本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-12-11 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-Dec-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
|
综述 | 本文综述了细菌芳香聚酮生物合成中的氧化重排反应,重点介绍了相关氧化还原酶在结构多样性和生物活性形成中的作用 | 系统总结了细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排的化学规律和酶学机制,包括Baeyer-Villiger、Favorskii型重排及创新碳骨架重排 | NA | 阐明细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的化学和酶学基础 | 细菌芳香聚酮生物合成途径中的氧化还原酶及其催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 42 | 2025-12-11 |
Advances in Producing Health-Promoting Punicic Acid: From Extraction Technologies to Cutting-Edge Biotechnology Innovations
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12722
PMID:41284366
|
综述 | 本文综述了促进健康pun酸的生产进展,从提取技术到前沿生物技术创新 | 探讨了微波、超声波、酶辅助和超临界流体辅助提取技术,以及合成生物学在植物和微生物中优化pun酸积累的生物技术进展 | NA | 提高pun酸的产量、纯度和稳定性,以促进其在功能性食品中的广泛应用 | pun酸(一种ω-5多不饱和脂肪酸) | NA | NA | 微波提取、超声波提取、酶辅助提取、超临界流体辅助提取、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物、微生物 | 调整脂肪酸谱以促进pun酸积累 | 食品、工业生物技术 |
| 43 | 2025-12-11 |
Dietary Saponins as Antiaging Agents: A Systematic Review of Molecular Mechanisms, Nutritional Intervention, and Product Development
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12207
PMID:41288460
|
综述 | 本文系统综述了膳食皂苷作为抗衰老剂的分子机制、结构-活性关系及产品开发 | 系统总结了膳食皂苷通过多种信号通路(如Nrf2/HO-1、PI3K/Akt等)实现抗衰老的分子机制,并探讨了基于合成生物学和纳米封装的产品开发策略 | 未涉及具体临床验证数据,未来需优先研究高纯度单体并进行临床疗效验证 | 探讨膳食皂苷在抗衰老及年龄相关疾病中的作用机制与应用开发 | 膳食皂苷(来源于植物等) | 营养学与衰老生物学 | 年龄相关疾病 | 系统综述方法 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学(功能食品或营养补充剂) |
| 44 | 2025-12-11 |
A Reporter System for Assessment of Transcription from Divergently Oriented Promoters in Pseudomonas putida
2025-Dec-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00723
PMID:41367291
|
研究论文 | 本研究开发了一种针对恶臭假单胞菌优化的质粒基双报告系统,用于同时监测发散启动子区域的基因表达 | 开发了首个针对恶臭假单胞菌优化的双荧光报告系统,结合毒素-抗毒素模块实现无抗生素选择下的质粒维持,并允许动态评估转录活性 | 在测试条件下,基于排斥子的转录抑制效率有限 | 开发用于恶臭假单胞菌基因表达监测的快速、灵敏、非侵入性工具 | 恶臭假单胞菌及其生物膜相关基因 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、荧光报告系统、共聚焦显微镜 | NA | 荧光图像、基因表达数据 | NA | 质粒构建、毒素-抗毒素模块 | 恶臭假单胞菌 | 双荧光报告系统,包含SYFP2和Scarlet-I3荧光蛋白,用于监测发散启动子活性 | 工业生物技术 |
| 45 | 2025-12-11 |
Protein-Based Nanostructures: Column-free Biosynthesis of Bundlemer Peptides with Programmable, Orthogonally Reactive Handles for Nanomaterial Construction
2025-Dec-10, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17204
PMID:41369150
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于重组表达的、可编程的束状肽(bundlemer)生物合成平台,用于构建具有明确结构和功能的蛋白质纳米结构 | 通过融合pH可切割的intein-inclusion body实现无柱纯化,并整合SpyTag和sortase识别基序,实现了正交、可编程的组装策略 | NA | 开发模块化的蛋白质纳米结构构建平台,以模拟自然界蛋白质的多尺度精确组装 | 工程化的卷曲螺旋束状肽(bundlemer)及其融合构建体 | 合成生物学 | NA | 重组表达、TEM、SEC-MALS、SDS-PAGE、DLS | NA | NA | NA | SpyCatcher-SpyTag ligation, sortase-mediated ligation | NA | NA | 生物材料工程、靶向药物递送、合成生物学 |
| 46 | 2025-12-11 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2025-Dec-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
|
综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合结构生物学、计算模拟与多种工程化技术,结合机器学习与高通量筛选,以克服萜烯合酶催化复杂性和序列-功能相关性弱的挑战 | 萜烯合酶催化复杂性高且序列-功能相关性弱,这构成了显著的工程化挑战 | 工程化I类萜烯合酶以生成多样化的萜烯骨架,这是合成生物学的一个关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制导向工程、半理性与随机方法(如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化)、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | 结构引导设计、进化方法、机制导向工程、丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化 | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 47 | 2025-12-11 |
Rewiring central metabolism in Komagataella phaffii for efficient mannose synthesis
2025-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02886-8
PMID:41366679
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母,重塑其中心代谢途径,实现了高效的甘露糖生物合成 | 采用双碳源系统(甘油用于生物质生成,葡萄糖用于甘露糖合成),通过敲除和下调关键基因(pfk2、pfk1、zwf1)重塑糖酵解和磷酸戊糖途径,同时抑制副产物生成基因并过表达异源磷酸酶基因yniC,最终在微生物发酵中获得了目前报道的最高甘露糖滴度(约121.1 g/L) | NA | 通过代谢工程改造酵母中心代谢途径,实现高效、大规模的甘露糖生物合成 | Komagataella phaffii酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因敲除、基因下调、基因过表达、高细胞密度补料分批发酵 | NA | NA | NA | 基因敲除、基因下调、基因过表达 | Komagataella phaffii(酵母) | 甘露糖生物合成途径的重塑:包括糖酵解通量衰减(pfk2敲除、pfk1下调)、磷酸戊糖途径通量减少(zwf1下调)、F6P向甘露糖转化增强(磷酸甘露糖异构酶抑制、大肠杆菌来源的yniC磷酸酶过表达),以及副产物生成途径阻断(阿拉伯糖醇和核糖醇相关基因删除) | 工业生物技术 |
| 48 | 2025-12-11 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2025-Dec-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
|
研究论文 | 本文报告了首个使用中性双组分系统在生理pH下促进cAMP和AMP跨脂质体膜转运的实例 | 首次实现了cAMP和AMP通过人工设计的小分子系统进行跨膜转运,结合合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物以提高效率 | NA | 研究核苷酸跨膜转运机制,开发新型药物递送和合成生物学工具 | cAMP和AMP核苷酸 | 合成生物学 | NA | 荧光实验、P NMR实验 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 合成生物学 |
| 49 | 2025-12-11 |
Nanotechnology-based cytokine delivery strategies in gastrointestinal cancers
2025-Dec, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2025.11.002
PMID:41242181
|
综述 | 本文综述了基于纳米技术的细胞因子递送策略在胃肠道癌症治疗中的应用、优势与挑战 | 系统总结了利用脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶和智能纳米载体等纳米平台实现细胞因子的靶向、可控和持续释放,以增强抗肿瘤免疫并克服传统细胞因子疗法的局限性 | 仍面临生物屏障、细胞因子不稳定性、免疫原性以及制造复杂性等挑战 | 探讨纳米技术驱动的细胞因子递送平台如何改善胃肠道癌症免疫疗法的疗效与安全性 | 胃肠道癌症(包括结直肠癌、胃癌和食管癌)及其肿瘤微环境 | NA | 胃肠道癌症 | 纳米技术递送平台(脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶、智能纳米载体等) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 50 | 2025-12-11 |
Screening and machine learning-based prediction of translation-enhancing peptides that reduce ribosomal stalling in Escherichia coli
2025-Oct-22, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00199d
PMID:41142649
|
研究论文 | 本研究通过筛选和机器学习预测,鉴定了能减少大肠杆菌中核糖体停滞的翻译增强肽 | 首次使用随机化人工四肽库进行翻译增强肽的全面筛选,并开发了基于随机森林算法的机器学习模型来预测肽活性 | 研究主要关注SecM AP诱导的翻译停滞,可能未涵盖所有类型的停滞肽或翻译系统 | 开发一种减少核糖体停滞的肽工具包和数据驱动方法,以应用于合成生物学 | 翻译增强肽及其对SecM AP诱导的翻译停滞的影响 | 机器学习 | NA | 随机化人工四肽库筛选、翻译分析 | 随机森林 | 肽序列和活性数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 51 | 2025-12-11 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
|
综述 | 本文综述了微生物生产类胡萝卜素torulene的现状、策略、生物特性及其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 系统总结了通过上游和下游工艺提高torulene产量的策略,并探讨了其在多个工业领域的应用潜力 | torulene的研究仍有限,其商业化潜力尚未充分开发,微生物生产面临挑战 | 总结torulene的微生物生产策略、生物特性及潜在应用,推动其商业化发展 | 红酵母生产的类胡萝卜素torulene | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 红酵母(如Rhodotorula和Sporobolomyces) | NA | 食品,化妆品,制药 |
| 52 | 2025-12-10 |
Forged in O2: Transition metal ions and the rise of aerobic life
2026-Feb, Journal of inorganic biochemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2025.113147
PMID:41265342
|
综述 | 本文探讨了金属离子在需氧生命演化中的核心作用,从生物无机化学、酶学、合成生物学和微生物组科学的角度,分析了金属蛋白如何调控和利用氧气 | 整合多学科视角,结合仿生分子复合物及天然与人工金属蛋白研究,阐明氧气反应性的结构功能策略,并系统探讨金属离子在维持氧化还原平衡、宿主-微生物互作及疾病中的作用 | NA | 理解金属离子在氧气化学中的关键角色,以支持健康代谢和氧化应激相关疾病的研究 | 金属蛋白、金属酶、生物仿生分子复合物、天然与人工金属蛋白 | 生物无机化学 | 氧化应激相关疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 53 | 2025-12-10 |
Biogenic amines in fermented foods: A comprehensive review from formation pathways, risk analysis, detection technologies to control measures
2026-Jan-15, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117832
PMID:41360534
|
综述 | 本文系统综述了发酵食品中生物胺的形成途径、风险分析、检测技术及控制措施,特别聚焦于微生物策略及其机制与未来展望 | 特别强调微生物控制策略作为内在兼容的解决方案,并展望了将微生物策略与AI驱动的生物传感器等智能技术结合,以及利用合成生物学提高酶产量的未来研究方向 | 在优化菌株效能、稳定性及大规模生产应用方面仍存在挑战 | 为发酵食品中生物胺的相关研究和实际应用提供结构化参考 | 发酵食品中的生物胺 | NA | NA | AI驱动的生物传感器、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 54 | 2025-12-10 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠的H3K9甲基化酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读分子HP1对转录和染色质结构的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基化酶和HP1,以克服系统冗余问题,直接评估其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能无法完全反映H3K9甲基化和HP1在高等生物中的全部功能,且未观察到对转录或染色质三维结构的显著影响 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的具体作用机制 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基化酶催化H3K9甲基化及HP1蛋白 | 基础研究 |
| 55 | 2025-12-10 |
Methyltransferase Detection Based on Target-Responsive Transcription Amplification of Light-Up Aptamer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05886
PMID:41296341
|
研究论文 | 开发了一种基于目标响应转录扩增的DNA甲基转移酶检测新方法 | 提出了一种名为MTA的简单、无标记、通用策略,利用Broccoli RNA光敏适配体和转录扩增实现高灵敏度检测,并支持逻辑门设计和多目标检测 | NA | 开发高灵敏度、高特异性的DNA甲基转移酶检测方法 | DNA甲基转移酶(如Dam和M.SssI MTase) | 合成生物学 | NA | 转录扩增、光敏适配体检测 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | 基于甲基化响应开关的转录调控电路,支持逻辑门设计 | 生物医学 |
| 56 | 2025-12-10 |
Phenotyping and Selection of Cells Using Mass Spectrometry and a Microfluidic Droplet Printer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05032
PMID:41309380
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机的系统,用于无标记细胞表型分析和选择 | 整合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机,实现在线分析和捕获含细胞液滴,提供无标记表型分析和选择能力 | 系统操作速率限制在0.4-1.2液滴/秒范围内,可能影响高通量筛选效率 | 开发一种高通量、无标记的细胞表型分析和选择方法 | 含细胞的微流控液滴 | 合成生物学 | NA | 液滴电喷雾电离质谱、微流控电压介导液滴打印 | NA | 质谱数据、图像数据 | NA | NA | 微生物细胞 | NA | 合成生物学、酶工程 |
| 57 | 2025-12-10 |
Construction and Functional Characterization of a Heterologous Quorum Sensing Circuit in Clostridium sporogenes
2025-Dec-08, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00628
PMID:41359820
|
研究论文 | 本研究在严格厌氧革兰氏阳性菌中构建并功能表征了一个异源群体感应电路,实现了密度依赖性基因调控 | 首次在严格厌氧菌中成功工程化agr群体感应系统,扩展了合成生物学工具包 | NA | 开发革兰氏阳性菌中的工程化群体感应系统,以用于细菌疗法和代谢工程 | 严格厌氧革兰氏阳性菌Clostridium sporogenes | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Clostridium sporogenes | 异源群体感应电路,基于agr-QS系统,包括自诱导肽产生和GFP报告基因调控 | 医学, 工业生物技术 |
| 58 | 2025-12-10 |
Toward Full Automation in Synthetic Biology: A Progressive Conceptual Framework Integrating Robotics and Intelligent Agents
2025-Dec-06, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100378
PMID:41360266
|
综述 | 本文探讨了合成生物学中物理(机器人)和认知(智能代理)自动化的进展与前景,并提出了一个双重概念框架 | 提出了一个双重概念框架,分别针对DBTL循环的全面自动化和适应不同实验室环境的渐进式自动化 | NA | 支持合成生物学实验室中自动化系统的开发和负责任实施 | 合成生物学中的自动化技术 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 59 | 2025-12-10 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
|
综述 | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用,旨在通过可持续方式增强鱼类免疫力并控制疾病爆发 | 提出了基于微藻的口服疫苗的理性设计,并讨论了其口服递送和免疫益处,结合合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动创新 | NA | 探讨微藻基疫苗在水产养殖中的可持续应用,以增强鱼类免疫力和减少疾病 | 微藻基口服疫苗及其在水产养殖鱼类中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 农业 |
| 60 | 2025-12-09 |
Extraction, preparation, pharmacological activities, and potential applications of ginsenosides Rk1 and Rg5
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120678
PMID:41052692
|
综述 | 本文系统总结了稀有皂苷Rk1和Rg5在天然来源、提取加工、结构特性、药理机制及在功能性食品和营养品中潜在应用的最新进展 | 整合了网络药理学和分子对接技术来预测Rk1和Rg5的潜在抗癌及生殖保护作用,并探讨了人工智能辅助生物转化和合成生物学等新兴技术为其规模化生产提供的新途径 | 稀有皂苷Rk1和Rg5的天然丰度低、结构复杂且可持续生产面临挑战,其药代动力学特征尚不明确,缺乏严格的临床试验验证其疗效 | 系统总结稀有皂苷Rk1和Rg5的研究进展,弥合临床前研究与临床转化之间的差距,促进其在医疗保健和营养领域的更广泛应用 | 人参属植物(人参、西洋参、三七)中的稀有皂苷成分,特别是Rk1和Rg5 | NA | 肿瘤、代谢性疾病、神经退行性疾病、心血管疾病 | 网络药理学、分子对接、化学与物理转化方法、人工智能辅助生物转化、合成生物学策略 | NA | 文献数据、药理模型数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、功能性食品、营养品 |