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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-05 |
Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00978-25
PMID:40793766
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研究论文 | 本研究解析了海洋玫瑰杆菌类群细菌中芳香族化合物的完整降解途径,发现了不同代谢途径间的交叉作用 | 发现了芳香化合物降解途径与β-氧化途径在最终硫醇化步骤的交叉作用,建立了新型海洋平台用于系统水平研究和生物勘探 | NA | 解析海洋细菌中芳香化合物的降解途径,为生物修复和生物碳循环利用提供基础 | 海洋玫瑰杆菌类群细菌及其芳香化合物降解代谢途径 | 合成生物学 | NA | 多组学分析,CRISPR-Cas基因组编辑 | NA | 基因组数据,代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 海洋玫瑰杆菌类群细菌 | 芳香化合物降解途径,β-酮己二酸途径,β-氧化途径 | 环境,工业生物技术 |
| 542 | 2025-10-05 |
Probiotic Bacteria as Therapeutics and Biohybrid Drug Carriers: Advances, Design Strategies, and Future Outlook
2025-Sep-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00959
PMID:40888536
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综述 | 探讨益生菌作为药物递送平台的多样化策略及其在精准医疗中的应用前景 | 系统整合了益生菌作为生物杂交药物载体的多种工程化策略(包括细菌幽灵、外膜囊泡等),并重点探讨了与纳米颗粒系统的整合方法 | NA | 分析益生菌在靶向药物递送领域的最新进展和未来发展方向 | 益生菌及其工程化衍生物(细菌幽灵、外膜囊泡、孢子等) | 合成生物学 | 癌症, 胃肠道疾病 | 基因工程, 纳米技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | 质粒表达, 基因组整合 | 益生菌 | 靶向治疗系统, 免疫调节系统, 刺激响应机制 | 医药 |
| 543 | 2025-10-05 |
Cephalotaxus-Derived Homoharringtonine: Biosynthesis, Mechanism of Action, and Role in Modern Cancer Therapy
2025-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70122
PMID:40970823
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综述 | 本文系统评述三尖杉属植物来源的高三尖杉酯碱的生物合成、作用机制及其在现代癌症治疗中的应用 | 首次全面评估三尖杉生物碱在实体瘤中的未充分研究机制,并探讨合成生物学和精准医疗等创新策略 | 存在化学复杂性、监管障碍和毒性特征等挑战,相关代谢物的生物活性知识仍存在空白 | 探讨三尖杉生物碱作为抗癌药物的潜力及其在精准肿瘤学中的应用 | 三尖杉属植物及其生物活性代谢物(特别是高三尖杉酯碱) | NA | 白血病, 实体瘤 | 合成生物学, 先进药物递送系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 544 | 2025-10-05 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
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研究论文 | 本文介绍利用农杆菌介导的瞬时表达技术在植物中区室化生产萜类化合物的方法 | 采用农杆菌介导的瞬时表达技术实现萜类生物合成的亚细胞区室化 | NA | 开发快速构建萜类化合物合成通路并实现区室化生产的方法 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中的萜类化合物合成通路 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达技术 | NA | NA | NA | 农杆菌介导的转化 | 本氏烟草 | 萜类化合物合成通路的区室化设计(质体、细胞质、脂滴表面) | 工业生物技术 |
| 545 | 2025-10-05 |
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-Oct, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103631
PMID:40712326
|
综述 | 探讨工程化生物系统中空间计算实现的原理与应用 | 提出超越传统单细胞逻辑系统的空间分布式计算框架,模拟形态发生梯度等自然现象 | NA | 研究如何通过空间和适应性计算解决复杂计算挑战 | 工程化生物计算系统 | 合成生物学 | NA | 空间计算框架 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间计算系统、形态发生梯度模拟、细胞区室化 | 医疗,环境,诊断 |
| 546 | 2025-10-05 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
|
综述 | 总结通过转录和翻译调控因子提高CHO细胞中重组治疗蛋白表达的策略 | 系统整合转录因子工程与翻译调控策略,结合合成生物学和基因组学新进展优化蛋白表达 | NA | 提高CHO细胞中重组治疗蛋白的表达水平和质量 | 中国仓鼠卵巢(CHO)细胞和重组治疗蛋白(RTPs) | 合成生物学 | NA | 转录因子工程、翻译调控 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | CHO细胞 | 定制转录因子和启动子设计 | 医药 |
| 547 | 2025-10-05 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2025-Sep-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的BT模型,用于预测转录因子BmoR的关键残基区域,并通过半理性工程获得具有严格信号分子正交性的BmoR突变体,应用于生物燃料高产菌株筛选 | 首次证明氢键计数在TF-SM相互作用中的主导作用,并建立了机器学习引导的TF进化框架,实现了严格信号分子正交性 | NA | 设计具有严格信号分子正交性的生物传感器以最大化可再生生物燃料的过量生产 | 转录因子BmoR及其与信号分子的相互作用 | 合成生物学 | NA | 随机森林算法、Discovery Studio模拟、微尺度热泳动(MST)亲和力测定 | 随机森林 | 蛋白质-配体复合物结构数据 | 245个TF-SM复合物的转录激活效应验证,5,700个BmoR突变体与4种信号分子的结合模拟 | 半理性工程 | 微生物 | 基于BmoR的生物传感器 | 能源,工业生物技术 |
| 548 | 2025-10-05 |
Developmental regulatory factors promote the efficiency of crop genetic transformation
2025-Sep, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-345
PMID:40962472
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综述 | 系统探讨发育调控因子在提高作物遗传转化效率中的应用与前景 | 首次系统梳理发育调控因子在克服遗传转化技术瓶颈中的多重作用机制 | NA | 探讨发育调控因子如何提升作物遗传转化技术的效率和应用范围 | 主要农作物及其遗传转化技术体系 | 农业生物技术 | NA | 农杆菌介导转化、基因枪技术 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |
| 549 | 2025-10-05 |
Modular design of synthetic receptors for programmed gene regulation in cell therapies
2022-04-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.03.023
PMID:35427499
|
研究论文 | 本研究通过模块化工程设计开发了合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs),用于编程治疗性细胞的基因调控 | 采用临床驱动设计流程构建受体,展示了系统模块化工程可生成具有可调传感和转录反应能力的受体平台 | NA | 开发用于治疗性细胞程序化基因调控的合成受体 | 合成跨膜蛋白水解受体(SNIPRs)和人类原代T细胞 | 合成生物学 | NA | 调节性跨膜蛋白水解技术 | NA | NA | NA | 模块化工程 | 人类原代T细胞 | 合成跨膜蛋白水解受体,具有多抗原识别和剂量控制生物活性载荷产生能力 | 医学 |
| 550 | 2025-10-05 |
De novo biosynthesis of Asperosaponin VI in Saccharomyces cerevisiae
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.007
PMID:40951686
|
研究论文 | 本研究首次在酿酒酵母中实现了Asperosaponin VI的完整生物合成途径重构 | 首次在酿酒酵母中采用模块化合成生物学策略完整重建ASA VI生物合成途径,包括UDP-阿拉伯糖原位生物合成和多个糖基化步骤 | 产量仍处于痕量水平(395 ng/L),下游糖基化步骤和UDP-阿拉伯糖供应可能是主要限速因素 | 开发可持续生产Asperosaponin VI及相关阿拉伯糖基化皂苷的微生物平台 | Asperosaponin VI(ASA VI)三萜皂苷及其生物合成中间体 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学策略、LC-MS分析、异源表达 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 异源基因表达、多拷贝表达 | 酿酒酵母 | 完整生物合成途径包括:UDP-阿拉伯糖原位生物合成、三萜骨架生成(齐墩果酸生产)、下游修饰(C-23羟基化、C-28逐步葡萄糖基化、C-3阿拉伯糖基化) | 医药 |
| 551 | 2025-10-05 |
Microreactors derived from water-in-water pickering emulsions for Bacillus amyloliquefaciens proliferation and synthesis of 4-methyl-5-thiazoleethanol
2025-Dec, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133231
PMID:40882929
|
研究论文 | 开发了一种基于水包水Pickering乳液微反应器,用于提高枯草芽孢杆菌增殖和4-甲基-5-噻唑乙醇的生物合成效率 | 结合合成生物学与胶体组装技术构建新型微反应器平台,通过工程化硫胺素酶II突变体和界面屏障优化酶-底物相互作用 | NA | 解决4-甲基-5-噻唑乙醇生物合成中产率低和挥发性损失的问题 | 枯草芽孢杆菌及其工程化硫胺素酶II突变体 | 合成生物学 | NA | 水包水Pickering乳液、甲基纤维素/羟丙基甲基纤维素水相分离、液体发酵 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 枯草芽孢杆菌 | 硫胺素酶II突变体(A82Y/Y113A/T163K/F169L)的代谢工程改造 | 食品工业,香料工业 |
| 552 | 2025-10-05 |
Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis
2025-Oct, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069
PMID:40450816
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研究论文 | 本研究通过整合基因组、转录组和代谢组分析,探索钩吻中钩吻素甲生物合成途径及相关酶基因 | 首次完成钩吻基因组测序组装,结合多组学数据鉴定出20个钩吻素甲生物合成候选基因,并对其中两个基因进行了功能验证 | 仅对两个候选基因进行了初步功能验证,完整的生物合成途径仍需进一步研究 | 解析钩吻中钩吻素甲生物合成途径,挖掘相关酶基因 | 钩吻植物及其生物活性成分钩吻素甲 | 合成生物学 | 炎症和焦虑症 | PacBio测序, 液相色谱-质谱联用技术 | NA | 基因组, 转录组, 代谢组数据 | 不同组织和激素处理的钩吻样本 | NA | 钩吻植物 | 钩吻素甲生物合成途径 | 医药 |
| 553 | 2025-10-05 |
Accurate prediction of thermoresponsive phase behavior of disordered proteins
2025-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70284
PMID:40944421
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研究论文 | 开发了能够准确预测无序蛋白质热响应相行为的残基分辨率模型Mpipi-T | 通过整合原子尺度溶剂化自由能数据和实验浊点测量,参数化了短程非键相互作用,同时解析地标度长程静电相互作用随温度的变化 | NA | 定量预测蛋白质的LCST型相变行为 | 无序蛋白质的热响应相行为 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 原子尺度溶剂化自由能计算,实验浊点测量 | 残基分辨率模型Mpipi-T | 蛋白质序列数据,相变实验数据 | 三个关键蛋白质:hTau40、Pab1、ELF3 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 554 | 2025-10-05 |
Synthetic C1 metabolism in Pseudomonas putida enables strict formatotrophy and methylotrophy via the reductive glycine pathway
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01976-25
PMID:40824035
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造恶臭假单胞菌,使其能够通过还原甘氨酸途径利用甲酸盐和甲醇作为唯一碳源和能源 | 首次在任何假单胞菌物种中实现严格的合成甲酸营养和甲醇营养,通过途径重连和适应性实验室进化实现高效C1同化 | NA | 扩展微生物宿主范围以实现高效C1原料利用,开发碳效率生物制造工艺 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化(ALE),代谢工程,途径工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 质粒整合, 转座子模块 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 还原甘氨酸途径,甲酸脱氢酶途径,甲醇脱氢酶途径 | 工业生物技术, 环境 |
| 555 | 2025-10-05 |
Engineering chimeric polyhydroxyalkanoate synthases for enhanced copolymerization of poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate): A promising biotechnological approach
2025-Sep-10, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133307
PMID:40939657
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研究论文 | 通过交换PHA合酶的N端结构域构建嵌合酶,提高聚羟基脂肪酸酯共聚物中3-羟基己酸酯的掺入效率并优化颗粒形态 | 通过结构域交换构建嵌合PHA合酶,解决了传统嵌合酶设计中的β链干扰问题,实现了3HHx掺入量和颗粒形态的同步优化 | NA | 开发高性能生物可降解塑料的合成生物学策略 | 聚羟基脂肪酸酯合酶(PhaCs) | 合成生物学 | NA | 结构预测、嵌合酶构建 | NA | NA | NA | 结构域交换 | NA | 嵌合酶设计 | 材料, 工业生物技术 |
| 556 | 2025-10-05 |
DNA Vaccines in the Post-mRNA Era: Engineering, Applications, and Emerging Innovations
2025-Sep-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178716
PMID:40943636
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综述 | 本文全面探讨DNA疫苗在mRNA疫苗时代的技术进展、工程原理、临床应用及创新方向 | 系统阐述DNA疫苗通过合成基因电路、自扩增DNA和DNA编码单克隆抗体等技术实现的免疫原性突破 | NA | 评估DNA疫苗在精准免疫治疗中的技术优势和发展路线 | DNA疫苗技术平台及其临床应用 | 合成生物学 | 传染病、癌症、免疫介导疾病 | 合成基因电路、自扩增DNA、DNA编码单克隆抗体、电穿孔、冻干技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 合成基因电路、自扩增DNA系统、DNA编码单克隆抗体表达系统 | 医学 |
| 557 | 2025-10-05 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶,在人类细胞系和原代T细胞中实现了差异化的甲基化和基因沉默活性 | 在DNMT3A催化核心引入突变,稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达,同时保持DNA甲基化和基因沉默功能 | 研究主要局限于人类细胞系和原代T细胞,尚未在其他哺乳动物细胞类型中验证 | 开发优化的表观遗传编辑工具,用于在哺乳动物细胞中实现可编程的DNA甲基化 | 人类细胞系和供体来源的原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, 表观遗传编辑, DNA甲基化分析 | dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白 | 表观遗传数据, 基因表达数据 | 多种人类细胞系和供体来源的原代人类T细胞 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞系, 原代人类T细胞 | 表观遗传编辑系统, DNA甲基转移酶融合蛋白 | 医学, 生物技术 |
| 558 | 2025-10-05 |
Exploring the diversity and antimicrobial potential of actinomycetes isolated from different environments in Saudi Arabia: a systematic review
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1568899
PMID:40207161
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综述 | 系统回顾沙特阿拉伯不同环境中放线菌的多样性和抗菌潜力 | 聚焦沙特独特生态系统(极端环境等)中放线菌的抗菌潜力,结合基因组挖掘、AI生物信息学等前沿技术 | 稀有菌株培养困难、基因组表征有限、生产成本高 | 探索新型抗菌剂以应对抗菌素耐药性 | 沙特阿拉伯不同环境来源的放线菌 | 微生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 基因组挖掘、宏基因组学、AI生物信息学、CRISPR基因激活、质谱分析、液相色谱、核磁共振波谱 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 放线菌 | NA | 医学, 农业 |
| 559 | 2025-10-05 |
Yarrowia lipolytica as a promising cell factory for microbial production of value-added nutraceuticals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673169
PMID:40948964
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综述 | 总结解脂耶氏酵母作为细胞工厂生产高附加值营养保健品的工程策略与进展 | 系统整合代谢工程与合成生物学工具,重点突出细胞器区室化工程和生物传感器驱动筛选等先进策略 | NA | 开发解脂耶氏酵母作为可持续生产营养保健品的微生物平台 | 解脂耶氏酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学、多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 生物传感器 | 解脂耶氏酵母 | 代谢通路工程、异源基因表达优化、前体供应增强、竞争途径重定向 | 食品, 工业生物技术 |
| 560 | 2025-10-05 |
Reprogramming cancer immunity with next-generation combination therapies
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1652047
PMID:40950404
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综述 | 本文全面分析新一代癌症免疫联合疗法的机制基础与临床整合策略 | 系统整合多模态免疫治疗策略,结合纳米技术、免疫工程和人工智能建模等前沿技术 | 存在免疫相关不良事件和治疗反应异质性等挑战 | 探讨通过新一代联合疗法重编程癌症免疫应答 | 癌症免疫治疗策略及其临床应用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 多组学分析、纳米技术、人工智能建模 | NA | NA | NA | 免疫工程 | NA | NA | 医学 |