合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
501	2025-03-21	Modulating ion channels with nanobodies 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.005 PMID:40103710	综述	本文综述了纳米抗体在离子通道研究和调控中的应用进展	纳米抗体因其小尺寸、高特异性和识别难以接近的表位的能力，为离子通道的结构-功能关系研究提供了新的机会，并有望克服传统药物的脱靶效应和毒性问题	NA	探讨纳米抗体在离子通道研究和治疗中的潜力	离子通道	合成生物学	NA	纳米抗体技术	NA	NA	NA
502	2025-03-21	Recent advances in biological synthesis of food additive succinate 2025-Mar-19, Critical reviews in biotechnology IF:8.1Q1 DOI:10.1080/07388551.2025.2472636 PMID:40107767	综述	本文综述了生物合成食品添加剂琥珀酸的最新进展，重点介绍了代谢工程策略在增强琥珀酸生物合成中的应用	本文通过先进的合成生物学技术，强调了开发强大的微生物细胞工厂的潜力，并塑造了微生物在工业应用中整合的未来方向	尽管在优化发酵过程和下游操作方面做出了大量努力，但仍需提高成本效益和竞争力，同时考虑环境问题	提高琥珀酸生物合成的效率和经济效益，同时考虑环境问题	琥珀酸	合成生物学	NA	代谢工程策略，包括发酵调控、代谢调控、细胞调控和模型指导	NA	NA	NA
503	2025-03-21	Microalgae in health care and functional foods: β-glucan applications, innovations in drug delivery and synthetic biology 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1557298 PMID:40103595	综述	本文综述了微藻在医疗保健和功能性食品中的应用，特别是β-葡聚糖的治疗潜力、药物递送创新和合成生物学应用	强调了微藻在免疫调节和抗癌治疗中的潜力，以及合成生物学和生物工艺工程在提高微藻治疗和营养价值方面的创新应用	需要进一步研究和开发以解决可扩展性、法规一致性和消费者接受度问题	探讨微藻在医疗保健和功能性食品中的应用潜力	微藻及其衍生的生物活性化合物，如β-葡聚糖	生物技术	癌症	合成生物学、生物工艺工程	NA	NA	NA
504	2025-03-21	Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase 2024-03-19, Biochemistry IF:2.9Q3 DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681 PMID:38420671	研究论文	本文通过结构基础的工程改造，将一种倍半萜环化酶转化为α-红没药醇合酶，展示了其作为合成生物学应用平台的潜力	通过突变活性位点轮廓，重新设计EIZS以生成倍半萜醇产物，而非倍半萜烃产物，扩展了EIZS作为设计环化酶平台的潜力	突变后的酶在生成α-红没药醇时的保真度仅为65%至74%，表明仍有改进空间	研究目的是通过结构基础的工程改造，将EIZS转化为α-红没药醇合酶，以扩展其在合成生物学中的应用	研究对象是EIZS酶及其突变体，特别是F95S-F198S双突变体	合成生物学	NA	X射线晶体学、生化表征	NA	晶体结构数据、生化数据	NA
505	2025-03-21	Small RNAs Turn Over a New Leaf as Morphogens 2017-11-06, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2017.10.025 PMID:29112845	研究论文	本文探讨了移动小RNA梯度通过基于阈值的读取机制创建基因表达尖锐边界的可能性	通过操纵参与叶片上下模式的小RNA和一种新颖的合成生物学方法，支持了这一假设	NA	研究小RNA梯度在基因表达边界形成中的作用	叶片模式形成中的小RNA	发育生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
506	2025-03-20	A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling 2025-Jan-13, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01816-w PMID:39806069	研究论文	本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感器信号放大电路，该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入	开发了一种新型的无细胞生物传感器信号放大电路PSR，通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收，显著提高了生物传感器的灵敏度	未提及具体的局限性	扩展无细胞生物传感器的功能，提高其检测小分子的灵敏度	无细胞系统中的基因表达和传感	合成生物学	NA	聚合酶链回收（PSR）	NA	核酸	NA
507	2025-03-20	Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation 2024-Nov, Nature chemistry IF:19.2Q1 DOI:10.1038/s41557-024-01596-9 PMID:39294420	研究论文	本文揭示了一种包含N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-His-1-羧酸盐（HExxH）结构域的单一翻译后修饰酶的结构和功能	首次展示了自由基SAM结构域和HExxH结构域在单一酶中的融合，并揭示了这种酶催化三残基环芳烃形成和β-羟基化的功能	NA	研究一种新型翻译后修饰酶的结构和功能	包含N端自由基SAM结构域和C端HExxH结构域的酶	酶学	NA	晶体结构分析	NA	晶体结构数据	NA
508	2025-03-20	Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression 2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.01556-24 PMID:39291982	研究论文	本文介绍了一种改进的Tn7转座子载体，用于控制染色体基因的表达	通过添加诱导型和组成型启动子，增强了mini-Tn插入载体的功能，实现了染色体上基因的差异转录控制	研究主要针对革兰氏阴性菌，未涉及其他类型细菌或真核生物	开发一种更灵活的染色体基因表达控制系统，以替代质粒在基因互补中的应用	K-12菌株MG1655的染色体	合成生物学	NA	染色体整合技术	NA	NA	NA
509	2025-03-19	Development of CRISPR-Cas9-based genome editing tools for non-model microorganism Erwinia persicina 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.006 PMID:40092160	研究论文	本研究开发了基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具，用于非模式微生物Erwinia persicina的基因操作	成功应用CRISPR-Cas9系统于Erwinia persicina，通过优化gRNA设计和单质粒系统实现高效基因组编辑，并展示了其在合成生物学中的应用潜力	研究主要针对Erwinia persicina，未涉及其他非模式微生物的适用性验证	开发适用于非模式微生物Erwinia persicina的基因组编辑工具	Erwinia persicina细菌	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9	NA	基因组数据	NA
510	2025-03-19	A dual light-controlled co-culture system enables the regulation of population composition 2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.012 PMID:40092159	研究论文	本研究开发了一种双光控共培养系统，能够动态调节种群比例，为代谢工程和合成生物学提供通用工具包	利用优化的色适应传感器/调节器（CcaS/R）系统和蓝光激活的YF1-FixJ-PhlF系统作为诱导模块，结合正交群体感应系统和毒素-抗毒素系统，实现了种群比例的动态调控	NA	开发一种能够动态调节种群比例的双光控共培养系统，以优化生物生产性能	微生物共培养系统	合成生物学	NA	光遗传学系统，群体感应系统，毒素-抗毒素系统	NA	NA	NA
511	2025-03-19	Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells 2025-Mar-17, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-025-01879-3 PMID:40097648	研究论文	本文介绍了在合成细胞中直接表达RNA折纸细胞骨架模拟物的方法，以替代依赖化学合成和热退火的DNA纳米结构	使用RNA折纸技术直接在合成细胞中表达细胞骨架模拟物，实现了在等温条件下自组装成微米级三维RNA折纸纳米管	NA	探索基于RNA的活性、可进化的合成细胞	合成细胞中的RNA折纸细胞骨架模拟物	合成生物学	NA	RNA折纸技术	NA	分子动力学模拟数据	NA
512	2025-03-19	Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots 2025-Mar-17, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-024-01133-5 PMID:40097832	研究论文	本文开发了一种在活细胞中合成量子点（QDs）的方法，并验证了其在多种细胞中的可行性	通过耦合细胞内代谢途径，实现了在活细胞中精确时空序列下合成量子点，解决了传统有机溶剂中合成的量子点生物相容性差的问题	需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该过程	开发一种生物相容性更好的量子点合成方法，以扩展其在生物医学领域的应用	酵母（Saccharomyces cerevisiae）、金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）、MCF-7细胞和MDCK细胞	材料科学	NA	活细胞合成、准生物合成	NA	NA	多种细胞类型（酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞和MDCK细胞）
513	2025-03-19	Magnetizing Biotech-Advances in (In Vivo) Magnetic Enzyme Immobilization 2025-Mar, Engineering in life sciences IF:3.9Q2 DOI:10.1002/elsc.70000 PMID:40083857	综述	本文综述了磁性酶固定化的现有和新兴方法，特别关注体内固定化解决方案	结合合成生物学和多功能材料（如磁性纳米材料）的发展，提出了新的酶固定化方法，提高了分离和纯化过程的效率	NA	提高工业生物催化中酶的稳定性和活性，改善酶的使用效率	酶固定化方法，特别是磁性蛋白固定化	生物技术	NA	磁性纳米材料	NA	NA	NA
514	2025-03-19	Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping 2025-Feb-13, The Plant cell DOI:10.1093/plcell/koaf026 PMID:39899469	研究论文	本文介绍了一种快速、自动化、可扩展的高通量植物生物工程管道（FAST-PB），用于玉米和本氏烟草的基因组编辑和产物表征	FAST-PB整合了自动化生物工厂工程与单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱（MALDI-MS），显著提高了合成生物学、基因组编辑和代谢工程的通量	NA	提高植物细胞中的脂质产量	玉米（Zea mays）和本氏烟草（Nicotiana benthamiana）	合成生物学	NA	CRISPR编辑、单细胞基质辅助激光解吸/电离质谱（MALDI-MS）	NA	单细胞脂质组学数据	96个载体并行构建
515	2025-03-19	Cyanobacterial type I CRISPR-Cas systems: distribution, mechanisms, and genome editing applications 2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2025.1552030 PMID:40084131	研究论文	本文深入分析了蓝藻基因组中的内源性CRISPR-Cas系统，特别是分布最广的I型系统，并总结了其在基因组编辑中的应用	首次全面总结了蓝藻I型CRISPR-Cas系统的DNA防御机制及其在基因组编辑中的应用，并展望了其在合成生物学中的潜力	未提及具体的实验验证或应用案例，主要基于已有文献的总结和分析	探索蓝藻I型CRISPR-Cas系统的分布、机制及其在基因组编辑中的应用	蓝藻及其内源性CRISPR-Cas系统	合成生物学	NA	CRISPR-Cas系统	NA	基因组数据	NA
516	2025-03-19	Current status and future perspectives of the diagnostic of plant bacterial pathogens 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1547974 PMID:40093602	综述	本文综述了植物细菌病原体诊断的现状和未来展望，从基于培养的策略发展到无培养检测	介绍了微拉曼光谱技术在单细胞水平上快速、无标记、非侵入性地鉴别活但不可培养病原体的创新应用	光谱学方法在检测先前未知的植物病原体方面存在不足	探讨植物细菌病原体诊断技术的发展及其应用	植物细菌病原体	植物病理学	NA	微拉曼光谱技术、单细胞测序、合成生物学	NA	光谱数据	NA
517	2025-03-19	Fungi: Pioneers of chemical creativity - Techniques and strategies to uncover fungal chemistry 2025, IMA fungus IF:5.2Q1 DOI:10.3897/imafungus.16.142462 PMID:40093757	review	本文综述了真菌在药物开发和新型化学物质发现中的重要作用，并探讨了从过去到现在天然产物发现和药物先导物识别的分析及战略框架	强调了利用合成生物学系统探索真菌基因组的努力，并提出了合作与协作的必要性以充分利用真菌次级代谢物的潜力	未具体提及研究的局限性	探讨真菌在药物开发和新型化学物质发现中的应用及其技术进展	真菌及其次级代谢物	生物化学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
518	2025-03-19	Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling 2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.25.591074 PMID:38712145	研究论文	本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感信号放大电路，通过利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录来回收DNA链置换电路中的核酸输入	开发了PSR电路，扩展了无细胞生物传感的能力，实现了高特异性和低检测限的RNA目标直接传感	NA	扩展无细胞电路的能力，通过PSR实现信号放大，用于生物技术中的多种应用	RNA目标和小分子检测	合成生物学	NA	聚合酶链回收（PSR），DNA链置换电路	双平衡模型	核酸	NA
519	2025-03-18	CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization 2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.28.640911 PMID:40060553	研究论文	本文提出了一种名为CasGen的新型生成模型，用于设计CRISPR Cas蛋白，通过分类和基于边缘的优化来提高新生成Cas9和Cas12蛋白的质量	CasGen是一种基于Transformer的深度生成模型，结合了分类、贝叶斯优化和AlphaFold结构验证，以增强新生成Cas蛋白的功能性和结构相似性	研究依赖于现有的Cas9和Cas12蛋白序列数据，可能限制了生成蛋白的多样性	扩展基因组编辑工具包，设计更多样化的Cas蛋白，以应用于合成生物学和治疗领域	Cas9和Cas12蛋白	合成生物学	NA	AlphaFold结构预测、BLAST序列比对	Transformer	蛋白质序列	3,021个Cas9、597个Cas12和597个非Cas蛋白序列
520	2025-03-18	Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene 2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.01191-24 PMID:39283105	研究论文	本研究构建了一个微生物平台，用于高效生产具有强杀菌活性的植物源倍半萜5-epi-jinkoheremol	首次构建了用于可持续生产这种抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂	关键酶TPS18的催化活性限制了5-epi-jinkoheremol的进一步产量	开发一种可持续的生物杀菌剂生产方法	5-epi-jinkoheremol	合成生物学	NA	代谢工程、蛋白质工程	NA	NA	NA