合成生物学相关文章
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当前共找到 3115 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-03-03 |
Next-generation biocontainment systems for engineered organisms
2018-06, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0056-x
PMID:29769737
|
研究论文 | 本文讨论了工程生物在工业、临床和环境应用中日益增加的使用，以及由此带来的生物安全风险，并介绍了合成生物学中的新技术如何用于开发新型生物防护系统 | 本文强调了合成生物学中的新技术（如基因电路工程、基因组编辑和基因表达调控）在开发新型生物防护系统中的应用 | 本文未具体提及现有生物防护系统的具体局限性 | 研究目的是开发更有效的生物防护系统，以应对工程生物在环境中的潜在风险 | 研究对象是工程生物及其在工业、临床和环境中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因电路工程、基因组编辑、基因表达调控 | NA | NA | NA |
| 542 | 2025-03-01 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
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研究论文 | 本文通过基因组学、转录组学和合成生物学方法，揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物emodin和endocrocin的生物合成途径，以及它们甲基化为黄色色素physcion和dermolutein的过程 | 发现了Cortinarius蘑菇中非还原性聚酮合酶（nrPKSs）和特异性O-甲基转移酶（OMTs）的平行进化起源，并成功在酵母中异源合成了physcion和dermolutein | 化学合成复杂且不经济，从森林中大量采集野生蘑菇不可行 | 研究Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物的生物合成途径及其应用 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 |
| 543 | 2025-03-01 |
Microbiome Engineering for Sustainable Rice Production: Strategies for Biofertilization, Stress Tolerance, and Climate Resilience
2025-Jan-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13020233
PMID:40005600
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综述 | 本文更新并批判性地讨论了水稻微生物组的多样性、功能角色以及增强生物施肥和抗逆性的微生物组工程策略 | 强调了微生物组工程从传统接种剂到合成生物学的进展，以及利用微生物组塑造基因（M基因）提高作物抗逆性的创新方法 | 需要进一步探索M基因以培育抗病性状，且商业化成功的关键因素包括土壤特性、实际环境条件和植物基因型 | 增强水稻的生物施肥、抗逆性和气候适应能力，以实现可持续水稻生产 | 水稻及其微生物组 | 农业生物技术 | NA | 微生物组工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 544 | 2025-03-01 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
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研究论文 | 本文探讨了同义密码子替换如何通过调节反义RNA的产生来影响上游基因的转录和翻译 | 揭示了同义密码子替换不仅影响单个基因的表达，还能显著影响邻近基因的表达，特别是通过反义RNA的产生 | 研究仅限于质粒编码的基因，未涉及更广泛的基因组环境 | 研究同义密码子替换对邻近基因表达的影响 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游的四环素抗性基因 | 分子生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 九种同义重编码的CAT基因序列 |
| 545 | 2025-03-01 |
De novo-designed minibinders expand the synthetic biology sensing repertoire
2024-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.12.575267
PMID:38293112
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研究论文 | 本文探讨了设计的新型小型结合蛋白（minibinders）在细胞工程工具中的应用潜力 | 展示了小型结合蛋白LCB1在下一代蛋白水解受体SNIPR和嵌合抗原受体（CAR）中的广泛应用，相比传统抗体具有更快的生产周期和独特的靶向特性 | 研究主要集中于SARS-CoV-2 Spike蛋白和表皮生长因子受体，未广泛测试其他抗原 | 探索小型结合蛋白在细胞工程工具中的通用性和应用潜力 | SARS-CoV-2 Spike蛋白和表皮生长因子受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质序列和功能数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 546 | 2025-02-28 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
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研究论文 | 本文研究了自然发生的DNA倒位系统在合成生物学中的应用，特别是Shufflon倒位酶（SI）的改进和扩展 | 鉴定了14个以前未测试的SI基因及其位点，并建立了一种基于单分子测序的检测方法，以量化这些酶的倒位速率，并确定了正交SI/对 | 研究中仅使用了单一酶，且重组速率中等，这可能限制了SI的广泛应用 | 扩展合成生物学工具包，特别是Shufflon样重组系统的应用 | Shufflon倒位酶（SI）及其基因 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | DNA序列 | 14个SI基因 |
| 547 | 2025-02-28 |
Cell-Free Systems to Mimic and Expand Metabolism
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00729
PMID:39878226
|
研究论文 | 本文探讨了利用无细胞系统模拟和扩展代谢的研究进展 | 将无细胞系统的应用从蛋白质合成扩展到代谢途径的原型设计和新型反应网络的构建 | 目前仅探索了代谢可能性的一小部分，且主要使用模式生物的提取物作为起点 | 理解和设计生物基化学转化 | 无细胞系统中的代谢途径和反应网络 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 548 | 2025-02-28 |
Considerations for Domestication of Novel Strains of Filamentous Fungi
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00672
PMID:39883596
|
综述 | 本文综述了丝状真菌作为生物技术资源的潜力及其在商业化应用中的挑战 | 提出了利用合成生物学和系统生物学工具来开发丝状真菌作为微生物细胞工厂的新方法 | NA | 探讨丝状真菌在生物技术中的应用潜力及其作为微生物细胞工厂的开发方法 | 丝状真菌 | 生物技术 | NA | 合成生物学, 系统生物学 | NA | NA | NA |
| 549 | 2025-02-28 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GenomeOcean的高效基因组基础模型，该模型在大规模宏基因组组装数据上进行训练，旨在提升对稀有微生物物种的表征能力 | GenomeOcean直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练，增强了对稀有微生物物种的表征能力，并改进了超越基因组中心方法的泛化能力 | NA | 开发一种高效的基因组基础模型，以提升对稀有微生物物种的表征能力，并推动精准医学、药物发现和复杂生物系统的理解 | 宏基因组数据集中的微生物物种 | 基因组学 | NA | 宏基因组测序 | 生成式基因组基础模型 | 基因组序列 | 220 TB的宏基因组数据集，包含600 Gbp的高质量重叠群 |
| 550 | 2025-02-28 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
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研究论文 | 本研究从千金藤属植物Stephania epigaea中克隆并功能表征了三种O-甲基转移酶（OMTs），重点研究了其中两种Se6OMTs在头花千金藤碱生物合成途径中的作用 | 首次鉴定了参与头花千金藤碱生物合成途径的Se6OMTs，并阐明了这些酶在(R)-和(S)-立体异构体生物碱生成中的作用 | 未探讨Se6OMTs在其他生物碱生物合成途径中的潜在作用 | 阐明头花千金藤碱生物合成途径中关键酶的作用机制 | Stephania epigaea植物中的O-甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生物化学数据 | 三种OMTs，九种1-BIAs底物 |
| 551 | 2025-02-28 |
Harnessing Gut Microbiota for Biomimetic Innovations in Health and Biotechnology
2025-Jan-24, Biomimetics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/biomimetics10020073
PMID:39997096
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综述 | 本文探讨了肠道微生物群在健康和生物技术中的仿生创新潜力 | 利用肠道微生物群的生物机制，开发个性化益生菌、人工微生物群、仿生生物传感器和生物修复系统等创新应用 | 在人工环境中复制微生物复杂性、基因工程微生物的伦理问题以及公平获取先进疗法的挑战 | 探索基于微生物群的仿生创新在医疗和生物技术中的潜力 | 肠道微生物群及其生物机制 | 生物技术 | NA | 人工智能、生物工程、多组学方法 | NA | NA | NA |
| 552 | 2025-02-28 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
|
研究论文 | 本文报道了通过工程化细菌孢子组装形成的宏观材料 | 利用T7驱动的表达系统在孢子表面展示高密度的pH响应自结合蛋白，实现了pH依赖的蛋白质水平结合和颗粒材料的组装 | 机械性能在pH变化时基本保持不变，但侵蚀稳定性与工程化表面蛋白之间的pH依赖相互作用一致，存在pH依赖性 | 设计宏观材料并研究卷曲螺旋相互作用在不同长度尺度上的影响 | 工程化细菌孢子 | 合成生物学 | NA | T7驱动的表达系统 | NA | NA | NA |
| 553 | 2025-02-27 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
|
研究论文 | DNAdesign是一个基于网络的工具，用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | DNAdesign能够同时考虑序列突变引起的不同读取模式的改变，提供基于DNA序列和形状特征的突变设计 | NA | 研究基因调控和合成生物学应用，如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 生物信息学 | NA | Deep DNAshape | NA | DNA序列 | NA |
| 554 | 2025-02-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-Feb, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 本文研究了UAG（琥珀）终止密码子的抑制如何影响沙门氏菌的致病性 | 揭示了UAG终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的选择性影响，特别是对SPI-1基因表达的减弱作用 | 未探讨UGA和UAA终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的影响 | 探讨终止密码子抑制对细菌致病性的影响 | 沙门氏菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 系统遗传和生化分析 | NA | NA | NA |
| 555 | 2025-02-27 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
|
综述 | 本文综述了调节性T细胞（Treg细胞）在治疗疾病中的潜力，包括增强或抑制Treg细胞活性的临床试验进展 | 探讨了利用纳米医学和合成生物学进展来精确调控Treg细胞功能的新一代临床试验 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解答的问题 | 探讨调节性T细胞在治疗多种疾病中的应用 | 调节性T细胞（Treg细胞） | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA |
| 556 | 2025-02-27 |
Glucose 6-phosphate dehydrogenase variants increase NADPH pools for yeast isoprenoid production
2024-Mar, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13755
PMID:38124687
|
研究论文 | 本研究通过提高NADPH生成酶的效率，增强酵母中异戊二烯类化合物的产量 | 不同于以往通过增加戊糖磷酸途径流量或过量生产NADPH生成酶的方法，本研究专注于提高NADPH生成酶的效率，并通过基因融合和理性突变策略成功提高了G6PD酶的活性 | NA | 提高酵母中异戊二烯类化合物的产量 | 酵母 | 合成生物学 | NA | 基因融合、理性突变 | NA | NA | NA |
| 557 | 2025-02-26 |
Living Fiber Dispersions from Mycelium as a New Sustainable Platform for Advanced Materials
2025-Feb-25, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418464
PMID:39998258
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研究论文 | 本文提出了一种从菌丝体生成活纤维分散体（LFD）的可持续方法，结合了生物聚合物纤维的优异材料形成特性和活材料的高度动态特性 | 提出了一种新的可持续方法，通过工业可用的液体培养和机械解纤方法生成分散良好的活菌丝体纤维，展示了在无需添加营养的情况下通过生长利用动态特性的能力 | 未明确提及具体限制 | 开发可持续的先进材料平台 | 菌丝体纤维 | 材料科学 | NA | 液体培养和机械解纤方法 | NA | NA | NA |
| 558 | 2025-02-26 |
Utilizing microbial metabolite in catalytic cascade synthesis of conjugated oligomers for In-Situ regulation of biological activity
2024-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107188
PMID:38377815
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研究论文 | 本文结合微生物代谢途径和钯催化过程，用于原位生成具有生物活性的共轭寡聚物 | 将微生物代谢途径与钯催化过程结合，实现生物活性共轭寡聚物的原位合成 | NA | 研究生物代谢与化学催化反应的结合，以实现非天然分子的生物合成和生物活性的原位调控 | 工程化大肠杆菌及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 钯催化的Heck反应 | NA | NA | NA |
| 559 | 2025-02-26 |
Chaos in synthetic microbial communities
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010548
PMID:36215322
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研究论文 | 本文探讨了合成微生物群落中混沌行为的可能性及其控制方法 | 首次在合成微生物群落中查询混沌行为的存在，并提供了控制此类系统的见解 | 研究主要关注小型微生物群落，可能不适用于更大或更复杂的系统 | 理解并控制合成微生物群落中的混沌行为 | 小型合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | 近似贝叶斯计算 | NA | NA | NA |
| 560 | 2025-02-25 |
Information Transmission through Biotic-Abiotic Interfaces to Restore or Enhance Human Function
2024-06-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c00435
PMID:38729914
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综述 | 本文综述了通过生物-非生物界面进行信息传输以恢复或增强人类功能的最新进展 | 提出了一个模块化框架，用于定义和描述生物和非生物组件的工程以及界面设计，以促进使用光或电的生物-非生物信息传输 | NA | 探讨如何通过生物-非生物界面进行信息传输，以恢复或增强人类功能 | 神经元细胞与电子设备之间的通信，视网膜疾病患者，脊髓损伤患者 | 生物医学工程 | 视网膜疾病，脊髓损伤 | 光敏蛋白工程，脑机接口，刺激植入物，有机晶体管 | NA | NA | NA |