合成生物学相关文章
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当前共找到 5201 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-19 |
Engineered suppressor tRNAs enable precise translational control of genetic circuits in E. coli
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag623
PMID:42312487
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研究论文 | 通过工程化携带标准氨基酸的抑制性tRNA，在大肠杆菌中实现遗传电路的精确翻译调控 | 首次系统筛选了20种抑制性tRNA变体，明确了tRNA反密码子与琥珀终止密码子相似性决定翻译通读效率的设计规律，并展示了其在生物传感器和代谢工程中的应用 | 未探讨在多种宿主或复杂环境中的普适性；长期稳定性及脱靶效应未被评估 | 开发用于遗传电路精确正交翻译调控的工程化抑制性tRNA工具 | 大肠杆菌中的抑制性tRNA及其对遗传电路的调控效果 | 合成生物学 | NA | 抑制性tRNA工程化、糖酵解通量动态平衡 | NA | NA | 20种tRNA变体；涉及LacI生物传感器和代谢工程菌株 | 抑制性tRNA | 大肠杆菌 | LacI生物传感器、代谢通路（pykA/pykF调控）用于N-乙酰神经氨酸增产 | 工业生物技术、医学 |
| 42 | 2026-06-19 |
Metabolic engineering strategies for neuroactive postbiotic production: Current progress and perspectives
2026-Jun-06, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107571
PMID:42251865
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综述 | 系统综述了代谢工程与合成生物学策略在神经活性后生元生产中的最新进展，并评估其产业化潜力 | 首次将技术就绪水平评估整合到神经活性后生元生产系统分析中，连接实验室创新与商业实施 | 未提供具体实验数据或定量比较，主要基于文献综述 | 促进神经活性后生元的工业化生产，应用于功能食品、营养保健品和神经治疗领域 | 神经活性后生元（GABA、短链脂肪酸、血清素、多巴胺、吲哚衍生物等）的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢通路优化、调控元件调谐、辅因子平衡 | 医学、食品、工业生物技术 |
| 43 | 2026-06-19 |
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03036-4
PMID:42243878
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 | 强调了多组学技术、合成生物学与生物技术工具在解锁内生真菌生物合成潜力中的整合应用 | 低产量、沉默基因簇及大规模生产困难仍是主要障碍 | 探索药用植物内生真菌作为下一代治疗药物生物工厂的潜力 | 药用植物内生真菌及其产生的次生代谢产物 | NA | NA | OSMAC, 共培养, 表观遗传修饰, 基因组学, 转录组学, 代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 药用植物 | NA | 医药 |
| 44 | 2026-06-19 |
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jun, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01549-8
PMID:41485148
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综述 | 本文综述了除虫菊酯生物合成的最新进展，并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现其可持续生产的可能性 | 将除虫菊酯生产从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新思路，总结了关键酶的发现与异源合成进展 | 异源合成仍面临代谢路径瓶颈和工程技术挑战，具体解决方略尚需进一步验证 | 探索除虫菊酯的异源生物合成途径，并利用工程细胞工厂实现规模化、可持续生产 | 除虫菊酯及其生物合成途径中的关键酶和代谢路径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程微生物、酵母 | 除虫菊酯生物合成途径 | 农业、环境 |
| 45 | 2026-06-19 |
A review on Mitragyna alkaloids pharmacology, biosynthesis and biotechnological insights
2026-Jun, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2026.100710
PMID:42309612
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综述 | 综述九种帽柱木属植物的民族植物学、药理特性、植物化学组成及生物技术方法 | 更新了2022至2024年间九种帽柱木属植物的研究，并全面回顾了其植物生物技术方法及吲哚生物碱的代谢工程和合成生物学进展 | NA | 总结帽柱木属植物的药理特性、生物合成途径及生物技术应用，以促进可持续的药用化合物生产 | 九种帽柱木属植物（美丽帽柱木、多裂帽柱木、托叶帽柱木等）及其次生代谢产物如帽柱木碱、钩藤碱和异钩藤碱 | NA | 心血管疾病、神经系统疾病、消化系统疾病 | 植物生物技术（培养基操控、前体喂饲、植物生长调节、诱导），代谢工程，合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 帽柱木属植物 | 吲哚生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 46 | 2026-06-19 |
Machine learning-assisted single-cell Raman imaging for rapid, sensitive detection and intracellular mapping of carotenoids in plant cell cultures
2026-May-23, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03858-x
PMID:42176120
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研究论文 | 将拉曼成像与多层感知器神经网络结合，用于烟草BY-2细胞中类胡萝卜素的无损、无标记分类和细胞内定位 | 首次结合拉曼成像与神经网络对植物细胞进行基于类胡萝卜素组成的无标记分类，实现活细胞水平的无损检测和代谢物分布成像 | 文中未明确提及局限性，但可能包括神经网络模型对特定拉曼峰特征的依赖以及通用性需要进一步验证 | 开发一种基于拉曼成像与机器学习结合的植物细胞分析平台，以无标记方式分类和定位类胡萝卜素 | 烟草BY-2细胞（野生型与转基因细胞系） | 机器学习 | NA | 拉曼成像, 表面增强拉曼散射（SERS）, 高效液相色谱（HPLC） | 多层感知器神经网络 | 图像 | 涉及野生型和转基因烟草BY-2细胞系，具体样本数量未明确 | NA | 烟草（Nicotiana tabacum）BY-2细胞 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 47 | 2026-06-19 |
Hypergraph learning with multi-dimensional metabolite feature extractions and static-dynamic attention mechanisms to fill missing reactions in metabolic networks
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag314
PMID:42308419
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研究论文 | 提出一种基于超图学习的多维代谢物特征提取与静动态注意力机制方法，用于预测和填补代谢网络中的缺失反应 | 首次结合超图神经网络、多种预训练语言模型和静动态多头注意力机制，实现代谢网络中缺失反应的高精度预测 | 仅在计算层面验证，未在湿实验中对预测的缺失反应进行生物学验证 | 提高基因组规模代谢模型重建质量，自动填补知识空白中的缺失反应 | 108个BiGG数据库中的基因组规模代谢模型及24种细菌的表型数据 | 机器学习 | NA | 超图学习、预训练语言模型、多头注意力机制 | 超图神经网络、有向图神经网络 | 代谢物特征和反应数据 | 108个GEMs和24种细菌生物体 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学、生物制造、生物医学 |
| 48 | 2026-06-19 |
Genetically engineered pig-to-human liver xenotransplantation
2026-Mar, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.044
PMID:41076089
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研究论文 | 本文报道了全球首例基因编辑猪肝向活体人类进行辅助异种移植并存活171天的病例 | 首次在活体人类中进行10基因编辑猪肝辅助异种移植，实现171天存活，并详细记录了异种移植相关血栓性微血管病的免疫学和组织病理学分析 | 患者最终因反复上消化道出血死亡，且移植后38天因xTMA移除辅助肝，长期成功率尚待改进 | 探索基因编辑猪肝作为人类肝移植桥接策略的可行性 | 接受10基因编辑猪肝辅助异种移植的右叶大肝细胞癌患者 | 合成生物学与临床移植 | 肝细胞癌，肝衰竭 | 基因编辑（10个靶向基因编辑） | NA | 临床监测数据 | 1例患者 | CRISPR-Cas9（基于10基因编辑平台） | 猪 | 基因敲除（异种抗原基因）和基因敲入（7个人类免疫和凝血相容性基因） | 医学 |
| 49 | 2026-06-19 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于2325个宏基因组样本，构建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录（CRMC），揭示了维生素合成微生物的路径选择和基因共选择模式 | 首次构建大规模反刍动物胃肠道维生素合成微生物参考基因组目录，发现不同反刍动物宿主间维生素合成微生物存在高度趋同的路径选择和基因共选择模式，且与人类肠道微生物组具有一致性 | 未提及因果关系验证和功能实验验证 | 系统解析反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征和生态分布模式 | 8种反刍动物宿主的2325个宏基因组样本 | 微生物组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本，来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（8种宿主） | NA | 农业, 医学 |
| 50 | 2026-06-19 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-11-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
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研究论文 | 通过将葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶共封装于二氧化硅纳米胶囊内，构建自放大质子生成的类线粒体ATP纳米发生器，实现人工细胞自主能量供应和代谢耦合 | 首次通过定量共封装葡萄糖氧化酶和过氧化氢酶于二氧化硅纳米胶囊中，建立自增强酶级联反应放大质子生成，并结合ATP酶整合脂质体双层涂层，实现高效ATP合成 | 研究主要基于人工细胞模型（巨型单层囊泡），在更复杂细胞环境中长期稳定性和集成效率有待验证 | 构建能够自主供应能量并耦合代谢的人工线粒体，推动自下而上合成生物学发展 | 人工细胞模型中的线粒体模拟ATP纳米发生器 | 合成生物学 | NA | 酶共封装、纳米胶囊合成、ATP酶整合脂质体涂层 | NA | NA | NA | NA | NA | 自增强酶级联反应（葡萄糖氧化酶-过氧化氢酶）驱动的质子梯度，耦合ATP合酶实现ATP合成 | 合成生物学 |
| 51 | 2026-06-19 |
Transforming Crowded Coacervates into Multi-Compartmental Hybrid Microreactors for Practical Enzymatic Catalysis
2025-10-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502479
PMID:40884011
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研究论文 | 提出一种基于Pickering乳液的封装方法，将无膜凝聚层转化为多室混合微反应器，用于高效酶催化 | 首次利用Pickering乳液封装法将无膜凝聚层转化为具有层级分隔结构、分子拥挤环境、选择性渗透能力和机械增强稳定性的多室混合微反应器，实现空间有序调控生物和非生物催化反应，显著提升催化活性、热稳定性和长期耐久性 | 未提及限制，但可能涉及方法的普适性和规模化应用挑战 | 设计构建具有组织复杂性、功能多样性和实际应用性的人工原细胞，用于体外合成生物学和生物工程 | 无膜凝聚层（凝聚层室）和混合微反应器 | 合成生物学 | NA | Pickering乳液封装、脂肪酶催化动力学拆分 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 多室混合微反应器（分级结构、分子拥挤环境、选择性渗透膜） | 医学、工业生物技术 |
| 52 | 2026-06-19 |
From Nano to Quantum: Ethics Through a Lens of Continuity
2025-10-13, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-025-00557-w
PMID:41082020
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评论 | 文章通过连续性视角审视从纳米科技到量子技术的伦理讨论，强调避免重复造轮子 | 将纳米伦理的经验系统应用于量子技术伦理的早期讨论，提出连续性分析框架而非强调新兴技术的独特性 | NA | 探讨如何借鉴过往新兴科学技术的伦理研究经验，指导量子技术伦理讨论 | 纳米科技伦理讨论与量子技术伦理讨论 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2026-06-19 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-10-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
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综述 | 本文综述了拓扑工程引导RNA（TE-gRNA）在实现CRISPR/Cas系统可编程调控中的应用 | 通过设计聚合物、环状和树枝状等拓扑结构，TE-gRNA实现了CRISPR活性的精确空间控制、可逆性和可编程激活，优于传统线性gRNA | TE-gRNA在合成可行性、稳定性及降低脱靶效应方面仍面临挑战，其在大规模应用中表现有待进一步验证 | 探讨拓扑工程引导RNA如何实现对CRISPR/Cas活动的精准时序和条件控制 | 拓扑工程引导RNA（TE-gRNA）及其在CRISPR/Cas系统中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 功能基因组学, 治疗干预 |
| 54 | 2026-06-19 |
Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks
2025-09-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511909
PMID:40776809
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research paper | 提出一种可编程DNA纳米笼策略，用于构建稳定且自适应的合成细胞器网络 | 通过DNA纳米笼模块化设计，实现机械增强的仿生纳米笼，并集成逻辑门控DNA元件作为动态接触位点，实现环境响应性的空间组织与信号重配置 | 当前研究以细胞外囊泡为模型，未来需验证其在其他合成细胞器系统中的普适性与体内应用稳定性 | 构建具有自适应反馈机制的稳定合成细胞器网络 | 细胞外囊泡与四面体DNA框架组装的DNA纳米笼 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、回文杂交链式反应、逻辑门控DNA元件 | NA | NA | NA | DNA纳米笼、回文杂交链式反应 | NA | 逻辑门控DNA元件作为动态接触位点，响应环境信号重配置空间组织与信号传递 | 合成生物学、生物医学、智能材料设计 |
| 55 | 2026-06-19 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-09-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
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研究论文 | 提出一种基于DNA酶的单链DNA辅助双链DNA切口产生的PCR-free定点突变方法 | 首次利用DNA酶在无PCR条件下对重复序列进行定点突变，扩展了DNA酶的底物范围至双链超螺旋质粒，且仅使用未修饰的DNA寡核苷酸，成本低、制备简单 | 该研究对DNA酶在重复序列上的效率与通用性可能仍需更多验证 | 开发一种无PCR的定点突变方法，用于处理包含高重复序列的DNA模板 | 含有PCR不相容重复序列的质粒DNA | 合成生物学 | NA | DNA酶介导的定点突变 | NA | DNA序列 | 使用单个含有重复序列的质粒作为样本 | NA | NA | 单链DNA辅助的DNA酶切口系统（DANDA） | 生物化学与生物技术应用 |
| 56 | 2026-06-19 |
A digital CRISPR-dCas9-based gene remodeling biocomputer programmed by dietary compounds in mammals
2024-10-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.002
PMID:39383861
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研究论文 | 开发了一种由膳食化合物编程的数字CRISPR-dCas9基因重塑生物计算机，用于哺乳动物体内外基因转录调控 | 首次利用白藜芦醇和原儿茶酸作为输入信号，构建了可编程的CRISPR介导基因重塑生物计算机（REPA），实现了对基因抑制和激活的逻辑控制，并建立了预测目标基因转录水平的数学模型 | 未提及具体局限性，但可能包括体内应用的长期稳定性和安全性待验证 | 开发一种基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机，实现精细化的内源基因转录调控，推动基因精准医学发展 | 哺乳动物体外细胞和体内小鼠模型中的内源基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9 | 数学模型 | 基因转录数据 | 体外细胞样本和体内小鼠模型（具体数量未提及） | CRISPR-dCas9 | 哺乳动物细胞，小鼠 | 逻辑门（AND逻辑门），基因抑制与激活逻辑控制回路 | 医学 |
| 57 | 2026-06-19 |
Transcriptional memory formation: Battles between transcription factors and repressive chromatin
2024-10-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.008
PMID:39419001
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研究论文 | 探讨转录记忆形成中转录因子与抑制性染色质的相互作用 | 利用合成生物学方法揭示了转录因子与抑制性染色质在巩固转录记忆中的关键对抗机制 | NA | 理解转录记忆形成的分子机制，特别是转录因子与抑制性染色质之间的动态交互 | 转录因子和抑制性染色质 | 分子生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2026-06-19 |
Systematic identification of transcriptional activator domains from non-transcription factor proteins in plants and yeast
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.12.557247
PMID:37745555
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research paper | 系统鉴定植物和酵母中非转录因子蛋白的转录激活域 | 首次在两种模式真核生物（拟南芥和酿酒酵母）的全蛋白质组中，系统挖掘并实验验证非转录因子蛋白中的转录激活域，发现这些激活域可能具有未知的生物学功能，并鉴定出能在酵母和植物中普遍有效的短激活域 | 仅基于预测工具PADDLE的预测结果进行验证，可能遗漏某些激活域；实验验证仅在酵母中进行，植物中的功能验证有限；未深入探究激活域在非核蛋白中的生理角色 | 揭示非转录因子蛋白中转录激活域的存在和功能，发掘可用于合成生物学的通用遗传元件 | 拟南芥和酿酒酵母中800多个非转录因子基因的18,000个片段 | synthetic biology | NA | PADDLE预测、酵母单杂交实验 | NA | 蛋白质序列数据 | 从超过800个非转录因子基因中选取18,000个片段，在酵母中验证89%的蛋白质含有激活片段 | NA | 酿酒酵母, 拟南芥 | 转录激活域作为遗传元件，未涉及具体电路设计 | synthetic biology |
| 59 | 2026-06-19 |
Optimization-based Eukaryotic Genetic Circuit Design (EuGeneCiD) and modeling (EuGeneCiM) tools: Computational approach to synthetic biology
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103000
PMID:34622181
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研究论文 | 开发基于优化的真核遗传电路设计与建模工具，用于合成生物学应用 | 首次将优化概念应用于真核生物遗传电路设计，并开发了EuGeneCiD和EuGeneCiM两种工具，可有效避免问题设计，加速合成生物学应用开发 | 标题和摘要未明确说明限制 | 开发基于优化的真核遗传电路设计与建模工具，支持合成生物学应用开发 | 30种基本逻辑门遗传电路概念化设计，以及抑制子振荡器电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 30种逻辑门电路概念化，每种数百个设计方案 | NA | 真核生物 | 逻辑门、抑制子振荡器 | 工业生物技术 |
| 60 | 2026-06-18 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-Jun-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
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研究论文 | 开发下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2，用于先进生物制造 | 通过删除毒力相关和非必需基因增强生物安全性，同时保持快速生长和蛋白质表达，并整合多种功能模块（如无DNA微细胞生成、表面展示、蛋白转运） | 可能存在的长期稳定性或大规模生产中的未知挑战 | 开发可编程的细菌底盘用于工业生物制造和生物治疗 | AMAX2底盘及其工程化功能模块 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因工程 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 气单胞菌 | 可诱导系统、表面展示系统、VI型分泌系统、微细胞生成系统 | 工业生物技术, 医药 |