合成生物学相关文章
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当前共找到 5121 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-09 |
A yeast-based platform for etoposide production via yatein bioconversion
2026-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2026.e00280
PMID:42255528
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研究论文 | 建立基于酵母的依托泊苷生产平台，通过亚铁素生物转化实现可持续生产 | 首次在酵母中重构完整的亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源途径，结合途径重构、基因拷贝数优化和辅酶匹配性改造，并成功将生物生产与下游半合成转化衔接 | 依赖植物资源提供前体亚铁素，且酵母生产效率和规模化仍需进一步优化 | 开发依托泊苷中间体的可持续生物制造路径，替代传统植物提取方法 | 酿酒酵母细胞工厂、鬼臼类植物中的亚铁素前体 | 合成生物学 | 固体肿瘤、血液恶性肿瘤 | 途径重构、基因拷贝数优化、辅酶匹配性改造、发酵工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 亚铁素到(-)-4'-去甲基表鬼臼毒素的异源代谢途径 | 医药 |
| 42 | 2026-06-09 |
Degradation dynamics: an insight into microbial interactions with explosive compounds
2026-May-10, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10299-6
PMID:42107032
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综述 | 探讨爆炸物化合物与微生物相互作用的降解动力学 | 将生物组学和合成生物学工具（如CRISPR/Cas系统）应用于工程化高活性微生物菌株，以研究爆炸物降解 | 未明确说明具体局限性，但仅提供研究现状概述 | 概述爆炸物化合物降解动力学的研究现状 | 爆炸物化合物（如硝胺、硝基取代芳香族、苦味酸、TETRYL、HEXYL、脂肪族、RDX等）及微生物（细菌和真菌） | NA | NA | 生物组学、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌，真菌 | NA | 环境 |
| 43 | 2026-06-09 |
Protein coacervation-driven active forces power protocell dynamics
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71593-8
PMID:41946707
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研究论文 | 开发一种温度响应的弹性蛋白原细胞模型，展示蛋白质凝聚驱动的主动力生成及力学放大机制 | 首次证明蛋白质凝聚物可以独立于ATP驱动马达产生主动力，并通过交联弹性蛋白膜放大皮牛级力量以实现大规模机械工作 | 未明确讨论模型在生物体内环境中的稳定性和长期应用潜力 | 探索蛋白质液-液相分离凝聚物作为主动力发生器的力学协调与缩放机制 | 温度响应的弹性蛋白原细胞模型中的蛋白质凝聚动力学 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离、弹性蛋白交联 | 数学模型 | 实验数据与模拟数据 | NA | NA | NA | 温度调控收缩性与力捕获的蛋白质凝聚回路 | 合成生物学、生物材料、下一代软体机器人 |
| 44 | 2026-06-09 |
Application of Biotechnology in Marine-Derived Fermented Foods: Technological Evolution and Future Prospects
2026-03, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70422
PMID:41693674
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综述 | 综述现代生物技术在海洋源发酵食品中的应用，包括技术演进和未来展望 | 系统总结了微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术和智能发酵控制等现代生物技术在海洋发酵食品中的研究轨迹和应用进展，并比较了新型生物技术与传统发酵技术的差异 | 讨论了生物技术在海洋源发酵食品中应用的挑战和局限性 | 评估现代生物技术在海洋源发酵食品风味和品质精准调控、营养价值定向提升及安全性改善方面的关键作用 | 海洋源发酵食品（包括鱼类、甲壳类、贝类和大型藻类等海洋生物资源） | 机器学习 | NA | 微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术、智能发酵控制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 鱼类、甲壳类、贝类、大型藻类 | 代谢通路、生物传感器 | 食品、工业生物技术 |
| 45 | 2026-06-09 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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research paper | 开发了一种名为Ouroborosyn-ssDNA的机器学习优化长单链DNA合成技术，实现了高纯度、均一性长ssDNA的高效生产，并应用于活细胞中的精准诊疗整合 | 通过机器学习指导参数优化，识别镁离子动态和热调节是酶效率的关键决定因素，并结合固相合成与自动化磁珠纯化系统，实现了高达15,000 nt长ssDNA的合成，产量提升4.73倍 | 固相合成的硫醇-金固定模板纯化回收率为86.38%，仍有提升空间；实验仅在宫颈癌细胞中验证，需在更广泛的生物系统中测试 | 克服当前长单链DNA合成技术在纯度和均一性方面的关键限制，推动DNA纳米技术从概念验证向标准化生物制造发展 | 长单链DNA合成技术及其在活细胞中的诊断治疗整合应用 | 合成生物学、纳米医学、分子数据存储 | 宫颈癌 | NEAR平台、phi29 DNA聚合酶、Nb.BbvCI切口酶、机器学习、固体合成、CRISPR | 机器学习优化模型 | NA | 宫颈癌细胞 | CRISPR-Cas9 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物，用于核仁靶向基因组编辑，结合GFP诊断与E7癌基因破坏 | 医学 |
| 46 | 2026-06-08 |
Recent advances and challenges in the biomanufacturing of L-homoserine as a versatile C4 platform chemical
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108880
PMID:41921584
|
综述 | 综述L-高丝氨酸作为通用C4平台化学品在生物制造中的最新进展与挑战 | 系统整合了L-高丝氨酸细胞工厂的代谢工程策略，并总结了其高价值衍生物的生物合成途径，强调L-高丝氨酸多功能化平台的应用潜力 | 目前缺乏涵盖整合代谢工程策略的系统性综述 | 总结构建高效L-高丝氨酸细胞工厂的进展，讨论技术障碍与新兴机遇，为开发稳健的微生物制造平台提供战略路线图 | L-高丝氨酸及其下游衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | L-高丝氨酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 47 | 2026-06-08 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
|
综述 | 系统梳理了基于GPCR的酵母生物传感器从模块化工程到实际应用的研究进展 | 通过模块化框架分析传感、转导和输出核心模块的工程策略，并强调人工智能与合成生物学整合的未来方向 | 未明确讨论当前传感器在复杂环境中的稳定性和可重复性限制 | 总结GPCR酵母生物传感器的工程优化方法及应用扩展 | 基于GPCR的酵母生物传感器 | 合成生物学 | 不适用 | GPCR信号转导 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 酿酒酵母 | 模块化传感器电路（传感模块-GPCRs、转导模块-酵母信号网络、输出模块-报告系统） | 医学、环境、农业、工业生物技术 |
| 48 | 2026-06-08 |
Biological valorization of non-food feedstocks: A critical review
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108918
PMID:42128207
|
综述 | 全面评述非食物原料的生物转化，涵盖原料特性、转化路径、废物升级及技术经济评估 | 系统梳理非食物原料特性与生物转化途径间的机制联系，并整合合成生物学和多组学驱动的前沿转化技术与废物升级策略 | 未详细讨论不同转化路线在工业放大中的具体工程障碍 | 阐明非食物原料生物转化的挑战与进展，为可持续生物炼制提供战略指导 | 非食物原料（如木质纤维素、有机废弃物等）及其生物转化系统 | 工业生物技术 | NA | 厌氧消化、堆肥、合成生物学驱动发酵、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞, 植物 | 代谢途径工程、逻辑门、生物传感器 | 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 49 | 2026-06-08 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Jun-06, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
|
综述 | 探讨利用自然界中其他生物操控植物代谢和发展的机制，为植物合成生物学提供新型工程策略 | 超越传统基因工程，从细菌、真菌和昆虫等生物操控植物代谢的自然机制中获取灵感，拓展植物工程的边界 | 未提及具体实验验证或技术局限性 | 通过研究自然界中生物操控植物的机制，为新型植物代谢工程方法提供思路 | 植物代谢系统及自然界的操控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 代谢通路操控 | 农业, 工业生物技术 |
| 50 | 2026-06-08 |
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jun-06, Journal of natural medicines
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s11418-026-02044-3
PMID:42251226
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综述 | 本文综述了人体微生物组作为新型生物活性天然产物来源的研究进展，涵盖其结构、生物活性及生物合成见解 | 系统总结了人体微生物组在不同解剖部位产生的天然产物多样性及其与宿主共进化关系，并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学方法，加速了生物合成基因簇和代谢物的发现 | 未明确提及具体研究限制，但综述性质决定了可能缺乏对特定代谢物深入的实验验证 | 概述人体微生物组来源的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性，并讨论其药物开发与人类健康的应用潜力 | 人体微生物组（包括肠道、口腔、皮肤、阴道等部位的微生物）及其产生的生物活性天然产物 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 单细胞基因组学, 合成生物学, 整合组学 | NA | NA | NA | NA | 人体微生物组（肠道、口腔、皮肤、阴道等） | NA | 医学, 药物开发 |
| 51 | 2026-06-08 |
Engineering a PD-L1-sensing synthetic receptor for programmable macrophage response
2026-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00708-y
PMID:42251359
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研究论文 | 描述了一种基于合成Notch的受体（SNIPR），能检测PD-L1并触发巨噬细胞的可编程吞噬程序 | 将PD-L1从治疗终点靶点重新定义为可编程输入信号，实现了配体响应式巨噬细胞行为控制 | 目前仅在体外验证了THP-1来源巨噬细胞对SKOV-3卵巢癌细胞的吞噬增强效应 | 设计合成受体实现巨噬细胞对免疫调节配体的感知和条件性激活 | PD-L1配体及THP-1单核细胞来源的巨噬细胞 | 合成生物学 | 卵巢癌 | 合成Notch受体工程 | NA | NA | 体外细胞实验，涉及SKOV-3卵巢癌细胞和THP-1巨噬细胞 | 合成生物学受体工程 | 人类细胞（THP-1单核细胞） | PD-L1感应合成Notch受体（SNIPR）电路，调控荧光报告基因或CV1-Fc效应器表达 | 医学 |
| 52 | 2026-06-08 |
A deep learning multi-attention Bi-GRU framework for kcat prediction with segmentation-based insights
2026-Jun-01, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110915
PMID:42250496
|
研究论文 | 提出一种基于深度学习多注意力机制的双向门控循环单元框架KcatNeuroCortex，用于预测酶的催化效率kcat值 | 通过分割策略捕捉局部功能基序，并结合多注意力机制整合长程相互作用，实现可解释性和预测精度的提升，相比DLKcat将R²提高57% | 未明确提及模型的泛化能力验证或对极端序列条件的测试 | 开发可解释且准确的酶催化效率预测工具，支持代谢工程和合成生物学研究 | 酶的催化效率预测 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 双向门控循环单元（Bi-GRU）结合多注意力机制 | 酶序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 代谢工程, 合成生物学 |
| 53 | 2026-06-08 |
Membrane-Spanning Nanopores Formed from Nucleic Acids
2026-May-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00905
PMID:42173496
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综述 | 综述了基于核酸（特别是DNA）构建的跨膜纳米孔的最新进展，重点介绍其设计原理、结构多样性及其在合成生物学和单分子传感中的应用 | 系统总结了核酸纳米孔相较于传统蛋白质纳米孔的可编程性和多功能优势，并首次深入探讨RNA折纸技术用于构建基因编码纳米孔的独特潜力 | 缺乏对核酸纳米孔体内稳定性和免疫原性的定量评估，且未讨论大规模生产及临床转化中的技术瓶颈 | 阐述核酸基跨膜纳米孔的理性设计策略，并展望其在合成细胞信号传导、单分子检测和细胞操控中的应用前景 | DNA纳米孔和RNA折纸纳米孔结构 | 合成生物学, 纳米技术 | NA | DNA纳米孔自组装, RNA折纸 | NA | NA | NA | DNA折纸, RNA折纸 | NA | 跨膜纳米孔通道（包括亚纳米离子通道和大分子传输通道） | 医学, 生物技术 |
| 54 | 2026-06-08 |
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-Apr-03, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00700-8
PMID:41932911
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研究论文 | 提出一种名为CellTarget的凸优化算法，用于从实验通量数据中推断细胞目标 | 首次结合凸通量平衡分析模块与误差最小化模块，通过隐式微分反向传播优化目标系数，实现细胞目标的直接推断 | 细胞目标存在显著的非可辨识性，预测精度更依赖于网络约束而非目标特异性 | 解决哺乳动物代谢模型因缺乏细胞内通量测量而难以指定优化目标的问题 | 中国仓鼠卵巢细胞系的生产者和非生产者细胞系及不同生长阶段 | 机器学习 | NA | 通量平衡分析 | 凸优化模型 | 通量数据 | 多个中国仓鼠卵巢细胞系样本，涵盖不同细胞类型和生长阶段 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 55 | 2026-06-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
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综述 | 介绍非模式细菌物种合成生物学工具箱的开发策略，重点以拟杆菌属为例 | 系统总结了针对非模式共生菌和益生菌的基因工程工具开发方法，填补了该领域系统性指导的空白 | 未提供具体实验验证数据，主要基于文献总结和策略建议 | 为跨学科研究人员开发非模式细菌的遗传操作工具提供方法论框架 | 非模式细菌菌株，特别是拟杆菌属 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 拟杆菌属、大肠杆菌、非模式细菌 | NA | 医学 |
| 56 | 2026-06-08 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本综述文章探讨了如何通过整合代谢组学、CRISPR基因组编辑、合成生物学和人工智能技术，培育抗旱作物的方法 | 强调将代谢组学与前沿技术（CRISPR、人工智能等）相结合，建立从诊断到预测和处方平台的转化框架，用于抗旱作物改良 | 未明确提及具体局限性，但综述性质可能缺乏实验验证和定量评估 | 建立代谢组学驱动的抗旱作物改良转化框架，促进气候智能农业 | 干旱胁迫下的植物代谢物，包括初级和次级代谢产物 | 机器学习, 数字农业 | NA | 代谢组学, CRISPR, 基因编辑, 合成生物学, 单细胞和空间代谢组学, 生态代谢组学, AI驱动的预测建模 | NA | 代谢组学数据, 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物（作物） | NA | 农业 |
| 57 | 2026-06-08 |
Yeast-based green nanoparticle synthesis: past, present and future in nanomedicine
2026-Apr, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2642296
PMID:41797356
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综述 | 综述了酵母合成纳米颗粒在纳米医学中的历史、当前应用和未来前景 | 系统总结了酵母合成纳米颗粒从传统微生物合成到现代生物工程的演变，特别强调了遗传可操作性和规模化生产的优势 | 临床转化受限于标准化GMP生产、毒性和免疫原性评估以及监管框架的不足 | 评估酵母基绿色纳米颗粒合成在纳米医学中的应用潜力 | 酵母合成的银、金、硒纳米颗粒及其生物医学应用 | 纳米医学 | 癌症 | 绿色合成、酶还原途径、基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、生物过程工程 | 酵母 | NA | 医学、纳米医学 |
| 58 | 2026-06-08 |
Biotechnology meets AI: Accelerating next-generation of microbial breeding for food biomanufacturing
2026-Mar-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118152
PMID:41652737
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综述 | 探讨生物技术与人工智能融合加速下一代微生物育种用于食品生物制造 | 整合大气室温等离子体诱变、空间诱变等先进生物技术与人工智能蛋白质语言模型，实现更高效、精准和智能的微生物育种 | 未提及具体实验验证或局限性分析 | 加速下一代微生物育种以推动食品生物制造的可持续和智能化发展 | 用于食品生物制造的微生物菌株 | 机器学习, 数字生物学 | NA | ARTP诱变, 空间诱变, 合成生物学, 蛋白质语言模型 | 蛋白质语言模型 | 文本 | NA | NA | 微生物 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 59 | 2026-06-08 |
Engineering Basal Cognition: Minimal Genetic Circuits for Habituation, Sensitization, and Massed-Spaced Learning
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00766
PMID:41666326
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research paper | 采用合成生物学方法设计最小遗传电路，在单细胞系统中实现习惯化、敏感化和间隔学习效应 | 首次通过合成基因回路在单细胞层面复现非联想学习行为，揭示基因调控网络与神经学习系统的时序动力学差异 | 目前仅基于理论模型和计算机模拟，缺乏实验验证数据 | 探索最小遗传电路实现单细胞非联想学习的可行性 | 合成基因回路中的调控元件（激活子、抑制子、荧光报告基因、群体感应分子） | 合成生物学 | NA | 合成基因回路设计、计算机模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 单细胞生物 | 习惯化回路、敏感化回路、间隔学习效应回路（含激活子、抑制子、荧光报告基因、群体感应分子） | 基础生物学、合成生物学 |
| 60 | 2026-06-08 |
APMSR: an intelligent QA system for synthetic biology empowered by adaptive prompting and multi-source knowledge retrieval
2026-Feb-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38006-8
PMID:41644613
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研究论文 | 提出了一种结合自适应提示生成与多源知识检索的合成生物学智能问答系统APMSR | 利用LinUCB算法引导自适应提示生成与动态多源知识检索的平衡，增强领域信息检索的相关性和精准性 | 未提及具体限制 | 解决大语言模型在合成生物学领域知识问答中的知识缺口和幻觉问题 | 合成生物学领域的复杂专业级查询 | 机器学习 | NA | 大语言模型、自适应提示、多源知识检索、LinUCB算法 | LinUCB | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |