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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-10-01 |
The Role of AI-Driven De Novo Protein Design in the Exploration of the Protein Functional Universe
2025-Sep-15, Biology
DOI:10.3390/biology14091268
PMID:41007412
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综述 | 系统综述AI驱动的从头蛋白质设计在探索蛋白质功能宇宙中的作用、方法和应用 | 通过AI计算框架突破自然进化和传统蛋白质工程的限制,实现定制化折叠和功能的蛋白质设计 | 存在持续的技术挑战和局限性 | 探索蛋白质功能宇宙并扩展蛋白质工程的可能性 | 蛋白质序列、结构和功能 | 计算生物学 | NA | AI驱动的计算设计方法 | AI计算框架 | 蛋白质序列和结构数据 | NA |
42 | 2025-10-01 |
Engineering Antioxidants with Pharmacological Applications: Biotechnological Perspectives
2025-Sep-12, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14091110
PMID:41009014
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综述 | 本文探讨了利用生物技术方法生产抗氧化剂的最新进展及其在药理学中的应用 | 系统综述了微生物细胞工厂、酶催化合成、植物细胞培养和代谢工程等生物技术生产抗氧化剂的新策略 | 未提及具体的研究局限性,但指出了规模化生产和成本控制方面的挑战 | 研究生物技术生产抗氧化剂的方法及其在疾病治疗中的应用潜力 | 酶类抗氧化剂(超氧化物歧化酶、过氧化氢酶、谷胱甘肽过氧化物酶)和非酶类抗氧化分子(类胡萝卜素、多酚、维生素) | 生物技术 | 恶性肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、衰老相关疾病 | 微生物发酵、酶催化合成、植物细胞培养、代谢工程、生物勘探、合成生物学 | NA | 文献资料、临床前和临床数据 | NA |
43 | 2025-10-01 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块通过调控抗氧化系统和冷信号通路基因表达来增强植物耐寒性的分子机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在耐寒性调控中的功能,并验证该模块可通过异源表达策略增强拟南芥的耐寒性 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源表达验证,尚未在小麦本物种中完成功能验证 | 探究冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在冷胁迫响应中的分子调控机制 | 冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和转基因拟南芥 | 植物分子生物学 | 非疾病研究(植物胁迫响应) | 基因过表达、短串联靶标模拟物(STTM)、异源表达、分子生物学分析 | NA | 基因表达数据、生理指标数据、形态观察数据 | 冬小麦品种和转基因拟南芥植株(具体数量未明确说明) |
44 | 2025-10-01 |
Synthetic Protein-Assisted Co-Assembly of Zeolitic Imidazolate Framework-8 and Novosphingobium capsulatum for Enhanced Saline-Alkali Resistance of Wheat
2025-Sep-09, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30183669
PMID:41011563
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研究论文 | 本研究通过合成蛋白辅助构建ZIF-8与Novosphingobium capsulatum的共组装体系,用于增强小麦的盐碱抗性 | 首次通过合成多糖结合蛋白介导的金属有机框架-益生菌共组装体系,实现了益生菌和抗逆分子在作物根际的高效固持 | NA | 开发提高作物盐碱抗性的新型纳米生物技术策略 | 小麦及其根际微生物群落 | 合成生物学与纳米技术 | 作物盐碱胁迫 | 金属有机框架组装、微生物共培养、微生物组分析 | NA | 土壤理化数据、微生物群落数据、植物生理指标 | NA |
45 | 2025-10-01 |
Sustainable Production of Ginsenosides: Advances in Biosynthesis and Metabolic Engineering
2025-Sep-09, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182821
PMID:41011973
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综述 | 本文综述了人参皂苷生物合成与代谢工程的最新进展,重点关注可持续生产方法 | 系统整合了合成生物学在人参皂苷生产中的应用,包括植物细胞培养、工程微生物宿主和无细胞酶合成等先进方法 | NA | 探讨人参皂苷的可持续生产方法,替代传统农业种植模式 | 人参皂苷及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、植物细胞培养、微生物工程 | NA | 文献综述 | NA |
46 | 2025-10-01 |
Review of the Arbitrium (ARM) System: Molecular Mechanisms, Ecological Impacts, and Applications in Phage-Host Communication
2025-Sep-04, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092058
PMID:41011390
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综述 | 本文综述了噬菌体仲裁(ARM)通信系统的分子机制、生态影响及其在噬菌体-宿主通信中的应用潜力 | 首次系统整合了ARM系统这一新发现的噬菌体决策机制的研究进展,强调其在分子水平调控噬菌体群体动态的创新性 | ARM系统是相对较新的发现,相关研究仍处于早期阶段,许多分子细节和生态影响尚未完全阐明 | 深入理解噬菌体仲裁通信系统的分子机制、生态功能及其在生物技术中的应用前景 | 噬菌体及其与细菌宿主的相互作用,特别是ARM通信系统 | 分子生物学与微生物生态学 | NA | 群体感应样肽信号机制 | NA | 文献资料与实验数据 | NA |
47 | 2025-10-01 |
Biofilms Exposed: Innovative Imaging and Therapeutic Platforms for Persistent Infections
2025-Aug-28, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090865
PMID:41009844
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综述 | 探讨生物膜持久性感染的分子机制及创新成像与治疗平台 | 整合超分辨率显微镜、微流控和AI建模等先进技术,提出CRISPR-Cas修饰噬菌体、群体感应拮抗剂等精准生物膜管理策略 | NA | 分析生物膜耐药机制并开发新型诊疗策略 | 临床和工业环境中的生物膜 | 生物医学工程 | 持久性感染 | 超分辨率显微镜、微流控、AI建模、CRISPR-Cas、合成生物学 | AI驱动建模 | NA | NA |
48 | 2025-10-01 |
Untangling the Complexity of Two-Component Signal Transduction in Bacteria
2025-Aug-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092013
PMID:41011345
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综述 | 探讨细菌双组分信号转导系统的非典型结构、调控机制及其在生物技术和医学中的应用潜力 | 系统阐述非典型双组分系统的转录调控多样性、替代性反应调节蛋白活性、磷酸化调控变异及负调控机制,提出信号特异性管理的新视角 | 对非典型双组分系统的生理相关性认知仍存在知识空白 | 解析细菌双组分信号转导系统的复杂性和多样性 | 细菌双组分信号转导系统(TCSs) | 合成生物学 | 细菌感染 | NA | NA | 文献资料 | NA |
49 | 2025-10-01 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-06, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 探讨物理学与细胞生物化学在生命/物质关联中的耦合机制 | 整合近十年实验与计算进展,关注空间组织和区室化对布朗运动与流体物理的影响 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建活细胞 | 揭示物质转化为生命的功能增益机制 | 生物细胞 | 系统生物学 | NA | 全细胞建模与合成生物学 | 计算模型 | NA | NA |
50 | 2025-10-01 |
Functionalized Protein Binders in Developmental Biology
2024-10, Annual review of cell and developmental biology
IF:11.4Q1
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综述 | 本文综述了功能化蛋白质结合剂在发育生物学中的应用及其技术发展 | 系统总结了蛋白质结合剂与功能域融合实现靶蛋白降解、重定位、可视化和翻译后修饰的创新方法 | NA | 探讨功能化蛋白质结合剂在发育生物学中对蛋白质功能研究的推动作用 | 纳米抗体和其他合成支架衍生的蛋白质结合剂 | 发育生物学 | NA | 蛋白质结合剂技术、计算蛋白质设计、支架工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
51 | 2025-10-01 |
CRISPR Tools for Engineering Prokaryotic Systems: Recent Advances and New Applications
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 回顾CRISPR工具在原核生物系统工程中的最新进展与应用 | 从分子工程角度系统阐述CRISPR组件设计策略及其在原核生物中的新型应用 | NA | 总结CRISPR技术在原核生物遗传工程中的应用现状与未来方向 | 原核生物系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
52 | 2025-10-01 |
Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过可扩展设计加速多样化细胞疗法发展的方法与前景 | 整合合成生物学工具和先进基因组编写技术,为细胞疗法提供可扩展的设计方案 | NA | 探讨如何通过工程化方法增强细胞功能以推进细胞疗法发展 | 原代细胞和干细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因方法、遗传载体设计、基因组编写技术 | NA | NA | NA |
53 | 2025-10-01 |
Heterologous synthesis of the complex homometallic cores of nitrogenase P- and M-clusters in Escherichia coli
2023-10-31, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2314788120
PMID:37871225
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研究论文 | 本研究报道在大肠杆菌中异源合成固氮酶P-簇和M-簇核心的成功方法 | 首次在非固氮宿主中通过共表达特定基因成功合成P-簇和L-簇,并采用金属中心、分而治之的策略 | 尚未在异源宿主中完成完整固氮酶的表达,仅实现了关键金属簇的合成 | 解决固氮酶在异源表达中复杂金属簇合成的关键难题 | 固氮酶的P-簇([FeS])和M-簇核心(L-簇; [FeSC]) | 合成生物学 | NA | EPR、XAS/EXAFS光谱分析、金属含量测定 | NA | 光谱数据、活性测定数据 | 纯化的金属蛋白样品 |
54 | 2025-10-01 |
Ribozyme activity modulates the physical properties of RNA-peptide coacervates
2023-06-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83543
PMID:37326308
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研究论文 | 本研究开发了一种连接酶核酶系统,通过RNA-肽凝聚层调节液滴物理性质 | 首次证明核酶活性可通过改变RNA链长度来调控凝聚层液滴的物理特性,建立了基因型-表型关联 | NA | 研究核酶活性对RNA-肽凝聚层物理性质的影响机制 | 连接酶核酶系统、聚赖氨酸和RNA片段组成的凝聚层微滴 | 合成生物学 | NA | 连接酶核酶催化、凝聚层形成技术 | NA | 物理性质测量数据、催化活性数据 | 包含活性和非活性核酶序列的凝聚层微滴对比实验 |
55 | 2025-09-30 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-Sep-28, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
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观点文章 | 回顾SBOL Visual标准在过去十年间的发展历程及其在合成生物学领域的应用情况 | 首次系统总结SBOL Visual标准从2013年推出到3.0版本的演进过程及其在科学出版物中的采用趋势 | 尚未实现完全合规性和最佳实践的普遍采用,需要进一步努力 | 分析SBOL Visual标准在合成生物学领域的采用情况和未来发展前景 | SBOL Visual标准及其相关可视化工具 | 合成生物学 | NA | 可视化标准制定 | NA | 图表标准 | 从最初21个图形符号发展为全面的图示语言体系 |
56 | 2025-09-30 |
Unearth hidden terpenoids in plants by genome mining and synthetic biology
2025-Sep-27, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103365
PMID:41016367
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综述 | 本文综述了通过基因组挖掘和合成生物学技术发掘植物中隐藏萜类化合物的方法与应用 | 整合基因组挖掘与合成生物学技术,系统发现和表征所有主要萜类中的新型支架,显著扩展药物开发的化学空间 | NA | 探索植物中隐藏萜类化合物的发现与表征方法 | 植物萜类化合物,包括三萜、二萜、倍半萜和双萜等 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、可扩展生产系统 | NA | 基因组数据 | NA |
57 | 2025-09-30 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
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研究论文 | 本研究开发了一种内含子优化的双碱基编辑器,用于提高构巢曲霉对棘白菌素B的耐受性并优化其调控回路 | 开发了基于真菌内含子的策略解决质粒不稳定性问题,创建了PAM-less SpRY-CABE系统实现高效双碱基编辑 | 未明确说明实验样本量及系统在其他丝状真菌中的普适性 | 解决棘白菌素B生产中的调控机制理解不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其相关基因(AniJ, aniA, FKS1) | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(CABE)、启动子突变、发酵优化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物数据 | NA |
58 | 2025-09-30 |
Edible fungus Fusarium venenatum: advances, challenges, and engineering strategies for future food production
2025-Sep-25, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.009
PMID:41015229
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综述 | 系统总结食用真菌Fusarium venenatum在合成生物学工具开发、底盘工程及应用方面的最新进展 | 首次系统聚焦该菌株的合成生物学工具开发与底盘工程研究,提出未来食品生物制造的发展策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述和分析 | 为基于F. venenatum的未来食品生产系统开发提供思路和指导 | 食用丝状真菌Fusarium venenatum | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、微生物制造 | NA | 文献资料 | NA |
59 | 2025-09-30 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-05, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展,包括合成生物学工具和数学建模在开发微生物细胞工厂中的应用 | 强调了合成生物学和代谢模型加速代谢工程设计-构建-测试-学习周期的创新方法 | NA | 开发能够可持续生产各种化合物的酵母微生物细胞工厂 | 酵母菌作为平台细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、数学建模 | 代谢模型 | NA | NA |
60 | 2025-09-30 |
Light-Controlled Synthetic Communication Networks via Paired Connexon Nanopores
2025-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.11.648033
PMID:40291719
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研究论文 | 通过工程化连接蛋白通道在合成细胞间构建光控通讯网络 | 首次设计出对紫外光和近红外光分别响应的连接蛋白43和32通道,实现合成细胞间正交信号传递 | NA | 在基于脂质体的合成细胞中模拟生物细胞间的通讯网络 | 连接蛋白通道和脂质体合成细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、脂质体组装 | NA | 实验数据 | NA |