合成生物学相关文章
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当前共找到 3249 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-06-12 |
Toehold Switch-Based Approach for Engineering Acid-Tolerance Modules to Enhance Production Robustness of Industrial E. coli Strains at Low pH
2025-Jun, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70175
PMID:40485106
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研究论文 | 本研究提出了一种基于toehold switch的合成生物学方法，用于增强工业大肠杆菌菌株在低pH条件下的酸耐受性 | 利用toehold switch构建酸耐受模块，整合多种酸响应启动子和抗酸基因，显著提高工业菌株在低pH条件下的生产稳定性 | 研究仅针对特定工业赖氨酸生产菌株，未验证在其他工业菌株中的普适性 | 提高工业微生物的酸耐受性以增强发酵效率和可持续性 | 工业大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | toehold switch技术 | NA | 基因表达数据 | 约10个构建模块，包含4种酸响应启动子和18个抗酸基因 |
| 42 | 2025-06-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文综述了微流控系统中软物质和多相系统（如液滴和囊泡）在电场调控下的传输动力学 | 系统地研究了电场强度、流体特性和膜特性对软物质传输动力学的耦合影响，并探讨了囊泡与简单液滴在电动力学行为上的独特差异 | 存在稳定性、可扩展性和可重复性等挑战 | 研究电场调控下软物质和多相系统在微流控系统中的传输行为 | 液滴和囊泡 | 微流控 | NA | 高精度成像、微操作和复杂计算建模 | NA | NA | NA |
| 43 | 2025-06-12 |
Intranodal injection of neoantigen-bearing engineered Lactococcus lactis triggers epitope spreading and systemic tumor regressions
2025-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.02.041
PMID:40486831
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research paper | 该研究开发了一种携带新抗原的工程化乳酸乳球菌（Ag-FOLactis），通过淋巴结注射触发表位扩散和系统性肿瘤消退 | 利用Plug-and-Display系统在FOLactis表面展示肿瘤抗原，显著增强树突状细胞呈递和新抗原特异性细胞免疫，诱导局部反应性T细胞数量增加45倍并引发表位扩散 | NA | 开发一种基于益生菌的个性化肿瘤免疫治疗平台 | 工程化乳酸乳球菌（FOLactis）及其携带的新抗原肽（Ag-FOLactis） | 免疫治疗 | 肿瘤 | Plug-and-Display系统 | 皮下和转移性肿瘤模型 | NA | NA |
| 44 | 2025-06-12 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
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research paper | 探讨利用天然产物、合成生物学和人工智能技术开发下一代治疗方法 | 结合eXchange Unit between Thiolation domains方法和AI驱动工具（如Synthetic Intelligence）改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程，创造新型生物活性化合物 | NA | 解决抗生素耐药性和癌症等关键挑战，扩展化学空间并优化生物合成途径 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程 | synthetic biology, artificial intelligence | antibiotic resistance, cancer | eXchange Unit between Thiolation domains approach, Synthetic Intelligence | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-06-12 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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research paper | 该研究利用合成生物学方法开发了一种能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程细菌，这种细菌能够增强光的聚焦 | 通过工程化细菌表达硅酸盐生物矿化酶，使其能够自组装聚硅酸盐外壳，形成具有可调结构特性的活体微透镜，其光聚焦能力比未修饰细菌强近一个数量级 | NA | 开发一种环境友好、具有可调结构特性的活体微透镜，用于光聚焦和操纵 | 工程化细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 46 | 2025-06-11 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Jun-10, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 介绍了一种名为DASH的多功能高容量基因堆叠系统，用于植物合成生物学 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点，解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种更高效、灵活的基因组装工具，用于植物合成生物学 | 植物基因组装系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、重组工程、位点特异性重组酶系统 | NA | DNA序列 | 一个116 kb的DNA构建体，包含35个转录单元 |
| 47 | 2025-06-11 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Jun-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
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研究论文 | 该研究开发了一个用于识别宿主诱导细菌生物传感器的发现平台，扩展了生物传感器筛选的灵活性和能力 | 利用细菌记忆电路构建了来自多种肠道细菌的传感器组件库，并通过超变DNA条形码实现并行追踪数千个独特克隆 | 研究中使用的传感器组件库可能仍有限，且需要进一步验证其在不同环境中的稳定性和可靠性 | 开发合成生物学工具，用于复杂环境中的部署，如肠道内的合成功能自主控制和炎症性疾病的非侵入性监测 | 肠道微生物及其传感器组件 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | 双组分系统识别和克隆流程，超变DNA条形码技术 | NA | 基因序列数据 | 数千个独特克隆，对应约150个潜在生物传感器 |
| 48 | 2025-06-11 |
Synthetic CRISPR Networks Driven by Transcription Factors via Structure-Switching DNA Translators
2025-Jun-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06913
PMID:40491004
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research paper | 该研究介绍了一个利用转录因子（TFs）通过工程DNA翻译器调控CRISPR-Cas12a反式切割活性的平台 | 通过动态DNA结构响应TF结合并调控Cas12a活性，建立了TF作为CRISPR-Cas系统有效调控因子的新方法 | 研究中仅使用了TATA结合蛋白和Myc-Max作为TF模型，可能不适用于所有类型的转录因子 | 开发一种新型的CRISPR-Cas系统调控平台，用于合成生物学应用 | 转录因子（TFs）和CRISPR-Cas12a系统 | synthetic biology | NA | CRISPR-Cas12a, DNA翻译器技术 | NA | NA | NA |
| 49 | 2025-06-11 |
Codes across (life)sciences
2025-Jun-07, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
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综述 | 本文探讨了“代码”在不同学科中的含义、意图和形式化，并试图构建一个跨学科的代码研究框架 | 提出了一个跨学科的视角，探讨代码在生物学、心理学、文化等领域的作用，并展望了生物代码与机器逻辑的未来融合 | 文章更多是概念性讨论，缺乏具体的实验验证或数据分析 | 探索代码在不同学科中的共性和潜在的统一理论 | 代码在数学、计算机科学、心理学、生物学等领域的应用和影响 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-06-11 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台，用于在大肠杆菌中实现模块化和信号响应的转录调控 | 整合了转录因子生物传感器与FnCas12a CRISPR系统，利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应的mRNA转录物处理crRNA，实现了精确的信号依赖性转录调控 | NA | 克服现有转录调控工具的局限性，扩展合成生物学中转录调控工具的功能 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a CRISPR系统 | NA | NA | NA |
| 51 | 2025-06-11 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
|
research paper | 利用迭代深度学习设计人类增强子，利用浓缩序列语法实现细胞类型特异性 | 应用迭代深度学习设计合成增强子，实现两种人类细胞系之间的强差异活性，并通过实验验证和模型再优化提高特异性 | 仅针对两种人类细胞系进行研究，未涉及更广泛的细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型的基因表达问题 | 人类增强子序列 | synthetic biology | NA | iterative deep learning | deep learning | sequence data | two human cell lines |
| 52 | 2025-06-11 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
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研究论文 | 本文描述了三种小分子和两种细胞接触诱导系统在小鼠胚胎干细胞(mESCs)中用于基因表达和分化的特性 | 在小鼠胚胎干细胞中首次详细表征了小分子和细胞接触诱导系统的功能，并展示了这些系统在驱动mESCs直接分化为神经元中的应用 | 现有合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的表征较少 | 研究合成发育生物学方法，以理解多细胞性并控制细胞行为 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成生物学 | NA | 基因表达控制系统 | NA | NA | NA |
| 53 | 2025-06-11 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
research paper | 探讨了无生命物质与生命之间的区别，以及物理学与细胞生物化学之间的紧密耦合如何揭示物质/生命关系 | 结合实验和计算进展，探索物理学与细胞生物化学的深度耦合，为理解物质与生命的关系提供新视角 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建一个活细胞，表明对生命本质的理解仍有限 | 探索物质与生命之间的区别，以及如何通过物理学和生物化学的耦合来理解这一关系 | 生物细胞及其物理和生物化学特性 | systems biology | NA | whole-cell modeling and synthesis | NA | NA | NA |
| 54 | 2025-06-11 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
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研究论文 | 本研究展示了在Komagataella phaffii中通过T7 RNAP/CRISPRa系统构建合成遗传电路的潜力 | 利用T7转录系统有效表达sgRNA，并通过插入tRNA序列增强转录激活效率，设计了能进行布尔逻辑运算的基因电路 | NA | 探索在工业Komagataella phaffii菌株中构建基因调控工具包 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa, T7转录系统, Tet-on诱导系统, split-T7系统, HH-HDV RNA切割处理 | NA | NA | NA |
| 55 | 2025-06-11 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
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review | 本文系统总结了碱基编辑技术的发展历史、最新进展及其在工业微生物构建中的应用 | 全面概述了多种主要碱基编辑器（如CBEs、ABEs、CRISPR-free碱基编辑器等）及其优化策略，并探讨了其在工业微生物构建中的应用 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 工业微生物（如枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒状杆菌、酿酒酵母等） | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术（如CBEs、ABEs、CGBEs等） | NA | NA | NA |
| 56 | 2025-06-11 |
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204920
PMID:40493005
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研究论文 | 该研究介绍了一套小分子和细胞接触诱导系统，用于控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 | 开发了新的小分子和细胞接触诱导系统，用于模拟发育过程 | NA | 研究发育生物学的原理 | 小鼠胚胎干细胞 | 合成生物学 | NA | 小分子和细胞接触诱导系统 | NA | NA | NA |
| 57 | 2025-06-11 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计具有强细胞类型特异性的合成增强子 | 利用迭代深度学习方法设计合成增强子，实现细胞类型特异性基因表达 | 仅验证了两种人类细胞系中的增强子活性 | 解决合成生物学中靶向特定细胞类型基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | NA | 基因组序列数据 | 两种人类细胞系 |
| 58 | 2025-06-11 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
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综述 | 本文探讨了利用铁硫（Fe-S）酶进行合成生物学的核心挑战及解决方案 | 总结了Fe-S酶在工程代谢途径中的三个核心挑战，并提出了克服这些挑战的方法 | 尚未实现工业规模应用，仍处于研究阶段 | 开发工业级Fe-S酶依赖的生物合成途径 | 铁硫（Fe-S）酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测与设计 | NA | NA | NA |
| 59 | 2025-06-10 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-09, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 本文设计并验证了一个名为pXpressome的工具包，用于稳健表达和纯化α-羧酶体，并研究了其结构和性能的调控 | 开发了pXpressome工具包，能够稳健表达和纯化α-羧酶体，并通过荧光标记构建体观察到更均匀的表达和更好的细胞健康状态 | NA | 促进羧酶体的研究和重新设计，以增强碳固定或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧酶体 | 合成生物学 | NA | 荧光标记 | NA | NA | NA |
| 60 | 2025-06-10 |
Sensl: a synthetic biology sensor for tracking strigolactone signaling in rice
2025-Jun-08, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70242
PMID:40484984
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |