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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-06-29 |
Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jun-18, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf032
PMID:40577080
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研究论文 | 本文描述了一种在酿酒酵母中实现基因组集成表达盒交换的系统,通过CRISPR技术实现已集成盒的模块化替换或移除 | 首次提出将模块化原则延伸至菌株水平,通过特定条形码和CRISPR技术实现已集成表达盒的高效交换或移除 | 目前仅在荧光蛋白表达盒上进行了验证,尚未在其他类型表达盒上测试 | 开发一种标准化方法实现酿酒酵母基因组中已集成表达盒的模块化修改 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | CRISPR (Cas9和Cas12a核酸酶) | NA | 分子生物学数据(基因序列)、流式细胞数据 | 使用先前开发的Easy-MISE工具包进行测试 |
42 | 2025-06-29 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 本文探讨了生成式人工智能(GenAI)在生命科学和农业业务中的多方面影响 | GenAI在药物发现、蛋白质折叠预测、基因组学研究、疾病诊断和生物标志物识别等领域的创新应用,以及在农业中优化作物育种和提高生产力的潜力 | 讨论了GenAI在生命科学和农业业务中的伦理问题,如数据隐私、算法偏见和利益公平分配,以及环境可持续性问题 | 探讨GenAI在生命科学和农业业务中的应用及其潜在影响 | 生命科学和农业业务中的GenAI应用 | 人工智能 | NA | 生成式人工智能(GenAI) | NA | 基因组和生态信息数据集 | NA |
43 | 2025-06-29 |
Hammerhead Ribozymes: Structural Insights, Catalytic Mechanisms, and Cutting-Edge Applications in Synthetic Biology
2025-Jun-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125624
PMID:40565088
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综述 | 本文全面回顾了锤头状核酶在合成生物学中的最新研究进展,探讨了当前面临的挑战并展望了未来的发展方向 | 总结了锤头状核酶在基因调控、疾病治疗和生物传感等领域的广泛应用潜力 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 为锤头状核酶的生物医学应用提供有价值的观点和见解 | 锤头状核酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
44 | 2025-06-29 |
The Sustainable Production of Terpenoids in Cyanobacterial Chassis
2025-Jun-10, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13061342
PMID:40572229
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综述 | 本文全面总结了萜类化合物的生物合成途径以及利用蓝藻作为底盘生产萜类化合物的研究进展,并进一步讨论了提高萜类化合物产量的策略 | 综述了利用蓝藻作为底盘生产萜类化合物的最新进展,并讨论了提高产量的策略 | NA | 探讨利用蓝藻可持续生产萜类化合物的可行性和策略 | 萜类化合物及其在蓝藻中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
45 | 2025-06-29 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
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综述 | 本文综述了利用植物病毒载体的瞬时表达系统在烟草本氏烟中生产生物药物的应用 | 强调了病毒载体瞬时表达系统在健康紧急情况(如COVID-19)中的快速重组蛋白生产作用,以及病毒载体修饰、水培技术和受控环境农业的创新 | NA | 探讨瞬时表达系统在生物药物生产、教育、合成生物学和基因编辑中的应用 | 烟草本氏烟及其作为生物反应器的应用 | 生物技术 | NA | 病毒载体瞬时表达系统、糖工程 | NA | NA | NA |
46 | 2025-06-29 |
Cell-Based Therapies for Solid Tumors: Challenges and Advances
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125524
PMID:40564987
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综述 | 本文综述了针对实体瘤的细胞免疫疗法的最新进展和挑战 | 探讨了多种新兴细胞疗法,包括肿瘤浸润淋巴细胞、T细胞受体工程T细胞、CAR T细胞、CAR自然杀伤细胞和巨噬细胞,并分析了自体与异体细胞来源的影响 | 某些疗法的有效性可能受到肿瘤抗原变异和肿瘤微环境抑制性等因素的限制 | 探讨细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的潜力和挑战 | 实体瘤 | 肿瘤免疫治疗 | 实体瘤 | 细胞免疫疗法、基因编辑、合成生物学 | NA | NA | NA |
47 | 2025-06-29 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
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研究论文 | 本研究描述了三种小分子和两种细胞接触诱导系统在小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化控制 | 首次在小鼠胚胎干细胞中详细表征了合成生物学工具,并展示了这些系统在控制基因表达和直接分化成神经元方面的可靠性和高效性 | 现有合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的表征较少 | 通过工程方法理解多细胞性,目标包括重现发育过程和构建合成生物体 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成生物学 | NA | 小分子和细胞接触诱导系统 | NA | 基因表达数据 | NA |
48 | 2025-06-29 |
Nuclear Assembly in Giant Unilamellar Vesicles Encapsulating Xenopus Egg Extract
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412126
PMID:40390663
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research paper | 该研究提出了一种在巨型单层脂质体(GUVs)中组装细胞核的方法,利用非洲爪蟾卵提取物诱导核的重构 | 通过改进的倒置乳液法提高GUV形成效率,并验证了GUVs中形成的类核结构具有功能性核输入能力 | NA | 构建人工细胞系统以模拟真核细胞 | 巨型单层脂质体(GUVs)和非洲爪蟾卵提取物 | 合成生物学 | NA | 倒置乳液法 | NA | NA | NA |
49 | 2025-06-29 |
Biosynthesis of Two Types of Exogenous Antigenic Polysaccharides in a Single Escherichia coli Chassis Cell
2025-May-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15060858
PMID:40566513
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研究论文 | 本研究在大肠杆菌W3110细胞中同时引入了Wzy/Wzx依赖和ABC转运体依赖的抗原多糖生物合成途径,实现了两种结构不同的多糖在单一宿主中的同时生物合成,为疫苗开发提供了一种简化且可扩展的策略 | 在单一宿主细胞中同时实现两种不同生物合成途径的多糖生产,并成功进行体内生物共轭生成糖蛋白,简化了复杂糖蛋白疫苗的生产流程 | 共表达水平有所降低,初期诱导阶段存在微弱的竞争性相互作用 | 开发针对耐药病原体的多价结合疫苗的合成生物学平台 | 大肠杆菌W3110细胞 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | Wzy/Wzx依赖途径和ABC转运体依赖途径的基因工程 | NA | 蛋白质组学数据 | 工程菌株 |
50 | 2025-06-29 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
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研究论文 | 介绍了一种名为GenomeOcean的高效基因组基础模型,该模型基于大规模宏基因组组装数据训练 | 直接在大规模宏基因组样本的共组装上进行训练,增强了对稀有微生物物种的表征,并提高了超越基因组中心方法的泛化能力 | NA | 开发一个高效的基因组基础模型,以推动精准医学、药物发现和对复杂生物系统的理解 | 宏基因组数据集中的高质量contigs | 机器学习 | NA | byte-pair encoding (BPE) tokenization策略 | 生成式基因组基础模型 | 宏基因组数据 | 220 TB的宏基因组数据集,包含600 Gbp的高质量contigs |
51 | 2025-06-28 |
The Rise of Mechanobiology for Advanced Cell Engineering and Manufacturing
2025-Jun-27, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501640
PMID:40576525
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research paper | 本文探讨了机械生物学在高级细胞工程和制造中的崛起及其应用 | 强调了机械信号在细胞制造中的关键作用,提出了利用机械生物学替代传统可溶性因子的新方法 | 当前制造路线在生产效率、安全性、监管、成本效益和可扩展性方面存在限制 | 推动细胞工程和制造技术的发展,以满足细胞治疗、再生医学和合成生物学的需求 | 细胞工程和制造技术,特别是机械生物学在其中的应用 | 生物医学工程 | NA | 机械生物学、生物材料设计、微纳米技术 | NA | NA | NA |
52 | 2025-06-28 |
Combining synthetic biology with synthetic electrochemistry to expand the chemical space of the indolocarbazole family
2025-Jun-27, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d5ob00766f
PMID:40576641
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研究论文 | 本研究通过结合合成生物学与合成电化学,开发了一种环境友好的方法来扩展吲哚咔唑类化合物的化学空间 | 首次将多步生物级联与电催化结合,作为一种新型绿色合成方法,扩展了异生物质化合物的多样性,并观察到吲哚咔唑结构家族中前所未有的N-N同源二聚化现象 | NA | 开发一种环境友好的方法,扩展吲哚咔唑类化合物的化学多样性 | 吲哚咔唑类化合物及其衍生物 | 合成生物学与合成化学 | 肿瘤 | 合成生物学、合成电化学、酶促糖基化 | NA | 化学合成数据、生物活性数据 | 17种吲哚咔唑衍生物,针对20种不同人类肿瘤细胞系进行抗增殖活性评估 |
53 | 2025-06-27 |
A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit
2025-Jul, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3559480
PMID:40232911
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研究论文 | 提出了一种基于DNA杂交反应电路的新型线性机器学习方法 | 利用DNA杂交反应实现并行计算,采用'双轨'机制实现学习算法的DNA编译,支持权重更新为负值 | 目前仅能预测和拟合线性函数 | 开发基于DNA杂交反应电路的机器学习模型 | DNA杂交反应电路 | 机器学习 | NA | DNA杂交反应 | 线性机器学习模型 | NA | NA |
54 | 2025-06-27 |
Autonomous chemo-metabolic construction of anisotropic cell-in-shell nanobiohybrids in enzyme-powered cell microrobots
2025-Jun-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5451
PMID:40561036
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研究论文 | 本文提出了一种创新的化学代谢耦合策略,用于在细胞生长培养基中自主构建细胞壳结构 | 利用乙醇发酵与酶级联反应化学耦合,自主驱动聚多巴胺纳米壳的形成,产生各向异性细胞壳结构 | NA | 开发具有增强保护和外源功能的细胞壳纳米生物杂化体 | 细胞壳纳米生物杂化体 | 合成生物学 | NA | 乙醇发酵、酶级联反应(酒精氧化酶和辣根过氧化物酶) | NA | NA | NA |
55 | 2025-06-27 |
A path to perpetual chemical synthesis via photocatalytic cofactor regeneration
2025-Jun-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc02770e
PMID:40453794
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Perspective | 本文探讨了通过光催化辅因子再生实现永续化学合成的设计原则及其潜力 | 提出将光催化再生辅因子与天然酶循环相结合,实现化学品的永续合成 | 讨论了集成系统的现有局限性及缓解这些限制的努力 | 探索利用太阳能进行永续化学合成以减少化学工业的碳足迹 | 光催化辅因子再生与天然酶循环的集成系统 | 化学合成 | NA | 光催化与生物催化 | NA | NA | NA |
56 | 2025-06-27 |
Magnesium-Free Assembly of Cationic Peptide/DNA Nanostructures with Defined Geometries for Anticancer Drug Delivery
2025-Jun-25, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c07816
PMID:40560802
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研究论文 | 本研究提出了一种利用阳离子靶向肽(RGD-TAT)替代传统镁离子促进DNA纳米结构自组装的方法,用于抗癌药物递送 | 使用RGD-TAT肽替代镁离子促进DNA纳米结构自组装,提高了细胞摄取效率和结构稳定性 | 研究仅在免疫缺陷小鼠肿瘤模型中进行验证,未涉及更复杂的生理环境 | 开发一种新型的DNA纳米结构药物递送系统,提高抗癌药物的递送效率和治疗效果 | DNA纳米结构和抗癌药物(阿霉素和KRAS siRNA) | 纳米医学 | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | 免疫缺陷小鼠肿瘤模型 |
57 | 2025-06-27 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
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研究论文 | 本文开发了一种分支卷积神经网络(B-CNN)结合微流控荧光激活细胞分选(μFACS)技术,用于合成酵母启动子的设计与高通量筛选 | 结合B-CNN和遗传算法预测并改造启动子核心区域,开发了新型μFACS系统实现高效单细胞分选 | 未明确提及实验样本的具体数量或筛选范围的具体限制 | 提升酵母合成启动子的设计效率与产物产量 | 酵母酒精氧化酶1启动子(P)及其突变体 | 合成生物学 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS)、遗传算法 | 分支卷积神经网络(B-CNN) | DNA序列、荧光信号数据 | 分选通量达7000细胞/秒,具体样本量未明确 |
58 | 2025-06-27 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
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研究论文 | 介绍了一种名为SPN-FLUX的全翻译后平台,用于快速、可调地报告细胞过程 | SPN-FLUX平台整合了合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白,提供了一种快速、实时的细胞信号事件报告方法 | NA | 开发一种新型合成受体平台,用于精确调控细胞功能 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白整合技术 | NA | 荧光和发光信号 | NA |
59 | 2025-06-27 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
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研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应工具,用于革兰氏阴性细菌之间的通信 | 使用SEVA质粒集合构建了包含发送和接收模块的三套群体感应系统,提高了系统的通用性和可交换性 | 目前仅适用于革兰氏阴性细菌,未在更多非模型物种中验证 | 开发标准化的群体感应工具以促进合成菌群的分布式功能 | 革兰氏阴性细菌 | 合成生物学 | NA | SEVA质粒构建 | 数学模型 | 实验数据 | 未明确提及具体样本数量 |
60 | 2025-06-27 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 本文设计并验证了一个名为pXpressome的质粒工具包,用于稳健表达和纯化功能完整的α-羧基体,以促进其研究和重新设计 | 开发了pXpressome工具包,能够稳健表达并纯化功能完整的α-羧基体,且表现优于以往发表的羧基体表达系统 | 未明确提及具体局限性 | 促进羧基体的研究和重新设计,以增强碳固定或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧基体 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、荧光标记 | NA | NA | NA |