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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-07 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 本研究对榕树(Ficus microcarpa)中三萜类化合物生物合成的关键酶和基因对进行了功能表征 | 首次鉴定了桑科中罕见的多功能ψ-蒲公英固醇合酶FmOSC1,并定位了其与α-香树脂醇主导的FmOSC2的关键差异残基 | 未明确说明研究的局限性 | 解析榕树中三萜类化合物生物合成的遗传基础 | 榕树中的八种氧化鲨烯环化酶(FmOSC1-8)和细胞色素P450酶(FmCYP716A520) | 生物化学 | NA | 功能表征、序列分析、酶活性检测 | NA | 基因序列、酶产物结构数据 | 八种氧化鲨烯环化酶和一种细胞色素P450酶 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 42 | 2026-06-07 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 探讨生物工厂如何通过集成自动化、人工智能和标准化工作流程来推动酵母工程的高通量发展 | 强调了从设计-构建-测试-学习循环向设计-构建-部署循环的转变,并展望了自主优化型“自驱动实验室”的未来 | 协议可变性和人工智能工具的集成仍是关键障碍 | 实现可扩展的合成生物学和自主酵母工程 | 酵母工程中的菌株开发流程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 43 | 2026-06-07 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
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综述 | 本文综述了基于无细胞系统的生物传感器的设计、功能和临床应用 | 强调了无细胞系统在生物传感器开发中的模块化、可定制化和快速响应优势,并探讨了与智能技术(如物联网)的结合 | 当前无细胞生物传感器面临保质期、灵敏度和可扩展性等限制 | 全面介绍无细胞生物传感器的设计原理和应用潜力 | 无细胞生物传感器及其在病原体检测、环境监测等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 体外转录和翻译 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 基因电路、信号输出策略 | 医疗保健, 环境科学, 农业, 食品安全 |
| 44 | 2026-06-07 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
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综述 | 本文探讨了无细胞系统与自动化和机器人技术结合在生物技术和生物工程领域的变革作用 | 系统性地分析了无细胞系统与自动化平台集成的设计、功能和局限性,并强调了人工智能和机器学习在实验设计和过程优化中的潜力 | 面临标准化、更稳健经济的无细胞提取物制备以及AI/ML集成等挑战 | 推动无细胞系统与自动化和机器人技术的融合,以加速发现、开发创新生物材料并拓宽生物技术应用 | 无细胞蛋白合成(CFPS)系统、自动化机器人平台(微流控装置、液体处理机器人、集成分析平台) | 生物工程 | NA | 无细胞蛋白合成(CFPS) | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学电路 | 生物技术,生物工程 |
| 45 | 2026-06-07 |
Exploring the frontier of rapid prototyping technologies for plant synthetic biology and what could lie beyond
2024-05, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19650
PMID:38426415
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综述 | 综述了植物合成生物学中快速原型技术的进展,探讨如何通过设计-构建-测试循环加速研究 | 系统分析了多种快速原型技术的互补优势,并提出未来整合这些策略的可能性以实现植物合成生物学的快速规模化部署 | 现有技术各有局限,限制了广泛适用性,且快速原型技术的结合策略仍处于理论阶段 | 探索快速原型技术如何克服植物合成生物学中基因转化周期长、世代时间长和实验规模限制等瓶颈 | 植物合成生物学中的快速原型技术 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 设计-构建-测试循环(含快速原型技术) | 农业, 生物学研究 |
| 46 | 2026-06-07 |
Visioning synthetic futures for yeast research within the context of current global techno-political trends
2023-10, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.3897
PMID:37653687
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综述 | 本文综述了酵母研究在当前全球技术政治趋势下的新方向,重点关注酿酒酵母,并将这些趋势置于其地缘政治背景中 | 将酵母研究的新科学工具和方向与全球技术竞争的地缘政治背景相结合,强调生命科学与信息科学的融合 | 作为综述,未提供具体实验数据或验证新方法 | 概述酵母研究的新方向,并探讨其在全球技术政治背景下的机遇和挑战 | 酿酒酵母 | 合成生物学, 生命科学 | NA | 计算机辅助设计, AI工具, 合成基因组技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 计算机辅助设计工具 | 酿酒酵母 | 合成基因组, 最小基因组, 泛基因组, 新染色体, 宏基因组 | 工业生物技术, 农业, 环境, 医学 |
| 47 | 2026-06-06 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
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综述 | 系统综述AI-2的双重结构动态、受体多样性及其在菌群互作中的调控机制 | 首次系统整合AI-2双重结构动态(S-THMF-硼酸盐/R-THMF互变)及其在细菌间通讯中的环境依赖性角色,并梳理受体多样性(如LuxP与LsrB)及信号传导机制 | 未深入探讨空间异质性对AI-2介导通讯的影响及多群体感应系统协调的机制 | 解码AI-2作为通用语言在菌群通讯中的作用,并绘制其在化学工程与环境可持续性中的应用路线 | AI-2信号分子及其介导的微生物群落互作 | 微生物组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 健康, 农业, 工业, 环境生态 |
| 48 | 2026-06-06 |
Melatonin-enabled omics: understanding plant responses to single and combined abiotic stresses for climate-smart agriculture
2026-Dec, GM crops & food
DOI:10.1080/21645698.2026.2614130
PMID:41589633
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综述 | 本文综述了褪黑素在基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等多组学层面调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制,并探讨了多组学整合(泛组学)方法及遗传工程和合成生物学在气候变化智慧农业中的应用潜力 | 首次系统整合褪黑素在多组学层面(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学)调控植物非生物胁迫耐受性的机制,并强调多组学交叉和泛组学方法的应用 | 作为综述,未提供新的实验数据,且各研究间方法、物种和胁迫条件差异较大,限制了结论的直接可比性 | 阐明褪黑素通过多组学调控植物应对单一和复合非生物胁迫的机制,并为培育气候智慧型作物提供策略 | 植物在单一和复合非生物胁迫下的多组学响应 | 机器学习 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、miRNA组学、表观基因组学、表型组学、离子组学、微生物组学) | NA | 多组学数据 | NA | 遗传工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 49 | 2026-06-06 |
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101619
PMID:42242210
|
综述 | 探讨合成生物学如何通过自下而上的方法阐明胚胎发育的一般原理和因果机制 | 强调合成系统虽简化但能测试发育潜力极限、厘清因果关系并为预测模型提供依据 | 未明确讨论合成系统与自然系统的差异及简化带来的潜在偏差 | 理解多细胞组织如何从细胞间相互作用中涌现 | 合成生物学重建的发育过程(干细胞与合成生物学重建的类胚胎系统) | 合成生物学、发育生物学 | NA | 基因工程、成像技术、计算建模 | NA | NA | NA | 基因组工程 | NA | NA | 医学、发育生物学研究 |
| 50 | 2026-06-06 |
Living buildings with living electronics: towards biologically intelligent biohybrids
2026-Jun-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.015
PMID:42242980
|
观点文章 | 探讨将电活性生物膜作为生物智能组件融入建筑,实现从实验室原型到集成架构的转型 | 提出将电活性生物膜编程为生物晶体管和逻辑处理器等生物智能组件,而非简单生物催化剂,实现建筑功能化 | 未明确提及局限,可能涉及从实验室原型到实际建筑集成的技术挑战和规模化问题 | 规划电活性生物膜混合生物-人工系统从实验室原型向分布式资源回收集成架构的转型路线 | 电活性生物膜及其在建筑中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 电活性生物膜 | 生物晶体管、逻辑处理器 | 建筑、环境、工业生物技术 |
| 51 | 2026-06-06 |
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03036-4
PMID:42243878
|
综述 | 探讨药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 | 系统综述了多组学技术与合成生物学在激活沉默基因簇和提高代谢物产量中的应用,并提出了产业化面临的挑战与解决方案 | 大规模生产中产量低、沉默基因簇难激活、规模化困难仍是主要障碍 | 揭示内生真菌作为生物工厂生产生物活性次级代谢物的潜力及未来研究方向 | 药用植物内生真菌及其产生的生物活性次级代谢物 | 天然产物发现与生物技术 | 癌症、感染性疾病、炎症、糖尿病 | OSMAC共培养、表观遗传修饰、基因组学、转录组学、代谢组学 | NA | 基因组、转录组、代谢组数据 | NA | 合成生物学工具 | 药用植物内生真菌 | 生物合成基因簇调控与代谢途径工程 | 医药、环境友好型制药 |
| 52 | 2026-06-06 |
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Jun, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.03.006
PMID:42034479
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综述 | 本文综述了在遗传编码中同时引入多种非规范氨基酸的研究进展 | 介绍了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子库实现多种非规范氨基酸同时编码的突破性技术,特别是哺乳动物系统中稀有密码子重新编码与终止密码子抑制的整合实现了五种不同非规范氨基酸的遗传编码 | 未明确阐述当前技术的局限性 | 总结在遗传编码中同时编码多种不同非规范氨基酸的变革性进展 | 多种非规范氨基酸及其遗传编码系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码, 非规范氨基酸(ncAA)引入, 密码子重新编码, 终止密码子抑制 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医药, 合成生物学 |
| 53 | 2026-06-06 |
Antimicrobial discovery from underexplored environments: unlocking specialized metabolism
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102745
PMID:41880737
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综述 | 探讨从未充分探索环境中发现抗生素的新策略,重点介绍先进培养技术、多组学、合成生物学和人工智能如何解锁隐秘的微生物代谢途径以应对抗生素耐药性危机 | 整合生态学、组学、合成生物学和人工智能等新兴方向,覆盖从稀有微生物群落到古菌及古代蛋白质组挖掘的跨维度创新方法 | 未具体讨论这些新策略在实际应用中的可扩展性、成本效益及潜在生态环境影响 | 总结和推进从新环境中发现抗生素的研究方向,填补抗生素发现创新缺口 | 常规土壤微生物以外的未被充分探索的微生物资源(稀有分类群、古菌、未培养微生物、古代蛋白质组) | 机器学习 | 抗微生物耐药性相关疾病 | 多组学、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 54 | 2026-06-06 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 系统总结了通过代谢工程和合成生物学手段改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 | 首次全面梳理了Rhodobacter sphaeroides作为微生物底盘在萜类和四吡咯生物合成中的代谢灵活性及工程改造策略 | 未涉及大规模工业生产中成本控制和长期稳定性挑战 | 评估并展示Rhodobacter sphaeroides作为平台生物在合成生物学和工业生物生产中的应用潜力 | 紫色非硫光合细菌Rhodobacter sphaeroides | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学, 发酵控制 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 55 | 2026-06-06 |
Engineering an Artificial Taxol Biosynthetic Pathway from Baccatin III in Yeast
2026-May-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00148
PMID:42186953
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研究论文 | 本文在酵母中构建了一条人工紫杉醇生物合成途径,从巴卡亭III出发仅需三步酶促反应即可转化为紫杉醇 | 构建了一条人工途径替代天然复杂途径,利用β-苯丙氨酰辅酶A连接酶的广泛底物范围和结构-活性分析改造BAPT酶以提高对非天然底物的催化效率 | 目前该途径仍处于酵母工程初步阶段,可能面临产量和可扩展性等瓶颈挑战 | 利用合成生物学实现紫杉醇的可持续生产,解决其半合成方法成本高和条件苛刻的问题 | 酵母细胞以及紫杉醇生物合成相关酶(PCL和BAPT) | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程 | NA | NA | NA | 酵母代谢工程 | 酿酒酵母 | 人工紫杉醇生物合成途径(将巴卡亭III转化为紫杉醇的三步酶促途径) | 医学, 工业生物技术 |
| 56 | 2026-06-06 |
Decoding heavy metal tolerance in rice: Nucleic acid-based technologies shaping global food security
2026-May-25, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152693
PMID:42190784
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综述 | 回顾核酸基技术在提升水稻重金属耐受性中的应用,从QTL定位到CRISPR编辑及多组学分析的最新进展 | 系统梳理了从QTL定位、群体GWAS、泛基因组到CRISPR基因组编辑的完整技术演化路径,整合转录组、表观基因组和宏基因组工具揭示重金属耐受机制 | 特异性与必需性困境、多金属拮抗(镉/砷氧化还原冲突)以及调控分歧(SDN-1豁免与转基因分类差异)构成主要障碍 | 阐明核酸基技术如何重构水稻重金属耐受性的发现到部署流程,保障全球粮食安全 | 水稻(特别是镉和砷耐受性与低累积品系) | 机器学习 | 肺癌 | QTL定位,GWAS,CRISPR-Cas9,转录组学,表观基因组学,宏基因组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,表观基因组数据,宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | NA | 农业,食品 |
| 57 | 2026-06-06 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-May-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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research paper | 本文报道了一种通过将蛋白-脂质偶联物后插入到预先形成的脂质体中,自下而上生成病毒样颗粒的方法 | 利用SNAP-tag/BG生物正交反应实现蛋白-脂质共价偶联,并实现无洗涤剂插入脂质双层,解耦偶联物设计与脂质体设计,促进病毒样颗粒的快速系统优化 | NA | 开发一种自下而上的方法生成脂质体病毒样颗粒,用于疫苗递送和合成生物学等应用 | SARS-CoV-2 Spike蛋白与绿色荧光蛋白(GFP)构建的病毒样颗粒 | synthetic biology | COVID-19 | NA | NA | NA | NA | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物后插入脂质体形成病毒样颗粒 | medicine, vaccine development, drug delivery, synthetic biology |
| 58 | 2026-06-06 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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综述 | 对1994-2024年间植物基因工程领域的全球趋势和合作网络进行文献计量分析 | 首次系统揭示植物基因工程领域的国际合作双核心结构,并预测未来技术方向包括种质数字化、多基因编辑、智能育种和合成生物学 | NA | 系统分析植物基因工程全球趋势及合作网络 | 全球植物基因工程相关文献 | 文献计量学 | NA | 文献计量分析 | NA | 文本 | 1994-2024年全球文献数据 | CRISPR-Cas9, 农杆菌介导转化, RNA干扰 | 烟草 | NA | 农业 |
| 59 | 2026-06-06 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
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研究论文 | 构建了一个综合合成基因电路,将生物化学信号(NO)转化为电信号,实现电化学生物传感 | 通过合成生物学工具设计间接电子传递(IET)通路,结合NO响应模块和PCA合成模块,创制电活性细菌以增强电信号输出,首次实现单细胞水平NO的原位电化学检测 | 受限于合成基因电路的复杂性和工程改造细菌的稳定性,实际应用可能面临长期运行和转化效率挑战 | 开发基于工程电活性微生物的电化学生物传感器,用于细胞内信号分子的高灵敏检测 | 作为电活性细菌模型的大肠杆菌(Escherichia coli),以及信号分子一氧化氮(NO) | 合成生物学、电化学生物传感 | NA | 合成生物学、电化学检测、间接电子传递通路、基因电路工程 | NA | 电化学信号数据 | 单细胞水平检测,具体样本数量未提及 | Synthetic Biology, 基因电路设计 | 大肠杆菌 (Escherichia coli) | NO响应模块与PCA合成模块耦合的合成基因电路,实现生化信号转电信号 | 医学(如生物传感诊断)、环境监测、生物技术 |
| 60 | 2026-06-06 |
One-step construction of robust protocells and prototissues in water
2026-Apr-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71650-2
PMID:41951631
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研究论文 | 提出一种气液微流控辅助扩散抑制络合策略,实现原细胞和原组织的一步法稳健构建 | 首次实现低成本、高通量原细胞制造及厘米级三维原组织精确构建,所得原组织在水和空气中均具良好机械完整性 | 未说明具体限制 | 开发稳健原细胞和原组织的构建方法并模拟复杂生命行为 | 原细胞和原组织 | NA | NA | 气液微流控辅助扩散抑制络合 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物工程 |