合成生物学相关文章
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当前共找到 4268 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-11-22 |
Enhancing Escherichia coli production of material proteins using circular mRNAs
2025-Nov-19, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01579-25
PMID:41055377
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研究论文 | 本研究开发了一种环状mRNA表达系统，用于提高大肠杆菌中材料蛋白的产量 | 利用自切割核酶构建环状mRNA结构，结合绝缘RNA环提高蛋白翻译效率，显著增强重复序列蛋白的表达稳定性 | NA | 解决高分子量重复序列蛋白在微生物宿主中表达不稳定和产量低的问题 | 材料蛋白（包括蛛丝蛋白、肌联蛋白重复序列、贻贝足蛋白寡聚体和丝蛋白-淀粉样重复序列） | 合成生物学 | NA | 环状mRNA技术，逆转录DNA扩增测序 | NA | 蛋白质表达数据，质粒稳定性数据 | 多种材料蛋白（包括96-mer重复的牵引丝蛋白等） | 自切割核酶，绝缘RNA环 | 大肠杆菌 | 环状mRNA表达系统 | 工业生物技术，材料 |
| 542 | 2025-11-22 |
Illuminating the dark majority: photobiology of nonphotosynthetic bacteria
2025-Nov, Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s43630-025-00789-6
PMID:41114917
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综述 | 综述非光合细菌的光生物学研究，揭示其通过光感受器介导的膜电位调节、应激反应和趋光性等生理过程 | 首次系统阐述非光合细菌利用光作为环境信号的分子机制，打破传统认为光仅与光合作用相关的认知局限 | 主要基于现有研究综述，缺乏原始实验数据支持 | 阐明非光合细菌的光感应机制及其生物学意义 | 非光合细菌及其光感受器系统 | 微生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 抗菌治疗, 合成生物学, 环境生物技术 |
| 543 | 2025-11-22 |
A modular high-throughput approach for advancing synthetic biology in the chloroplast of Chlamydomonas
2025-Nov, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02126-2
PMID:41184475
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研究论文 | 本研究建立了莱茵衣藻作为叶绿体合成生物学的原型平台，开发了高通量自动化工作流程和标准化遗传元件 | 建立了首个叶绿体合成生物学高通量原型平台，开发了自动化工作流程可并行处理数千个转基因株系，并扩展了选择标记和调控元件的工具箱 | 研究主要基于模式生物莱茵衣藻，在高等植物中的直接应用仍需进一步验证 | 推进叶绿体合成生物学发展，克服叶绿体工程中遗传工具稀缺和通量低的限制 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 分子克隆、自动化工作流程、转基因技术 | NA | 生物分子数据、表型数据 | 数千个转基因株系，140多个调控元件 | Gibson Assembly, 分子克隆标准 | Chlamydomonas reinhardtii（莱茵衣藻） | 合成光呼吸途径、启动子设计库、调控元件 | 农业, 能源, 环境 |
| 544 | 2025-11-22 |
SpatialPPIv2: Enhancing protein-protein interaction prediction through graph neural networks with protein language models
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.022
PMID:41255828
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研究论文 | 提出了一种基于图神经网络和蛋白质语言模型的蛋白质-蛋白质相互作用预测方法SpatialPPIv2 | 不再依赖蛋白质结构预测算法，能够独立预测蛋白质相互作用，结合大型语言模型和图注意力网络 | NA | 提高蛋白质-蛋白质相互作用预测的特异性和鲁棒性 | 蛋白质-蛋白质相互作用 | 生物信息学 | NA | 图神经网络，蛋白质语言模型 | 图注意力网络 | 蛋白质序列和结构数据 | PINDER数据集（包含RCSB PDB和AlphaFold数据库的相互作用数据） | NA | NA | NA | 药物发现，合成生物学 |
| 545 | 2025-11-21 |
Engineering heterologous core promoters to optimize the SES expression system for Pichia pastoris
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.10.005
PMID:41245009
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研究论文 | 通过工程化异源核心启动子优化毕赤酵母SES表达系统 | 首次从解脂耶氏酵母中筛选214个候选启动子，成功构建41个性能提升达5.4倍的SES系统，并结合CRISPR/Cas9多拷贝整合策略 | 未在更广泛的工业应用场景中验证系统稳定性 | 优化毕赤酵母合成表达系统(SES)的转录调控能力 | 毕赤酵母表达系统及其异源核心启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9, 荧光筛选 | NA | 基因表达数据, 荧光强度数据 | 214个合成启动子，54个功能验证，41个性能提升系统 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 毕赤酵母 | 合成表达系统(SES), 核心启动子工程 | 工业生物技术, 医药 |
| 546 | 2025-11-21 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 本文综述了基因表达与蛋白质丰度之间关系的研究进展，重点关注不同实验环境和细胞背景下两者的关联性 | 系统分类和比较了基于不同相关性度量方法的研究，并整合了单细胞分析等最新技术进展 | 主要依赖相关性分析，对因果关系的解释有限 | 探讨基因表达与蛋白质丰度之间的关联程度及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关系研究 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、代谢工程、合成生物学 |
| 547 | 2025-11-21 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
|
综述 | 探讨细菌通过RNA水平机制精确控制蛋白质亚基化学计量比及其在合成生物学中的应用 | 超越经典转录调控，聚焦转录后精细调控机制，并展示如何将这些天然策略转化为可编程的合成基因电路设计 | NA | 解析细菌控制转录化学计量比的机制并开发合成生物学应用工具 | 细菌转录调控机制和合成基因电路 | 合成生物学 | NA | RNA水平调控分析、合成基因电路设计 | NA | NA | NA | 启动子文库、工程化终止子、RNase处理模块 | 细菌 | 合成基因电路、代谢途径工程、蛋白质组装系统 | 生物技术、生物医学 |
| 548 | 2025-11-21 |
Synthetic biology for scalable production of medical polyhydroxyalkanoates: Advances and applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108722
PMID:41046988
|
综述 | 本文综述了合成生物学在医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产中的进展与应用 | 系统整合了CRISPR/Cas基因组编辑、启动子工程、核糖体结合位点优化等合成生物学技术，并引入嗜盐菌下一代工业生物技术提升生产经济性 | 未提供具体实验数据验证技术改进效果，主要基于现有研究进展的总结分析 | 探讨合成生物学技术促进医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产的进展与前景 | 聚羟基脂肪酸酯及其生产工艺 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, 启动子工程, 核糖体结合位点优化, 代谢通路优化, 形态工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 549 | 2025-11-21 |
Microbial Remediation of Agrochemical-Contaminated Soils: Enzymatic Mechanisms, Quorum Sensing, and Emerging Opportunities
2025-Nov-19, Integrated environmental assessment and management
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/inteam/vjaf167
PMID:41259652
|
综述 | 本文综述了微生物修复农用化学品污染土壤的酶学机制、群体感应调控及新兴生物修复策略 | 系统整合了酶降解机制与群体感应调控网络，并探讨了合成生物学和人工智能在生物修复中的新兴应用 | 面临土壤异质性、QS信号非生物抑制、酶不稳定性、工程菌株生物安全风险等挑战 | 开发生态友好且可持续的农用化学品污染土壤生物修复方法 | 土壤微生物组及其酶系统 | 环境生物技术 | NA | 酶工程、合成生物学、人工智能建模 | NA | NA | NA | 合成QS电路 | 工程菌株 | 合成群体感应电路、QS生物传感器 | 环境 |
| 550 | 2025-11-21 |
The role of extremophile microbiomes in terraforming Mars
2025-Nov-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08973-1
PMID:41249546
|
综述 | 探讨极端微生物在火星地球化改造中的潜在作用及合成生物学应用 | 提出从单一物种研究转向复杂微生物群落协同作用的新视角，强调合成生物学在增强微生物适应性中的应用 | 缺乏对复杂微生物群落相互作用的系统研究，伦理和行星保护问题尚未完全解决 | 探索利用极端微生物实现火星地球化改造的生物策略 | 极端微生物及其群落 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 实验证据 | NA | NA | 极端微生物 | NA | 环境, 太空探索 |
| 551 | 2025-11-21 |
Design and pharmacodynamic study of live biotherapeutic products with efficient degradation of branched-chain amino acids
2025-Nov, Bioengineering & translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/btm2.70075
PMID:41244347
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法设计两种能够高效代谢支链氨基酸的工程菌株，用于治疗支链氨基酸代谢相关疾病 | 成功构建了两种具有不同支链氨基酸代谢途径的工程菌株ECN-Deg和ECN-Tra，并验证了其在体内外的治疗效果 | NA | 开发能够降解或转化过量支链氨基酸的活体生物治疗产品 | 工程改造的大肠杆菌Nissle 1917菌株 | 合成生物学 | 枫糖尿症 | 合成生物学方法 | NA | 体内外实验数据 | 高支链氨基酸小鼠模型 | 代谢途径工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 支链氨基酸降解代谢模块和转化代谢模块 | 医药 |
| 552 | 2025-11-21 |
Advancing Genetically Encoded Lysine (GEK) Chemistry: From Precision Modulation to Therapeutic Innovation
2025-Oct-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.5c00401
PMID:41004624
|
研究论文 | 本文系统介绍了基因编码赖氨酸化学的发展及其在蛋白质工程和精准治疗中的应用 | 开发了工程化的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶变体，能够高效整合具有定制化学反应性的多样化赖氨酸衍生物 | NA | 推进基因编码赖氨酸化学技术，实现蛋白质精确修饰和功能调控 | 赖氨酸衍生物、蛋白质工程工具、治疗性分子 | 化学生物学 | NA | 基因编码赖氨酸化学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | PylRS变体 | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 553 | 2025-11-21 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
|
研究论文 | 探索从地球化学到生物化学过渡过程中原始代谢系统的演化，提出连接非生物化学与早期生命的潜在途径 | 将LUCA代谢反应规则映射到前生物反应，建立综合建模框架测试非生物化学与早期生命的连接假说 | 连接原始地球化学与LUCA复杂代谢能力仍存在挑战，模型需要进一步验证 | 研究生命起源过程中代谢系统的演化机制和化学根源 | 最后共同祖先(LUCA)的代谢系统、前生物化学反应 | 系统化学、计算生物学 | NA | 生成模型、计算建模 | 生成模型 | 化学反应数据、热力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 554 | 2025-11-20 |
Engineered microbial sensors: providing a new paradigm for disease detection
2025-Nov-19, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb01468a
PMID:41114525
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综述 | 本文系统阐述了工程微生物传感器在疾病检测中的设计原理、研究进展和应用前景 | 提出了工程微生物传感器作为疾病检测新范式，总结了最新的封装策略和临床转化潜力 | 存在生物安全问题、信号稳定性问题以及缺乏标准化临床评估方案 | 探讨工程微生物传感器在疾病检测领域的设计原理和应用进展 | 工程微生物传感器及其封装策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 微生物 | 生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 555 | 2025-11-20 |
Development of a modified RNA circularization system to improve circRNA-based protein expression in mammalian cells
2025-Nov-17, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080733.125
PMID:40935594
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研究论文 | 开发了一种改进的RNA环化系统，通过优化IRES与CMV启动子间距显著提高哺乳动物细胞中circRNA的蛋白表达效率 | 揭示了HRV-B3 IRES在哺乳动物细胞中的双重调控作用，并整合HIV-1 LTR截短体和WPRE元件增强转录效率 | 未明确说明改进系统对超大型RNA插入片段的环化效率提升程度 | 提高circRNA在哺乳动物细胞中的环化效率和蛋白表达水平 | circRNA环化系统和哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | RNA环化技术 | NA | 分子生物学数据 | NA | Tornado系统 | 哺乳动物细胞 | 改进的RNA环化系统，包含HRV-B3 IRES、HIV-1 LTR截短体和WPRE调控元件 | 医学 |
| 556 | 2025-11-20 |
Engineering Bacteria as Living Therapeutics in Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507820
PMID:40878391
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术改造细菌作为活体疗法在癌症治疗中的应用 | 将工程化细菌重新定位为能够靶向肿瘤、调节肿瘤微环境和释放抗癌药物的活体治疗剂 | NA | 探讨工程细菌在癌症治疗中的潜力和挑战 | 工程化细菌作为活体治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤微环境调节和抗癌药物释放的遗传回路 | 医学 |
| 557 | 2025-11-20 |
Synthetic biology, genetic circuits and machine learning: a new age of cancer therapy
2023-06, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.13420
PMID:37002698
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评论 | 探讨合成生物学、遗传电路和机器学习在癌症治疗中的新兴应用 | 结合非经典信号通路与合成基因电路增强工程化T细胞的抗肿瘤表型，并利用机器学习预测CAR-T细胞表型 | NA | 扩展未来基因电路的设计选择，开发能响应多重环境线索的细胞疗法 | 工程化T细胞、合成受体、信号传导通路 | 合成生物学 | 癌症 | 合成锌指工程、机器学习预测 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 合成受体信号电路、可控转录调节电路 | 医学 |
| 558 | 2025-11-19 |
In silico evolutionary origin, structural properties, molecular docking, following expression analysis of the nitrate transporters in maize to explore their roles in abiotic stress tolerance
2025-Nov, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01669-0
PMID:41245216
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究玉米硝酸盐转运蛋白的进化起源、结构特性及其在非生物胁迫耐受中的作用 | 首次系统分析玉米硝酸盐转运蛋白的进化起源、结构特性，并通过分子对接和表达分析揭示其在热胁迫、盐胁迫和干旱胁迫中的功能 | 研究主要基于生物信息学预测，实验验证相对有限，需要更多功能验证实验 | 探索玉米硝酸盐转运蛋白在养分平衡、氮积累和非生物胁迫耐受中的关键作用 | 玉米硝酸盐转运蛋白家族成员 | 生物信息学 | NA | 系统发育分析、分子对接、qRT-PCR、RNA-Seq、亚细胞定位 | NA | 基因组数据、表达数据、蛋白质结构数据 | 83个转运蛋白 | GFP标记、合成生物学方法 | 玉米 | 基于NRT的遗传回路，用于改善氮吸收、转运、动员和积累 | 农业 |
| 559 | 2025-11-19 |
Reprogramming encapsulins into modular carbon-fixing nanocompartments
2025-Oct-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65307-9
PMID:41168233
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研究论文 | 本研究开发了一种基于封装蛋白纳米隔室的模块化固碳系统，为在C3作物中引入二氧化碳浓缩机制提供了新方法 | 利用来自嗜热拟杆菌的封装蛋白纳米隔室，通过融合短肽实现多种Rubisco同工型的靶向封装，建立了植物兼容的合成羧酶体模拟系统 | 碳酸酐酶尚未整合到系统中 | 开发模块化固碳纳米隔室系统以增强作物光合效率 | 封装蛋白纳米隔室和Rubisco酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、纳米隔室技术 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质融合技术 | 嗜热拟杆菌 | 固碳纳米隔室系统、合成羧酶体模拟 | 农业 |
| 560 | 2025-11-18 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
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研究论文 | 本研究在热纤维梭菌中开发了一种热稳定的L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围和可忽略背景表达的热稳定L-阿拉伯糖诱导系统 | 未在其他梭菌属微生物中进行广泛验证 | 开发适用于热纤维梭菌的热稳定诱导表达系统 | 热纤维梭菌（Acetivibrio thermocellus） | 合成生物学 | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌（Acetivibrio thermocellus） | L-阿拉伯糖诱导系统，包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |