合成生物学相关文章
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当前共找到 3243 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-06-11 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
|
research paper | 利用迭代深度学习设计人类增强子，利用浓缩序列语法实现细胞类型特异性 | 应用迭代深度学习设计合成增强子，实现两种人类细胞系之间的强差异活性，并通过实验验证和模型再优化提高特异性 | 仅针对两种人类细胞系进行研究，未涉及更广泛的细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型的基因表达问题 | 人类增强子序列 | synthetic biology | NA | iterative deep learning | deep learning | sequence data | two human cell lines |
| 42 | 2025-06-11 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
|
研究论文 | 本文描述了三种小分子和两种细胞接触诱导系统在小鼠胚胎干细胞(mESCs)中用于基因表达和分化的特性 | 在小鼠胚胎干细胞中首次详细表征了小分子和细胞接触诱导系统的功能，并展示了这些系统在驱动mESCs直接分化为神经元中的应用 | 现有合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的表征较少 | 研究合成发育生物学方法，以理解多细胞性并控制细胞行为 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成生物学 | NA | 基因表达控制系统 | NA | NA | NA |
| 43 | 2025-06-11 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
research paper | 探讨了无生命物质与生命之间的区别，以及物理学与细胞生物化学之间的紧密耦合如何揭示物质/生命关系 | 结合实验和计算进展，探索物理学与细胞生物化学的深度耦合，为理解物质与生命的关系提供新视角 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建一个活细胞，表明对生命本质的理解仍有限 | 探索物质与生命之间的区别，以及如何通过物理学和生物化学的耦合来理解这一关系 | 生物细胞及其物理和生物化学特性 | systems biology | NA | whole-cell modeling and synthesis | NA | NA | NA |
| 44 | 2025-06-11 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
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研究论文 | 本研究展示了在Komagataella phaffii中通过T7 RNAP/CRISPRa系统构建合成遗传电路的潜力 | 利用T7转录系统有效表达sgRNA，并通过插入tRNA序列增强转录激活效率，设计了能进行布尔逻辑运算的基因电路 | NA | 探索在工业Komagataella phaffii菌株中构建基因调控工具包 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa, T7转录系统, Tet-on诱导系统, split-T7系统, HH-HDV RNA切割处理 | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-06-11 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
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review | 本文系统总结了碱基编辑技术的发展历史、最新进展及其在工业微生物构建中的应用 | 全面概述了多种主要碱基编辑器（如CBEs、ABEs、CRISPR-free碱基编辑器等）及其优化策略，并探讨了其在工业微生物构建中的应用 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 工业微生物（如枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒状杆菌、酿酒酵母等） | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术（如CBEs、ABEs、CGBEs等） | NA | NA | NA |
| 46 | 2025-06-11 |
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204920
PMID:40493005
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研究论文 | 该研究介绍了一套小分子和细胞接触诱导系统，用于控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 | 开发了新的小分子和细胞接触诱导系统，用于模拟发育过程 | NA | 研究发育生物学的原理 | 小鼠胚胎干细胞 | 合成生物学 | NA | 小分子和细胞接触诱导系统 | NA | NA | NA |
| 47 | 2025-06-11 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计具有强细胞类型特异性的合成增强子 | 利用迭代深度学习方法设计合成增强子，实现细胞类型特异性基因表达 | 仅验证了两种人类细胞系中的增强子活性 | 解决合成生物学中靶向特定细胞类型基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | NA | 基因组序列数据 | 两种人类细胞系 |
| 48 | 2025-06-11 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
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综述 | 本文探讨了利用铁硫（Fe-S）酶进行合成生物学的核心挑战及解决方案 | 总结了Fe-S酶在工程代谢途径中的三个核心挑战，并提出了克服这些挑战的方法 | 尚未实现工业规模应用，仍处于研究阶段 | 开发工业级Fe-S酶依赖的生物合成途径 | 铁硫（Fe-S）酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测与设计 | NA | NA | NA |
| 49 | 2025-06-10 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-09, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 本文设计并验证了一个名为pXpressome的工具包，用于稳健表达和纯化α-羧酶体，并研究了其结构和性能的调控 | 开发了pXpressome工具包，能够稳健表达和纯化α-羧酶体，并通过荧光标记构建体观察到更均匀的表达和更好的细胞健康状态 | NA | 促进羧酶体的研究和重新设计，以增强碳固定或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧酶体 | 合成生物学 | NA | 荧光标记 | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-06-10 |
Sensl: a synthetic biology sensor for tracking strigolactone signaling in rice
2025-Jun-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70242
PMID:40484984
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2025-06-10 |
Dynamical mechanisms of growth-feedback effects on adaptive gene circuits
2025-Jun-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89170
PMID:40470804
|
研究论文 | 本文研究了工程基因电路在宿主细胞中的动态机制，特别是生长反馈对电路性能的影响 | 系统研究了400多种拓扑结构，揭示了电路失败的三种动态机制，并发现了一种电路鲁棒性度量与生长反馈强度之间的比例关系 | 研究主要基于计算模拟，需要进一步的实验验证 | 理解基因电路与宿主细胞间的相互作用机制，特别是生长反馈对电路性能的影响 | 工程基因电路的拓扑结构和动态行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控电路 | NA | 计算模拟数据 | 400多种拓扑结构 |
| 52 | 2025-06-10 |
From molecular mechanisms to clinical translation: Silk fibroin-based biomaterials for next-generation wound healing
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144266
PMID:40381758
|
综述 | 本文系统总结了丝素蛋白（SF）及其复合材料在伤口愈合中的制备策略、功能修饰和多维应用机制 | 整合了SF分子机制和材料设计的最新进展，并强调其在精准医学中的潜力，如开发基因工程SF用于定制免疫调节网络 | 当前SF材料开发面临的挑战包括机械稳定性、降解可控性以及大规模生产的标准化 | 开发高效、多功能且可临床转化的SF基材料用于伤口愈合 | 丝素蛋白（SF）及其复合材料 | 生物材料 | 伤口愈合 | 3D生物打印和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 53 | 2025-06-10 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-May-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
|
研究论文 | 本文揭示了Burkholderia pseudomallei病原体毒力因子malleicyprol中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 首次阐明通过两个聚酮链的头对头融合和还原环化构建丁烯内酯核心的非经典生物合成途径 | NA | 解析malleicyprol毒力因子中丁烯内酯核心的生物合成机制 | Burkholderia pseudomallei病原体的毒力因子malleicyprol | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学合成、体外生物转化重构、突变分析、生化测定 | NA | 实验数据 | NA |
| 54 | 2025-06-10 |
Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies
2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04342-6
PMID:40289223
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综述 | 本文综述了利用耐盐微生物和先进技术修复盐渍土壤的创新策略 | 整合耐盐微生物与基因组编辑、合成生物学、高级组学工具及数字技术（如机器学习和AI）以优化土壤修复过程 | 需要未来研究协调这些技术和方法，以最大化植物-微生物相互作用并建立可持续农业系统 | 缓解盐分胁迫，修复盐渍土壤，保障粮食安全 | 耐盐微生物及其与植物的协同作用 | 农业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9、合成生物学、宏基因组学、宏转录组学、微生物挥发性有机化合物(mVOCs)、纳米技术 | NA | NA | NA |
| 55 | 2025-06-10 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-10-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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review | 本文全面综述了蛇毒研究中的尖端技术进展，重点关注蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 介绍了合成生物学和多组学方法（统称为毒液组学）在蛇毒研究中的革命性应用，为毒液功能及其治疗潜力提供了更深入的见解 | 毒素功能表征和成本效益抗蛇毒血清开发等挑战仍然存在 | 探索蛇毒的分子组成、进化驱动力及其生物医学应用潜力 | 蛇毒及其毒素 | 生物医学研究 | NA | 蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 生物信息学, 合成生物学, 多组学方法, 冷冻电子显微镜 | NA | 分子数据 | NA |
| 56 | 2025-06-10 |
Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543915
PMID:37333159
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research paper | 研究工程基因回路在宿主细胞中整合时，由于回路与宿主相互作用（如生长反馈）导致的动态失败机制及其拓扑结构的韧性 | 系统地研究了四百多种拓扑结构，识别了三类回路失败的动态机制，并发现了一种回路稳健性度量与生长反馈强度之间的比例关系 | 仅关注了转录调控回路中的适应性问题，未涉及其他类型的基因回路或更复杂的宿主环境 | 理解工程基因回路在宿主细胞中整合时的动态行为，识别对生长反馈具有韧性的拓扑结构 | 工程基因回路及其在宿主细胞中的整合 | synthetic biology | NA | transcriptional regulation circuits | NA | NA | over four hundred topological structures |
| 57 | 2025-06-10 |
Protocol for in vitro phospholipid synthesis combining fatty acid synthesis and cell-free gene expression
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103051
PMID:38700978
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研究论文 | 本文提出了一种体外合成和定量磷脂的协议 | 结合脂肪酸合成和无细胞基因表达系统在体外合成磷脂 | 未提及该协议在不同条件下的适用性或效率问题 | 开发一种体外合成和定量磷脂的方法 | 磷脂 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-质谱联用技术(LC-MS) | NA | NA | NA |
| 58 | 2025-06-09 |
Biotechnological approaches for the production of neuroactive huperzine A
2025-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.04.020
PMID:40311807
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综述 | 本文综述了石杉碱甲（HupA）的神经保护特性及其在治疗神经退行性疾病中的潜力，并探讨了提高HupA产量的生物技术策略 | 强调了HupA在神经退行性疾病治疗中的多靶点潜力，并讨论了通过生物技术方法提高HupA产量的最新进展 | HupA生物合成途径中的知识空白仍需填补，以实现经济高效且可持续的生产方法 | 探讨HupA的神经保护作用及其在神经退行性疾病治疗中的应用，以及提高其产量的生物技术策略 | 石杉碱甲（HupA）及其在神经退行性疾病治疗中的应用 | 生物技术 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化症、癫痫、重症肌无力 | 化学合成、微生物发酵、植物组织培养、合成生物学 | NA | 文献调查数据（体外、体内及临床研究数据） | NA |
| 59 | 2025-06-09 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路，用于在原始细胞与活细胞群落中实现自我调节的双向通信 | 开发了一种包含识别模块、激活模块和反馈模块的DNA电路，使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号来自主调节与活细胞的相互作用 | NA | 开发合成生物学工具以控制细胞间信号传导，从而编程所需的细胞行为 | 原始细胞与活细胞群落的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |
| 60 | 2025-06-09 |
QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion
2025-Jun-06, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202500817
PMID:40296212
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研究论文 | 本研究通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白在亚硝酸盐还原过程中的催化机制 | 揭示了活性位点结构重组对亚硝酸盐还原机制的关键调控作用，特别是氢键网络变化和HONO中间体配位转换的影响 | 研究主要基于计算模拟，需要后续实验验证 | 阐明YtfE蛋白催化亚硝酸盐还原的分子机制 | 大肠杆菌铁中心修复蛋白(YtfE) | 计算生物学 | NA | QM/MM, QM/MM MD, QM计算 | NA | 计算模拟数据 | NA |