合成生物学相关文章
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当前共找到 5561 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-07-12 |
Programmable saponin biosynthesis from gene networks to predictive biomanufacturing
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1800149
PMID:41971552
|
综述 | 本文综述了皂苷生物合成从通路解析到可预测与可编程生物制造的最新进展，重点介绍了基于基因网络的合成生物学工具、酶工程和AI辅助设计在多平台生产中的应用 | 将皂苷研究从传统的路径描述转向预测性和可编程生物制造，提出了结合基因调控网络、合成生物学工具和AI辅助蛋白设计的通用框架，并强调通过设计-构建-测试-学习循环实现迭代优化 | 综述性文章，未提供具体实验数据或比较不同方法的优劣，且可能未涵盖所有最新进展 | 系统梳理皂苷生物合成的最新概念和技术进展，将其作为连接基因网络、调控逻辑和工业生物制造的模型系统，为复杂植物天然产物的可预测设计和规模化生产提供参考框架 | 皂苷类植物糖苷 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 多组学分析, CRISPR, AI辅助蛋白设计 | NA | 基因组、多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成启动子, 转录因子重编程 | 工程微生物, 植物悬浮细胞, 毛状根, 不定根系统 | 代谢通路调控网络, 生物传感器 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 522 | 2026-07-12 |
Automated Genetic Engineering in the Laboratory
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5320-3_19
PMID:42423905
|
研究论文 | 描述了一种用于构建大型多样化遗传设计文库的自动化DNA组装协议 | 将实验室自动化硬件软件平台与合成生物学工具相结合，实现高通量、可重复性和组合优化，支撑生物铸造厂概念 | NA | 提高实验通量和可重复性，探索多维生物设计空间 | 自动化DNA组装协议及遗传设计文库 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | NA | NA | 自动化平台 | NA | 遗传设计文库 | 生物工程 |
| 523 | 2026-07-12 |
Advances in phage therapy for Acinetobacter baumannii: mechanisms and applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1839739
PMID:42428312
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综述 | 探讨噬菌体疗法对抗多重耐药鲍曼不动杆菌的机制与应用进展 | 系统总结了噬菌体疗法的最新机制，包括受体介导的适应性代价使耐药菌株对抗生素恢复敏感性，以及PEGylation递送、光敏剂偶联噬菌体和嵌合裂解酶等前沿工程策略 | 临床试验仍以同情使用病例为主，存在噬菌体耐药性发展和患者反应异质性等挑战 | 评估噬菌体疗法作为多重耐药鲍曼不动杆菌感染替代治疗方案的潜力 | 多重耐药鲍曼不动杆菌及其噬菌体 | 数字病理学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 524 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 525 | 2026-07-10 |
From fragmented workflows to integrated pipelines: Bridging enzymatic DNA synthesis, assembly, and MutS-based error correction
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108941
PMID:42225240
|
综述 | 本文回顾了酶促DNA合成、组装和基于MutS的纠错技术的集成方法，提出构建从片段化工作流到集成管线的基因合成流程 | 强调上游选择对下游结果的约束关系，提出基于MutS的酶促错配清除策略具有更优的纠错效率和流程兼容性，并论证酶促DNA合成与下游酶促过程的水相兼容性为构建连续自动化工作流创造了机会 | 未提供具体的实验验证或定量比较不同纠错策略的性能数据 | 探讨如何将酶促DNA合成、片段组装和MutS纠错整合为连续自动化工作流，以实现高保真、高通量和可扩展的基因与通路级DNA序列构建 | 酶促DNA合成、片段组装、基于MutS的纠错技术以及基因构建流程的集成 | 合成生物学 | NA | 酶促DNA合成、MutS酶促错配清除、基因组装 | NA | NA | NA | MutS | NA | NA | 合成生物学、生物技术 |
| 526 | 2026-07-10 |
Liquid-liquid phase separation in metabolic engineering: Mechanistic insights, emerging applications, and future challenges
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108931
PMID:42225537
|
综述 | 系统总结液-液相分离在代谢工程中的设计原理、分子决定因素和调控策略，及其在代谢通道、基因表达控制和可编程细胞功能模块构建中的应用 | 首次系统整合液-液相分离与人工智能/深度学习在代谢工程中的应用，建立序列-相行为定量关系，推动从经验设计向预测性工程框架转变 | 凝聚体老化及与宿主细胞环境的兼容性等关键挑战尚未完全解决，限制了下一代稳定可调凝聚体的开发 | 为合成生物学和代谢工程领域提供集成理论框架和前瞻性视角，促进基于液-液相分离的下一代可编程微生物细胞工厂平台开发 | 基于液-液相分离的人工凝聚体及其在代谢工程中的应用 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | 深度学习 | 序列数据 | NA | NA | 微生物细胞 | 人工凝聚体（代谢通道、基因表达调控、可编程功能模块） | 工业生物技术, 医学 |
| 527 | 2026-07-10 |
Recent advances in microbial production of S-adenosyl-L-methionine and its high-value derivatives
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108948
PMID:42288128
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综述 | 综述了利用微生物生产S-腺苷-L-甲硫氨酸及其高价值衍生物的最新进展 | 重点总结了系统代谢工程和合成生物学在提高微生物系统中SAM生物合成、利用和循环方面的策略，特别是SAM在合成阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸等代表性衍生物中的作用 | 当前挑战包括工业生产仍依赖化学合成，环境负担和可持续性问题尚未完全解决 | 推动微生物平台实现SAM及其高价值衍生物的可持续生物制造 | 微生物系统中的SAM及其衍生物（如阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸） | 数字生物学 | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物（具体种类未提及） | SAM生物合成和循环途径 | 工业生物技术 |
| 528 | 2026-07-10 |
Breaking the photosynthetic monopoly on carbohydrate production through artificial synthesis
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108952
PMID:42303061
|
综述 | 批判性审视超越光合作用限制的人工碳水化合物合成途径策略 | 提出通过人工智能驱动的催化剂设计、模块化合成生物学平台和可再生能源整合来突破光合作用局限的创新思路 | 辅因子再生效率低、催化剂选择性权衡和经济竞争力不足是当前实际应用的主要障碍 | 建立人工碳水化合物合成途径以超越光合作用的效率、空间和时间限制 | 三种人工碳水化合物合成途径：直接电化学CO₂还原、合成酶级联反应和杂合生物人工系统 | 合成生物学 | NA | 电化学还原、酶工程、生物人工系统 | NA | NA | NA | 模块化合成生物学平台 | NA | 人工碳水化合物合成途径 | 农业,能源,环境,工业生物技术 |
| 529 | 2026-07-10 |
Codon compression and novel codon creation for multiplex non-canonical amino acid incorporation
2026-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108961
PMID:42342169
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综述文章 | 系统分类了用于多重非规范氨基酸整合的两种主要策略框架：自然密码子压缩和新型密码子创建 | 首次将多重非规范氨基酸整合策略系统分为密码子压缩和新型密码子创建两大框架，并提出结合部分密码子压缩、适应性实验室进化和人工智能辅助设计的集成未来流程 | 依赖于宿主适应性、编码容量和整合效率的多重约束因素分析，但未提供具体的实验验证数据 | 推进合成生物学中多重非规范氨基酸同时整合的关键前沿技术 | 非规范氨基酸的遗传编码系统及多重整合策略 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术、全基因组重编码、非天然碱基对技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 |
| 530 | 2026-07-10 |
Scarless one-tube genome assembly via computationally optimized uracil-DNA glycosylase reactions
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00317b
PMID:42238783
|
研究论文 | 本研究提出了一种利用尿嘧啶-DNA糖基化酶的单管无疤痕基因组组装平台，用于高效构建工程噬菌体 | 无需长同源臂、限制性酶切位点、Cas系统或同源重组，通过尿嘧啶-DNA糖基化酶实现模块化基因组组装，并减少二级结构形成风险 | NA | 开发一种快速、灵活的噬菌体基因组组装和编辑方法 | T7噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶反应 | NA | NA | NA | 尿嘧啶-DNA糖基化酶 | T7噬菌体 | NanoLuc荧光素酶报告基因整合入T7基因组 | 医学、环境监测、工业生物技术 |
| 531 | 2026-07-10 |
The structural chemistry and biosynthesis of chlorophylls
2026-Jul-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00082g
PMID:42370298
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研究论文 | 综述叶绿素的结构化学与生物合成途径，涵盖从原卟啉IX到叶绿素a的七步反应及多种叶绿素和细菌叶绿素的合成机制，并利用AlphaFold 3建模预测酶结构 | 利用AlphaFold 3建模完整叶绿素生物合成酶体系，揭示亚基关联、辅因子排列及催化机制，提出底物结合与产物转移新模型，为合成生物学构建杂合途径扩展光谱范围提供见解 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 阐明叶绿素和细菌叶绿素的生物合成途径及结构化学特征，探索利用合成生物学扩展太阳光谱利用范围的潜力 | 叶绿素a、b、c、d、f以及细菌叶绿素a、b、e等 | 结构生物学 | NA | AlphaFold 3 | AlphaFold 3 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 杂合叶绿素和细菌叶绿素合成途径 | 能源、农业 |
| 532 | 2026-07-10 |
pH-Tolerant Tripeptide Coacervates as Biomimetic Catalytic Microreactors
2026-Jul-08, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.71406
PMID:42417505
|
研究论文 | 构建基于三肽的凝聚液滴作为仿生催化微反应器，具备广泛的pH和盐浓度耐受性 | 通过将芳香族残基和低聚乙二醇基团整合到最小肽序列中，设计出环境耐受性强的三肽凝聚液滴，实现高效催化和多功能应用 | 未提及具体局限性 | 开发环境稳定且功能多样的仿生催化微反应器，用于增强化学反应效率 | 三肽凝聚液滴及其在催化反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 凝聚液滴微反应器 | 合成生物学，前生物化学 |
| 533 | 2026-07-10 |
Protein Turnover in Plants - Cost of Synthesis, Repair and Crop Engineering Opportunities
2026-Jul-08, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag481
PMID:42418770
|
综述 | 本文探讨植物蛋白质周转的代价，包括合成、修复及作物工程机会 | 强调化学损伤作为蛋白质周转的重要原因，并系统分析其呼吸成本对作物产量的影响，提出利用修复机制改善作物性能的新策略 | 未详细讨论不同植物物种中蛋白质修复机制的差异，以及实际田间应用面临的挑战 | 理解蛋白质损伤的原因、能量后果及修复机制，为提高作物产量提供工程策略 | 植物中的蛋白质周转过程，包括损伤、修复和合成 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 蛋白质修复机制及代谢途径优化 | 农业 |
| 534 | 2026-07-10 |
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.05.025
PMID:42419270
|
综述 | 总结工程化活体生物治疗产品（eLBPs）在多种疾病中的应用进展 | 提出了下一代eLBPs理性设计的框架，综合了底盘选择、DNA递送、治疗表达调控和生物遏制系统的进展 | 在实现可预测定植、持久治疗活性和体内稳健生物遏制方面仍存在挑战 | 综述工程共生微生物在宿主健康中的应用，并推动eLBPs从实验系统向临床应用的转化 | 工程化活体生物治疗产品（eLBPs）及其在炎症性疾病、代谢疾病、癌症和感染性疾病中的应用 | 合成生物学 | 炎症性疾病、代谢疾病、癌症、感染性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 共生微生物 | 感知和响应宿主生理信号的微生物疗法 | 医学 |
| 535 | 2026-07-10 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 | 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力，并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 | 未提及具体局限性，可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 | 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性，以及发现策略和治疗应用前景 | 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习和深度学习 | 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 | 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 人类微生物组（肠道、口腔、皮肤、阴道） | NA | 医学、药物开发 |
| 536 | 2026-07-10 |
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70561
PMID:42415276
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综述 | 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用，探讨了从传统防腐到风味创新的转变 | 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变，通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络，以解决减盐带来的安全与风味挑战 | 未提供具体实验数据或案例验证，仅基于现有文献提出概念框架 | 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制，并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 | 发酵鱼中的微生物群落（如嗜盐菌、乳酸菌、酵母）及其代谢产物 | 食品生物技术 | NA | 多组学、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | NA | NA | 微生物代谢网络重建 | 食品工业 |
| 537 | 2026-07-10 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了甲基单胞菌DH-1菌株遗传和代谢工程生物技术方法的最新进展 | 系统总结了针对DH-1菌株的分子工具开发，包括优化转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子库和合成小调控RNA平台 | 未明确提及局限性 | 促进甲基单胞菌DH-1菌株作为甲烷利用底盘细胞的代谢工程和合成生物学研究 | 甲基单胞菌DH-1菌株 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | Cre重组酶 | 甲基单胞菌DH-1 | 可调启动子库、合成小调控RNA平台 | 工业生物技术, 环境 |
| 538 | 2026-07-10 |
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-04-03, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00700-8
PMID:41932911
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研究论文 | 提出一种名为CellTarget的凸优化算法，用于从实验通量数据中推断细胞目标 | CellTarget结合凸通量平衡分析模块和误差最小化模块，通过隐式微分实现目标系数的反向传播和联合优化，解决了哺乳动物细胞代谢模型中目标函数未知的难题 | 细胞目标存在显著的非可识别性，预测准确性更多地受网络约束而非目标特异性驱动 | 开发一种从实验通量数据中推断细胞目标的算法，提高哺乳动物细胞代谢模型的预测能力 | 中国仓鼠卵巢细胞系 | 数字病理学 | NA | 通量平衡分析 | 凸优化模型 | 通量数据 | 生产者与非生产者中国仓鼠卵巢细胞系，多个生长期 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 539 | 2026-07-10 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-03-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出一种基于人工神经网络的框架，用于在酿酒酵母中实现上下文感知的合成启动子设计，从而重编程真核转录网络 | 首次开发了可预测最优转录因子结合位点插入位置及启动子重写程度的神经网络工具，无需前期实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 | 研究仅在本模式生物酿酒酵母中验证，且依赖已知转录因子结合位点数据，通用性及跨物种应用需进一步探索 | 开发可扩展的计算方法用于人工启动子工程，实现转录网络的精确重编程 | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的天然启动子及TetR、Mig1转录因子结合位点 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络、启动子工程、转录因子结合位点重组 | ANN (人工神经网络) | DNA序列数据 | 分析6,011个天然酵母启动子，实验验证了部分设计启动子 | NA | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组电路，包含TetR和Mig1响应元件 | 生物技术 |
| 540 | 2026-07-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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综述 | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合，聚焦其在生物元件、基因线路和基因组设计中的创新应用 | 首次系统综述生成式AI在合成生物学中的前沿应用，提出从数据驱动设计到可预测、可编程生物系统的路线图 | 未深入涉及具体算法的实现细节或实验验证案例 | 评估生成式AI如何变革合成生物学的设计方法论并展望未来发展 | 合成生物学中的生物元件、基因线路和基因组 | 合成生物学 | NA | 生成式AI | NA | NA | NA | NA | NA | 基因线路、基因组 | 医药、工业生物技术 |