合成生物学相关文章
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当前共找到 4035 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-05 |
Modular multi-enzyme cascades enable green and sustainable synthesis of non-canonical amino acids from glycerol
2025-Aug-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63341-1
PMID:40883312
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研究论文 | 开发模块化多酶级联平台，利用甘油可持续合成非经典氨基酸 | 通过定向进化OPSS酶将C-N键形成催化效率提升5.6倍，建立可扩展至2升反应系统的模块化平台 | NA | 开发绿色可持续的非经典氨基酸合成方法 | 非经典氨基酸（含C-S、C-Se和C-N侧链） | 合成生物学 | NA | 定向进化、多酶级联催化 | NA | NA | 22种非经典氨基酸，克至十克级规模 | NA | NA | 模块化多酶级联系统 | 医药, 合成生物学, 生物材料 |
| 522 | 2025-10-05 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
|
综述 | 本文综述了利用代谢模型研究植物-微生物相互作用的最新进展 | 系统整合基因组尺度代谢模型应用于植物-微生物互作研究，并探索合成微生物群落的计算机设计 | NA | 通过代谢网络建模理解植物-微生物相互作用的机制 | 植物宿主及其相关微生物组成的全生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型数据 | NA | NA | 植物、微生物 | NA | 农业 |
| 523 | 2025-10-05 |
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 提出通过微生物组工程构建合成微生物群落以增强农业气候韧性的综合框架 | 提出可编程全息生物体概念，整合微生物生态学、合成生物学和计算建模构建具有动态反馈和生态记忆的植物-微生物共生系统 | NA | 开发气候韧性农业的工程化微生物组解决方案 | 植物全息生物体（植物宿主及其微生物组） | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物、微生物 | 生物传感器电路、群体感应模块、可编程微生物功能 | 农业 |
| 524 | 2025-10-05 |
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1655730
PMID:40963622
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综述 | 本文综述了先天淋巴样细胞(ILCs)在免疫调节和疾病中的作用，并探讨了其作为生物标志物和免疫治疗新策略的潜力 | 系统阐述了ILCs作为新型免疫治疗蓝图的转化潜力，包括CAR-ILC工程、细胞扩增技术和多组学方法的应用 | ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床应用的障碍 | 探讨ILCs在自身免疫疾病和癌症中作为预测、诊断和治疗靶点的作用 | 先天淋巴样细胞(ILCs)及其亚群(ILC1s、ILC2s、ILC3s、LTi细胞) | 免疫学 | 自身免疫疾病,癌症 | 多组学技术、单细胞图谱、合成生物学方法 | NA | NA | NA | CAR工程 | 脐带血、多能干细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)工程 | 医学 |
| 525 | 2025-10-05 |
Revolutionizing structural biology: AI-driven protein structure prediction from AlphaFold to next-generation innovations
2025, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.04.002
PMID:40973394
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综述 | 本文回顾了蛋白质结构预测技术的发展历程，重点分析了AlphaFold的创新贡献及其对结构生物学领域的革命性影响 | 系统梳理了从传统方法到以AlphaFold为代表的AI驱动蛋白质结构预测技术的演进，并展望了下一代AI和量子计算在结构生物学中的应用前景 | 现有方法在蛋白质复合物预测、动态构象变化模拟等方面仍存在局限 | 探讨人工智能在蛋白质结构预测领域的发展历程、现状和未来方向 | 蛋白质结构预测技术及其应用 | 结构生物学 | NA | AI驱动预测、同源建模、穿线法、从头预测 | AlphaFold、RoseTTAFold、OmegaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 526 | 2025-10-05 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
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综述 | 本文回顾疫苗学发展历程并展望未来技术变革，重点介绍mRNA疫苗等突破性技术对疫苗领域的革新作用 | 系统梳理疫苗学关键技术演进，强调反向疫苗学、合成生物学和mRNA平台等革命性技术如何将失败转化为成功疫苗 | 未涉及具体实验数据或临床研究，主要基于历史视角和技术展望 | 探讨疫苗学技术发展历程及未来变革方向 | 疫苗技术发展历程及免疫机制研究 | 疫苗学 | 传染病（脑膜炎B型、呼吸道合胞病毒等） | 反向疫苗学、合成生物学、结构设计、mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 527 | 2025-10-05 |
Integrating kinetic models, gene circuits, and biofilm dynamics for enhanced exopolysaccharide production in nitrifying bacterial consortia
2025-Oct, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107237
PMID:40850333
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研究论文 | 本研究通过动力学模型和合成生物学方法优化硝化细菌群落胞外多糖生产和氮去除性能 | 整合动力学模型与基因电路设计来优化细菌群落的胞外多糖生产和氮去除效率 | NA | 优化硝化细菌群落的胞外多糖生产和氮去除性能 | 从生活废水中富集的细菌群落 | 合成生物学 | NA | 动力学模型, 基因电路设计, 扫描电子显微镜, PCR | Monod模型, Verhulst模型 | 生物量浓度, 多糖产量, 氮浓度数据, 显微镜图像 | 生活废水中富集的细菌群落 | 基因电路设计 | 硝化细菌群落 | BUFFER门逻辑基因电路用于控制琥珀聚糖生产 | 环境, 废水处理 |
| 528 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 本研究利用基因工程细菌构建了能够将3位二进制码转换为3位格雷码的单层人工神经网络 | 首次在基因工程细菌中实现人工神经网络架构，完成二进制码到格雷码的转换功能 | 仅实现3位码转换，系统复杂度有限，处于技术发展初期阶段 | 开发基于基因工程细胞的神经形态计算系统 | 基因工程细菌群体构建的人工神经网络 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | 人工神经网络(ANN) | 化学信号输入，荧光蛋白输出 | 五个工程化细菌群体 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 细菌 | 单层人工神经网络架构，逻辑转换电路 | 生物计算机技术 |
| 529 | 2025-10-05 |
CELLM: Bridging Natural Language Processing and Synthetic Genetic Circuit Design with AI
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00391
PMID:40905372
|
研究论文 | 本研究开发了一个结合Cello软件与大语言模型的集成系统，能够通过自然语言指令创建、分析和优化遗传电路 | 首个将语言模型与合成生物学设计工具Cello集成的系统，实现了自然语言到功能性生物设计的转化 | NA | 通过AI技术降低遗传电路设计的复杂性，提高合成生物学的可及性和效率 | 遗传电路设计系统 | 自然语言处理, 合成生物学 | NA | 自然语言处理, 遗传电路设计 | 大语言模型(DeepSeek-R1, Phi-4) | 文本 | NA | Cello v2.1 | NA | 遗传电路设计与优化 | 合成生物学, 生物技术 |
| 530 | 2025-10-05 |
Intelligent Design of Escherichia coli Terminators by Coupling Prediction and Generation Models
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00429
PMID:40905909
|
研究论文 | 本研究通过结合预测模型和生成模型实现了大肠杆菌终止子的智能设计 | 首次将序列特征与热力学特征结合构建终止子强度预测模型，并应用生成对抗网络(GAN)生成可靠的终止子序列 | 预测模型性能仍有提升空间(R²=0.72)，实验验证样本量较小(18个终止子) | 开发计算工具准确预测和设计终止子序列，提高基因电路设计的精确度 | 大肠杆菌内在终止子 | 合成生物学 | NA | 机器学习，生成对抗网络(GAN) | GAN，机器学习模型 | DNA序列数据 | 18个实验验证的终止子 | NA | 大肠杆菌 | 基因电路中的终止子元件设计 | 工业生物技术 |
| 531 | 2025-10-05 |
Genome-Wide Simplification of the AcMNPV Genome Using Synthetic Biology
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00156
PMID:40910264
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法对AcMNPV病毒基因组进行系统性简化，获得了能够产生芽生病毒的简化功能基因组 | 开发了通过共转染线性化基因组片段快速拯救病毒的策略，加速了基因组删除的迭代评估，获得了删除28kb非必需基因的最小功能基因组 | NA | 实现杆状病毒基因组的大规模简化，为开发高容量杆状病毒载体奠定基础 | 苜蓿银纹夜蛾多核多角体病毒(AcMNPV)基因组 | 合成生物学 | NA | 合成生物学设计-构建-测试-学习框架，基因组简化策略 | NA | 基因组数据 | 合成了35个不同大小的简化基因组 | Gibson Assembly | 昆虫细胞 | 基因组简化设计，删除非必需基因区域 | 工业生物技术 |
| 532 | 2025-10-05 |
Engineering Noncanonical Cofactors To Expand Cellular Functions
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00473
PMID:40923492
|
综述 | 探讨利用非经典辅因子扩展细胞功能的方法与前景 | 提出通过非经典辅因子隔离代谢途径的创新策略，突破传统共因子共享的热力学限制 | NA | 研究非经典辅因子在合成生物学中的应用潜力 | 非经典辅因子及其依赖酶 | 合成生物学 | NA | 异源酶反应、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 隔离代谢途径、非经典辅因子依赖型生物传感器 | 工业生物技术、医药 |
| 533 | 2025-10-05 |
Engineering of a Complex of the DNase Domain of Colicin E9 with the Immunity Protein Im9 Activated by the Protease pS273R of African Swine Fever Virus
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00398
PMID:40925015
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研究论文 | 设计了一种由非洲猪瘟病毒蛋白酶激活的DNase E9/Im9-1.4复合物蛋白开关 | 开发了首个通过ASFV蛋白酶特异性激活的DNA酶杀伤开关系统 | 目前仅完成体外验证，尚未进行体内动物实验 | 开发针对非洲猪瘟病毒的新型抗病毒策略 | 非洲猪瘟病毒蛋白酶pS273R及其底物复合物 | 合成生物学 | 非洲猪瘟 | 蛋白质工程、蛋白酶切分析、体外酶活检测 | NA | 蛋白质活性数据 | 多个Im9变体构建及优化 | 蛋白质工程 | NA | 病毒蛋白酶激活的DNA酶杀伤开关 | 医学,农业 |
| 534 | 2025-10-05 |
Innovations in Yeast Synthetic Biology: Engineered Discovery Systems for Immunotherapy
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00321
PMID:40802971
|
综述 | 本文综述酵母合成生物学平台在免疫治疗蛋白发现中的创新应用 | 整合高通量表面展示技术、自动化进化系统和计算设计策略，建立新型设计-构建-测试-学习工作流程 | NA | 探讨酵母合成生物学平台在免疫治疗蛋白发现中的应用 | 酵母表面展示的蛋白质（如纳米抗体）和免疫受体（如GPCRs、TCRs）的潜在抗原 | 合成生物学 | NA | 高通量表面展示技术、自动化进化系统、计算设计策略 | NA | NA | NA | OrthoRep | 酵母 | 蛋白质表面展示系统、免疫受体筛选平台 | 医药 |
| 535 | 2025-10-05 |
Unraveling the Constrained Cell Growth in Engineered Living Materials
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00378
PMID:40808544
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研究论文 | 本研究探讨了工程活性材料中空间限制对蓝藻细胞生长和功能的动态影响 | 揭示了封装细胞在受限空间中异常高活性氧水平和受损光合作用的新现象，阐明了细胞生长与空间限制的动态相互作用 | 主要关注蓝藻类工程活性材料，其他微生物系统的普适性有待验证 | 探究空间限制对工程活性材料中细胞行为的影响机制 | 封装在工程活性材料中的工程改造蓝藻 | 合成生物学 | NA | 细胞封装技术、光合作用分析、活性氧检测 | NA | 生长动态数据、生理指标数据、形态观察数据 | NA | 合成生物学工具 | 蓝藻 | 定制化产物合成途径 | 材料科学, 工业生物技术 |
| 536 | 2025-10-05 |
Multiplexed Genome Editing and Transcriptional Knockdown in Yarrowia lipolytica by CRISPR-Cpf1 and an Orthogonal T7 System
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00104
PMID:40810600
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研究论文 | 本研究开发了一种结合CRISPR-Cpf1和正交T7系统的工具包，用于解脂耶氏酵母的多重基因组编辑和转录敲低 | 首次在解脂耶氏酵母中结合CRISPR-AsCpf1与正交T7系统，实现高达四基因的多重编辑和高效转录敲低 | 同源定向重组效率仅观察到轻微改善，工具在解脂耶氏酵母中的应用仍不如面包酵母成熟 | 开发解脂耶氏酵母的高效基因工程工具 | 解脂耶氏酵母的基因组编辑和转录调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cpf1, T7转录系统, 同源定向重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, T7系统 | 解脂耶氏酵母 | 多重基因组编辑系统, 转录敲低系统 | 工业生物技术 |
| 537 | 2025-10-05 |
Bioengineering of Probiotic Yeast Saccharomyces boulardii for Advanced Biotherapeutics
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00236
PMID:40811432
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综述 | 本文综述了布拉酵母菌在基因修饰、代谢工程和合成生物学策略方面的最新进展，重点介绍其作为工程化活体生物治疗平台的潜力 | 首次系统整合了布拉酵母菌在基因改造、代谢工程和合成生物学领域的治疗应用进展，区别于以往侧重临床应用和安全性的综述 | NA | 探讨布拉酵母菌作为工程化活体生物治疗平台和微生物组疗法的发展前景 | 布拉酵母菌（Saccharomyces boulardii） | 合成生物学 | NA | 基因修饰、代谢工程、合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 布拉酵母菌（Saccharomyces boulardii） | 疾病响应型生物传感器、生物防护菌株设计 | 医学, 食品生物技术 |
| 538 | 2025-10-05 |
Recent Advances in the Biological Synthesis of l-Tyrosine Derivatives by Genetically Engineered Microbes
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00475
PMID:40833382
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综述 | 本文总结了基因工程微生物生物合成l-酪氨酸衍生物的最新研究进展 | 系统归纳了通过合成生物学策略克服传统生产方法局限性的微生物发酵合成途径 | NA | 提高l-酪氨酸衍生物的微生物合成效率 | 酪醇、左旋多巴、对香豆酸及相关l-酪氨酸衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶修饰、菌种选育 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物 | 代谢通路工程 | 食品,化妆品,制药 |
| 539 | 2025-10-05 |
Progress in the Synthesis of Sterols and Related Natural Products by Manipulating the Ergosterol Biosynthetic Pathway in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00438
PMID:40859817
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综述 | 本文系统评述了通过代谢工程改造酿酒酵母麦角固醇合成途径生产甾醇及相关天然产物的研究进展 | 通过整合异源途径和系统增强代谢通量，实现了多种高价值甾体化合物的从头合成 | NA | 探讨利用酿酒酵母作为微生物底盘合成甾醇及相关天然产物的代谢工程策略 | 酿酒酵母的麦角固醇生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 麦角固醇生物合成途径 | 农业, 制药工业 |
| 540 | 2025-10-05 |
Microbial therapeutics for cancer: emerging strategies and biomedical applications
2025-Sep-18, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc03618f
PMID:40891348
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综述 | 系统阐述工程化微生物在癌症治疗中的设计策略、功能优化及生物医学应用 | 整合合成生物学与纳米技术实现微生物的精准药物递送和时空调控功能 | 临床转化面临挑战，需要跨学科整合 | 开发基于工程微生物的下一代癌症治疗方法 | 工程化微生物及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、表面修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 药物释放系统、免疫调节回路 | 医学 |