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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-05 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2025-Sep-16, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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系统综述 | 系统综述虫媒病毒病的进化机制、宿主-媒介相互作用及新型控制策略 | 整合基因组分析、荟萃流行病学综合和预测建模的多学科分析框架,系统评估CRISPR基因驱动和RNAi抗病毒等新型控制策略 | 基因编辑和微生物干预存在伦理、生态和监管问题需要谨慎考虑 | 理解虫媒病毒的进化机制和传播动态,探索有效疾病控制策略 | 虫媒病毒(登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗河病毒)及其传播媒介(蚊子和蜱) | 传染病学 | 虫媒病毒病 | 基因组分析、预测建模、荟萃流行病学分析 | 预测模型 | 基因组数据、流行病学数据 | 从16,320条初始记录中筛选出12项高质量研究 | CRISPR基因驱动 | NA | NA | 医学 |
| 562 | 2025-10-05 |
Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase
2025-Nov, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003
PMID:40774389
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研究论文 | 本研究开发了基于SacB的基因编辑系统,用于木葡糖酸醋杆菌的标记自由基因编辑,并探索细菌纤维素合酶功能 | 开发了pK18mobsacB系统实现高达83.33%效率的标记自由基因编辑,首次系统研究bcs操纵子对细菌纤维素合成和结构的影响 | NA | 开发高效基因编辑工具并研究细菌纤维素合酶功能 | 木葡糖酸醋杆菌CGMCC 2955及其细菌纤维素合成机制 | 合成生物学 | NA | SacB介导的基因编辑系统 | NA | 基因编辑效率数据、纤维素结构表征数据 | 木葡糖酸醋杆菌CGMCC 2955菌株 | pK18mobsacB, SacB系统 | Komagataeibacter xylinus(木葡糖酸醋杆菌) | 基因删除、插入和替换操作 | 生物技术,食品,医药,工业生物技术 |
| 563 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications
2025-Oct-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
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综述 | 本文探讨利用合成生物学原理设计蛋白质变构调控及其在生物医学领域的应用潜力 | 整合人工智能生成式蛋白质设计方法开发新型变构调控系统,实现对外部信号响应的精准蛋白质功能调控 | NA | 通过合成生物学方法设计蛋白质变构调控机制,开发新型治疗策略 | 蛋白质变构调控系统 | 合成生物学 | NA | 结构域插入、从头蛋白质开关设计、工程化变构机制 | AI生成式蛋白质设计 | NA | NA | NA | NA | 变构蛋白质开关、变构调节剂、配体结合响应系统 | 医学 |
| 564 | 2025-10-05 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
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综述 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传平台的发展历程、主要特性及其在细胞信号操控中的应用 | 开发了基于自定位配体的蛋白质易位技术,能够可逆且重复地操控细胞内膜信号传导 | NA | 开发用于解析细胞信号网络和工程化细胞功能的化学遗传工具 | 细胞信号蛋白和脂质 | 合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白易位) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞, 大肠杆菌 | 蛋白质易位系统,光诱导空间调控蛋白招募,多重信号操控 | 医学 |
| 565 | 2025-10-05 |
Engineering Proteinosomes with Cellular-Like Functionalities
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500448
PMID:40810682
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综述 | 本文综述了蛋白质体作为仿生结构在模拟细胞功能方面的研究进展,包括构建方法、功能化策略及其在人工细胞模型和生物医学应用中的潜力 | 详细阐述了通过界面自组装、聚合物膜模板和混合脂质-聚合物系统构建具有可调渗透性、机械稳定性和刺激响应行为的蛋白质体,并强调了其在构建原型组织方面的创新 | NA | 探索蛋白质体作为人工细胞模型的构建方法和功能化策略 | 蛋白质体及其仿生结构 | 合成生物学 | 癌症 | 界面自组装、聚合物膜模板、混合脂质-聚合物系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 刺激响应材料、多室结构、原型组织构建 | 医学 |
| 566 | 2025-10-05 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 通过分析Pepper RNA变体揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦关系 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦现象,并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度的重要影响 | 仅研究了53种变体,可能未覆盖所有关键序列变异 | 理解RNA适配体配体识别和荧光激活的序列-结构-功能关系,为理性设计荧光RNA适配体提供框架 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建、结合亲和力测定、荧光强度测量 | NA | 生物化学数据、荧光数据 | 53种Pepper变体 | NA | NA | 荧光RNA适配体 | 医学, 合成生物学 |
| 567 | 2025-10-05 |
Mining unique cysteine synthetases and computational study on thoroughly eliminating feedback inhibition through tunnel engineering
2024-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.5160
PMID:39275998
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研究论文 | 通过数据库挖掘获得高催化活性OPSS酶并利用隧道工程策略彻底消除其产物反馈抑制 | 采用半理性设计与隧道分析相结合的策略,成功构建了完全消除产物抑制且不牺牲催化效率的AsOPSS变体 | NA | 开发高效的L-半胱氨酸生物合成途径 | 来自Acetobacterium sp.的O-磷酸丝氨酸硫化氢酶(AsOPSS) | 合成生物学 | NA | 数据库挖掘、分子对接、分子动力学模拟、随机加速分子动力学模拟、伞形采样模拟 | NA | 酶活性数据、分子模拟数据 | NA | 隧道工程 | Acetobacterium sp. | 代谢途径工程 | 医药, 农业 |
| 568 | 2025-10-05 |
Multivalent engineering of bio interfaces with DNA-based nanomaterials
2025-Oct, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115681
PMID:40865643
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综述 | 本文探讨了基于DNA的纳米材料在生物界面多价工程中的应用与进展 | 提出从传统多价结合向'多价工程'的概念转变,通过DNA纳米材料实现配体空间排列的精确编程 | 在复杂体内环境中实现系统全部潜力仍需解决重大挑战 | 开发生物界面多价工程系统以模拟或利用自然相互作用模式 | DNA纳米材料及其在生物界面工程中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米材料 | NA | 配体空间组织、几何依赖型靶向策略 | 诊断, 治疗, 合成生物学 |
| 569 | 2025-10-05 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
|
综述 | 本文系统分析DNA纳米结构在刺激响应型药物递送和多模式生物传感中的创新应用 | 重点阐述DNA纳米结构对肿瘤微环境刺激的动态响应能力及其在多模式检测中的创新应用 | 存在规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等关键转化挑战 | 解决精准医疗中靶向药物递送和生物医学成像的关键挑战 | DNA工程纳米结构(包括瓦片组装体、折纸框架、球形核酸和刺激响应水凝胶) | 合成生物学 | 癌症 | FRET探针、电化学发光放大电路、SERS底物、细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 刺激响应型药物递送系统、多模式生物传感电路 | 医学 |
| 570 | 2025-10-05 |
Introduction to "Biomolecular Technologies"
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb90031j
PMID:40843437
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综述 | 介绍生物分子技术领域的最新进展及其在基础科学和实际应用中的机会 | 汇集了基于工程生物分子的多种技术,涵盖小分子、核酸和蛋白质,展示生物分子设计的模块化和可调性 | NA | 概述生物分子技术在生物催化、生物传感和合成生物学等领域的应用 | 工程生物分子(小分子、核酸、蛋白质) | 合成生物学 | NA | 生物分子工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 571 | 2025-10-05 |
Gene duplication and clustering underlie the conservation and diversification of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in plants
2025-Aug-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63175-x
PMID:40826018
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研究论文 | 本研究揭示了植物中苄基异喹啉生物碱(BIA)生物合成途径的保守性与多样化机制,重点关注基因复制和基因簇形成的作用 | 首次在木兰类植物中发现CYP80G介导的酚偶联反应,揭示了BIA骨架形成基因在木兰类和毛茛目之间的保守性,并发现CYP80B与4'OMT、6-OMT基因的动态簇聚现象 | 研究主要集中于蕺菜(Houttuynia cordata),对其他木兰类植物的BIA生物合成研究仍较少 | 探究植物中苄基异喹啉生物碱生物合成的进化机制和基因组织方式 | 蕺菜(Houttuynia cordata)及其他被子植物中的BIA生物合成基因 | 植物分子生物学 | NA | 功能分析、全基因组分析、酶学表征 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 572 | 2025-10-05 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
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研究论文 | 提出一种生物分子自适应控制器,通过合成生物学方法优化干细胞分化过程中的细胞命运决策 | 设计了一种类似非相干前馈环(IFFL)拓扑结构的自适应控制器,无需详细内源网络机制知识即可实现细胞命运偏置 | 需要足够的隔离速率才能实现理想的微分输出特性,且性能受参数扰动影响 | 优化基于干细胞的治疗方法,提高特定细胞类型的产量 | 干细胞分化过程中的细胞命运决策机制 | 合成生物学 | 创伤或疾病相关的细胞替代治疗 | 合成基因电路设计 | 自适应控制器 | 理论分析和计算模拟 | NA | 合成基因电路 | 干细胞 | 基于隔离机制和中间物种延迟的非相干前馈环(IFFL)拓扑结构 | 医学 |
| 573 | 2025-10-05 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌Kay病毒进行结构修饰,实现成像和生物传感应用 | 首次报道葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,开发了双菌株编辑策略结合CRISPR-Cas10反选系统 | 仅针对812h1噬菌体进行验证,未测试其他噬菌体系统的适用性 | 开发噬菌体结构蛋白工程化方法并验证其生物应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1及其尾部鞘蛋白 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、同源重组、荧光显微镜、生物层干涉术、ELISA、流式细胞术 | NA | 图像数据、生物传感数据 | NA | CRISPR-Cas10 | 葡萄球菌噬菌体 | 在尾部鞘蛋白暴露环中插入多组氨酸标签 | 医学,纳米技术,合成生物学 |
| 574 | 2025-10-05 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 本研究通过优化FapR/FapO生物传感器,开发了一种用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性的重构无细胞系统 | 通过工程化T7启动子与FapO操纵子间的间隔序列,开发了具有宽检测范围(50-1500 μM)的无细胞丙二酰辅酶A生物传感器系统,最大动态范围达到95.3倍 | NA | 开发高灵敏度的丙二酰辅酶A生物传感器用于ACC的高通量筛选和定向进化 | FapR/FapO生物传感器系统和乙酰辅酶A羧化酶(ACC) | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统,定向进化,高通量筛选 | NA | 荧光信号数据 | NA | 启动子工程,同源筛选 | NA | FapR/FapO生物传感器系统,可将丙二酰辅酶A浓度转换为荧光信号 | 工业生物技术,医药 |
| 575 | 2025-10-05 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 本研究利用自主生物发光技术优化了三种双生病毒载体在植物合成生物学中的应用 | 首次使用自主生物发光作为实时报告系统来表征双生病毒载体的基因表达特性 | BCTV载体表现出较差的表达控制水平 | 优化双生病毒载体作为植物生物技术工具 | 菜豆黄矮病毒(BeYDV)、番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 生物发光信号数据 | 三种双生病毒复制子系统 | Gibson Assembly | 植物 | 合成复制子、多基因表达系统 | 农业,工业生物技术 |
| 576 | 2025-10-05 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
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研究论文 | 本研究通过工程化细胞分裂素调节因子实现对植物根系发育的精确调控 | 利用工程化B型响应调节因子调控细胞分裂素依赖性生长发育过程,通过组织特异性启动子实现可预测的表型调控 | 未提及具体局限性 | 开发精确控制植物发育表型的合成生物学工具 | 植物根系发育,特别是侧根数量的调控 | 合成生物学 | NA | 基因工程,组织特异性表达 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 植物 | 工程化转录因子调控网络,组织特异性表达系统 | 农业 |
| 577 | 2025-10-05 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
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研究论文 | 开发了结合预印本分析和实验实践的主动学习工作流程,以改善合成生物学教学体验 | 使用预印本作为教育资源让学生批判性分析手稿与最终发表作品的差异,并设计基于CRISPRi基因电路的实践实验环节 | NA | 改进合成生物学的教学方法,提升学生的学习体验和技能 | 大学生 | 合成生物学教育 | NA | CRISPRi | NA | 教育反馈数据 | 学生群体(具体数量未明确说明) | CRISPRi | NA | 基于CRISPRi的基因电路 | 教育 |
| 578 | 2025-10-05 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 开发用于蛋白质结构预测和设计工具的容器化解决方案,以解决高计算需求和部署难题 | 开发了针对多种计算架构优化的容器化解决方案,并创建了OmniFold包装平台实现多工具并行运行和自动质量报告生成 | 未提及具体性能提升的量化数据或与其他部署方法的直接比较 | 解决蛋白质结构预测和设计工具的高计算需求和部署困难问题 | AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion等蛋白质结构预测和设计工具 | 计算生物学 | NA | 容器化技术、GPU优化计算 | 深度学习模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、疾病治疗 |
| 579 | 2025-10-05 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
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综述 | 本文回顾了MultiBac技术的发展历程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | 引入相对较新的MultiBac技术,整合合成生物学方法增强多功能性 | 存在某些缺陷,研究人员需根据具体需求考虑其局限性 | 为基础研究人员提供新的蛋白表达方法 | MultiBac技术及其在重组蛋白生产和复杂蛋白复合物研究中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac技术 | NA | NA | NA | MultiBac | 昆虫细胞 | NA | 制药, 生物技术 |
| 580 | 2025-10-05 |
Peptide Coacervates Can Protect Sequestered Oligonucleotides from Nucleases and Release Them for Transcription and Translation
2025-Sep-08, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c00600
PMID:40802871
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研究论文 | 本文证明肽凝聚层可通过液-液相分离形成无膜细胞器,有效隔离并保护短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因免受多种核酸酶降解 | 发现基于聚组氨酸肽与ATP静电相互作用的关联性凝聚层能高效保护寡核苷酸,并可通过离子强度或温度变化实现可控释放 | 基于黏附-间隔模型肽的简单凝聚层保护效果有限 | 开发能够保护和可控释放功能性遗传物质的生物相容性递送系统 | 短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |