合成生物学相关文章
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当前共找到 3173 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-05-28 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-May-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
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研究论文 | 本研究介绍了Ponceau S作为一种选择性调节剂，用于诱导和监测蛋白质的液-液相分离（LLPS） | 首次提出Ponceau S作为小分子调节剂，能够精确调控蛋白质的液-液相分离，并通过其荧光特性监测相分离过程 | 研究仅针对牛血清白蛋白和溶菌酶两种蛋白质，未验证其在更广泛蛋白质体系中的适用性 | 探索小分子对蛋白质液-液相分离的精确调控方法 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 生物分子工程 | NA | 荧光监测技术 | NA | 实验数据 | 两种蛋白质（牛血清白蛋白和溶菌酶） |
| 42 | 2025-05-28 |
Mitigating Uricase Immunogenicity through Zwitterionic Peptide Fusion for Enhanced Gout Therapy
2025-May-27, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c00829
PMID:40374583
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研究论文 | 通过合成生物学方法将两性离子肽与尿酸氧化酶融合，降低其免疫原性，从而增强痛风治疗效果 | 利用不同长度的两性离子肽（重复VPKEG序列）融合尿酸氧化酶，显著降低其免疫原性，并提高酶活性、底物亲和力及血液循环时间 | 研究仅在大鼠痛风模型中进行验证，尚未进行人体临床试验 | 开发低免疫原性的尿酸氧化酶以增强痛风治疗效果 | 尿酸氧化酶及两性离子肽融合蛋白 | 合成生物学 | 痛风 | 合成生物学 | NA | NA | 大鼠痛风模型 |
| 43 | 2025-05-28 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 该研究设计了一种在大肠杆菌中生产(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 结合合成生物学、生物催化和合成化学方法，设计了一个五步工程生物合成途径，用于生产复杂的吲哚生物碱 | NA | 简化对含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物的获取途径 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |
| 44 | 2025-05-27 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
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综述 | 本文综述了麦角硫因的微生物合成研究进展与发展前景 | 系统梳理了麦角硫因的应用、代谢途径、微生物合成策略及发酵优化方法，并展望了未来研究方向与技术挑战 | 未涉及具体实验数据或案例分析 | 提高麦角硫因的生物合成效率以满足市场需求 | 麦角硫因及其微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程与发酵工艺优化 | NA | 文献资料 | NA |
| 45 | 2025-05-27 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine sensing mRNA element
2025-May-22, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文研究了2'-脱氧鸟苷（2'-dG）感应mRNA元素的遗传开关机制，揭示了调控螺旋在转录调控中的关键作用 | 发现dGsw-int转录中间体在无配体时形成稳定的抗终止螺旋（ON状态），而在2'-dG存在时该螺旋解离（OFF状态），提出代谢物感应发生在两个转录中间体合成的短暂时间窗口 | 研究主要基于体外化学探测和荧光淬灭实验，未涉及体内复杂环境验证 | 阐明2'-dG感应核糖开关的精细调控机制及其在转录过程中的动态变化 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关（dGsw）及其转录中间体（dGsw-fl和dGsw-int） | 分子生物学 | NA | 化学探测技术、荧光淬灭实验 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 46 | 2025-05-27 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | 通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | NA | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA (miRNA)的比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 47 | 2025-05-26 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-May-24, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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research paper | 开发了一种基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 设计了一种简单的二肽，能够自凝聚成微米级液滴，并可作为微反应器用于疏水反应物，同时在不同pH值下形成纤维状组装体，作为高效的酯酶模拟催化剂 | NA | 探索最小化设计的超分子催化剂在酶学和合成生物学中的应用 | 二肽自凝聚形成的液滴和纤维 | synthetic biology | NA | liquid-liquid phase separation (LLPS) | NA | NA | NA |
| 48 | 2025-05-26 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
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研究论文 | 本文描述了一种通过RNA-DNA三链体调节转录速率的机制，并在大肠杆菌启动子设计的架构中验证了其能力 | 揭示了RNA-DNA三链体通过扭曲双链DNA结构来增强或抑制转录的新机制 | 实验证据仍缺乏在更复杂生物（如哺乳动物）中的验证 | 探究非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | 大肠杆菌启动子及其与RNA-DNA三链体的相互作用 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征 | NA | NA | NA |
| 49 | 2025-05-26 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 本研究通过基于知识的筛选和重新设计σ54的RpoN盒及其配对启动子，开发了三组基于σ54-R456H、R456Y和R456L的正交表达系统 | 开发了三组具有不同启动子偏好和理想相互正交性的σ54正交表达系统，并证明其在三种非模式细菌中的特异性转录能力 | NA | 扩展合成生物学工具包，提供可靠且多样化的基因表达 | σ54依赖性转录过程 | 合成生物学 | NA | 知识筛选和重新设计 | NA | NA | 三种非模式细菌 |
| 50 | 2025-05-26 |
Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells
2025-May-22, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00964-8
PMID:40405135
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研究论文 | 本研究利用酵母细胞中的转化相关重组（TAR）方法，成功组装了来自昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段 | 首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的组装，为基因组工程研究提供了新思路 | 研究中发现了初始合成时存在的突变和缺失，可能影响组装片段的准确性 | 探索TAR方法在昆虫病毒基因组工程研究中的适用性 | Heliothesis virescens ascovirus 3h (HvAV-3h) dsDNA基因组 | 合成生物学 | NA | TAR, PCR, NGS | NA | DNA序列数据 | 15个约2.9-3.2 Kb的DNA片段组装成44.6 Kb长片段 |
| 51 | 2025-05-25 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-May-23, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 本研究提出了一种利用光响应DNA液滴通过动态相分离调控酶级联途径的新方法 | 设计了带有偶氮苯修饰粘性末端的Y-motif序列，形成光响应DNA液滴，实现了酶级联途径的动态光调控 | NA | 开发调控酶级联途径的新方法 | 光响应DNA液滴和酶级联系统（GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT） | 合成生物学 | NA | 光响应DNA液滴技术 | NA | 生化实验数据 | 两种酶级联系统（GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT） |
| 52 | 2025-05-25 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and its Potential Biomedical Applications
2025-May-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
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research paper | 本文探讨了利用合成生物学原理设计变构调控及其在生物医学中的应用 | 通过合成生物学策略设计变构蛋白调控，包括变构调节剂的设计、从头变构蛋白开关的生成以及工程化变构机制的应用 | NA | 研究变构调控在生物医学和生物技术中的应用，并推进对天然变构的理解 | 变构蛋白调控及其在生物医学中的应用 | synthetic biology | NA | AI-based generative protein design | NA | NA | NA |
| 53 | 2025-05-25 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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research paper | 评估NEIMS质谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性，以改进未知生物分子检测 | 首次评估NEIMS算法对超出训练数据的氨基酸的预测准确性，并指出其不足 | 预测光谱对于超出算法训练数据的氨基酸不准确，且无法通过物理化学差异或氨基酸衍生化状态解释这些不准确性 | 改进质谱预测算法，以扩展数据库覆盖范围，包括理论分子 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | mass spectral data | NA |
| 54 | 2025-05-25 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-May, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
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研究论文 | 本文介绍了RNA折纸细胞骨架模拟物作为合成细胞的核酸分子硬件，并展示了其在巨型单层脂质囊泡中的表达和应用 | 首次将RNA折纸技术应用于合成细胞的细胞骨架构建，实现了在等温条件下由DNA模板直接表达和自组装RNA折纸纳米管 | 研究仅局限于体外合成细胞系统，尚未在真实细胞环境中验证其功能 | 开发基于RNA的合成细胞分子硬件 | RNA折纸纳米管和合成细胞 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术、分子动力学模拟 | NA | 分子结构数据 | NA |
| 55 | 2025-05-25 |
Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414777
PMID:40125621
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研究论文 | 该文章介绍了一种名为KD-FRET的方法，用于在活细菌细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的解离常数（K） | 开发了KD-FRET方法，能够在活细菌细胞中直接定量测量PPIs，克服了体外测量中的假阳性信号问题，并能够测量在标准缓冲条件下不稳定的相互作用对 | 未明确提及方法的局限性，但可能包括荧光共振能量转移（FRET）技术本身的技术限制 | 开发一种在活细胞中直接定量测量蛋白质-蛋白质相互作用的方法，以促进合成生物学、蛋白质工程和药物发现 | 活细菌细胞（E. coli和S. cerevisiae）中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移（FRET） | NA | 荧光信号数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及E. coli和S. cerevisiae中的蛋白质相互作用对 |
| 56 | 2025-05-25 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
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研究论文 | 介绍了一个名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释 | 开发了一个自动化工具ProteoSeeker，用于高效识别和注释宏基因组中的蛋白质，支持用户自定义蛋白质家族筛选和宿主生物分类学分析 | 未提及具体的性能对比或与其他工具的基准测试结果 | 加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新 | 宏基因组中的蛋白质 | 生物信息学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA |
| 57 | 2025-05-24 |
Microbiome catalog and dynamics of the Chinese liquor fermentation process
2025-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132620
PMID:40334798
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研究论文 | 该研究构建了中国白酒发酵过程中的微生物基因目录（MTFGC），揭示了发酵食品的独特性和高代谢潜力 | 建立了最大的发酵食品遗传资源库，发现了20%的新物种和基因，并验证了BGCs在合成香气相关脂肽中的作用 | 研究主要聚焦于中国白酒发酵过程，可能不适用于其他类型的发酵食品 | 揭示发酵食品中微生物的多样性和代谢潜力，推动传统发酵向精准合成生物学的转变 | 中国白酒发酵过程中的微生物群落 | 合成生物学 | NA | 宏基因组组装 | NA | 宏基因组数据 | 5,159个宏基因组组装基因组（MAGs） |
| 58 | 2025-05-24 |
Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection
2025-05-23, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c00275
PMID:40329593
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research paper | 本研究开发了一种新型的活体电化学生物传感器，用于高灵敏度和实时检测尼古丁 | 通过合成生物学和材料工程的结合，开发了具有增强活性和热稳定性的基因工程NOX突变体，并将其展示在孢子表面，结合FeSe@MHCS复合电极，实现了超低检测限和出色的稳定性 | NA | 开发一种高灵敏度和实时检测尼古丁的方法 | 尼古丁 | 生物传感器 | NA | 电化学阻抗谱(EIS), 差分脉冲伏安法(DPV) | NA | 电化学数据 | 血液和尿液样本 |
| 59 | 2025-05-24 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-May-23, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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研究论文 | 本文描述了一种通过共识设计获得的转肉桂酸脱羧酶PSC1，用于苯乙烯的生物合成 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1，能够在细菌中高效催化肉桂酸脱羧生成苯乙烯，解决了传统真菌脱羧酶在细菌系统中应用的难题 | NA | 开发一种高效、环保的苯乙烯生物合成方法 | 转肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
| 60 | 2025-05-24 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-May-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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review | 本文综述了人工孢子中单细胞纳米封装（SCNE）技术的最新进展，重点讨论了纳米壳的细胞保护和多功能作用 | 受自然界隐生现象的启发，设计了具有纳米壳保护和功能能力的人工'细胞壳'结构，克服了生物原始细胞的固有局限 | NA | 通过SCNE技术实现细胞内和细胞周围化学调控的精细调节，设计和构建满足特定功能需求的人工孢子 | 人工'细胞壳'结构 | 合成生物学、生物化学、材料科学、生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装（SCNE） | NA | NA | NA |