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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-05 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌Kay病毒进行结构修饰,实现成像和生物传感应用 | 首次报道葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,开发了双菌株编辑策略结合CRISPR-Cas10反选系统 | 仅针对812h1噬菌体进行验证,未测试其他噬菌体系统的适用性 | 开发噬菌体结构蛋白工程化方法并验证其生物应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1及其尾部鞘蛋白 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、同源重组、荧光显微镜、生物层干涉术、ELISA、流式细胞术 | NA | 图像数据、生物传感数据 | NA | CRISPR-Cas10 | 葡萄球菌噬菌体 | 在尾部鞘蛋白暴露环中插入多组氨酸标签 | 医学,纳米技术,合成生物学 |
| 522 | 2025-10-05 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 本研究通过优化FapR/FapO生物传感器,开发了一种用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性的重构无细胞系统 | 通过工程化T7启动子与FapO操纵子间的间隔序列,开发了具有宽检测范围(50-1500 μM)的无细胞丙二酰辅酶A生物传感器系统,最大动态范围达到95.3倍 | NA | 开发高灵敏度的丙二酰辅酶A生物传感器用于ACC的高通量筛选和定向进化 | FapR/FapO生物传感器系统和乙酰辅酶A羧化酶(ACC) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统,定向进化,高通量筛选 | NA | 荧光信号数据 | NA | 启动子工程,同源筛选 | NA | FapR/FapO生物传感器系统,可将丙二酰辅酶A浓度转换为荧光信号 | 工业生物技术,医药 |
| 523 | 2025-10-05 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 本研究利用自主生物发光技术优化了三种双生病毒载体在植物合成生物学中的应用 | 首次使用自主生物发光作为实时报告系统来表征双生病毒载体的基因表达特性 | BCTV载体表现出较差的表达控制水平 | 优化双生病毒载体作为植物生物技术工具 | 菜豆黄矮病毒(BeYDV)、番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 生物发光信号数据 | 三种双生病毒复制子系统 | Gibson Assembly | 植物 | 合成复制子、多基因表达系统 | 农业,工业生物技术 |
| 524 | 2025-10-05 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
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研究论文 | 本研究通过工程化细胞分裂素调节因子实现对植物根系发育的精确调控 | 利用工程化B型响应调节因子调控细胞分裂素依赖性生长发育过程,通过组织特异性启动子实现可预测的表型调控 | 未提及具体局限性 | 开发精确控制植物发育表型的合成生物学工具 | 植物根系发育,特别是侧根数量的调控 | 合成生物学 | NA | 基因工程,组织特异性表达 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 植物 | 工程化转录因子调控网络,组织特异性表达系统 | 农业 |
| 525 | 2025-10-05 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
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研究论文 | 开发了结合预印本分析和实验实践的主动学习工作流程,以改善合成生物学教学体验 | 使用预印本作为教育资源让学生批判性分析手稿与最终发表作品的差异,并设计基于CRISPRi基因电路的实践实验环节 | NA | 改进合成生物学的教学方法,提升学生的学习体验和技能 | 大学生 | 合成生物学教育 | NA | CRISPRi | NA | 教育反馈数据 | 学生群体(具体数量未明确说明) | CRISPRi | NA | 基于CRISPRi的基因电路 | 教育 |
| 526 | 2025-10-05 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 开发用于蛋白质结构预测和设计工具的容器化解决方案,以解决高计算需求和部署难题 | 开发了针对多种计算架构优化的容器化解决方案,并创建了OmniFold包装平台实现多工具并行运行和自动质量报告生成 | 未提及具体性能提升的量化数据或与其他部署方法的直接比较 | 解决蛋白质结构预测和设计工具的高计算需求和部署困难问题 | AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion等蛋白质结构预测和设计工具 | 计算生物学 | NA | 容器化技术、GPU优化计算 | 深度学习模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、疾病治疗 |
| 527 | 2025-10-05 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
|
综述 | 本文回顾了MultiBac技术的发展历程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | 引入相对较新的MultiBac技术,整合合成生物学方法增强多功能性 | 存在某些缺陷,研究人员需根据具体需求考虑其局限性 | 为基础研究人员提供新的蛋白表达方法 | MultiBac技术及其在重组蛋白生产和复杂蛋白复合物研究中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac技术 | NA | NA | NA | MultiBac | 昆虫细胞 | NA | 制药, 生物技术 |
| 528 | 2025-10-05 |
Peptide Coacervates Can Protect Sequestered Oligonucleotides from Nucleases and Release Them for Transcription and Translation
2025-Sep-08, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c00600
PMID:40802871
|
研究论文 | 本文证明肽凝聚层可通过液-液相分离形成无膜细胞器,有效隔离并保护短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因免受多种核酸酶降解 | 发现基于聚组氨酸肽与ATP静电相互作用的关联性凝聚层能高效保护寡核苷酸,并可通过离子强度或温度变化实现可控释放 | 基于黏附-间隔模型肽的简单凝聚层保护效果有限 | 开发能够保护和可控释放功能性遗传物质的生物相容性递送系统 | 短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 529 | 2025-10-05 |
Expanding Immunotherapy Beyond CAR T Cells: Engineering Diverse Immune Cells to Target Solid Tumors
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172917
PMID:40941014
|
综述 | 本文综述了除CAR-T细胞外多种工程化免疫细胞在实体瘤治疗中的最新进展 | 探讨γδ T细胞、iNKT细胞、病毒特异性T细胞、NK细胞及髓系效应细胞等作为CAR平台替代方案的独特优势 | NA | 扩展细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的应用范围 | 工程化免疫细胞(γδ T细胞、iNKT细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞等) | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CAR工程技术 | 人类免疫细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计 | 医学 |
| 530 | 2025-10-05 |
One-pot cloning and protein expression platform for genetic engineering
2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.28.672974
PMID:40909620
|
研究论文 | 开发了一种集成突变、质粒组装和功能蛋白测试的一锅法克隆与蛋白表达平台 | 将Golden Gate克隆与无细胞转录翻译系统结合,实现无需中间纯化或细菌扩增的遗传变异高效生成与筛选 | NA | 建立高通量克隆和蛋白质工程的通用自动化方法 | 荧光蛋白、荧光素酶、抗生素转化酶和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术 |
| 531 | 2025-10-05 |
Molecular Mechanisms of Herbicide Resistance in Rapeseed: Current Status and Future Prospects for Resistant Germplasm Development
2025-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178292
PMID:40943213
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综述 | 系统总结油菜除草剂抗性分子机制及抗性种质开发策略 | 首次系统整合非靶标抗性机制、多组学与AI技术在抗除草剂油菜育种中的应用潜力 | NA | 为抗除草剂油菜的可持续发展提供安全有效的创新方法指导 | 油菜及其除草剂抗性机制 | 农业生物技术 | NA | 基因编辑、合成生物学、定向蛋白进化、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 油菜 | NA | 农业 |
| 532 | 2025-10-05 |
Unlocking Casein Bioactivity: Lactic Acid Bacteria and Molecular Strategies for Peptide Release
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178119
PMID:40943047
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综述 | 本文综述了利用乳酸菌和分子生物学策略释放牛β-酪蛋白中生物活性肽的方法 | 系统整合合成生物学、分子生物技术和系统生物学方法增强β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现与生产 | NA | 提高β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现和生产效率 | 牛β-酪蛋白中的生物活性肽 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统、多组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | 诱导型表达平台、无细胞系统 | 食品, 医药 |
| 533 | 2025-10-05 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 开发了一种能够检测和治疗肠道炎症的微生物生物传感器 | 首次开发了针对临床验证生物标志物钙卫蛋白的合成生物传感器,兼具诊断记录和治疗功能 | NA | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物系统 | 肠道炎症生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症疾病 | 合成生物学技术 | NA | 生物分子数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 锌摄取调节因子(Zur)控制启动子与记忆电路耦合的生物传感器,结合抗炎细胞因子IL10产生系统 | 医学 |
| 534 | 2025-10-05 |
A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM
2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.17678
PMID:39552172
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研究论文 | 本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全和生物安保风险进行定量分析 | 将传统定性风险分析扩展为定量评估,构建了针对iGEM项目的攻击树模型 | 主要针对中低风险场景,且参与者经验相对不足可能影响评估准确性 | 评估合成生物学项目中的生物安全和生物安保风险 | 2022年iGEM竞赛项目 | 合成生物学 | NA | 攻击树分析 | 攻击树模型 | 项目风险评估数据 | 2022年iGEM项目 | iGEM | NA | NA | 生物安全 |
| 535 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2025-Sep-12, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法异源表达和纯化肠球菌素A,开发了一种生产抗菌肽的有效策略 | 首次从头设计合成完整的肠球菌素A基因盒,建立从包涵体高效回收活性抗菌肽的优化工艺 | 表达产物主要形成包涵体,需要复杂的变复性过程 | 开发替代抗生素的新型抗菌策略 | 肠球菌素A及其对多重耐药病原菌的抗菌活性 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因合成,PCR,DNA测序,Ni-NTA亲和层析 | NA | NA | 5种病原菌:金黄色葡萄球菌ATCC 25923、铜绿假单胞菌ATCC 27853、鲁氏不动杆菌GPE 3002、藤黄微球菌GPE 3001、蜡样芽孢杆菌GPE 3003 | Gibson Assembly | 大肠杆菌BL21(DE3) | 包含功能调控元件和N端His标签的肠球菌素A基因盒 | 医药,食品 |
| 536 | 2025-10-05 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2025-Sep-12, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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研究论文 | 本文综述了在本氏烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略 | 开发了响应化学和电磁信号的新型传感器系统、与可编程转录因子整合的合成启动子、基于重组酶的处理器以及病毒衍生复制子 | 存在转基因沉默、产量低和代谢毒性等限制可扩展性的挑战 | 实现本氏烟草中转基因的精确表达控制和代谢途径优化 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、病毒衍生复制子、重组酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成基因电路、传感器系统、合成启动子、逻辑门、生物传感器 | 农业,工业生物技术,环境 |
| 537 | 2025-10-05 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸菌中醌类前体DHNA生物合成的双相调控机制及其与底物限制的协同作用 | 发现MenF和MenD酶通过可逆通量和变构反馈抑制形成双相调控模式,并首次阐明底物可用性对DHNA过量生产的限制作用 | 研究聚焦于乳酸菌中的DHNA调控机制,在其他微生物中的普适性仍需验证 | 阐明微生物调控醌类水平的分子机制,为代谢工程改造微生物生产醌类提供理论基础 | 乳酸菌中醌类前体1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的生物合成调控机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学模型 | 数学模型 | 酶活性数据、代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 乳酸菌 | 醌类生物合成途径调控网络 | 工业生物技术 |
| 538 | 2025-10-05 |
Advancing biomaterial innovation for tissue engineering through microbial synthetic biology: A review
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146771
PMID:40803465
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综述 | 本文综述了微生物合成生物学在组织工程生物材料创新中的应用与前景 | 系统阐述了利用工程化微生物生产生物材料的新策略及其在组织工程中的创新应用 | 面临技术挑战,具体限制未详细说明 | 探讨微生物合成生物学在组织工程生物材料开发中的应用 | 工程化微生物及其生产的生物材料 | 合成生物学 | NA | 微生物基因组改造、代谢调控 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物宿主 | 代谢途径工程 | 医学 |
| 539 | 2025-10-05 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
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综述 | 本文综述了高通量和基因组规模动力学建模的最新进展与未来发展方向 | 整合机器学习与机制性代谢模型、开发新型动力学参数数据库、使用定制化参数化策略 | NA | 推动动力学建模在系统和合成生物学、代谢工程及医学研究中的应用 | 动力学建模方法 | 机器学习 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机制性代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 540 | 2025-10-05 |
Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01512-w
PMID:39259478
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研究论文 | 通过启动子捕获方法从南极微生物群落中鉴定出在多种假单胞菌门细菌中具有功能的广宿主范围启动子序列 | 首次从南极微生物群落中发现能在多种假单胞菌门细菌中工作的广宿主范围启动子序列 | 仅构建了约2000个克隆的文库,样本规模相对有限 | 扩展合成生物学可用生物元件的目录 | 南极微生物群落中的启动子序列 | 合成生物学 | NA | 启动子捕获方法 | NA | 基因序列数据 | 约2000个克隆,从中鉴定出13个功能启动子序列 | 启动子捕获 | Pseudomonas putida KT2440, Escherichia coli DH5α, Cupriavidus taiwanensis R1, Paraburkholderia phymatum STM 815, Ensifer meliloti 1021, Pseudomonas sp. UYIF39 | 启动子元件 | 工业生物技术 |