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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-05-12 |
Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications
2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996
PMID:40032480
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综述 | 本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸(DHA)的当前生物技术及其在食品中的应用 | 系统总结了裂殖壶菌DHA生产的当前生物技术,并提出了改进菌株、优化发酵过程、提高DHA产品氧化稳定性、掩盖DHA气味缺陷及利用合成生物学开发DHA潜在功能的建议 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述 | 探索裂殖壶菌DHA的生产技术及其在食品和健康领域的应用发展 | 裂殖壶菌及其DHA产品 | 生物技术 | NA | 发酵优化、纳米颗粒包装技术、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
42 | 2025-05-12 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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research paper | 该研究提出了一种名为SHIP的算法,用于系统性地识别真核生物中的基因组安全港(GSHs) | SHIP算法通过基因组通用特征注释系统性地识别GSHs,而非依赖经验方法,解决了现有GSHs多位于高基因密度区域导致表达不稳定的问题 | 研究仅在酿酒酵母中进行了实验验证,尚未在其他真核生物中广泛测试 | 开发一种系统性识别真核生物基因组安全港的工具,以支持合成生物学中多基因模块的研究 | 真核生物基因组中的基因组安全港(GSHs) | 合成生物学 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | 算法(SHIP) | 基因组数据 | 在酿酒酵母中实验验证了5个GSHs |
43 | 2025-05-12 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本文介绍了一种基于脂质的组织模拟物,即毫米大小的'脂质泡沫',它由微米大小的隔室组成,通过脂质双层结合,并展示了其自修复能力和在包含细菌时的网络张力波动 | 开发了一种易于制备和功能化的脂质泡沫组织模拟物,具有自修复能力和由游泳细菌驱动的网络张力波动,促进了原组织的流动和重组 | 目前的研究尚未探讨脂质泡沫组织模拟物在更复杂生物环境中的应用效果 | 开发并表征一种新型的脂质泡沫组织模拟物,以模拟和了解生物组织的特性 | 脂质泡沫组织模拟物及其在包含细菌时的行为 | 合成生物学 | NA | 脂质双层技术 | NA | NA | NA |
44 | 2025-05-12 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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research paper | 介绍了一个名为Dsembler的基于网络的软件工具,旨在优化长DNA序列的组装 | 开发了一个新工具Dsembler,用于优化寡核苷酸的设计,提高DNA组装的准确性 | 未提及工具在实际应用中的性能测试或用户反馈 | 解决合成生物学中寡核苷酸组装面临的挑战 | 长DNA序列的组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | DNA序列 | NA |
45 | 2025-05-11 |
Synthetic biology routes to new and extinct natural products
2025-May-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00047e
PMID:40171247
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research paper | 该文章探讨了通过合成生物学方法生产新型和已灭绝的天然产物 | 利用基因敲除和基因交换技术,生产了多种新的代谢产物,并优化了某些抗生素的生产 | 研究主要集中在细菌和真菌中的生物合成途径,可能不适用于其他生物系统 | 探索和优化天然产物的生物合成途径 | 细菌和真菌中的生物合成途径及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因交换、异源表达 | NA | 基因组数据 | 多种细菌和真菌菌株 |
46 | 2025-05-11 |
Cell-Penetrating Peptide-Based Triple Nanocomplex Enables Efficient Nuclear Gene Delivery in Chlamydomonas reinhardtii
2025-May-08, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29019
PMID:40342143
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研究论文 | 开发了一种基于细胞穿透肽的三重纳米复合系统,用于在莱茵衣藻中实现高效的核基因递送 | 整合了细胞穿透肽(CPPs)、核定位信号(NLS)肽和质粒DNA的新型三重纳米复合系统,显著提高了基因递送效率 | 仅在莱茵衣藻中进行了测试,尚未在其他微藻中验证效果 | 开发高效的基因递送系统以促进微藻合成生物学发展 | 莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)细胞 | 合成生物学 | NA | 细胞穿透肽(CPPs)技术、核定位信号(NLS)技术 | NA | 实验数据 | 野生型莱茵衣藻细胞 |
47 | 2025-05-11 |
Living Biotherapeutics Using Nanoparticles-Armed Cyanobacteria for Boosting Photodynamic-Immunotherapy of Cancer
2025-May-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502746
PMID:40344505
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研究论文 | 开发了一种结合蓝藻与多功能前药纳米颗粒的活体生物治疗平台,用于增强光动力免疫治疗癌症 | 结合合成生物学与材料科学,开发了一种新型的活体纳米治疗剂,能够自供应氧气和纳米颗粒,并协同增强抗癌效果 | 未提及临床试验结果或体内实验的具体数据 | 开发新型癌症治疗方法,结合光动力疗法与免疫疗法 | 癌症治疗 | 纳米医学 | 癌症 | 光动力疗法、静电吸附 | NA | NA | NA |
48 | 2025-05-11 |
Functional investigation of Zur in metal ion homeostasis, motility and multiple stresses resistance in cyanobacteria Synechocystis sp. PCC 6803
2025-May-07, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00224-x
PMID:40332629
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探讨了Zur在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中金属离子稳态、运动性和多重胁迫抗性中的多功能作用 | 揭示了Zur不仅调控锌离子稳态,还影响铁平衡、细菌运动性及对抗盐、氧化和抗生素胁迫的能力 | 研究仅基于转录组分析,缺乏蛋白质水平和具体调控机制的深入验证 | 探究Zur转录调控因子在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中的多功能调控作用 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803的Δzur突变体和野生型菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Δzur突变体和野生型Synechocystis sp. PCC 6803菌株 |
49 | 2025-05-11 |
Sustainable production of porphyrins through synthetic biology
2025-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.009
PMID:39341742
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评论 | 本文聚焦于通过合成生物学促进卟啉的可持续生产 | 讨论了卟啉生物合成在不同物种中的最新突破 | NA | 促进卟啉的可持续生产 | 卟啉化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
50 | 2025-05-11 |
A synthetic biology approach for identifying de-SUMOylation enzymes of substrates
2025-May, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13838
PMID:39835880
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研究论文 | 利用大肠杆菌中的稳健重构系统,通过合成生物学方法鉴定负责从特定蛋白质底物中去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶 | 采用合成生物学方法在大肠杆菌中建立重构系统,用于鉴定植物SUMO去修饰酶 | NA | 鉴定能够去除特定蛋白质底物上SUMO修饰的植物泛素样蛋白酶 | 植物泛素样蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
51 | 2025-05-11 |
Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI
2025-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010
PMID:40000312
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综述 | 本文综述了利用多组学策略和人工智能技术发现植物生物合成途径的最新进展 | 提出结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的集成工作流程,以及AI驱动的方法来革新途径发现 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 促进可持续生物经济发展,通过合成生物学获取复杂天然产物 | 植物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学 | AI驱动方法 | 多组学数据 | NA |
52 | 2025-05-11 |
CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00757
PMID:39989320
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研究论文 | 本研究建立了一种适用于Cupriavidus necator H16的lambda Red重组系统,用于高效的基因组编辑 | 首次在Cupriavidus necator H16中应用lambda Red重组系统,并结合电穿孔技术实现高效的基因删除和稳定基因组整合 | 研究仅验证了三个基因组位点的修改,可能需要在更多位点进行验证以证明其广泛适用性 | 开发高效的基因组编辑方法以优化Cupriavidus necator H16作为生物技术生产宿主的性能 | Cupriavidus necator H16细菌 | 合成生物学 | NA | lambda Red重组系统、电穿孔、PCR | NA | 基因组数据 | 三个不同的基因组位点 |
53 | 2025-05-11 |
Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00840
PMID:39991792
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研究论文 | 开发了在麦胚提取物中起作用的蛋白质响应性上调核糖开关(ON-riboswitches),用于构建多步基因调控级联 | 首次在真核无细胞系统中构建了复杂的基因调控级联,并成功提高了核糖开关的效率 | 初始设计的两种ON-riboswitches效率较低,且需要优化反应条件以防止表达效率降低 | 构建真核无细胞系统中的复杂基因调控电路 | 蛋白质响应性ON-riboswitches和基因调控级联 | 合成生物学 | NA | 核糖开关技术、HHR(锤头状核酶)自切割 | NA | NA | NA |
54 | 2025-05-11 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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research paper | 该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术以优化基因编辑酶的发现和设计,提高活性、特异性和降低免疫原性 | 未提及具体实验验证结果或临床转化时间表 | 开发更安全、高效的基因组编辑工具,以促进临床应用 | 基因编辑酶(如CRISPR-Cas系统) | 合成生物学 | NA | AI/ML模型、理性设计、诱变筛选、定向进化 | AI/ML | NA | NA |
55 | 2025-05-11 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力及其优化方法 | 提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的适应性调整来增强核糖开关调控动态范围的新策略,并展示了将两个盒式外显子组合以增强调控效果的方法 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常局限于特定基因或细胞类型 | 探索合成核糖开关通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力及其优化方法 | 人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因(ALOX5)在HEK293细胞中的表达 | 合成生物学 | NA | 合成核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | HEK293细胞 |
56 | 2025-05-11 |
Review of Recent Advances in Microbial Production and Applications of Nerolidol
2025-Mar-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12579
PMID:40013722
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综述 | 本文综述了橙花叔醇(nerolidol)的生物活性、应用及其微生物生产方法的最新研究进展 | 总结了代谢工程和合成生物学策略在构建微生物细胞工厂生产橙花叔醇方面的应用 | NA | 探讨橙花叔醇在人类健康、农业和食品工业中的潜在应用及其绿色生产前景 | 橙花叔醇及其生物活性衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
57 | 2025-05-11 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417695122
PMID:40009642
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研究论文 | 研究揭示了绿藻中双顺反子mRNA翻译的机制,通过漏核糖体扫描实现ORF2的可调翻译 | 首次在绿藻中证实漏核糖体扫描是双顺反子mRNA翻译ORF2的机制,并展示了通过调控ORF1的Kozak样序列强度可逆调节两个ORF的表达 | 研究仅针对两种绿藻,机制在其他真核生物中的普适性需要进一步验证 | 探究绿藻中多顺反子转录本的翻译机制 | 两种分歧绿藻(未明确命名)的双顺反子基因座 | 分子生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双荧光报告系统 | NA | 基因组数据、荧光报告数据 | 两种绿藻的高置信度手工注释双顺反子基因座数据集 |
58 | 2025-05-11 |
CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models
2025-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13780-2
PMID:40000974
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研究论文 | 本研究设计了一种新型双靶向CAR-NK细胞,用于靶向PD-L1和MICA/B,以增强对肺癌细胞的杀伤效果 | 设计了一种新型双靶向CAR(dtCAR),结合PD-L1纳米抗体和NKG2D,增强了NK细胞的活化和杀伤能力 | 研究仅针对H1299肺癌细胞模型,未涉及其他肺癌细胞类型或临床样本 | 开发一种新型免疫治疗策略,用于治疗肺癌 | 肺癌细胞H1299 | 免疫治疗 | 肺癌 | 合成生物学、CAR-NK细胞工程 | 双靶向CAR(dtCAR) | 体外和体内实验数据 | H1299肺癌细胞模型 |
59 | 2025-05-11 |
A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57280-0
PMID:39988594
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研究论文 | 设计了一种简洁的酶级联反应,用于高效生产天然和非天然的普罗托贝碱类生物碱 | 通过酶发现与工程化,以及系统优化普罗托贝碱类生物碱生物合成中的关键酶,实现了高效生产药物罗通定,并展示了其工业化潜力 | 未提及具体的生产规模限制或酶稳定性问题 | 克服植物源性天然产物在药物开发中因低丰度和结构多样性不足带来的限制 | 普罗托贝碱类生物碱,包括天然和非天然(如卤化)衍生物 | 合成生物学 | NA | 酶级联反应、酶工程 | NA | NA | NA |
60 | 2025-05-11 |
Marine Phytoplankton Bioactive Lipids and Their Perspectives in Clinical Inflammation
2025-Feb-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020086
PMID:39997210
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研究论文 | 探讨海洋浮游植物中具有免疫调节功能的生物活性脂质及其在临床炎症治疗中的潜力 | 提出利用海洋浮游植物作为生物技术平台生产功能性生物活性脂质,用于治疗慢性炎症疾病 | 脂质前体产量需要提高以具备商业竞争力 | 研究海洋浮游植物生物活性脂质在临床炎症治疗中的应用 | 海洋浮游植物中的生物活性脂质 | 生物技术 | 慢性炎症疾病 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |