合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-05-17	[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies] 2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.250032 PMID:40170318	综述	本文综述了智能生物制造中发酵过程的优化，重点探讨了在线监测技术、人工智能优化策略和数字孪生应用的最新进展	整合了在线监测技术、AI驱动的动态优化和数字孪生技术，为发酵过程的实时优化和规模化提供了新范式	未提及具体实施案例或实验验证结果	实现发酵过程的精确优化和高效规模化	发酵过程的实时传感与智能控制	智能生物制造	NA	在线监测技术、机器学习（如人工神经网络和支持向量机）、遗传算法	数字孪生、多尺度模型（如细胞代谢动力学和反应器流体力学）	实时传感数据	NA
42	2025-05-17	DNA/RNA hybrids avoid channel gating that leads to the continued packaging of numerous hybrids into the phi29 protein shell 2025-Mar-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf242 PMID:40193705	research paper	该研究探讨了phi29 DNA包装马达在包装双链DNA和RNA/DNA杂交体时的效率差异及其机制	发现RNA/DNA杂交体由于缺乏通道门控机制而比双链DNA更高效地被包装	通道门控的具体机制仍不明确	研究phi29 DNA包装马达对不同核酸结构的包装效率及其机制	phi29 DNA包装马达及其包装的双链DNA和RNA/DNA杂交体	分子生物学	NA	单通道电生理学和蔗糖梯度超速离心	NA	NA	NA
43	2025-05-17	Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division 2024-11-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54807-9 PMID:39614082	研究论文	该研究通过结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统在GUVs中的重构，展示了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环以实现合成细胞分裂的潜力	结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统，实现了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环，诱导囊泡中段变形和囊泡出芽	NA	开发合成细胞自分裂的最小模块	巨型单层囊泡(GUVs)和肌动蛋白环	合成生物学	NA	肌动蛋白环重构和MinDE蛋白系统	NA	NA	NA
44	2025-05-17	Biosynthesis of plant hemostatic dencichine in Escherichia coli 2022-09-19, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-022-33255-3 PMID:36123371	研究论文	该研究通过合成生物学方法在大肠杆菌中实现了植物止血成分dencichine的从头生物合成	通过逆向生物合成方法设计人工途径，优化关键酶翻译速率，并系统改造代谢网络以提高产量	NA	建立dencichine的可持续生产途径	植物源天然产物dencichine	合成生物学	NA	逆向生物合成、代谢工程	NA	NA	NA
45	2025-05-16	Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter 2025-May-14, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00025 PMID:40368332	研究论文	本文开发了一种分支卷积神经网络（B-CNN）结合遗传算法，用于设计和筛选合成酵母启动子，并通过微流控荧光激活细胞分选（μFACS）系统进行高通量筛选	结合B-CNN和遗传算法设计合成启动子，开发了μFACS系统进行高通量筛选，提高了启动子强度和产物产量	未提及实验的具体样本量或筛选范围的具体限制	提高合成酵母启动子的设计和筛选效率，以增强基因表达和代谢物生物合成	酵母启动子，特别是酒精氧化酶1启动子（P）	合成生物学	NA	微流控荧光激活细胞分选（μFACS），遗传算法	分支卷积神经网络（B-CNN）	序列数据，荧光信号	未明确提及具体样本量，但提到细胞通量达到7000细胞/秒
46	2025-05-16	Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends 2025-May-12, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602 PMID:40368116	review	本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势，重点介绍了定向进化和高通量策略在工程化蛋白酶底物特异性中的应用	讨论了新兴的蛋白酶工程策略，如抗体-蛋白酶融合和蛋白酶底物特异性切换，以及分裂和自抑制蛋白酶的设计原则	NA	探索蛋白酶工程的方法和策略，以实现对蛋白酶活性和特异性的精确控制	蛋白酶	合成生物学	NA	定向进化、高通量筛选	NA	NA	NA
47	2025-05-16	Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida 2025-Apr-18, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08039-2 PMID:40251395	研究论文	本文介绍了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法，显著提高了恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量	提出了一种分子和宿主无关的主动学习流程，通过半自动化管道快速优化培养基，并发现盐浓度是影响黄酮醇生产的关键因素	未明确说明该方法在其他宿主或分子生产中的普适性	优化培养基以提高恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量	恶臭假单胞菌KT2440和黄酮醇生产	合成生物学	NA	机器学习，主动学习，半自动化管道	NA	实验数据	三个不同的黄酮醇生产实验
48	2025-05-16	Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production 2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273 PMID:40129278	research paper	该研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术，提高了工程酵母细胞内人参皂苷的生产和输出效率	结合长期酵母培养与原位提取技术，显著提高人参皂苷产量，并实现酵母的重复利用	研究未提及该方法在大规模工业化生产中的可行性和成本效益	提高人参皂苷的生产效率，支持其工业化生产	工程酵母	合成生物学	NA	酵母培养与原位提取技术	NA	NA	NA
49	2025-05-16	Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts 2025-Mar-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02692-2 PMID:40155940	综述	本文综述了利用工程酵母合成植物源性异黄酮及其前体的进展，包括其药理活性、生物合成途径及生产技术策略	总结了合成生物学和先进生物技术策略在环境友好型生物活性异黄酮生产中的应用	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏对当前技术局限性的深入讨论	探讨利用工程酵母可持续高效生产异黄酮的方法	植物源性异黄酮及其前体，如大豆苷元和染料木素	合成生物学	NA	工程酵母生物合成	NA	NA	NA
50	2025-05-16	TTLOC: A Tn5 transposase-based approach to localize T-DNA integration sites 2025-Mar-28, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf102 PMID:40131780	研究论文	本文介绍了一种基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位方法TTLOC，用于高效、低成本地检测转基因植物的T-DNA整合位点	开发了基于Tn5转座酶的新型T-DNA整合位点定位技术，相比传统方法具有操作简便、高通量、成本低等优势	未明确说明该方法在复杂基因组中的定位准确率或与其他方法的直接比较数据	开发高效检测转基因植物T-DNA整合位点的技术，以促进作物育种和植物合成生物学研究	转基因拟南芥、水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦	植物分子生物学	NA	Tn5转座酶介导的基因组DNA片段化，NGS测序	NA	基因组测序数据	65个转基因拟南芥株系和多种转基因作物（水稻、大豆等）
51	2025-05-16	Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases 2025-Mar-28, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu1710 PMID:40153513	综述	本文探讨了利用其他物种的酶来逆转与年龄相关的代谢变化，以延缓衰老和年龄相关疾病的策略	提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的未开发资源	NA	探讨延缓衰老和年龄相关疾病的新策略	来自低等生物的一组酶，这些酶影响与年龄相关过程的代谢参数	合成生物学	老年病	NA	NA	NA	NA
52	2025-05-16	CAR-T therapy dilemma and innovative design strategies for next generation 2025-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07454-x PMID:40148310	综述	本文综述了CAR-T细胞疗法面临的困境及下一代设计的创新策略	提出了基于合成生物学、生物支架、纳米材料等多学科策略的创新技术，以克服当前CAR-T细胞的障碍	NA	探讨CAR-T细胞疗法在肿瘤免疫治疗中的困境及解决方案	CAR-T细胞疗法	肿瘤免疫治疗	血液肿瘤	合成生物学、生物支架、纳米材料、溶瘤病毒、CRISPR筛选、肠道微生物及其代谢物	NA	NA	NA
53	2025-05-16	Last Decade Insights in Exploiting Marine Microorganisms as Sources of New Bioactive Natural Products 2025-Mar-07, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md23030116 PMID:40137302	综述	本文回顾了过去十年在利用海洋微生物作为新型生物活性天然产物来源方面的关键进展	强调了基因组学、代谢组学和生物信息学技术创新在发现和表征这些化合物中的作用，以及合成生物学和代谢工程在优化天然产物产量和生成新型生物活性化合物方面的进展	NA	探索海洋微生物作为生物活性天然产物来源的潜力及其在蓝色经济领域的应用	海洋细菌、真菌和微藻	生物技术	NA	基因组学、代谢组学、生物信息学、合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
54	2025-05-16	Applied photosynthesis: An idea whose time has come 2025-01-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525 PMID:39571881	研究论文	本文介绍了生物混合能源系统在可持续能源生产中的前沿研究，特别是利用光合作用机制开发环保高效太阳能技术	结合合成生物学与纳米材料工程，优化生物混合设备的光吸收、能量转换和稳定性，探索独特的光活性色素	NA	开发可持续能源技术，替代传统太阳能技术	生物混合设备，包括蓝藻、藻类、紫色细菌和古菌等光合生物	可再生能源技术	NA	合成生物学、纳米材料工程	NA	NA	NA
55	2025-05-16	Analysis of rRNA processing and translation in mammalian cells using a synthetic 18S rRNA expression system 2012-Sep, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gks530 PMID:22718970	研究论文	开发了一种用于哺乳动物18S rRNA的表达系统，用于研究rRNA的加工、组装和功能	首次开发了能够修改并功能性地检查哺乳动物18S rRNA的表达系统	未明确说明系统的普适性或是否适用于其他类型的rRNA	研究高等真核生物核糖体RNA（rRNA）的加工、组装和功能	小鼠18S rRNA	合成生物学	NA	杂交监测表达和切割，突变分析	NA	NA	未明确说明具体的样本数量
56	2025-05-15	Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials 2025-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202502199 PMID:40143682	研究论文	该研究通过合成生物学与人工材料的结合，首次实现了基于DNA水凝胶的工程化活材料（ELMs）的生产	首次利用外生电细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶，开发了可诱导细胞表面锚定技术，实现了活细菌背景下DNA水凝胶的原位生产	研究尚处于初步阶段，仅展示了在生物电化学系统表面生成稳定生物混合生物膜的能力	开发具有导电性和代谢活性的动态生物混合材料系统	外生电细菌Shewanella oneidensis和DNA水凝胶	合成生物学	NA	SpyCatcher/SpyTag (SC/ST)技术	NA	NA	NA
57	2025-05-15	A pectin acetyl-transferase facilitates secondary plasmodesmata formation and RNA silencing movement between plant cells 2025-May, The Plant journal : for cell and molecular biology DOI:10.1111/tpj.70194 PMID:40353833	研究论文	本文研究了植物细胞间RNA沉默移动的机制，特别是通过果胶乙酰转移酶调控次级胞间连丝形成的过程	首次发现果胶乙酰转移酶突变会减少次级胞间连丝数量，从而影响小RNA和蛋白质的细胞间移动	研究主要局限于拟南芥叶片组织，根部细胞间移动机制可能不同	阐明植物细胞间小RNA移动的分子机制及其调控因素	拟南芥中的小RNA（miRNA和siRNA）和胞间连丝	植物分子生物学	NA	正向遗传筛选、原子力显微镜、抗体标记技术	NA	遗传数据、显微图像数据	拟南芥突变体
58	2025-05-15	Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems 2025-Apr-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622 PMID:40117974	研究论文	本研究探讨了动物细胞与叶绿体在体外培养系统中的相互作用及其光诱导反应	揭示了三种不同的动物细胞与叶绿体相互作用模式，并强调了光诱导ROS生成在细胞毒性中的重要性	缺乏完善的体外实验系统来研究叶绿体与动物细胞的相互作用	研究叶绿体与动物细胞的相互作用及其光诱导反应	人宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬细胞样J774.1细胞以及从Elysia marginata分离的细胞	合成生物学	宫颈癌	体外细胞培养	NA	细胞行为观察数据	HeLa细胞、J774.1细胞和Elysia marginata细胞
59	2025-05-15	Phase Separation-Mediated Multienzyme Assembly In Vivo 2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c09585 PMID:40107849	research paper	研究通过相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher标记系统的整合，探索其在多酶复合物形成中的潜力	首次将相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher系统结合，用于多酶复合物的自组装，显著提高了番茄红素的产量	研究主要集中于番茄红素生物合成途径中的六种酶，未广泛验证其他酶系统的适用性	探索相分离介导的多酶组装在合成生物学中的应用	相分离蛋白RGGRGG、ReverseTag/ReverseCatcher标记系统及番茄红素生物合成途径中的六种酶	synthetic biology	NA	coarse-grained simulations, enzyme immobilization	NA	simulation data, experimental data	六种番茄红素生物合成途径中的酶
60	2025-05-15	Engineering scutellarin biosynthesis in Artemisia annua 2025-Mar-21, Plant cell reports IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s00299-025-03471-4 PMID:40116969	研究论文	通过补充缺失的酶和优化黄酮6羟化酶，成功在青蒿中实现了异源合成灯盏花素	在野生型青蒿植物中鉴定出灯盏花素的两种关键前体，并通过共表达来自原宿主短葶飞蓬的三个关键基因，成功实现了灯盏花素的异源合成	NA	通过合成生物学手段在青蒿中生产稀缺药物	青蒿植物及其代谢产物	合成生物学	脑血管疾病和心血管疾病	基因工程和酶优化	NA	NA	NA