora crassa为模型 | 合成生物学 | NA | 转录重连,启动子工程 | NA | NA | NA |
517 | 2025-04-05 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文全面总结了木质素降解的前沿生物策略、木质素分解酶、代谢途径以及降解菌株或菌群,并批判性地评估了其潜在机制 | 强调了利用数字系统和合成生物学等创新方法来释放木质素衍生原材料的商业潜力,以及人工智能驱动技术在克服当前挑战和推动木质素增值广泛采用中的前景 | 木质素的复杂组成和抗分解性仍然是其定向增值的主要障碍 | 探索木质素增值和利用木质素基原材料进行生物制造的潜力 | 木质素及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、人工智能驱动技术 | NA | NA | NA |
518 | 2025-04-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 研究DNA纳米结构与脂质膜之间的相互作用,探讨纳米尺度立体效应对其影响 | 首次揭示了DNA纳米结构锚定物的立体环境及局部纳米级双层形态对膜相互作用的影响,并展示了通过非脂化DNA区域实现50和200纳米囊泡尺寸区分的创新方法 | 研究仅针对四种特定立体环境下的DNA纳米结构,可能无法涵盖所有可能的相互作用情况 | 探索DNA纳米结构与脂质膜相互作用的机制,为合成生物学和生物传感应用提供理论基础 | 具有四种不同立体环境膜锚定物的3D DNA纳米结构与不同尺寸膜囊泡的相互作用 | DNA纳米技术 | NA | 3D DNA纳米结构构建技术 | NA | 实验观测数据 | 不同尺寸的膜囊泡(特别展示了50nm和200nm囊泡的区分) |
519 | 2025-04-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
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research paper | 该研究介绍了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层(dsLBs)的新型合成细胞技术,用于体外扩增治疗相关的T细胞表型 | 提出了一种具有可调生物化学和生物物理特性的软合成细胞技术,作为人工抗原呈递细胞(aAPCs),用于体外T细胞扩增,并揭示了横向配体移动性在T细胞激活中的关键作用 | 研究主要基于体外实验,未涉及体内验证 | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术,以改善免疫治疗效果 | T细胞,特别是IL-4/IL-10分泌的调节性CD8 T细胞和Her2/CD3双特异性T细胞接合剂介导的T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离液滴支撑脂质双层(dsLBs)技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 |
520 | 2025-04-04 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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review | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在合成生物学和再生医学中的潜在应用 | 综述了多种原始细胞模型的构建方法及其组装成功能化原始组织的化学和物理策略,强调了原始组织在细胞间通讯和集体行为方面的独特性质 | NA | 探索原始细胞网络工程在原始组织发展中的应用 | 原始细胞模型(如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚体和乳液滴)及其组装成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |