合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-06-04	Super-robust synthetic microorganism can get chlorine resistance in advance and transfer their inserted DNA sequence in genome to indigenous bacteria in water 2025-Aug-01, Water research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.watres.2025.123594 PMID:40188791	研究论文	研究探讨了超级稳健合成微生物在水环境中的DNA序列转移能力及其对氯的抵抗机制	首次发现超级稳健合成微生物能够将插入的DNA序列转移给土著细菌，并展示出比野生型细菌更强的氯抵抗能力	研究未全面评估超级稳健合成微生物在更复杂环境中的长期生态影响	探究超级稳健合成微生物在水环境中的行为及其对人类健康的潜在风险	超级稳健合成微生物及其与土著细菌的相互作用	合成生物学	NA	CRISPR-Cas基因编辑	NA	实验数据	未明确说明样本数量，但涉及超级稳健合成微生物和野生型细菌的比较研究
42	2025-06-04	Bridging chemistry and biology for light-driven new-to-nature enantioselective photoenzymatic catalysis 2025-Jun-03, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/d4cs00561a PMID:40351234	教程综述	本文综述了光驱动酶催化领域的基本原理和策略，旨在介绍这一新兴的跨学科研究方向	结合光激发的高反应性与生物催化的高选择性，探索新型对映选择性光酶催化系统	未提及具体实验数据或案例研究的局限性	推动可持续不对称合成的发展	光酶催化系统	合成生物学	NA	光催化与酶催化协同	NA	NA	NA
43	2025-06-04	Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa 2025-Jun-03, The FEBS journal DOI:10.1111/febs.70151 PMID:40458033	研究论文	本研究对铜绿假单胞菌中的氯酸歧化酶进行了生化和结构表征	首次报道了铜绿假单胞菌中二聚体氯酸歧化酶的高分辨率晶体结构及其催化机制	未探讨该酶在实际环境修复应用中的效果	研究氯酸歧化酶在环境污染物降解中的应用	铜绿假单胞菌中的氯酸歧化酶	生物化学	NA	X射线晶体学	NA	蛋白质结构数据	NA
44	2025-06-04	Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture 2025-Jun-03, Current microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00284-025-04279-x PMID:40459729	review	本文探讨了利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌MCCB 117中绿脓菌素产量的前景，以作为水产养殖中的首选药物	综述了利用合成生物学工具增强绿脓菌素生物合成的分子机制和潜在方法	NA	探索通过合成生物学手段提高绿脓菌素产量，以应对水产养殖中的弧菌病	铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径	合成生物学	弧菌病	基因水平操作	NA	NA	NA
45	2025-06-04	Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control 2025-Jun-02, Annual review of phytopathology IF:9.1Q1 DOI:10.1146/annurev-phyto-120624-122024 PMID:40455885	review	该文章综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害控制中的作用及其应用	探讨了挥发性有机化合物（VOCs）在生物防治中的关键作用，以及通过定向诱变和合成生物学增强VOC生产剂的潜力	未提及具体实验数据或案例研究来支持理论观点	研究采后病害的生物防治方法，减少对合成杀菌剂的依赖	真菌挥发性有机化合物及其在采后病害控制中的应用	生物防治	采后病害	定向诱变、合成生物学、人工智能在分析化学中的应用	NA	NA	NA
46	2025-06-04	Fusions of Catalytically Inactive RusA to FokI Nuclease Coupled with PNA Enable Programmable Site-Specific Double-Stranded DNA Breaks 2025-May-27, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.4c11282 PMID:40454070	research paper	本研究开发了一种名为PC-FIRA的系统，结合了肽核酸（PNA）的序列特异性结合能力和FokI核酸酶与结构引导的失活RusA解离酶的融合体，实现了精确的双链DNA断裂	PC-FIRA系统无需现有位点特异性核酸酶和结构引导核酸酶的限制，实现了高靶标特异性和切割效率	需要精确的反应条件和适用性验证	开发一种新型的位点特异性双链DNA断裂系统，用于基因组编辑	双链DNA	基因组编辑	NA	PNA耦合技术	NA	DNA序列	多种DNA结构（如Holliday连接体、线性和环状DNA）
47	2025-06-04	Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots 2025-May, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021 PMID:38942381	研究论文	本研究开发了一种多模块组装的prime editing (mPE)系统，显著提高了双子叶植物中多碱基插入的精确编辑效率	提出多模块组装的mPE系统，相比原始PE2系统，在多个基因位点上实现了1.3至1288.5倍的编辑效率提升，尤其擅长多碱基插入（平均提升197.9倍）	研究仅针对双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草，尚未验证在其他植物中的适用性	解决prime editing在双子叶植物中效率低下的问题，开发系统性优化方案	拟南芥(Arabidopsis thaliana)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana)	植物合成生物学	NA	农杆菌介导转化、深度扩增子测序（20-50万clean reads）	多模块组装prime editing系统(mPE)	基因组测序数据	大规模转化实验（具体数量未明确说明）
48	2025-06-04	Exploring potential biosafety implications in DNA information storage 2025-Apr, Biosafety and health IF:3.5Q1 DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006 PMID:40453469	research paper	该研究评估了五种代表性DNA存储编码方法在生物安全性方面的风险，分析了它们与自然生物DNA的序列相似性	首次系统评估了DNA信息存储技术中人工合成DNA序列的生物安全风险，并提出了随机化策略以降低潜在风险	研究仅评估了五种编码方法，可能无法涵盖所有DNA存储技术的生物安全风险	探索DNA信息存储技术的生物安全影响	五种DNA存储编码方法（Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码）	合成生物学	NA	Kraken2分类、BLASTn比对分析	NA	DNA序列数据	五种代表性DNA存储编码方法产生的序列
49	2025-06-03	A cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling 2025-Jun, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01816-w PMID:39806069	研究论文	本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感器信号放大电路，该电路利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入	开发了PSR电路，通过T7 RNA聚合酶的脱靶转录实现核酸输入的回收，提高了生物传感器的灵敏度	未提及具体局限性	扩展无细胞生物传感技术的能力，提高生物传感器的灵敏度	无细胞系统中的基因电路和生物传感器	合成生物学	NA	聚合酶链回收（PSR），DNA链置换电路	NA	核酸	NA
50	2025-06-03	Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation 2025-Jun-01, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202502208 PMID:40451735	研究论文	该研究开发了一种能够长时间产生硫化氢(H₂S)用于治疗性血管舒张的红细胞微反应器	通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中，创建了一种新型的合成生物催化微反应器系统，实现了持续可控的H₂S生成	仅进行了体外实验验证，尚未进行体内研究	开发用于心血管治疗的气体递质递送平台	红细胞微反应器及其在血管舒张中的应用	合成生物学与生物工程	心血管疾病	低渗膨胀法封装技术	NA	生物化学数据、荧光成像数据	体外实验使用分离的胸主动脉环
51	2025-06-03	Bioinformatics analysis and Molecular cloning of Squalene Synthase from Simaroubaceae 2025-May-30, Protein expression and purification IF:1.4Q4 DOI:10.1016/j.pep.2025.106751 PMID:40451315	研究论文	本研究通过生物信息学分析和分子克隆技术，研究了苦木科植物中角鲨烯合成酶（SQS）的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用	首次从苦木科植物的转录组数据中筛选并分析了多种SQS，克隆了AaSQS并验证其功能，鉴定了关键催化残基	仅对苦木科部分物种的SQS进行了研究，未涵盖所有相关物种	研究苦木科植物中角鲨烯合成酶的功能及其在苦木素生物合成途径中的作用	苦木科植物中的角鲨烯合成酶（SQS）	生物信息学	NA	转录组分析、分子克隆、分子对接、突变分析	NA	序列数据	6种苦木科植物的SQS（AaSQS, BjSQS, AeSQS, QaSQS, ElSQS, SaSQS）
52	2025-06-03	Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis 2025-May-24, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069 PMID:40450816	研究论文	本文对钩吻的基因组、转录组和代谢组进行了综合研究，并挖掘了与钩吻碱生物合成相关的酶基因	首次对钩吻的基因组进行测序和组装，并构建了全面的转录组cDNA文库，鉴定了29种生物碱，并验证了两个候选基因在钩吻碱生物合成中的功能	钩吻碱的生物合成途径研究较少，理解不足，限制了通过育种或合成生物学提高钩吻碱产量的能力	研究钩吻中钩吻碱的生物合成途径	钩吻（Gelsemium elegans）	合成生物学	NA	PacBio测序、液相色谱-质谱技术	NA	基因组、转录组、代谢组数据	不同组织和激素处理的钩吻样本
53	2025-06-03	Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation 2025-May-23, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202505316 PMID:40410127	研究论文	本研究提出了一种利用光响应DNA液滴通过动态相分离控制酶级联途径的新方法	设计了带有偶氮苯修饰粘性末端的Y-motif序列，形成光响应DNA液滴，实现了对酶级联途径的动态调控	仅测试了两种酶级联系统，需要更多系统验证方法的普适性	开发一种调控酶级联途径的新方法	光响应DNA液滴和酶级联系统	合成生物学	NA	液-液相分离技术	NA	NA	测试了两种酶级联系统（GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT）
54	2025-06-03	Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00574 PMID:39509282	review	本文综述了细菌无细胞系统中的天然和工程调控组件及其应用	全面概述了无细胞系统中调控组件的使用，包括天然和工程化的组件	NA	探讨无细胞系统中调控组件的应用及其在合成生物学中的重要性	细菌无细胞系统中的调控组件	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
55	2025-06-03	Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00615 PMID:39509658	research paper	探讨合成生物学如何影响细菌纤维素（BC）基生物材料的现状及其在工程活性材料（ELMs）中的应用	结合合成生物学与材料科学，开发具有编程生物功能的可持续材料，并探索3D生物打印在BC基ELMs中的潜在应用	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持	研究合成生物学如何推动细菌纤维素基材料的创新及其在生物医学等领域的应用	细菌纤维素（BC）及其衍生的工程活性材料（ELMs）	合成生物学与材料科学	NA	3D生物打印	NA	NA	NA
56	2025-06-03	Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00149 PMID:39555579	研究论文	本文开发了一种新型的αCD206-synNotch受体，用于研究肿瘤微环境中巨噬细胞与癌细胞之间的瞬时相互作用	开发了针对CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch受体，这是一种新型的合成受体，可用于监测和理解巨噬细胞与癌细胞之间的相互作用对转移建立的影响	研究中发现了关于其应用的一些意外注意事项，具体细节未明确说明	开发新型合成受体以研究肿瘤微环境中巨噬细胞与癌细胞的相互作用	CD206巨噬细胞和癌细胞	合成生物学	癌症	synNotch受体工程	小鼠转移模型	NA	NA
57	2025-06-03	Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00388 PMID:39558834	research paper	本研究介绍了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP，用于细菌光遗传学应用	开发了首个红光诱导的Cre重组酶系统，解决了现有光遗传工具主要响应蓝光的限制，并展示了红光在密集培养穿透性和低毒性方面的优势	NA	开发适用于细菌的多色光遗传控制系统	细菌基因表达和DNA切除的光控系统	合成生物学	NA	光遗传学技术	OptoCre-REDMAP系统（基于PhyA和FHY1植物光感受器与分裂Cre重组酶）	NA	NA
58	2025-06-03	Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00221 PMID:39573840	research paper	研究SKIK肽标签如何缓解由连续脯氨酸残基引起的翻译停滞，并揭示其与EF-P协同促进翻译的机制	发现SKIK肽标签能有效缓解WPPP引起的翻译停滞，并揭示其与EF-P的协同作用	研究主要基于体外翻译反应和体内蛋白质生产系统，未涉及更复杂的生物环境	优化蛋白质生产过程以推动合成生物学应用	核糖体停滞肽（RAPs）如SecM AP和WPPP	合成生物学	NA	PURE无细胞蛋白质合成和体内蛋白质生产系统	NA	蛋白质序列和翻译效率数据	未明确提及具体样本数量
59	2025-06-03	Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00336 PMID:39601053	研究论文	本文探讨了通过基因修饰宏观活体材料的蛋白质基质来控制其结构和流变学特性的方法	研究了弹性蛋白样多肽（ELP）长度变化对活体材料微观结构和粘弹性行为的影响，揭示了序列-结构-特性之间的关系	研究结果与其它生物复合材料模型的相似性较少，复杂性较高	探索活体工程材料（ELMs）的序列、结构和流变学特性之间的关系	弹性蛋白样多肽（ELP）修饰的宏观活体材料	生物材料工程	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
60	2025-06-03	Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00627 PMID:39610115	研究论文	该研究开发了一种由吲哚激活的T7 RNA聚合酶变体，用于合成生物学中的精确基因表达调控	首次实现了全长单亚基T7 RNA聚合酶通过生理浓度吲哚的化学诱导激活，创建了新型配体激活核酸聚合酶(LARPs)平台	EC50值为344 μM的激活效率可能在某些应用中需要优化	开发化学诱导的基因表达调控系统用于合成生物学应用	T7 RNA聚合酶变体及其在细菌中的调控应用	合成生物学	NA	理性设计、定向进化	NA	NA	NA