合成生物学相关文章
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当前共找到 3992 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-05 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
|
研究论文 | 本文提出了两种用于精确工程化遗传传感器的互补方法：计算机筛选和机器学习辅助的正向工程 | 开发了基于大规模基因型-表型数据集的计算机筛选方法，以及可解释机器学习与生物物理模型相结合的正向工程方法 | NA | 开发能够定量精确工程化生物传感功能的方法 | 遗传传感器及其剂量响应特性 | 机器学习 | NA | 计算机筛选、机器学习 | 可解释机器学习模型、生物物理模型 | 基因型-表型数据集 | 大规模数据集 | NA | NA | 遗传传感器、剂量响应曲线、灵敏度(EC50)调节、反向剂量响应 | 工业生物技术 |
| 542 | 2025-10-05 |
The path to biotechnological singularity: Current breakthroughs and outlook
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108667
PMID:40744238
|
综述 | 探讨生物技术领域突破性进展及其向生物技术奇点发展的路径与展望 | 系统阐述基因编辑、合成生物学、人工智能等多技术融合带来的生物技术范式变革 | 未涉及具体实验数据支撑，主要基于现有技术发展的宏观分析 | 分析生物技术融合发展趋势及其社会影响 | 基因编辑、合成生物学、人工智能等前沿生物技术 | 生物技术 | 遗传疾病、癌症、退行性疾病 | CRISPR基因编辑、深度学习、干细胞技术、脑机接口 | 深度学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药、环境、工业生物技术 |
| 543 | 2025-10-05 |
Microalgal bioengineering for futuristic applications in synthetic and space biology
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108665
PMID:40738416
|
综述 | 探讨微藻生物工程在合成生物学和空间生物学中的前沿应用 | 整合CRISPR基因编辑与多组学、合成基因电路、人工智能等创新技术，开发适应太空环境的微藻系统 | NA | 通过合成生物学技术改造微藻，解决地球和太空环境中的生命支持资源短缺问题 | 微藻及其基因工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑、多组学技术、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 合成基因电路、代谢通路工程 | 环境,能源,太空探索 |
| 544 | 2025-10-05 |
Harnessing biological nitrogen fixation: Multi-scale engineering for self-sustaining agroecosystems
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108687
PMID:40803658
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综述 | 探讨通过多尺度工程方法利用生物固氮技术构建自维持农业生态系统的研究进展 | 提出从微生物底盘固氮回路设计到根际微生物组重编程，再到工程固氮作物及生态系统水平田间应用的多尺度集成工程方法 | NA | 提高固氮效率并使作物具备生物固氮能力，以替代化学氮肥 | 固氮酶活性分子机制、非固氮宿主中的固氮效率提升策略、合成生物学固氮系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物底盘, 工程作物 | 固氮回路设计, 生物传感器, 代谢通路 | 农业 |
| 545 | 2025-10-05 |
Phage therapy against Klebsiella pneumoniae: An evolving perspective
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108689
PMID:40840758
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综述 | 本文系统探讨了针对肺炎克雷伯菌的噬菌体疗法，分析了细菌-噬菌体协同进化动态，并提出了结合计算科学的综合治疗策略 | 整合临床案例与临床前研究评估联合策略，提出利用机器学习进行噬菌体表征和宿主互作预测的计算路线图 | NA | 推动噬菌体疗法从实验性治疗向标准化干预转变，解决抗菌素耐药性问题 | 肺炎克雷伯菌及其噬菌体 | NA | 细菌感染 | 噬菌体疗法、机器学习、合成生物学 | 机器学习 | NA | NA | NA | 肺炎克雷伯菌 | NA | 医学 |
| 546 | 2025-10-05 |
Multidimensional strategies for efficient heterologous protein expression in Aspergillus niger
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108690
PMID:40845950
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综述 | 本文总结并讨论了通过多维度策略提高黑曲霉异源蛋白表达效率的最新进展 | 从表达系统、分泌途径、代谢通量、智能发酵和多组学整合五个维度系统优化黑曲霉异源蛋白生产 | 由于不同蛋白质特性各异，构建通用的黑曲霉底盘细胞仍面临挑战 | 提高黑曲霉异源蛋白表达效率 | 黑曲霉异源蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程策略、多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | NA | 工业生物技术 |
| 547 | 2025-10-05 |
Engineering plant hosts for high-efficiency accumulation of flavonoids: Advances, challenges and perspectives
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108692
PMID:40850536
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综述 | 本文总结了利用系统和合成生物学方法改造植物宿主以实现高效黄酮类化合物积累的研究进展、挑战与前景 | 提出通过系统和合成生物学方法精确调控黄酮类化合物生物合成路径的创新策略 | 当前在构建下一代高效黄酮生物合成植物宿主方面仍存在技术限制 | 为利用系统和合成生物学方法改造植物黄酮类化合物生物合成提供理论指导 | 植物黄酮类化合物的分布、生物合成途径及调控机制 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学、蛋白质工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 黄酮类化合物生物合成路径改造、代谢通量重平衡 | 农业 |
| 548 | 2025-10-05 |
Machine learning in predictive biocatalysis: A comparative review of methods and applications
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108698
PMID:40885347
|
综述 | 比较分析机器学习在预测生物催化领域的方法与应用 | 系统比较了深度神经网络、卷积网络、图架构和Transformer等不同机器学习方法在生物催化预测中的优劣 | NA | 探讨机器学习在预测生物催化中的应用前景 | 酶功能预测、生物催化剂发现、反应建模和代谢途径优化 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 神经网络, 卷积网络, 图架构, Transformer | 生化数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 绿色生物催化 |
| 549 | 2025-10-05 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2025-Sep-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
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研究论文 | 本文探讨混合人工智能在合成生物学农业应用中的潜力与挑战 | 提出混合AI方法能更有效处理多组学复杂性，实现气候智能型高产量作物设计 | 需要清晰流程、精选数据集和自动化平台才能充分发挥潜力 | 利用混合AI技术推动合成生物学在农业领域的应用发展 | 多基因组、多性状和多环境数据驱动的作物工程 | 合成生物学 | NA | 多组学数据分析 | 混合AI | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | 复杂基因网络 | 农业 |
| 550 | 2025-10-05 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2025-Sep-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
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综述 | 本文探讨利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食品的可持续方法 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂进行精密发酵，超越传统单细胞蛋白生产 | NA | 开发不依赖农业的可持续食品生产技术 | 氢氧化细菌及其工程化应用 | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计、重组蛋白分泌系统 | 食品, 工业生物技术 |
| 551 | 2025-10-05 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-Sep-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
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研究论文 | 开发了一种无需PCR的位点定向诱变方法，使用DNA切割脱氧核酶和单链DNA辅助实现对重复序列的突变操作 | 首次将DNA切割脱氧核酶的应用范围扩展到双链超螺旋质粒，无需PCR或限制性内切酶即可在重复序列上进行位点定向诱变 | NA | 开发一种能够处理重复序列的PCR-free位点定向诱变技术 | 含有PCR不兼容重复序列的质粒 | 合成生物学 | NA | DNA切割脱氧核酶技术，单链DNA辅助双链DNA切割 | NA | NA | NA | DNA切割脱氧核酶 | NA | 单链DNA辅助双链DNA切割系统(DANDA) | 生物技术, 生物化学 |
| 552 | 2025-10-05 |
Controlling complex rhythms: A hierarchical approach to limit cycle switching
2025-Sep-01, Chaos (Woodbury, N.Y.)
DOI:10.1063/5.0296708
PMID:40932349
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研究论文 | 本文提出一种分层控制方法，通过周期性调制实现非线性动力系统中极限环之间的可靠切换 | 开发了通过分层逐步周期性调制控制多节律性的方法，能够在保持系统其他特性的同时实现节律状态间的可靠切换 | NA | 研究非线性动力系统中极限环之间的分层动力学转变 | 非线性动力系统中的极限环和节律行为 | 动力系统理论 | NA | 周期性调制控制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 神经工程,合成生物学 |
| 553 | 2025-10-05 |
Genome mining and characterization of a heme-dependent enzyme catalyzing intermolecular Nitrogen-Nitrogen bond formation in hydrazinosuccinic acid biosynthesis
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.006
PMID:40918557
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研究论文 | 通过基因组挖掘发现并表征了一种新型血红素依赖性酶系统，该酶催化分子间氮-氮键形成生成肼基琥珀酸 | 发现首个血红素依赖性酶系统能够催化分子间氮-氮键形成，并提出了涉及活性氮中间体的催化机制 | NA | 探索氮-氮键形成酶在天然产物生物合成中的作用机制 | 血红素酶与铁硫蛋白复合物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、体内外重组、定点诱变、结构建模 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 554 | 2025-10-05 |
Spatial Organization of the Metabolic Pathway for Enhancing l-Fucose Biosynthesis in Engineered Escherichia coli
2025-Sep-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06801
PMID:40853549
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研究论文 | 本研究通过空间组织策略优化工程大肠杆菌中l-岩藻糖的生物合成途径 | 采用无支架酶组装和工程蛋白质区室化两种空间组织策略，首次系统性地优化l-岩藻糖生物合成途径的空间构型 | NA | 通过合成空间组织提高微生物生物合成效率 | 工程大肠杆菌中的l-岩藻糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多酶复合物组装、蛋白质区室化 | NA | NA | NA | RIAD-RIDD肽相互作用、DIX结构域 | 大肠杆菌 | l-岩藻糖生物合成途径，包含WbgL和AfcA关键酶的多酶复合物，代谢通量导向系统 | 工业生物技术 |
| 555 | 2025-10-05 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-Sep-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 系统阐述细菌芳香聚酮化合物生物合成中氧化重排反应的关键作用及机制 | 首次全面总结氧化重排反应在细菌芳香聚酮生物合成中的多样性催化机制，揭示黄素依赖单加氧酶、酮还原酶和双加氧酶等酶的创新催化功能 | NA | 阐明天然酶如何利用氧化还原化学在细菌芳香聚酮生物合成中构建新碳骨架 | 细菌芳香聚酮化合物的生物合成途径及相关氧化重排酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医药，合成生物学 |
| 556 | 2025-10-05 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 开发基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE，用于链霉菌的高效基因编辑 | 使用尺寸仅为Cas9三分之一的ISDra2 TnpB开发基因组编辑工具，实现高效精确编辑并通过AI辅助蛋白工程获得近100%编辑效率的变体 | NA | 开发适用于链霉菌的高效基因组编辑工具 | 链霉菌菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、AI辅助蛋白工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-TnpB, STAGE, STAGE-cBEST, STAGE-McBEST | 链霉菌 | 基因组编辑系统、碱基编辑系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 557 | 2025-10-05 |
FluxRETAP: a REaction TArget Prioritization genome-scale modeling technique for selecting genetic targets
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf471
PMID:40848245
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研究论文 | 开发了一种基于基因组尺度模型的反应靶点优先排序技术FluxRETAP，用于选择遗传工程目标 | 结合机制性知识和机器学习流程，提供计算成本低廉的遗传靶点选择方法 | 需要依赖先前的生物学知识，不能完全独立使用机器学习方法 | 提高目标代谢物产量的遗传工程靶点选择 | 代谢工程中的遗传过表达、下调或删除靶点 | 机器学习 | NA | 基因组尺度建模 | NA | 代谢模型数据 | 在大肠杆菌和恶臭假单胞菌中验证 | NA | Escherichia coli, Pseudomonas putida | NA | 工业生物技术 |
| 558 | 2025-10-05 |
Evolution and synthetic biology
2023-12, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102394
PMID:37801925
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综述 | 本文综述了受进化观察启发的三个合成生物学领域：基于细胞的生物分子进化组合方法、建立微生物群落的工程互依赖性以及合成免疫学 | 系统梳理了进化观察如何为合成生物学设计提供灵感，并聚焦于三个具体研究方向的进化前提 | 仅涵盖了进化启发合成生物学应用的部分案例，未穷尽所有相关领域 | 探讨进化观察如何启发和塑造合成生物学与生物技术 | 合成生物学中受进化启发的技术平台和应用 | 合成生物学 | NA | 遗传电路构建、合成翻译系统、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞、微生物群落 | 遗传电路、合成翻译系统、代谢途径 | 生物技术 |
| 559 | 2025-10-05 |
Development of novel metabolite-responsive transcription factors via transposon-mediated protein fusion
2018-02-01, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzy001
PMID:29385546
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研究论文 | 开发了一种通过转座子介导的蛋白质融合将代谢物结合蛋白转化为代谢物响应转录因子的通用方法 | 提出了名为BERDI的创新方法，利用体外转座子插入反应在代谢物结合蛋白中随机插入DNA结合域，创建新型生物传感器 | 该方法目前仅以麦芽糖结合蛋白为模型进行验证，尚未在其他代谢物结合蛋白上广泛应用 | 开发通用方法将代谢物结合蛋白转化为代谢物响应转录因子 | 麦芽糖结合蛋白和锌指DNA结合域 | 合成生物学 | NA | 转座子插入反应、荧光激活细胞分选 | NA | NA | NA | BERDI | NA | 代谢物响应转录因子生物传感器 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 560 | 2025-10-05 |
Targeted metabolomics-guided rational refinement of cyanobacterial metabolism enables enhanced photosynthetic production of L-lysine
2025-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.07.015
PMID:40754064
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研究论文 | 本研究通过靶向代谢组学指导蓝藻代谢工程，显著提高了光合作用驱动的L-赖氨酸产量 | 首次结合靶向代谢组学与合成生物学方法系统识别并解除蓝藻赖氨酸生物合成的限速步骤 | 研究仅针对Synechococcus sp. PCC 7002菌株，未在其他蓝藻中验证通用性 | 开发碳负排放的赖氨酸光合生物合成路线 | 聚球藻Synechococcus sp. PCC 7002 | 合成生物学 | NA | 靶向代谢组学, 合成生物学 | NA | 代谢物数据 | 工程菌株系列 | 代谢工程 | Synechococcus sp. PCC 7002 | 赖氨酸生物合成途径优化 | 工业生物技术, 能源 |