合成生物学相关文章
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当前共找到 5211 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-05-26 |
Gut-engineered Bacillus subtilis-mediated BAMBI delivery for the treatment of thioacetamide-induced liver fibrosis through mechanotransduction inhibition
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1817519
PMID:42183058
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研究论文 | 利用肠道工程化枯草芽孢杆菌递送BAMBI蛋白治疗硫代乙酰胺诱导的肝纤维化 | 首次采用遗传工程枯草芽孢杆菌通过肠-肝轴持续递送BAMBI蛋白，同时抑制生化信号和机械传导，创新性地将合成生物学与机械生物学相结合治疗肝纤维化 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证；需评估长期口服活菌的安全性和潜在副作用 | 开发一种基于工程微生物的肝纤维化治疗方法，通过抑制机械传导来逆转肝纤维化 | 经硫代乙酰胺诱导肝纤维化的小鼠模型 | 合成生物学 | 肝纤维化 | 遗传工程、口服给药、组织分析、血清标志物检测 | NA | 实验数据（组织学评分、血清生化指标、蛋白表达数据） | 小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 构建持续分泌BAMBI蛋白的基因电路 | 医学 |
| 522 | 2026-05-26 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-10-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 利用微生物平台高效生产植物源抗真菌倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建高效微生物细胞工厂可持续生产该抗真菌倍半萜，通过蛋白质工程优化关键酶TPS18提升催化活性和稳定性 | 研究未评估大规模发酵的经济可行性和实际农业应用效果 | 构建微生物平台实现植物源抗真菌倍半萜的高水平生产 | 5-epi-jinkoheremol及其合成酶TPS18 | 合成生物学 | 作物真菌病害 | 代谢工程，蛋白质工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸和甾醇生物合成途径优化，转录因子Hac1和mA写入因子Ime4代谢工程策略 | 农业 |
| 523 | 2026-05-26 |
Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo
2024-04, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600
PMID:38548126
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综述 | 综述基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在模拟人类神经疾病中的应用 | 利用光遗传学和化学遗传学等合成生物学方法，在细胞层面精准诱导病理状态，模拟多种人类神经疾病，提供传统模型无法实现的新机遇 | 未明确说明具体局限性 | 总结基于光遗传学和化学遗传学的神经疾病动物模型及其未来发展方向 | 光遗传学和化学遗传学动物模型 | NA | 神经疾病, 阿尔茨海默病, 帕金森病, 肌萎缩侧索硬化, 癫痫, 共济失调 | 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学, 化学遗传学 | 动物（未指定具体物种） | 光遗传和化学遗传调控通路 | 医学 |
| 524 | 2026-05-26 |
Design and assembly of the 117-kb Phaeodactylum tricornutum chloroplast genome
2024-03-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad670
PMID:38114089
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研究论文 | 展示两种方法克隆三角褐指藻117-kb叶绿体基因组，并通过酵母组装实现高效克隆和工程改造 | 首次实现了高效克隆117-kb藻类叶绿体基因组，并设计了可线性化和整合表达盒的SapI位点，为叶绿体合成生物学底盘开发提供了新方法 | 该方法可能仅适用于类似基因组大小和结构的物种（如假微型海链藻），且尚未验证在藻类叶绿体中的实际递送和表达效果 | 开发高效克隆和工程改造叶绿体基因组的技术，拓展光合真核生物的合成生物学底盘 | 三角褐指藻的叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | 酵母组装, 金门克隆, PCR扩增 | NA | DNA序列 | 10个酵母菌落 | 酵母组装, 金门克隆 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术, 农业 |
| 525 | 2026-05-25 |
Bacillus-derived antimicrobial peptides as alternatives to antibiotics in poultry: mechanisms, applications, and future prospects- a review
2026-May-23, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04941-3
PMID:42176025
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综述 | 综述了芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的机制、应用及未来前景 | 系统总结了芽孢杆菌源抗菌肽（包括核糖体合成细菌素和非核糖体合成脂肽）的结构多样性、多机制作用（膜靶向、生物膜调节、免疫调节及霉菌毒素相关肠道保护）以及其在替代抗生素中的潜力与挑战 | 抗菌肽活性受肽类、配方、微生物生态和宿主生理因素影响，可能存在适应性或基因编码耐药性，且面临肽不稳定性、体内疗效差异、菌株特异性差异、安全性问题及缺乏标准化比较模型等转化挑战 | 评估芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的可行性，并探讨其作用机制、应用限制及未来发展方向 | 家禽病原菌及芽孢杆菌源抗菌肽 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品 |
| 526 | 2026-05-25 |
Bacterial 3D genome architecture: organization, regulation, and synthetic biology applications
2026-May-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04117-8
PMID:42177580
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综述 | 综述细菌三维基因组结构的组织、调控机制及其在合成生物学中的应用 | 整合染色体构象捕获与成像研究的见解，突出基因组架构对环境信号的动态响应，并探讨三维基因组学在合成生物学中的潜在应用 | 细菌基因组架构及其调控的详细原则尚未完全阐明 | 理解细菌三维基因组的结构组织、调控因素以及在合成生物学中的应用前景 | 细菌三维基因组架构及其调控因子 | NA | NA | 染色体构象捕获, 成像 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学, 医学 |
| 527 | 2026-05-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-04-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中利用Cre-lox系统实现可调低速率基因组重组的方法，应用于厌氧环境生物传感和合成生物学 | 开发了严格调控、可滴定的Cre重组酶系统，实现了低重组率和最小基础活性，并展示了其在厌氧砷检测中的实用性 | 论文未明确说明系统的长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发可用于环境生物传感和合成生物学的可调低速率基因组重组工具 | 大肠杆菌及基于重组的砷生物传感器 | 合成生物学 | NA | Cre-lox位点特异性重组 | NA | NA | 未明确样本数量 | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的砷响应生物传感器电路 | 环境监测, 合成生物学 |
| 528 | 2026-05-25 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
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综述 | 本文综述了生物膜工程与合成生物学交叉领域的最新进展，重点介绍了调控生物膜行为以用于生物技术应用和解决相关挑战的策略 | 整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物联合体设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等多种策略，实现了对生物膜结构、组成和代谢输出的精确调控 | 存在生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探讨合成生物学工具在生物膜工程中的应用，以优化生物膜在废水处理、生物修复、生物能源和诊断等领域的性能，并控制致病性生物膜 | 生物膜及其工程化系统 | 机器学习 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 遗传电路 | 环境, 能源, 医学 |
| 529 | 2026-05-25 |
Predicting lasso peptide structure with LassoPred
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.037
PMID:42177065
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研究论文 | 提出LassoPred，一个基于机器学习的模块化计算流程，用于从序列预测套索肽的三维结构 | LassoPred通过整合ESM2嵌入训练的支持向量机分类器注释关键拓扑特征（异肽环和塞子残基），并采用拓扑感知的结构构建器组装和优化原子模型，实现了近实验精度，同时将预测时间缩短至分钟级，并将已知套索肽结构覆盖率从不足50个扩展至超过4000个基因组挖掘模型 | 输入标题与摘要中未明确提及局限性 | 从序列准确预测套索肽的三维结构，桥接序列发现与结构洞察的差距 | 套索肽（LaPs） | 机器学习 | NA | 机器学习、同源建模、能量最小化 | 支持向量机 | 序列数据 | 超过4000个基因组挖掘模型 | NA | NA | NA | 酶学、结构生物学、合成生物学、治疗学设计 |
| 530 | 2026-05-25 |
Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria
2025-09-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00978-25
PMID:40793766
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研究论文 | 通过多组学分析和CRISPR-Cas基因编辑，破译海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物的降解途径，发现β-酮己二酸途径与β-氧化途径在硫解步骤的交叉对话 | 首次揭示海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物降解的完整途径，并发现途径交叉对话的新机制 | 研究主要基于模型化合物，对其他芳香化合物的适用性及海洋环境中的实际降解效率尚待验证 | 阐明海洋细菌中芳香化合物的生物转化途径，为环境修复和生物碳循环利用奠定基础 | 海洋玫瑰杆菌分支菌中的芳香化合物降解途径 | 合成生物学 | NA | 多组学分析, CRISPR-Cas基因编辑, NGS | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 海洋玫瑰杆菌分支菌 | β-酮己二酸途径与β-氧化途径的交叉对话 | 环境, 工业生物技术 |
| 531 | 2026-05-25 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-09-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
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研究论文 | 本研究利用SCRaMbLE方法对关键基因进行进化，构建了由三株工程化大肠杆菌组成的合成菌群，用于高效降解菲 | 首次将SCRaMbLE方法应用于多环芳烃降解菌群关键基因的定向进化，显著提升了菲的降解效率 | 研究仅测试了100 mg/L的菲浓度，未评估其他浓度或实际污染环境中菌群的降解性能 | 开发基于合成生物学和SCRaMbLE的微生物菌群策略，以增强菲的生物降解 | 菲，一种多环芳烃污染物 | 环境工程 | NA | SCRaMbLE | NA | 生物降解数据 | 三个工程化大肠杆菌菌株（E. coli SCRPHE033、E. coli SCRKA065、E. coli CRSA）在含有100 mg/L菲的MSM培养基中测试 | SCRaMbLE | 大肠杆菌BL21(DE3) | 菲完全矿化的三个分解代谢模块（上游、下游及辅助模块），整合17个关键基因 | 环境生物修复 |
| 532 | 2026-05-25 |
CTGCT, Centre of Excellence for the Technologies of Gene and Cell Therapy: Collaborative translation of scientific discoveries into advanced treatments for neurological rare genetic diseases and cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.051
PMID:39760072
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评论 | CTGCT卓越中心旨在将科学发现转化为针对神经系统罕见遗传病和癌症的先进基因与细胞疗法 | 斯洛文尼亚首个此类中心，整合合成生物学工具、基因编辑、RNA技术、免疫调控工程及新型递送系统，建立GMP设施推动临床转化 | 尚未提供具体实验数据或临床结果评估 | 推动基因与细胞疗法从基础研究向临床应用转化 | 神经系统罕见遗传病和癌症 | 数字病理学 | 神经系统罕见遗传病, 癌症 | 基因编辑, 剪接技术, RNA技术, 免疫调控工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 533 | 2026-05-24 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Aug, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次通过全原子分子动力学模拟系统比较嗜热与中温翻译起始因子1的动态特性，揭示嗜热因子通过扩展氢键和盐桥网络增强结构刚性的分子机制 | 仅基于计算机模拟，缺乏体外实验验证；仅研究了单一嗜热菌株的IF1蛋白 | 阐明嗜热细菌翻译起始因子1的热稳定性分子机制，为工程化耐热蛋白建立框架 | 嗜热菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的IF1蛋白（TT_IF1）与中温菌Flavobacterium kingsejongi的IF1蛋白（FK_IF1） | 分子生物学 | 不适用 | 分子动力学模拟，主成分分析 | 不适用 | 模拟轨迹数据 | 每种IF1蛋白3次独立模拟，每次1000纳秒 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学，工业生物技术 |
| 534 | 2026-05-24 |
PURE makes PURE: reconstitution of the PURE cell-free system from self-synthesized proteins
2026-May-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73337-0
PMID:42173857
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研究论文 | 本研究展示了PURE无细胞系统可以从其自身合成的蛋白质中重建，实现非核糖体蛋白质组分的自我再生 | 首次证明PURE系统中的36种非核糖体蛋白质可以完全通过该系统自身合成，并重建出功能完整的PURE系统，标志着向通用生化构建器迈出关键一步 | 尚未完全实现整个系统（包括核糖体和其他复杂组分）的自主复制，未提及长期稳定性和实际应用中的瓶颈 | 探索无细胞系统自我再生能力，推动通用生化构建器的实现 | PURE无细胞系统中36种非核糖体蛋白质 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞系统，蛋白质纯化 | NA | NA | 36种非核糖体蛋白质及其组合 | NA | E. coli（用于制备PURE系统组分） | 自我再生回路（PURE系统组分自我合成与重建） | 合成生物学，生物技术 |
| 535 | 2026-05-24 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
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研究论文 | 揭示了RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制，类似于GntR阻遏物中的DNA操纵子位点识别 | 首次解析了SELEX衍生的RNA适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构，发现其识别模式与DNA双链结合高度相似，并基于结构设计出新型适配体Dap1m1，实现了对同源蛋白NagR的调控 | 未提及实验的局限性，如适配体设计仅针对少数位点随机化，或对其他GntR家族成员的通用性有待验证 | 研究RNA适配体与细菌阻遏蛋白的相互作用，并探索设计新型适配体-蛋白相互作用对 | RNA适配体Dap1及其靶标GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR，以及同源蛋白NagR | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、SELEX | NA | 三维结构数据 | NA | SELEX | NA | RNA适配体调控回路（适配体-阻遏蛋白相互作用对） | 合成生物学、医学（基因调控应用） |
| 536 | 2026-05-24 |
Modeling the cost and benefit of proteome regulation in a growing bacterial cell
2018-05-09, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aabe43
PMID:29658492
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研究论文 | 构建了一个描述生长分裂细菌细胞中蛋白质组调控成本与收益的数学模型 | 通过内部动态机制内源性决定细胞生长速率，并利用模型研究调控的生态位边界 | 模型基于简化假设，可能未涵盖真实细胞中所有调控复杂性 | 研究细菌细胞中蛋白质组调控的成本与收益平衡，确定有利于调控进化的环境条件 | 大肠杆菌细胞中的代谢蛋白和核糖体蛋白分配调控 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | 模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 蛋白质组资源分配调控回路 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 537 | 2026-05-24 |
Template mediated protein self-assembly as a valuable tool in regenerative therapy
2018-04-11, Biomedical materials (Bristol, England)
DOI:10.1088/1748-605X/aab2fe
PMID:29489458
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研究论文 | 利用硅表面通过扩散限制聚集法自组装多种蛋白质，形成树枝状结构，用于再生治疗 | 提出一种无需电解质的扩散限制聚集方法，实现多种蛋白质在硅表面的自组装，并通过分形分析解释不同蛋白质的聚集路径差异 | 未讨论自组装结构在体内的长期稳定性和免疫原性 | 开发一种模板介导的蛋白质自组装平台，用于再生治疗中的表面修饰和细胞行为调控 | I型胶原蛋白、牛血清白蛋白、细胞色素C等蛋白质及大鼠骨髓干细胞 | 生物材料、再生医学 | NA | 扩散限制聚集法、分形分析 | NA | 图像 | 3种实验蛋白质和1种细胞模型（大鼠骨髓干细胞） | NA | NA | NA | 医学 |
| 538 | 2026-05-24 |
Bottom-up synthetic biology: modular design for making artificial platelets
2017-12-06, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aa9768
PMID:29091050
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研究论文 | 本文提出了利用自下而上的合成生物学构建人工血小板的模块化设计方案 | 首次提出利用自下而上合成生物学概念构建人工血小板，并定义了四个功能模块以实现这一目标 | 未提供具体的实验验证或模块实现的详细技术细节 | 探索利用合成生物学构建人工血小板的可行性 | 人工血小板的模块化设计功能 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人工血小板功能模块，包括凝血、黏附、释放等 | 医学 |
| 539 | 2026-05-23 |
Coarse-grained modeling of hydrodynamic behavior in DNA synthesis monomers
2026-May-28, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0325256
PMID:42170875
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研究论文 | 提出了一种用于DNA合成单体粗粒化建模的方法，并研究了其流体动力学行为 | 首次提出DMT保护核苷酸单体的四珠粗粒化模型，并通过玻尔兹曼反演验证，计算效率提升20倍以上 | 未涉及实验验证或实际合成场景中的多因素影响 | 理解DNA合成中单体的微观动力学，优化合成参数 | DMT保护的核苷酸单体（腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶、鸟嘌呤） | 机器学习 | NA | 粗粒化建模、随机欧拉-拉格朗日方法 | 粗粒化模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学，DNA数据存储 |
| 540 | 2026-05-23 |
Gene expression and metabolic regulation of carotenoid and withanolide biosynthetic pathways in Withania somnifera with emphasis on FPPS-mediated regulation
2026-May-22, Protoplasma
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s00709-026-02212-y
PMID:42171742
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研究论文 | 研究了睡茄中类胡萝卜素和睡茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控，重点分析了法尼基焦磷酸合酶介导的调控作用 | 首次系统揭示了FPPS作为睡茄内酯生物合成关键通量调控酶的作用，并通过瞬时过表达验证了WsFPPS2对睡茄内酯含量的提升效果 | NA | 解析睡茄中类胡萝卜素和睡茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控机制，探究FPPS作为代谢工程靶点的可行性 | 睡茄的营养组织和生殖组织，以及其22个相关基因的表达谱 | 植物生物学 | NA | 转录谱分析、瞬时过表达、系统发育分析 | NA | 基因表达数据、系统发育树 | NA | 瞬时过表达 | 睡茄 | NA | 医学、农业 |