合成生物学相关文章
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当前共找到 4965 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-03-28 |
Protocol to develop a synthetic biology toolkit for the non-model bacterium R. palustris
2023-Jun-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102158
PMID:37104094
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研究论文 | 本文介绍了一种为非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009开发合成生物学工具包的协议 | 为非模式细菌开发合成生物学工具包，扩展了合成生物学工具在非模型生物中的应用 | 协议可能需针对其他非模型生物进行优化，具体执行细节需参考原始文献 | 开发适用于非模式细菌的合成生物学工具包，以促进其独特代谢特性的研究与应用 | 非模式细菌Rhodopseudomonas palustris CGA009 | 合成生物学 | NA | 荧光标记和RT-qPCR | NA | NA | NA | NA | Rhodopseudomonas palustris CGA009 | NA | 工业生物技术 |
| 522 | 2026-03-28 |
Design and Experimental Evaluation of a Minimal, Innocuous Watermarking Strategy to Distinguish Near-Identical DNA and RNA Sequences
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00045
PMID:32413257
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研究论文 | 本研究设计并实验验证了一种最小化、无害的水印策略，用于区分近似的DNA和RNA序列，以在合成生物学中区分合成与天然基因副本 | 开发了一种系统性的DNA水印策略，通过谨慎交换密码子实现，对酵母生理影响最小，并首次在糖利用途径的13个基因中同时应用水印，结合CRISPR/Cas技术实现选择性基因组编辑 | 研究仅针对酵母模型，水印策略对Gpm1基因有轻微影响，且未在其他生物系统中验证其普适性 | 旨在开发一种DNA水印策略，以区分合成与天然基因副本，支持合成生物学中的基因组改造 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae）中的13个糖利用途径基因，包括糖酵解和酒精发酵相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子交换、CRISPR/Cas基因组编辑、转录组分析、蛋白质表达和活性检测 | NA | DNA序列、RNA转录本、蛋白质丰度和活性数据 | 酵母菌株，涉及13个水印基因 | CRISPR-Cas9, pathway swapping strategy | Saccharomyces cerevisiae | 水印策略应用于糖利用代谢途径，通过密码子修改设计合成基因变体 | 工业生物技术 |
| 523 | 2026-03-25 |
[Biomanufacturing driven by engineered organisms (2026)]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260153
PMID:41873064
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综述 | 本文回顾了2025年合成生物学与生物制造在智能化集成、系统优化及多元化应用方面的显著进展，并展望了该领域的未来发展方向 | 人工智能从辅助工具演变为核心驱动力，推动研究范式从“经验驱动”向“数据和模型驱动”的根本转变；环境生物修复从功能菌株工程转向合成微生物群落的理性设计，标志着可预测、可控修复策略的新时代 | NA | 总结合成生物学与生物制造领域的最新进展，并展望其未来发展趋势 | 合成生物学与生物制造领域的技术、应用及发展趋势 | NA | NA | 人工智能、酶工程、蛋白质设计、细胞工厂构建、合成微生物群落设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 传统及新兴底盘宿主 | 细胞工厂、合成微生物群落、人工细胞 | 工业生物技术、环境、能源、医药 |
| 524 | 2026-03-25 |
[Recent advances in the application value and biosynthesis of chiral reticuline]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250432
PMID:41873066
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综述 | 本文系统总结了手性网状碱作为苄基异喹啉生物碱核心骨架的应用价值、合成途径及最新研究进展 | 揭示了具有(-)-立体化学偏好的研究，为合成(-)-构型苄基异喹啉生物碱提供了新途径 | (-)-网状碱的生物合成仍受关键酶立体选择性的限制，需通过酶工程和途径重构等策略解决 | 为开发下一代高效、高选择性的苄基异喹啉生物碱提供理论支持和实践指导 | 手性网状碱及其在苄基异喹啉生物碱生物合成中的应用 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 酶工程、途径重构 | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 525 | 2026-03-25 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-Mar-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
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综述 | 本文系统总结了利用合成生物学策略在微生物细胞工厂中生物合成L-酪氨酸及其衍生物（如酪醇、对香豆酸和L-多巴）的工程策略、最新进展及未来挑战 | 聚焦于近五年（2021-2025）的最新进展，以酪醇、对香豆酸和L-多巴为关键节点，系统总结了从酶、代谢到细胞水平的工程策略，并提出了加速L-酪氨酸衍生物生物制造的路线图 | NA | 加速L-酪氨酸及其衍生物的绿色、可规模化生物制造 | L-酪氨酸及其衍生物（如酪醇、对香豆酸、L-多巴） | 合成生物学 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 代谢通路工程，生物合成途径设计 | 医药, 食品, 化学工业 |
| 526 | 2026-03-25 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
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综述 | 本文综述了微生物胞外多糖作为益生元候选物和食品技术功能添加剂的双重功能，探讨了其对人类健康和食品系统的潜在应用 | 提出了“EPS-微生物群-宿主轴”概念，并系统区分了微生物群介导的效应与直接生物活性机制，同时探讨了合成生物学在定制化多糖设计中的应用潜力 | 未提供具体的实验数据或案例研究，主要基于现有文献的综合分析 | 阐明微生物胞外多糖在功能性食品成分开发中的双重作用及其应用前景 | 微生物胞外多糖 | NA | 糖尿病, 肥胖症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药 |
| 527 | 2026-03-25 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文对2004年至2024年间发表的450多项研究进行了全面分析，总结了链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用趋势、关键成功因素和技术进展 | 首次提供了该领域二十年发展历程的定量视角，系统分析了表达趋势、宿主偏好及影响因素，并整合了合成生物学工具与基因组工程在克服表达障碍中的作用 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用潜力与技术进展 | 链霉菌宿主平台及异源表达的微生物生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评议研究 | 合成生物学工具 | 链霉菌 | 生物合成基因簇表达平台 | 药物发现 |
| 528 | 2026-03-25 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统在天然产物发现与工程化中的最新进展，强调计算工具与合成生物学方法的整合 | 提出将计算建模（如同源建模、分子对接、分子动力学模拟）和深度学习策略与传统技术相结合，加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS和PKS生物合成途径，以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 529 | 2026-03-25 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
|
研究论文 | 介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台，用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了结合丝氨酸和酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台，能够高效整合大于50 kb的大片段DNA，并实现100%的正确靶向富集 | NA | 克服哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的挑战 | 人类多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、标准细胞培养技术 | NA | NA | NA | Bxb1整合酶，Cre重组酶 | 人类多能干细胞 | 基因整合平台，包含着陆垫序列和辅助DNA序列切除机制 | 医学，药物发现 |
| 530 | 2026-03-25 |
Automated workflow for genotyping individual transposon library variants
2026-Jan-12, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-025-00054-3
PMID:41869086
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研究论文 | 本文介绍了一种用于转座子插入库个体变异基因分型的自动化工作流程，利用开源OT-2液体处理器和自定义Python包实现 | 开发了模块化、标准化的自动化工作流程，结合开源液体处理器和自定义软件，提高了基因分型的可靠性和可重复性 | 工作流程的吞吐量受液体处理器平台容量限制，需通过多次运行或多台设备并行处理来扩展 | 为基因组工程和合成生物学中的高通量筛选提供自动化、可扩展的个体变异基因分型解决方案 | 转座子插入库中的个体克隆变异 | 合成生物学 | NA | 转座子插入、PCR分析、测序 | NA | 测序数据 | 46个变异体（其中40个成功鉴定） | OT-2液体处理器 | 恶臭假单胞菌KT2440 | NA | 工业生物技术 |
| 531 | 2026-03-25 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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研究论文 | 本文报道了构建完全基于蛋白质的微三维打印机器人结构的过程，这些结构由最小化肌动球蛋白皮层涂层并驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建和驱动的三维机器人结构，结合了三维打印技术和肌动球蛋白主动涂层 | 需要生物材料专业知识，完成过程耗时15天，可能限制广泛采用 | 将生物分子活动组装和放大以在人造设备中执行工作，推动合成生物学应用 | 蛋白质基三维打印机器人结构、肌动球蛋白皮层 | 合成生物学 | NA | 三维打印、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 532 | 2026-03-25 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-12-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 本文综述了细菌芳香聚酮类化合物生物合成中的氧化重排反应，重点介绍了相关氧化还原酶的催化机制及其在天然产物合成中的应用 | 系统总结了细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的酶学机制，包括Baeyer-Villiger和Favorskii型重排、酮还原酶和双加氧酶催化的创新碳骨架重排，以及CYP450或NmrA样蛋白催化的分子间二聚化 | NA | 阐明细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的化学和酶学基础，为复杂天然分子的半合成或合成生物学提供生物催化剂 | 细菌芳香聚酮类化合物的生物合成途径及其相关的氧化还原酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 533 | 2026-03-25 |
Construction of complex bacteriogenic protocells from living material assembly
2025-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01148-6
PMID:40044914
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研究论文 | 本文提出了一种通过利用原核生物作为现场组分、功能和结构构建块库来构建细菌源性原始细胞的协议 | 采用空间分离的细菌菌落捕获和处理策略，在单个凝聚微滴中生产膜结合、分子拥挤、组成、结构和功能复杂的合成细胞，并实现内源性重塑以获取多种原始细胞器 | 协议完成需约27天，且需要微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术的专业知识 | 构建具有高组织和功能复杂性的逼真合成细胞，以理解细胞过程和生命基础 | 细菌源性原始细胞 | 合成生物学 | NA | 微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术 | NA | NA | NA | NA | 原核生物（细菌） | 膜结合、分子拥挤的合成细胞，包含空间分区核样DNA/组蛋白凝聚物、膜结合水泡、F-肌动蛋白原始细胞骨架网络和原始线粒体 | 工程合成生物学, 生物医学 |
| 534 | 2026-03-25 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
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综述 | 本文综述了2014至2024年间利用合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 聚焦于针对蓝藻系统的合成生物学创新，以解决天然宿主操作困难和异源表达平台有限的障碍，促进多样化蓝藻天然产物家族的生产 | NA | 扩大蓝藻天然产物的发现和生产 | 蓝藻系统及其天然产物 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、生物信息学工具、组合生物合成、转录与翻译调控 | NA | 基因组数据 | NA | NA | Synechocystis sp. PCC 6803, Synechococcus elongatus UTEX 2973, Anabaena sp. PCC 7120 | 生物合成基因簇（BGCs）克隆、宿主工程 | 医药 |
| 535 | 2026-03-25 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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综述 | 本文综述了过去十年中通过翻译后修饰重塑核糖体合成肽骨架的酶，强调了其在合成生物学中设计功能性肽制剂的应用潜力 | 突出了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶，这些酶能超越二十种蛋白质氨基酸的限制，产生结构复杂多样的肽类，为合成生物学提供新工具 | NA | 探索核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）的翻译后修饰酶，以促进功能性肽制剂的理性设计和生产 | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）及其翻译后修饰酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 536 | 2026-03-25 |
Biocomputation: Moving Beyond Turing with Living Cellular Computers
2024-Jun, Communications of the ACM
IF:11.1Q1
DOI:10.1145/3635470
PMID:41867488
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学与理论计算机科学的协同作用，超越传统图灵计算，开发更强大的活细胞计算机 | 倡导将理论计算机科学与合成生物学结合，探索活细胞系统的完整计算潜力，包括状态计算和问题解决复杂性 | 活细胞计算机的计算极限仍在探索中，尚未完全解决状态计算和基因调控复杂性等非平凡问题 | 推动活细胞计算机的发展，超越传统图灵计算，探索生物系统的计算能力 | 活细胞系统，如经过基因工程改造的细菌 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学、环境 |
| 537 | 2026-03-25 |
Chromosome-level Alstonia scholaris genome unveils evolutionary insights into biosynthesis of monoterpenoid indole alkaloids
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109599
PMID:38646178
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研究论文 | 本研究通过组装高质量的染色体级别基因组，揭示了Alstonia scholaris中单萜吲哚生物碱生物合成的进化机制 | 首次组装了Alstonia scholaris的染色体级别基因组，并识别了与MIA生物合成相关的基因簇，包括strictosidine合成酶和色氨酸脱羧酶的共线性区域 | NA | 探究单萜吲哚生物碱的生物合成途径及其进化起源 | Alstonia scholaris植物及其基因组 | 基因组学 | 癌症 | 纳米孔测序，Hi-C数据 | NA | 基因组数据，多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 538 | 2026-03-25 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过光色控制微升尺度溶液pH值调整的系统 | 创新点在于结合两种反向定向的光驱动质子泵（细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12），实现了通过光色精确控制pH变化，并采用计算机反馈环路自动调节 | NA | 研究目的是开发一种基于合成生物学的微升尺度pH控制技术，用于研究、医疗和工业应用 | 研究对象是工程化蛋白脂质体系统及其在溶液pH调节中的应用 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵技术、计算机反馈控制 | NA | NA | NA | 蛋白脂质体工程 | NA | 基于细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12的反向质子泵合成生物电路，实现光色控制的pH调节 | 医学, 工业生物技术 |
| 539 | 2026-03-25 |
Machine learning predicts new anti-CRISPR proteins
2020-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa219
PMID:32286628
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的工具AcRanker，用于从蛋白质序列中直接预测新的抗CRISPR蛋白 | 首次提出基于XGBoost排序的机器学习方法，仅使用蛋白质序列信息即可预测抗CRISPR蛋白，成功发现两个新型抗CRISPR蛋白AcrIIA20和AcrIIA21 | 预测的候选抗CRISPR蛋白仍需实验验证其抑制活性，且模型性能受训练数据集限制 | 开发快速发现新型抗CRISPR蛋白的生物信息学工具 | 细菌前噬菌体区域中的潜在抗CRISPR蛋白 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列分析，XGBoost机器学习 | XGBoost | 蛋白质序列数据 | 已知抗CRISPR蛋白训练集，从自靶向细菌基因组预测的前噬菌体区域筛选 | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学，农业，合成生物学 |
| 540 | 2026-03-25 |
A GoldenBraid cloning system for synthetic biology in social amoebae
2020-05-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa185
PMID:32232356
|
研究论文 | 本文介绍了GoldenBraid克隆系统在盘基网柄菌合成生物学中的应用，包括一个包含250个DNA部件和组件的库，以及一个概念验证菌株 | 首次将GoldenBraid克隆系统应用于盘基网柄菌，提供了一个模块化的合成生物学框架，并开发了一个包含250个DNA部件的库 | NA | 开发一个用于盘基网柄菌的快速、模块化和稳健的克隆系统，以促进合成生物学研究 | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | 合成生物学 | NA | GoldenBraid克隆系统 | NA | NA | NA | GoldenBraid | 盘基网柄菌（Dictyostelium amoebae） | cAMP趋化性概念验证菌株，包含四个荧光报告基因编码于一个质粒 | 医学 |