合成生物学相关文章
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当前共找到 5275 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-30 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
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研究论文 | 提出一种利用水熊虫来源蛋白实现无细胞表达系统低成本干燥储存的方法 | 首次利用水熊虫来源的CAHS蛋白单独保护无细胞表达系统，无需其他添加剂即可在室温干燥条件下保持蛋白质合成活性 | 未详细探讨CAHS蛋白对不同类型无细胞表达系统的普适性及长期储存稳定性 | 开发低成本、便携的无细胞表达系统干燥储存策略 | 无细胞表达系统及水熊虫来源的CAHS蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统、干燥储存 | NA | NA | NA | CAHS蛋白 | NA | 无细胞表达系统干燥保护机制 | 合成生物学、便携式生物技术 |
| 42 | 2026-06-30 |
Rational assembly of synthetic marine biofilm community with chitinase production
2026-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9419003/v1
PMID:42282017
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研究论文 | 本文提出了一种自上而下的组装方法，利用天然海洋细菌设计具有几丁质酶生产功能的多物种生物膜群落 | 通过营养条件调控和竞争排除策略，成功构建了高物种多样性且具有目标功能的生物膜群落，并发现多物种群落能增强生物膜的入侵抵抗力和稳定功能输出 | 研究仅限于17种初始分离菌株，且未探索长期生态稳定性及大规模应用中的潜在问题 | 设计并组装具有几丁质酶生产功能的合成海洋生物膜群落 | 天然海洋细菌群落及多物种生物膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 17种海洋细菌分离株 | NA | 天然海洋细菌 | 几丁质酶生产途径 | 海洋生物技术, 环境工程 |
| 43 | 2026-06-30 |
Coupled intracellular redox and extracellular respiration sensing for quantitative oxidative stress profiling
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.727573
PMID:42282784
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研究论文 | 开发了一种结合基因编码氧化还原生物传感器和光学氧传感器的双荧光传感平台，用于工业酵母系统中细胞内氧化还原状态和细胞外呼吸活性的并行定量检测 | 首次将细胞内氧化还原生物传感器与细胞外氧气传感器集成在一个平台上，实现了对工业酵母氧化应激的实时、非侵入性测量，并揭示了不同酵母的氧化还原-呼吸表型差异 | 未在摘要中明确提及研究限制 | 实现细胞氧化应激的定量评估，需要同时测量细胞内氧化还原状态和细胞外呼吸活性，并开发集成的传感方法 | 工业酵母系统，包括Crabtree阳性酵母和专性呼吸酵母 | 机器学习和生物学交叉应用 | NA | 基因编码氧化还原生物传感器，光学氧传感，荧光成像 | NA | 荧光强度，氧气消耗率 | 两种酵母菌株（具体数量未提及） | NA | 工业酵母（Crabtree阳性酵母和专性呼吸酵母） | 双荧光传感平台，包含roGFP2 Tsa2ΔC氧化还原生物传感器和嵌入式氧传感器 | 生物制造，合成生物学 |
| 44 | 2026-06-30 |
Nitrogenase regulation in Vibrio natriegens differs from other γ-proteobacteria
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728972
PMID:42282805
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研究论文 | 本文研究了固氮弧菌中固氮酶的调控机制，发现其与其他γ-变形菌存在差异 | 首次揭示固氮弧菌中NifA可不依赖NtrBC直接激活固氮酶表达，且P蛋白GlnB和GlnK对NtrBC的冗余抑制更接近非固氮大肠杆菌 | 仅关注NH4与N2条件下的调控，未探索其他环境因素对固氮酶调控的影响 | 阐明固氮弧菌固氮酶的调控网络，为利用廉价氮源生产铵提供基础 | 固氮弧菌中的固氮酶调控蛋白 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学、靶向突变、报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种突变株（如ΔntrBC、ΔglnBΔglnK等） | NA | 固氮弧菌 | 固氮调控通路（NtrBC-NifA固氮酶体系） | 工业生物技术、农业 |
| 45 | 2026-06-30 |
Combinatorial and Inducible CRISPRa/i Enables Canalized hiPSC Forward Programming and Iterative Refinement via Single-Cell Genomics
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.31.729073
PMID:42282825
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研究论文 | 开发了一种名为CIRI的组合型可诱导CRISPRa/i平台，用于人类诱导多能干细胞的前向编程和通过单细胞基因组学的迭代优化 | 在人类诱导多能干细胞中建立了可编程的合成基因调控逻辑，通过模块化RNA适配体实现正交CRISPR激活和干扰，并利用组合双向导RNA的单细胞RNA测序筛选识别肌肉分化成熟的关键调控因子 | NA | 在人类诱导多能干细胞及其衍生细胞中建立可编程的合成基因调控框架，实现前向编程和迭代优化 | 人类诱导多能干细胞、hiPSC来源的心脏类器官、骨骼肌细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPRa/i, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类诱导多能干细胞 | 四环素响应型单导RNA与模块化RNA适配体组合，形成正交CRISPR激活和干扰回路 | 医学, 再生医学 |
| 46 | 2026-06-30 |
CyanoConstruct: simple platform for cyanobacterial expression construct assembly and translational tuning
2026-Feb-16, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-01098-7
PMID:41699564
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研究论文 | 描述了一个名为 CyanoConstruct 的一锅法DNA组装系统，用于在蓝细菌中组装多基因表达质粒并通过核糖体结合位点（RBS）调控翻译 | 提出了一锅法Golden Gate组装系统，结合在线设计工具，简化了蓝细菌中多基因表达质粒的构建和翻译效率的独立调控 | 未提及具体的局限性 | 简化蓝细菌表达构建的组装流程，提高翻译调控的可及性以优化表达 | 蓝细菌Synechocystis sp PCC 6803 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly | NA | NA | 展示了不同两基因和三基因表达构建的组装 | Golden Gate Assembly | Synechocystis sp PCC 6803 | 多基因表达途径，通过RBS调控翻译效率 | 工业生物技术 |
| 47 | 2026-06-30 |
Antimicrobial peptides: emerging next-generation strategy for sustainable plant disease management
2026, Frontiers in antibiotics
DOI:10.3389/frabi.2026.1766594
PMID:41958967
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综述 | 本文综述了抗菌肽作为可持续植物病害管理的新一代策略，重点讨论了其机制、多样性及农业应用潜力 | 系统总结了抗菌肽模拟抗生素的机制、结构与功能多样性，并评估其作为化学农药和抗菌剂环境友好型替代品的可行性 | 标题和摘要中未明确提及局限性 | 评估抗菌肽作为替代化学农药和抗菌剂的潜力，用于可持续植物病害管理 | 抗菌肽，包括植物来源的防御素、硫素、环肽、脂质转移蛋白、snakin和橡胶素样肽，以及微生物来源的细菌素和脂肽 | NA | 植物病害 | 分子生物学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 48 | 2026-06-30 |
Microorganism delivery of cancer vaccines
2025-12-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114288
PMID:41045964
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综述 | 综述微生物介导的癌症疫苗，阐述其与宿主免疫系统的相互作用及抗肿瘤应用 | 综述微生物肿瘤靶向机制及合成生物学在精准表达肿瘤抗原或免疫检查点抑制剂中的应用 | 讨论了微生物癌症疫苗面临的潜在挑战 | 综合介绍微生物癌症疫苗的设计原理、优势及与其它疗法的联合应用 | 微生物（细菌和病毒）及病毒样颗粒在癌症疫苗中的应用 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 病毒 | 微生物癌症疫苗（用于表达肿瘤抗原或免疫检查点抑制剂） | 医学 |
| 49 | 2026-06-30 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-02-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 提出一种名为HEEL的高效酵母文库转化方法，通过热激与电穿孔双重处理提高单转化细胞比例，实现精确的表型-基因型映射 | 首次将热激与电穿孔结合，将单转化细胞比例从20%提升至超过70%，并实现近100倍转化效率提升，结合双条形码及自动化基因分型流程，克服了文库大小与质量之间的长期权衡 | NA | 开发一种高转化效率且能保持高质量单基因型细胞的酵母文库转化方法，促进精确表型-基因型测量，用于改进计算机建模 | 高多样性酵母突变文库 | NA | NA | 热激电穿孔 (HEEL)，Sanger测序 | NA | 基因型数据 | NA | NA | 酿酒酵母 (S. cerevisiae) | NA | 分子生物学, 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 50 | 2026-06-30 |
Expanding the capabilities of MuGENT for large-scale genetic engineering of the fastest-replicating species, Vibrio natriegens
2024-06-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03964-23
PMID:38667341
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研究论文 | 扩展MuGENT技术在快速复制物种Vibrio natriegens大规模基因工程中的应用 | 鉴定中性插入位点并展示两次选择性标记交换方法，首次实现MuGENT用于异位染色体位点的基因插入，开发可靠质粒消除方法，构建280 kb大规模缺失 | 未讨论缺失对细胞生理的影响或长期稳定性 | 提升Vibrio natriegens的基因工程能力，推动其作为合成生物学模型生物的应用 | Vibrio natriegens细菌 | 合成生物学 | NA | MuGENT, 自然转化, 靶向诱变 | NA | NA | NA | MuGENT | Vibrio natriegens | 基因插入回路, 大规模缺失回路 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 51 | 2026-06-29 |
Optimizing Bispecific Antibody Expression via Multi-Omics Analysis and Vector Redesign
2026-Jul, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70228
PMID:42089360
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研究论文 | 通过多组学分析和载体重新设计，优化双特异性抗体在CHO细胞中的表达 | 首次整合多组学分析（RNA测序、剪接预测、密码子优化评估和基序筛选）来识别双特异性抗体低表达机制，并通过靶向工程改造实现11倍表达滴度提升 | 未提及 | 解决双特异性抗体在CHO细胞中表达低下的问题，提供通用框架来改善复杂生物制剂的可制造性 | 三种IgG-scFv格式的双特异性抗体 | 合成生物学，生物信息学 | NA | RNA测序，多组学分析 | NA | 序列数据，表达数据 | 三种双特异性抗体候选分子 | 蛋白质工程，DNA序列工程 | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 52 | 2026-06-29 |
Decoding heavy metal tolerance in rice: Nucleic acid-based technologies shaping global food security
2026-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152693
PMID:42190784
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综述 | 综述了核酸技术在破解水稻重金属耐受性中的应用，从发现到部署的全流程 | 系统梳理了从QTL定位、全基因组关联分析到CRISPR基因组编辑的技术演进，强调了核酸技术在大米重金属治理中的可用方案性质 | 特异性与必需性权衡、多金属拮抗（镉/砷氧化还原冲突）以及国际监管分歧（SDN-1豁免与转基因分类）仍是主要障碍 | 探讨核酸技术如何重塑水稻重金属耐受性的研究与应用流程 | 水稻重金属耐受性机制及低积累品种开发 | 基因组编辑、计算生物学 | 无 | QTL定位、全基因组关联分析、泛基因组学、CRISPR基因组编辑、转录组学、表观基因组学、宏基因组学 | 无 | 基因组数据、转录组数据、表观组数据、宏基因组数据 | 无 | CRISPR-Cas9 | 水稻 | 无 | 农业、食品安全、环境 |
| 53 | 2026-06-29 |
Metabolic Engineering for Biotechnological Production of Bioactive Methylated Flavonoids and Stilbenes: Progress and Perspectives
2026-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05658-1
PMID:41964842
|
综述 | 综述利用代谢工程和合成生物学在微生物中生产甲基化类黄酮和二苯乙烯类化合物的最新进展 | 系统总结了甲基化修饰对类黄酮和二苯乙烯类化合物的生物活性增强作用，以及通过代谢工程策略（如途径优化、SAM再生、酶工程和CRISPR基因编辑）提高产量的方法 | 仍存在酶特异性、代谢瓶颈和下游加工等挑战 | 探讨甲基化修饰对类黄酮和二苯乙烯类化合物的药理学意义，以及利用工程微生物平台可持续规模化生产这些化合物的潜力 | 甲基化类黄酮（如樱花素、金合欢素、异鼠李素）和甲基化二苯乙烯类（如紫檀芪） | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR基因编辑 | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 链霉菌属 | 甲基化代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 54 | 2026-06-29 |
Bioorthogonal chemistry-driven multi-enzyme strategy for efficient terpenoid biosynthesis
2026-Jun-24, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135232
PMID:42341954
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研究论文 | 开发了一种基于生物正交化学的体外多酶级联策略，用于高效合成萜类化合物 | 利用生物正交蛋白质配对技术将六个缩短的甲羟戊酸途径酶组装成有序交联酶复合物，实现了空间有序组织，并展示出模块化设计和通用适用性 | 目前仅测试了β-法尼烯和紫杉二烯两种产物，且仍存在一定酶活性损失（保留62±9%） | 开发一种高效、可重复使用的体外萜类生物合成平台 | β-法尼烯合酶和紫杉二烯合酶相关的多酶级联系统 | 合成生物学 | 不适用 | 生物正交化学、多层荧光标记技术 | 不适用 | 不适用 | 单个实验重复测量8次（n=8） | 生物正交蛋白质配对 | 大肠杆菌 | 有序交联酶复合物（甲羟戊酸途径级联） | 工业生物技术, 医药 |
| 55 | 2026-06-29 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-Jun-23, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 综述了机械互锁肽在自然界中的发现、化学合成进展，并提出了统一命名法以促进合成生物学领域的跨学科研究 | 首次系统比较天然与化学合成的机械互锁肽，提出统一命名法以弥合分子生物学与超分子化学的学科鸿沟 | 未讨论机械互锁肽在实际生物医学应用中的具体挑战，如体内稳定性或靶向递送问题 | 建立机械互锁肽的跨学科综述与命名体系，推动合成生物学中新型互锁肽的生物工程 | 机械互锁肽、机械互锁分子、蛋白大环、DNA索烃 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 机械互锁结构（如索烃、链甲球体） | 医学, 生物技术 |
| 56 | 2026-06-29 |
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Jun-23, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135229
PMID:42336113
|
综述 | 系统综述了氨基酸氧化酶的催化机制、蛋白质工程改造策略及合成应用进展 | 首次全面整合定向进化、理性/半理性设计及AI引导等蛋白质工程策略在氨基酸氧化酶改造中的应用，并系统总结其在化学酶级联反应、多酶级联去消旋化和动力学拆分等拓展合成应用 | 部分新兴蛋白质工程策略（如AI引导方法）的实际应用案例有限，缺乏大规模工业应用验证 | 总结氨基酸氧化酶的催化机制和活性测定方法，阐述蛋白质工程改造策略（包括定向进化、理性/半理性和AI引导方法）及其在合成生物学中的应用进展 | 氨基酸氧化酶（D型和L型） | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质工程, 定向进化, 理性设计, AI引导方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 化学酶级联反应, 多酶级送去消旋化, 动力学拆分 | 制药, 农用化学品, 工业生物技术 |
| 57 | 2026-06-29 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jun-12, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
|
perspective | 提出纳米流体学作为变革性平台，推动自下而上无细胞分子系统合成生物学的发展 | 利用纳米限域效应和精准质量传输，实现分子构建块的有序时空组装，突破传统无细胞系统随机性限制 | NA | 探索纳米流体学在自下而上无细胞分子系统合成生物学中的应用前景 | 纳米流体装置及分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 无细胞分子系统 | 合成生物学 |
| 58 | 2026-06-29 |
Decoding and exploiting intratumoral microbiota: from microenvironment modulation to clinical intervention
2026-Apr-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-11858-z
PMID:42033527
|
综述 | 总结肿瘤内微生物群在肿瘤微环境中的调控作用及其作为临床干预靶点的潜力 | 系统阐述了肿瘤内微生物群调控肿瘤微环境的多重机制，并提出整合空间多组学、合成生物学和纳米技术的精准治疗新范式 | 肿瘤内微生物群时空动态解析不足，与宿主细胞相互作用机制未明确，临床转化安全性和有效性仍存挑战 | 探索肿瘤内微生物群在肿瘤微环境中的调控机制及临床干预策略 | 肿瘤内微生物群、肿瘤微环境中的免疫细胞（如CD8+T细胞、Tregs、MDSCs）和信号通路（如PI3K-AKT、NF-κB） | 数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年病 | NA | NA | NA | NA | 工程细菌、噬菌体疗法、细菌胞外囊泡 | NA | NA | 医学 |
| 59 | 2026-06-29 |
Engineering strategies for the biosynthesis of rare sugars in microbial cell factories
2026-Apr-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04975-1
PMID:42033624
|
综述 | 本文综述了稀有糖类的生理功能、应用及微生物细胞工厂生物合成策略的进展 | 系统整合了代谢工程、酶工程、生物催化和发酵过程优化等多层次工程策略，以提升稀有糖类的生产效率和工业可行性 | 未提供具体实验数据或定量比较，主要依赖文献总结，可能受限于综述时点的研究进展 | 总结稀有糖类在微生物细胞工厂中的生物合成进展，并提出未来发展方向 | 稀有糖类（包括D-阿洛酮糖、D-塔格糖、D-阿洛糖、L-核糖、L-核酮糖和L-木酮糖） | 合成生物学,代谢工程 | NA | 代谢工程,酶工程,生物催化,发酵工艺优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物（如大肠杆菌、酵母等） | 生物合成途径（如稀有糖代谢通路） | 食品,医药,健康相关产业 |
| 60 | 2026-06-29 |
The cancer-microbiome axis: Mechanisms and emerging therapeutic strategies
2026-Apr-16, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-026-01072-1
PMID:41989595
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综述 | 总结癌症-微生物组轴机制及基于微生物调控的治疗策略 | 首次系统整合从粪菌移植到工程微生物等减量策略的转化进展，并探讨其与常规癌症治疗的交互作用 | 粪菌移植存在变异性、标准化及机制不确定性；技术及生物学挑战仍待解决 | 阐明微生物组在癌症发生、进展及治疗响应中的调控机制，并评估基于微生物组的治疗策略 | 人体微生物组（尤其是肠道细菌）与宿主免疫、代谢通路及肿瘤的相互作用 | 数字病理学 | 多种癌症类型 | 测序及功能分析技术 | NA | 微生物组测序及代谢物数据 | NA | 粪菌移植、工程微生物 | 人体肠道微生物组 | 微生物调控回路（如递送免疫调节载荷的工程菌） | 医学 |