本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-31 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
|
研究论文 | 通过基因可用性的可编程时序控制实现生物传感器电路中的数字切换 | 利用位点特异性重组酶通过可编程时序控制多基因电路中基因可用性,显著降低传感器基础状态泄漏 | NA | 通过时序控制基因可用性改善合成生物学基因电路的稳健部署 | 内源性microRNA比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 位点特异性重组酶 | 细胞(具体类型未指定) | 比例传感器生物电路,具有可编程时序控制的基因可用性设计 | 医学诊断 |
| 42 | 2025-10-30 |
An efficient CRISPR-Cas12a tool for iterative genome editing, streamlined minimization, and payload engineering of Pseudomonas phage S1
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.09.019
PMID:41141487
|
研究论文 | 开发了一种用于假单胞菌噬菌体S1的高效CRISPR-Cas12a基因组编辑工具 | 实现了近乎完全效率的基因编辑,完成了噬菌体领域最大的基因组缩减(13.9 kb) | NA | 推进噬菌体生物技术和治疗开发 | 假单胞菌噬菌体vB_PaeM_SCUT-S1 (S1) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 假单胞菌噬菌体 | 双质粒系统,支持基因删除、点突变、基因插入和替换 | 医药, 工业生物技术 |
| 43 | 2025-10-30 |
Expanding the biocatalytic and oxidative landscape of the old yellow enzyme family
2025-Nov, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70363
PMID:41158077
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和合成生物学技术,系统探索了古老黄色酶家族的自然多样性,显著扩展了其生物催化和氧化功能 | 发现了古老黄色酶家族成员在常温条件下广泛存在的反向氧化化学反应,并鉴定出具有增强催化活性或改变立体选择性的新型酶 | 仅对约115,000个家族成员中的118个酶进行了实验表征,大部分成员仍未探索 | 系统探索古老黄色酶家族的生物催化多样性并发现新型高效生物催化剂 | 古老黄色酶家族的115,000多个成员 | 合成生物学 | NA | 蛋白质相似性网络分析,生物信息学,合成生物学 | NA | 蛋白质序列数据,晶体结构数据 | >115,000个古老黄色酶家族成员,其中118个进行了实验表征 | NA | NA | NA | 工业生物技术,医药 |
| 44 | 2025-10-30 |
Gene silencing regulated by aggregates of Corn aptamer at 3' UTR of mRNA
2025-Oct-28, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00510h
PMID:41148632
|
研究论文 | 开发了一种通过在mRNA 3' UTR引入核酸自组装模块实现基因沉默的新策略 | 首次在mRNA 3' UTR引入核酸自组装模块形成RNA聚集体实现基因沉默,可构建多维转录后调控网络 | NA | 开发新型基因沉默技术并研究其调控机制 | 真核细胞中的mRNA翻译效率调控 | 合成生物学 | NA | 核酸自组装技术 | NA | mRNA和蛋白质表达水平数据 | NA | NA | 真核细胞 | 3' UTR自组装模块与5' UTR元件(如TOP序列)组合的多维转录后调控网络 | 医学 |
| 45 | 2025-10-30 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-Oct-28, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
|
观点论文 | 提出新的生物分类概念以解决水平基因转移带来的分类挑战 | 引入epaktovars(表型趋同但独立获得相似功能的生物群)和xenotypes(通过水平基因转移共享同源基因的生物)两个互补概念 | NA | 为描述非严格树状进化历史的生物建立分类框架 | 具有水平基因转移和趋同进化特征的生物体 | 进化生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 灭绝物种重建 |
| 46 | 2025-10-30 |
A Lactose-Based Kluyveromyces lactis Cell-Free Protein Synthesis System
2025-Oct-23, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00011
PMID:41158605
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸克鲁维酵母的无细胞蛋白质合成平台,使用乳糖作为可持续碳源和能源 | 首次将乳糖作为碳源和能源整合到克鲁维酵母无细胞蛋白质合成系统中,并采用半自动化实验设计方法优化反应条件 | 仅验证了两种模型蛋白的合成效果,需要进一步测试更多蛋白质类型 | 开发可持续且经济高效的酵母无细胞蛋白质合成平台 | 乳酸克鲁维酵母无细胞提取物和蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、实验设计(DoE)、拉丁超立方实验设计 | NA | 蛋白质合成产量数据 | 测试了128种独特的CFPS反应混合物组成 | NA | Kluyveromyces lactis(乳酸克鲁维酵母) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 47 | 2025-10-30 |
Screening and machine learning-based prediction of translation-enhancing peptides that reduce ribosomal stalling in Escherichia coli
2025-Oct-22, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00199d
PMID:41142649
|
研究论文 | 本研究通过筛选和机器学习预测能够减少大肠杆菌核糖体停滞的翻译增强肽 | 首次系统筛选翻译增强肽并开发机器学习模型预测其活性 | 研究主要针对SecM停滞肽,对其他类型停滞肽的适用性需要进一步验证 | 开发能够缓解核糖体停滞的翻译增强肽工具 | 人工四肽库和SecM停滞肽诱导的翻译停滞系统 | 机器学习 | NA | 随机森林算法,翻译分析 | 随机森林 | 肽序列数据和翻译活性数据 | 随机人工四肽库 | NA | 大肠杆菌 | 翻译增强肽工具包 | 合成生物学 |
| 48 | 2025-10-30 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-Sep-23, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
|
综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为光合作用底盘在可持续生物生产中的应用进展、挑战与前景 | 系统总结了利用合成生物学技术改造三角褐指藻生产天然和异源化合物的最新策略,包括细胞器基因表达和DNA定点整合等新兴技术 | 存在产物产量不理想、生物量限制和生产成本过高等制约工业化应用的挑战 | 探讨三角褐指藻从模式硅藻向可扩展、环保生物制造平台的转型路径 | 海洋硅藻三角褐指藻及其遗传改造体系 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、高效转化系统、转基因元件优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻 | 代谢途径工程、底盘优化 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 49 | 2025-10-30 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
|
研究论文 | 评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的影响 | 首次系统评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的协同促进作用,并通过转录组测序揭示其分子机制 | 仅使用纯葡萄糖和木糖作为碳源,未验证其他碳源或实际工业原料的效果 | 探究锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的促进效果及机制 | 土曲霉(Aspergillus terreus)及其衣康酸发酵过程 | 工业生物技术 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据、发酵性能数据 | NA | 合成生物学工具 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 衣康酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 50 | 2025-10-30 |
Innovative approaches in bioremediation: the role of halophilic microorganisms in mitigating hydrocarbons, toxic metals, and microplastics in hypersaline environments
2025-Aug-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02817-7
PMID:40804729
|
综述 | 本文综述了嗜盐微生物在高盐环境中修复碳氢化合物、有毒金属和微塑料污染的作用及生物技术应用 | 系统阐述嗜盐微生物在极端环境生物修复中的独特优势,并整合基因编辑和合成生物学等前沿技术改造嗜盐微生物 | 基因工程菌株优化、生物安全性保障、微生物生态理解以及规模化应用的成本与监管问题仍需解决 | 探讨嗜盐微生物在高盐环境污染物生物修复中的应用潜力与挑战 | 嗜盐和耐盐微生物及其对污染物的降解能力 | 环境生物技术 | NA | 基因编辑、重组DNA技术、组学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 重组DNA技术 | 嗜盐微生物 | 污染物降解代谢通路 | 环境 |
| 51 | 2025-10-30 |
From single cells to communities: Mathematical perspectives on bacterial quorum sensing
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.09.030
PMID:41142755
|
综述 | 本文从数学角度综述细菌群体感应的建模方法及其应用前景 | 系统整合了从单细胞到群体水平的多种数学建模框架,并展望了在合成生物学和抗菌治疗等领域的应用潜力 | 未涉及具体的实验验证数据,主要聚焦于理论模型框架的讨论 | 探讨数学建模在理解细菌群体感应动力学中的作用 | 细菌群体感应机制及其数学建模方法 | 计算生物学 | NA | 数学建模 | 确定性模型、随机模型、空间模型 | 理论模型 | NA | NA | 细菌 | 群体感应系统 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 52 | 2025-10-30 |
Advances in yeast synthetic biology for human G protein-coupled receptor biology and pharmacology
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103176
PMID:39079313
|
综述 | 回顾酵母合成生物学在推动G蛋白偶联受体(GPCR)研究和药物开发方面的最新进展 | 利用酵母合成生物学技术为GPCR研究提供新的概念突破和技术创新 | NA | 解决GPCR信号传导、药理学和结构生物学研究中的挑战 | 人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学, 生物技术 |
| 53 | 2025-10-29 |
Actin Polymerizing Motors to Assist Cytoskeleton-like Networks Formation in Artificial Cells
2025-Oct-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12624
PMID:41100205
|
研究论文 | 本研究利用肌动蛋白聚合纳米马达辅助人工细胞内细胞骨架网络的形成 | 首次将肌动蛋白聚合纳米马达与人工细胞结合,模仿细菌运动机制实现主动推进 | NA | 开发能够模拟生物细胞机械响应功能的人工细胞系统 | 人工细胞和肌动蛋白聚合纳米马达 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白聚合反应、哺乳动物细胞裂解液环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 肌动蛋白丝聚合形成细胞骨架样网络 | 医学, 生物技术 |
| 54 | 2025-10-29 |
Bacillus velezensis LoaP promotes antitermination by antagonizing NusA
2025-Oct-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01429-25
PMID:41147751
|
研究论文 | 本研究揭示了Bacillus velezensis中LoaP蛋白通过特异性拮抗NusA实现抗终止的分子机制 | 首次发现LoaP类NusG旁系同源物通过特异性拮抗NusA实现抗终止,机制与已知的RfaH范式显著不同 | 研究仅针对革兰氏阳性细菌,未涉及其他NusG旁系同源物的作用机制 | 阐明LoaP蛋白在转录抗终止中的分子机制 | Bacillellus velezensis LoaP蛋白及其与转录复合物的相互作用 | 分子生物学 | NA | RNA聚合酶纯化、转录因子重构、体外转录分析 | NA | 生化实验数据 | NA | NA | Bacillus velezensis | NA | 合成生物学、天然产物发现 |
| 55 | 2025-10-29 |
Specialized Pro-Resolving Mediator Loaded Extracellular Vesicles Mitigate Pulmonary Inflammation
2025-Oct-22, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 开发了一种基于合成生物学的策略,将促消退脂质介质加载到细胞外囊泡中,用于减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法在HEK293T细胞中共同表达多种酶,生产并包装促消退介质到细胞外囊泡中 | 未评估长期安全性和在其他炎症模型中的效果 | 开发装载促消退介质的细胞外囊泡用于炎症治疗 | 细胞外囊泡、促消退脂质介质、炎症反应 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体构建、细胞转染、脂质介质分析 | NA | 细胞实验数据、动物模型数据 | HEK293T细胞、THP-1巨噬细胞、LPS处理的小鼠 | 多基因表达载体 | HEK293T细胞 | 共同表达COX-2、5-LOX和15-LOX酶的代谢通路,用于合成Resolvin D和E系列介质 | 医学 |
| 56 | 2025-10-29 |
Illuminating the dark majority: photobiology of nonphotosynthetic bacteria
2025-Oct-20, Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s43630-025-00789-6
PMID:41114917
|
综述 | 探讨非光合细菌通过光感受器介导的光诱导生理响应机制 | 首次系统阐述非光合细菌利用光作为环境信号的三类核心生理响应机制 | NA | 揭示非光合细菌的光生物学特性及其应用潜力 | 非光合细菌的光感受器与光响应机制 | 微生物光生物学 | NA | NA | NA | 文献综述数据 | NA | 合成生物学 | 非光合细菌 | 光感受器信号转导通路 | 抗菌治疗, 合成生物学, 环境生物技术 |
| 57 | 2025-10-28 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-Oct-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
|
综述 | 本文综述紫杉烷生物合成途径解析及通过合成生物学策略开发可持续生产方法的研究进展 | 提出整合酶工程、代谢工程和人工智能引导的定向进化等策略,构建新型紫杉烷衍生物库 | 仅I型紫杉烷骨架生物合成途径接近完全解析,其他类型骨架途径仍不明确 | 阐明多种紫杉烷骨架生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类二萜天然产物及其生物合成酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因回路、人工智能引导定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢途径工程、基因回路 | 医药 |
| 58 | 2025-10-26 |
Survival by Design: The BWC's Autopoietic Response at Fifty to a Disaggregated Biosecurity Ecosystem
2025 Sep-Oct, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094251381803
PMID:41043961
|
评论 | 本文分析《禁止生物武器公约》在日益复杂的全球生物安全生态系统中保持韧性的适应策略 | 将BWC概念化为自创生子系统,提出通过科学技术机制作为结构耦合装置来应对新兴生物技术挑战 | NA | 探讨BWC在生物技术快速发展背景下的适应性和有效性 | 《禁止生物武器公约》及其制度框架 | NA | NA | 合成生物学、生物信息学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2025-10-24 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
|
研究论文 | 开发了一种名为MOSAIC的高效一步法重组工程方法,用于质粒编辑和多样化 | 使用单链DNA退火蛋白CspRecT实现高达90%的单靶点编辑效率,并能一次性在质粒四个不同区域生成组合质粒文库 | NA | 开发高效质粒编辑和组合质粒文库构建方法 | 质粒编辑和质粒文库构建 | 合成生物学 | NA | 重组工程,纳米孔测序 | NA | DNA序列数据 | NA | 重组工程,CspRecT | NA | 质粒编辑和多样化 | 分子生物学,合成生物学 |
| 60 | 2025-10-24 |
Broad-Host-Range Synthetic Biology: Rethinking Microbial Chassis as a Design Variable
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00308
PMID:40964802
|
观点文章 | 本文探讨广宿主范围合成生物学如何将微生物宿主选择重新定义为设计变量 | 将宿主选择视为关键设计参数而非障碍,强调通过利用微生物多样性扩展生物技术设计空间 | NA | 重新定义微生物宿主在遗传设计中的作用 | 微生物宿主和工程遗传构建体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 模块化载体, 宿主无关遗传设备 | 多种微生物宿主 | 资源分配, 代谢相互作用, 调控串扰 | 生物制造, 环境修复, 治疗 |