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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-05-30 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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research paper | 该研究提出了一种多层自催化反馈策略,用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 利用多层反馈策略实现群体水平的积分反馈和多细胞积分器,控制功能通过不同细胞群体间的协调互动实现 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和复杂环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和多细胞系统 | synthetic biology | NA | autocatalytic integral feedback controllers | multilayer feedback controller | NA | NA |
42 | 2025-05-30 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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research paper | 该研究揭示了酒精依赖性半萜途径的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 揭示了ADH模块第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | NA | 探索和扩展异戊二烯生物合成的化学空间 | 酒精依赖性半萜途径及其酶 | 合成生物学 | NA | ADH途径 | NA | NA | NA |
43 | 2025-05-30 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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research paper | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包,用于高效且适应性强的Wolfiporia cocos遗传修饰 | 该工具包显著提高了转化效率,支持多基因整合,并通过鸡尾酒式组装多个基因到转座子中,避免了复杂的遗传电路组装 | 研究仅限于Wolfiporia cocos,未在其他真菌菌株中验证其普适性 | 开发高效且适应性强的真菌基因组工程工具包 | Wolfiporia cocos真菌菌株 | 合成生物学 | NA | 转座子工程 | NA | 基因组数据 | NA |
44 | 2025-05-30 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的稳健性及其基本性能权衡 | 提出了一个理论框架来量化生物反馈的准确性和稳健性,并使用多目标优化方法研究其性能权衡 | 仅研究了五种特定的生物反馈电路,可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 提高对生物反馈调控的理解,并为合成生物学中的稳健电路设计提供指导 | 五种生物反馈电路:正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈(切换开关) | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
45 | 2025-05-30 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 该研究利用新发现的转录后调控机制,设计了一种基于CsrA蛋白浓度的生物后转录带通滤波器 | 利用CsrA蛋白与mRNA 5' UTR + 100 nt CDS序列的异质性相互作用,实现了基于浓度的转录后调控,减少了合成电路组件的数量 | 需要进一步表征天然调控RNA-蛋白质系统以开发更复杂的RNP基电路 | 设计合成生物学中的转录后调控电路 | mRNA转录本和CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA |
46 | 2025-05-30 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株的高产无细胞蛋白质合成系统,用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因,开发了无需额外添加T7 RNA聚合酶的高产CFPS系统,并实现了半连续反应模式下超过1100 μg/mL的蛋白质产量 | NA | 开发高产无细胞蛋白质合成系统,用于合成生物学和生物技术应用 | Bacillus subtilis 164T7P菌株及其无细胞提取物 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS) | NA | NA | NA |
47 | 2025-05-29 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 本研究提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 采用高速激光诱导微射流技术可靠且可重复地生成细胞大小脂质体,实现了按需生产 | NA | 开发一种新型的细胞大小脂质体生成方法,推动膜科学和合成生物学领域的发展 | 细胞大小脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像技术、数值分析 | NA | 视频数据(高速摄像)、数值模拟数据 | NA |
48 | 2025-05-29 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-May-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
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研究论文 | 本研究开发了一种新型CRISPR/dCas介导的反沉默(CRISPRcosi)方法,通过使用无核酸酶活性的dCas酶来对抗Lsr2样异源沉默蛋白CgpS或Lsr2 | 提出CRISPRcosi方法,无需启动子工程即可有效反沉默异源沉默蛋白的靶启动子 | 在缺乏异源沉默蛋白CgpS的菌株中,反沉默效果因靶位点和链的不同而有所差异 | 研究如何通过CRISPR/dCas技术对抗异源沉默蛋白的抑制作用 | Lsr2样异源沉默蛋白CgpS和Lsr2 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas | NA | 基因组数据 | NA |
49 | 2025-05-29 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过基因剂量优化、表达盒设计和内质网分泌途径重编程三种策略优化了Pichia pastoris中scFv的分泌效率 | 挑战了结构同源性(63%氨基酸同一性;RMSD 0.47 Å)确保一致优化结果的假设,强调了合成生物学中蛋白质定制工程策略的必要性 | 研究仅针对两种scFv变体PR961和PR953,可能不适用于其他蛋白质 | 优化Pichia pastoris中scFv的分泌效率,以支持AI驱动的生物制剂制造 | 两种结构同源但基础分泌水平不同的scFv变体PR961和PR953 | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌途径重编程 | NA | 蛋白质分泌数据 | 两种scFv变体PR961和PR953 |
50 | 2025-05-29 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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研究论文 | 通过转录组学和代谢组学分析,研究了濒危植物Neopicrorhiza scrophulariiflora中三萜类化合物的生物合成途径及其关键酶编码基因的表达模式 | 鉴定了8个参与三萜类生物合成的上游氧化鲨烯环化酶(OSCs),其中NsOSC2是一种双功能酶,能够催化2,3-氧化鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇 | NA | 揭示三萜类生物合成的分子机制,为未来通过合成生物学方法生产关键三萜类化合物提供理论基础 | 濒危多年生草本植物Neopicrorhiza scrophulariiflora | 植物分子生物学 | NA | 转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | 不同组织样本 |
51 | 2025-05-29 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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research paper | 本文提出了一种改进的细菌转化实验设计(Griffith transformation experiment design 2.0),旨在实现DNA和非DNA结构与调控信息的高效交换,从而创造出具有显著形态/代谢表型差异的单细胞杂交微生物 | 提出了Griffith转化实验设计2.0,扩展了传统DNA转移的局限,整合了DNA、大分子、拓扑、调控和细胞遗传等多维度信息交换 | 该方法仍处于理论建议阶段,尚未经过实验验证,且跨物种应用可能仍存在兼容性挑战 | 探索通过改进细菌转化方法创建新型杂交微生物的可行性 | 细菌细胞(特别是(S)和(R)血清型的供体与受体细胞) | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验(Griffith transformation experiment) | NA | NA | NA |
52 | 2025-05-29 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新策略和进展,重点关注合成生物学方法 | 探讨了合成生物学在倍半萜醇微生物生产中的创新方法,包括适应性酶筛选、合成途径调控和细胞内区室化表达策略 | 面临产量低和生产成本高的挑战,阻碍了其工业化规模应用 | 推进倍半萜醇生物合成研究,解决当前生产中的关键挑战 | 倍半萜醇及其微生物生产系统 | 合成生物学 | NA | 微生物异源合成 | NA | NA | NA |
53 | 2025-05-29 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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review | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染中的作用 | 讨论了生物类似物开发中的障碍及创新技术,如抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成 | 未提及具体研究样本或数据 | 探讨生物类似物在治疗感染性疾病中的潜力和挑战 | 细菌、真菌、寄生虫和病毒等病原体 | NA | infectious diseases | antibody engineering, synthetic biology, cell-free protein synthesis | NA | NA | NA |
54 | 2025-05-29 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-Apr-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
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综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 探讨了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制,并加速基因组编辑过程 | 讨论了双生病毒载体应用中的障碍和挑战 | 评估双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用前景 | 植物基因组编辑中的双生病毒载体 | 合成生物学 | NA | 基因靶向/插入技术 | NA | NA | NA |
55 | 2025-05-29 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究通过工程化酿酒酵母应用多种策略增强甲基对羟基苯甲酸酯的合成 | 通过代谢工程策略突破合成过程中的瓶颈,包括调控内源莽草酸途径的限速步骤、增强中心碳通量以及改善外源酶表达 | NA | 开发一种环境友好的甲基对羟基苯甲酸酯合成方法 | 工程化酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程 | NA | NA | NA |
56 | 2025-05-29 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 本文通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器,实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 未提及具体应用场景或体内实验验证 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液-液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA |
57 | 2025-05-29 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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research paper | 该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计,提高活性、特异性和免疫原性预测 | 未提及具体实验验证结果或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | synthetic biology | NA | AI/ML, rational design, mutagenesis screens, directed evolution | machine learning models | biological sequence data | NA |
58 | 2025-05-29 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了利用CRISPR基因工具包提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能的最新进展 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的应用,包括基因编辑、转录调控和酶调节等方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能,使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
59 | 2025-05-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其非天然衍生物颜色谱的策略 | 天然色素的稳定性、颜色谱有限以及从自然资源中提取的低产量问题尚未完全解决 | 探索利用合成生物学方法生产天然色素及其非天然衍生物的策略 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
60 | 2025-05-29 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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research paper | 本研究开发了一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的抗终止微生物全细胞生物传感器,用于检测小鼠结肠炎 | 利用抗终止元件设计硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子,优化了生物传感器对炎症环境中硝酸盐和亚硝酸盐的敏感性和特异性响应 | 研究仅在小鼠模型中进行初步评估,尚未在人体中进行验证 | 开发一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的生物传感器,用于体内诊断结肠炎 | Bacteroides thetaiotaomicron和小鼠溃疡性结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 合成生物学技术、微生物全细胞生物传感器 | 微生物全细胞生物传感器(MWCB) | 生物传感器响应数据 | 化学诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型 |